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EDASA COVID-19化合物库可供合作使用

发表人:Andrea Altieri,博士安德烈亚-阿尔蒂耶里,博士分子。2733

发布时间:5/12/2020

EDASA Scientific,一个小型的MedChem组织(http://www.edasascientific。com)正在寻找COVID-19地区的生物合作伙伴。EDASA拥有约2700种化合物的库存,愿意免费提供这些化合物(运输由接收方负责)进行测试,如果有任何积极的结果,愿意为优化活性化合物和进一步的进展分配一名化学家。EDASA愿意探索任何这些化合物的ililico改性,并合成(免费)有限数量的改性化合物作为概念验证。所有收到的数据,或其中的一部分,将以联合投稿的形式发表在科学期刊上,IF>3。请注意,所有这些化合物都是EDASA科学公司内部的专利,我们已经为所有这些化合物制定了有效的合成协议。


COVID-19 Mpro活性碎片

出版者:Alex ClarkAlex Clark Molecules:1003

发布时间:3/28/2020

通过晶体结构发现对Mpro/COVID19具有活性的片段,由英国国家同步辐射科学设施Diamond Light Source与Dectris合作提供(Diamond的所有MX实验都使用其探测器)。原始数据请见://www.diamond.ac.uk/covid-19/for-scientists/Main-protease-structure-and-XChem/Downloads.html


Perlara ArkBase

出版社:Perlstein Lab Molecules:56756

PI:Ethan Perlstein

发布时间:2019年10月27日

一个完全开源的基于模型-机体的表型筛选数据语料库,包括在酵母、蠕虫、苍蝇和人类细胞模型中对先天性代谢错误(如溶酶体疾病和糖基化先天性疾病)的药物再利用和线索发现筛选。这些数据已经在G3杂志上发表了三个案例研究(Lao et al. //www.g3journal.org/内容/9/2/413.long)和疾病模型与机制(Iyer等人,2019a //dmm.biologists.org/内容/早/2019/09/18/dmm。040576.long; Iyer等人,2019年b //dmm.biologists.org/内容/早/2019/10/19/dmm。040584.long).


血清素受体的体外和体内活性

出版商:Nicholas MoleculesNichols Molecules:84

PI:Dave Nichols

发布时间:2019年10月14日

数据集侧重于利用多巴胺或血清素作为神经递质的大脑系统。这包括只对五种一般类型的多巴胺受体(D1-D5)中的一种具有特异性的分子探针,以及血清素5-HT1A、5-HT2A和5-HT2C受体的数据集。这些项目由系统的结构修饰和药理检测组成,目的是确定这些受体中配体结合域的结构决定因素。这项工作的一个主题是确定来自不同化学类别的分子如何都能被容纳在同一个受体结合部位。


多发性红斑狼疮。 OL的区别

发布者 髓鞘修复基础分子。 710

PI:Tassie Collins

发布时间:2016年10月21日

急性少突胶质细胞分化试验O4免疫纯化的OPCs以5k/孔的速度进行培养。电镀1小时后,加入测试品,细胞孵育4天,于是固定细胞,免疫染色MBP和总核(DAPI)。通过MBP染色/细胞数的定量确定OPC分化为OLs(通过DAPI核染色鉴定)。在2个浓度(10和2uM;2和0.4uM;0.4和0.08uM)下进行化合物的筛选,一式四份。数据归一化为DMSO(0%分化)和40 ng/ml T3(100%分化)。EC50是相对于试验品的EMax确定的。技术细节见Lariosa-Willingham, et. , al, BMC Res Notes.2016年9月5日;9(1):419或联系[email protected],了解详细协议。


多发性红斑狼疮。 OL保护

发布者髓鞘修复基础分子。 723

PI:Tassie Collins

发布时间:2016年10月21日

少突胶质细胞保护试验--活力(TNF+IFNg)扩增的OPCs以10K/孔镀制。电镀24小时后,加入测试品,加入测试品1小时后,加入10U/ml IFN-gamma/1ng/ml TNF-α进行侮辱。培养2天,加入AlamarBlue,培养4小时。量化AlamarBlue荧光,读出细胞活力。数据的比例为DMSO(0%活性)和1.1 uM喹硫平(100%活性)。技术细节见Rosler, et. , al, BMC Res Notes.2016年9月5日;9(1):444联系[email protected],了解详细协议。


多发性红斑狼疮。髓鞘化验

发布者髓鞘修复基础分子。 715

PI:Tassie Collins

发布时间:2016年10月21日

皮质髓鞘化试验 将E18大脑皮层的细胞制备并镀在Neuralbasal培养基中。四天后,媒体被切换到MyM媒体。第5天,加入测试物品,允许髓鞘化进行8天。在体外第13天,将细胞固定,并对MBP和Olig2进行免疫染色。通过定量的MBP/Olig2+核染色和MBP形态的变化(连续MBP染色的排列-纤维长度)确定髓鞘化。OL分化是通过对MBP密度x面积/Olig2+核的量化来确定的。化合物在2个浓度(5和1 uM)下用4个图像/孔一式两份进行筛选。数据归一化为DMSO(0%分化/髓鞘化)和DAPT(100%分化/髓鞘化)。EC50s确定相对于1 uM DAPT的反应。技术细节见Lariosa-Willingham, et. , al, BMC Neurosci.2016年4月22日;17:16或联系[email protected],了解详细协议。


多发性红斑狼疮。HEK293金霉素保护试验。

发布者髓鞘修复基础分子。 740

PI:Tassie Collins

发布时间:2016年7月10日

HEK-293保护试验

 

HEK-293细胞(10K/孔)孵育24小时,然后加入测试物品。1小时后,加入100 ng/ml的金霉素。额外的48小时孵育后,加入AlamarBlue,4小时后量化荧光。数据归一化为DMSO(0%活性)和5 uM胍基(100%活性)。EC50是相对于试验品的EMax确定的。联系 [email protected] 了解详细的协议。


多发性红斑狼疮。 OL毒性筛选

发布者髓鞘修复基础分子。 709

PI:Tassie Collins

发布时间:2016年7月10日

少突胶质细胞毒性试验(TNF+IFNg)

 

对通过的大鼠OPCs进行毒性测定,以10k/孔培养,与药物一起培养2天。读出的是AlamarBlue荧光在4小时孵育后。数据显示为相对于DMSO(100%)的生存百分比。最大杀伤力是用5纳克/毫升的金霉素,这使得约15%的细胞活着。技术细节见Lariosa-Willingham,等,al,BMC Res Notes。2016年9月5日;9(1):419或联系[email protected],了解详细协议。


绿色溶剂

发布者:Alex Clark亚历克斯・克拉克沙盒分子公司117

发布时间:2016年9月20日

绿色溶剂数据,由同名移动应用程序(http://molmatinf.com/greensolvents.html)使用。根据美国化学学会绿色化学研究所和GSK溶剂指南发布的信息汇编而成。发表在http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/sc3000509。


寄生虫。GSK Kineto Box用pIC50打出了一片天地

发布者:GSK Kineto Box项目(TCAKS)GSK Kineto Box项目(TCAKS)分子。592

PI:Pilar ManzanoPilar Manzano

发布时间:2016年6月16日

利用全细胞表型测定法,针对与人类疾病最相关的三种动植物,即利什曼不动杆菌、克鲁斯锥虫和布鲁斯锥虫,对180万种化合物的葛兰素史克公司高通量筛选(HTS)多样性集进行了筛选。进行了二次确认和正交细胞内抗寄生虫试验,并确定了非特异性细胞毒性的可能性。对命中的化合物进行了化学聚类,并对理想的物理化学性质进行了分流。通过生物信息学方法研究了这些多样性集所覆盖的假想生物靶标空间。因此,组装了三个抗动植物化学盒,每个化学盒约有200个化合物。该数据集包括热门化合物和所有相关的筛选结果。 http://www.nature.com/articles/srep08771


销售商:ASINEX PPI图书馆

出版社:ASINEX Molecules:8400

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

自2008年以来,ASINEX一直致力于蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)库的设计和合成。最新一代的ASINEX PPI库包括各种尺寸、框架和形状的分子,从碎片状实体到大环衍生物,设计为二级结构模拟物或表位模拟物。


销售商:亚信精英图书馆

出版社:ASINEX Molecules:12960

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

初期"中招"后有哪些问题?Asinex通过广泛的ADME剖析、便于medchem修改的优化设计和IP评估来解决这些问题,确保新颖性。


销售商:ASINEX表型库

出版社:ASINEX Molecules:9840

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

Asinex在公司内部运行基于目标的和表型的检测,并利用其收集到的实验信息来创建基于目标的和多样化的筛选集。通过这一经验,Asinex创建了一个表型筛选集;该集的过滤器如下:

MW:200-450,clogP:-1.0-7.0,clogD(pH7.4):-5.0-4.0,Rot.Bond:0-10,HA:1-10,HD:1-5,TPSA:15-135 A,N+O:2-10,HAC:19-34,Dipole:0.3-3.30,SHP2:0.240-0.450。


销售商:ASINEX多元化图书馆

出版社:ASINEX Molecules:9968

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

多样性仍然是一个强大的筛选工具,特别是在药物发现的早期"探针"阶段。在创建这套产品时,Asinex应用计算工具确保化学空间得到适当的体现,同时也将"精英"和"生物设计"概念的元素融入其中。


厂商:ASINEX BioDesign

出版社:ASINEX Molecules:8041

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

ASINEX的BioDesign方法将已知的药学相关天然产物(如生物碱和其他次生代谢物)的关键结构特征融入到综合可行的药物化学支架中。


CATALOG:分布式药物发现(D3) - IUPUI - IUPUI, Inc.

发表于:IUPUI - D3 Enum 73K N-酰基AA-OH,-OMe,-NH2分子。73234

PI: M. J. ODonnell和W. L. ScottM.J.O'Donnell和W.L.Scott。

发布时间:2016年2月24日

一个免费、开放存取的虚拟目录/图书馆,收录了超过73,000个分子。(a) N-酰基非天然α-氨基酸,(b) N-酰基非天然α-氨基酸的甲基酯,(c) N-酰基非天然α-氨基酸的初级酰胺。目录中的分子是通过基于用100R1X对甘氨酸阴离子当量进行固相组合烷基化,然后用100R2CO2H进行N-乙酰化和树脂裂解(分别为TFA、MeOH/Et3N或TFA)而列举得到的。遗留的48,818个分子的数据集(以上a和b集加上R1X和R2CO2H输入)于2009年1月1日发表。我们鼓励同事与我们沟通,关于在D3项目的兴趣(电子邮件:[email protected]<mailto:[email protected]>或 [email protected]<mailto:[email protected]>)。参考文献。J. Comb.Chem.J. Comb.2009, 11, 3-13, 14-33, 34-43; J. Org.Chem.2014,79,3140-51;J. Chem.Educ. 2015, 92, 819-26.</mailto:[email protected]></mailto:[email protected]>


MALARIA:5种恶性疟原虫激酶的生化筛选与GSK的TCAMS比较

出版者:Gregory J. CrowtherGregory J. Crowther Molecules:13451

PI:Gregory J. CrowtherGregory J. Crowther

发布时间:2016年3月2日

~对13 500种细胞活性化合物进行了筛选,以确定其对五种不同蛋白激酶的活性。GlaxoSmithKline公司的Tres Cantos抗疟套装(TCAMS)在恶性疟原虫钙依赖性蛋白激酶1和4(CDPK1/PF3D7_0217500和CDPK4/PF3D7_0717500)的生化试验中进行了筛选。丝裂原相关蛋白激酶2(MAPK2/MAP2/PF3D7_1113900)、蛋白激酶6(PK6/PF3D7_1337100)和蛋白激酶7(PK7/PF3D7_0213400)。发现了其中三种激酶的新型强效抑制剂(IC50<1 µM)。CDPK1、CDPK4和PK6。PK6抑制剂是迄今为止发现的对该酶最有效的抑制剂,值得进一步研究。


公共暗物质化合物

发布者:暗物质化合物分子。139352

PI: Guillermo MoralesGuillermo Morales

发布时间:12/7/2015

诺华公司发现,他们的803,990个化合物已经在至少诺华公司的100项检测中进行了测试,112,872个化合物没有活性(14.0%)。而对NIH数据的分析显示,363,598个化合物已经在至少100个试验中进行了测试,其中131,726个化合物为非活性化合物(36.2%)。

Anne Mai Wassermann, Eugen Lounkine, Dominic Hoepfner, Gaelle Le Goff, Frederick J King, Christian Studer, John M Peltier, Melissa L Grippo, Vivian Prindle, Jianshi Tao, Ansgar Schuffenhauer, Iain M Wallace, Shanni Chen, Philipp Krastel, Amanda Cobos-Correa, Christian N Parker, John W Davies&Meir Glick.Dark chemical matter as a promising starting point for drug lead discovery.Nature Chemical Biology 2015,Vol.11,pp.958-966(doi:10.1038/nchembio.1936)。


ADME.AZ公共ChEMBL数据AZ公共ChEMBL数据

发布者AZ Public ChEMBL Data Molecules:5799

PI:Sean Ekins

发布时间:10/5/2015

阿斯利康公司确定的一套公开披露的化合物的体外DMPK和物理化学实验数据。为这些测定提供的参考资料说明了生成数据时使用的实验程序。

//www.ebi.ac.uk/chembl/doc/inspect/CHEMBL3301361% 通过平衡透析与血浆结合。化合物与全豚鼠血浆在37C下孵育5小时以上。B. Testa 等人(Eds.),Pharmacokinetic Profiling in Drug Research中描述的方法。Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141.实验范围10%~99.95%结合.%通过平衡透析与血浆结合。化合物与全犬血浆在37C下孵育5小时以上。B.Testa等(Eds.),Pharmacokinetic Profiling in Drug Research中描述的方法。Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141.实验范围10%~99.95%结合.%通过平衡透析与血浆结合。化合物与全鼠血浆在37C下孵育5小时以上。B.Testa等(Eds.),Pharmacokinetic Profiling in Drug Research中描述的方法。Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141.实验范围10%~99.95%结合.%通过平衡透析与血浆结合。化合物与小鼠全血浆在37C下孵育5小时以上。B.Testa等(Eds.),Pharmacokinetic Profiling in Drug Research中描述的方法。Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141.实验范围10%~99.95%结合.在37C培养后在人肝细胞中测得的内在清除率。实验范围<3~>150微升/分钟/1E6细胞。实验范围<3至>150微升/分钟/1E6细胞。Mass Spectrom.2010,24,1730-1736.采用天狼星分析公司的标准方法,通过吸收和电位滴定法测定最基本的pKa值(pKa B1)。实验范围 碱。>= 2.第二大酸性pKa值(pKa A2)采用天狼星分析公司的标准方法,通过吸收和电位滴定法测定。实验范围 酸:<=11。

采用天狼星分析公司的标准方法,通过吸收和电位滴定法测定第三种最基本的pKa值(pKa B3)。实验范围碱。>= 2.

采用天狼星分析公司的标准方法,通过吸收和电位滴定法测定第二种最基本的pKa值(pKa B2)。实验范围碱。>= 2.

采用天狼星分析公司的标准方法,通过吸收和电位滴定法测定最酸性pKa值(pKa A1)。实验范围 酸性:<=11。


PDB配体

发布者蛋白质数据库(PDB)分子。16826

PI:Dale R. Cameron, Ph.D., M.C.I.C., P.Chem.

发布时间:2015年3月8日

配体信息是从PDB中提取出来的,经过过滤,去除"聚合物"和其他相关的"非自由"配体以及金属或金属结合配体。过滤程序的更新可能在没有警告的情况下发生。数据按原样提供,没有额外的整理或纠错。PDB的链接是由RCSB PBD提供的,可以引用为

H.M.Berman,J.Westbrook,Z.Feng,G.Gilliland,T.N.Bhat,H.Weissig,I.N.Shindyalov,P.E.Bourne(2000)The Protein Data Bank Nucleic Acids Research,28:235-242.

请向保险库管理员报告破损的链接、补充数据的请求等。


EBOLA:埃博拉病毒的小分子抑制剂

出版者:Nadia's Sandbox Molecules:55

PI:Nadia Litterman博士

发布时间:2015年2月2日

这个共享数据集包含了55个来自文献的小分子(截至2015年1月),这些小分子具有对抗埃博拉病毒和各种疾病模型的体外和或体内活性。我们已经包含了一位经验丰富的药物化学家的评估以及PAINS过滤的结果。这项工作已由Nadia Litterman、Christopher Lipinski和Sean Ekins提交给F1000Research发表)。


销售商:Synthonix - 建立更好的纽带

发布者:http://www.synthonix.com Molecules:10286

发布时间:1/2/2015

Synthonix公司通过提供10286个构件目录,帮助药物化学家突破药物发现的界限,使他们能够探索更多具有挑战性的化学空间,并扩大潜在的重要治疗靶点的范围,以治疗世界上的慢性和可治愈的疾病。Synthonix公司:919-875-9277;总邮箱:[email protected];Synthonix有限公司(欧洲办事处)。办公室:+44 1223 597934Synthonix Ltd(欧洲办事处):办公室:+44 1223 597934;电子邮件:[email protected]


PROBES:NIH化学探针

出版社:《Probes Vault Molecules》。Probes Vault Molecules:319

PI:Christopher Lipinski

发布时间:2014年12月11日

美国国立卫生研究院(NIH)资助了广泛的HTS工作,估计超过5.76亿美元,通过分子库筛选中心网络(MLSCN)和分子库探针生产中心网络(MLPCN),在院内和学术中心确定小分子化学探针或工具化合物。对于当选为探针的化合物,已经使用了各种定义,基于效力、选择性、溶解度和可用性的组合。到目前为止,NIH资助的学术筛选中心已经发现了300多个化学探针。这个集合包括探针结构、靶点、抗靶点、IC50值和其他参考文献。它还包括各种药物相似性的测量方法,包括Chris Lipinski博士分配的可取性分数,如"专家对化学探针评价的计算预测和验证"中所述。Litterman NK, Lipinski CA, Bunin BA, Ekins S. J Chem Inf Model.(2014)


供应商:安之平有限公司积木系列

发布者:Azepine Ltd. 分子式。600

PI:Julia

发布时间:10/8/2014

600块积木,现货供应,价格优惠。联系 [email protected]


NEU-CSIC-GSK激酶靶向 HTS

发布者:Pollastri实验室-东北大学分子。78

PI:Michael Pollastri

发布时间:9/25/2014

该数据集包含了通过东北大学(Pollastri实验室)、中船重工(Navarro实验室)和葛兰素史克Tres Cantos实验室(发展中国家疾病DPU)合作进行的高通量筛选的公开结果。文章为Diaz等人,PLoS-NTDs。

 

DOI: 10.1371/journal.pntd.0003253

 

如有问题请联系 [email protected]


供货商:Vitas-M实验室库存HTS收藏品

发布者:Vitas-M实验室Vitas-M实验室分子。388375

发布时间:2014年11月7日

Vitas-M实验室, LTD.收集的HTS化合物是大约400000个单独的分子,在库存。所有这些化合物都可以以不同的形式快速交付,包括毫克、微摩尔、干粉、DMSO溶液和干膜。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [email protected]


供應商:Vitas-M 實驗室組件公司

发布者:Vitas-M实验室Vitas-M实验室分子。33297

发布时间:2014年7月7日

Vitas-M实验室,有限公司。收集的有机积木包含超过33000个鉴定和测试项目。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [email protected]


供应商:Vitas-M实验室脚手架

发布者:Vitas-M实验室Vitas-M实验室分子。2898

发布日期:2014年8月7日

Vitas-M实验室,有限公司。收集支架(杜鹃花项目)。先进的想法,合成药物类迷你图书馆。它是获得绝对新颖的化合物的最佳选择,没有其他供应商提供。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko:[email protected]


供應商:Vitas-M實驗室碎片公司

发布者:Vitas-M实验室Vitas-M实验室分子。18631

发布日期:2014年8月7日

Vitas-M实验室, LTD.收集碎片(通过"3规则"和其他特殊过滤器的化学物质),用于基于碎片的药物发现。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko:[email protected]


销售商:生命化工-GPCR库

出版社:《生活化学》杂志生命化学分子公司。15948

PI:Alexandr KucherakAlexandr Kucherak

发布时间:6/20/2014

相似性/药相搜索是基于Sybyl-X提供的Topomer Search预测。第一步--相似性搜索假设将整个库存化合物与来自BindingeDB和ChemblDB的已知抑制剂进行比较。第二步--生成已知抑制剂的3D结构和它们的共同排列。这个化学空间空间被用作其余"相似"化合物的拟合模板。然而,这种方法是为"挑剔"而设计的,并且可以用虚拟筛选方法(所有筛选模型都是现成的,并且用训练集证明了)对这样的受体--腺苷、趋化因子、多巴胺、gaba-、组胺、毒蕈碱、阿片类、鞘氨醇进行替代库。http://www.lifechemicals.com/。


供應商:生命化學工業股份有限公司 - Kinase by Similarity(相似性)

出版社:《生活化学》杂志生命化学分子公司。62467

PI:Alexandr KucherakAlexandr Kucherak

发布时间:6/20/2014

使用MDL公钥和Tanimoto相似度截止值90%进行相似度搜索。近25K个参考化合物在168个生物试验中测试出活性(超过100个不同的激酶靶点),被用于相似性搜索。所有这些化合物可以根据客户的订单,针对更多的特定目标进行筛选。http://www.lifechemicals.com/。


供应商:生命化工-对接式激发酶

出版社:《生活化学》杂志生命化学分子公司15174

PI:Alexandr KucherakAlexandr Kucherak

发布时间:6/20/2014

Kinase library was prepared basing on virtual docking in a Sybyl environment.为此,对一组激酶结构的结合位点(约20个)进行了排列和分析。这样的叠加位点被用于通过Sybyl-X的Unity模块进行基于结构的药相建模。在所有的准备工作完成后,根据这个多药体模型对整个3D库存进行了筛选,最后进行了排名。http://www.lifechemicals.com/。


销售商:生命化学品-核受体

出版社:《生活化学》杂志生命化学分子公司。9896

PI:Alexandr KucherakAlexandr Kucherak

发布时间:6/20/2014

生命化工。虚拟对接和相似性/药丛搜索。http://www.lifechemicals.com/


销售商:生命化学品-CNS图书馆

出版社:《生活化学》杂志生命化学分子公司。16535

PI:Alexandr KucherakAlexandr Kucherak

发布时间:6/20/2014

用文献中描述的CNS过滤器作为我们全部库存的筛子。因为它表明,只有具有这种参数的化合物才能对神经组织渗透性具有适当的特征。所有描述符都是从Sybyl的Spreadsheets和Volsurf模块中获得的。(MW 200=350 cLogP=< 3.6 H-键接受体=< 8 H-键供体=< 5 tPSA=< 120 可旋转键=< 5 LogBB1=-3.0~1.0) http://www.lifechemicals.com/。


供应商:生命化工-天然产品类库

出版社:《生活化学》杂志生命化学分子公司。7808

PI:Alexandr KucherakAlexandr Kucherak

发布时间:6/20/2014

第一种方法是基于描述符的统计分析。以前曾对一个庞大的NP数据库进行分析,通过树状排列来研究NP支架。因此,对超过13万个NP结构的性质分布进行了分析,并对特定类别的天然化合物的典型子结构进行了鉴定,生成了一组通常存在于天然化合物中的片段。该方法在CRC天然产物词典(DNP)和合成分子(SMs)上进行了测试。另一种方法是基于支架相似性评估。一个分子生成的原子签名(来自fragmnets)的数量等于构成该分子的原子数量。每一个原子签名都独立地代表了分子的一个结构特征/片段,并为它计算出一个单独的分数。为了重现这样的实验,我们在CDK-Taverna 2.0中使用了一个已实现的模块Chemistry Development Kit。它包含了一个NP-Likeness scorer v1.4.1,它可以计算分子的Natural Product(NP)-likeness,即分子与已知天然产物所覆盖的结构空间的相似度。所有结果都进行了评分,范围从-3到+3。http://www.lifechemicals.com/。


供应商:生命化学品公司-筛选系列

出版社:《生活化学》杂志生命化学分子公司。371998

PI:Alexandr KucherakAlexandr Kucherak

发布时间:6/20/2014

精心设计的、新颖的、类似药物的小分子,其Lipinski规则为5,偏离该参数集的唯一原因是独特的支架或非标准化学。它是准备应用药用化学过滤器,如PAIN或任何目标集中过滤器(溶解性,渗透性,BBB)。http://www.lifechemicals.com/。


销售商:生命化学品公司-溶解度有保证的碎片

出版社:《生活化学》杂志生命化学分子公司。8241

PI:Alexandr KucherakAlexandr Kucherak

发布时间:6/20/2014

通过对整个LC-stock的过滤,以修改后的"三原则"选择片段化合物。片段化合物已在分析实验室进行了溶解度测试。在200mM浓度的DMSO中保证溶解度,75%的片段可溶于1mM浓度的pH7.5缓冲液中。http://www.lifechemicals.com/。


肺结核:从文献看小鼠体内疗效

发布者TB体内数据2分子。 778

PI:Sean Ekins, PhD

发布时间:2014年10月4日

回望未来。预测小分子对结核杆菌的体内疗效。在疾病的动物模型中选择并将疾病的体外线索转化为具有体内活性的分子是一个需要花费大量时间和金钱的挑战。我们演示了使用由773个化合物组成的机器学习分类模型(贝叶斯、支持向量机和递归分区)从体内活性和非活性化合物中学习。贝叶斯模型预测了11种额外的体内活性物中的8种,这些活性物没有作为外部测试集包含在模型中。因此,对七十年Mtb数据的整理可以提供统计学上稳健的计算模型,将资源集中在体内活性小分子抗结核药上。这凸显了在其他疾病中进行体内测试的成本效益预测。PMID:24665947


TB:TB Mobile 2的数据

发布者TB手机2.0更新分子。 79

PI:Sean Ekins

发布时间:3/19/2014

从最近的论文中选取了79个化合物,其中有一个或多个靶点在TB中,添加到TB Mobile的第二版应用中。另外20个分子作为测试集。论文已提交。


寄生虫:曼氏血吸虫的MMV疟疾框屏。

发布者:CDIPDCDIPD Vault Molecules:400

发布时间:11/6/2013

用构成MMV疟疾盒的400种化合物对曼森吸虫体细胞(感染后幼虫)和成虫进行全机体筛选(http://www.mmv.org/malariabox)。只有那些产生最严重表型的疟疾盒"类药物"化合物与体细胞进行了对成人的测试。这些数据也被上传到ChEMBL。联系Conor Caffrey,寄生虫病发现和创新中心(www.cdipd.org/),加州大学旧金山分校([email protected])。


激酶。Kinase Catalytic Activity (Theonie Anastassiadis Publication in Nature Biotechnology)

发布者Kinase Catalytic Activity Molecules:178

PI:Theonie AnastassiadisTheonie Anastassiadis

发布时间:2013年8月30日

激酶催化活性

Nature Biotechnology 2011年10月30日;29(11): 1039-1045.测试的文库包括178种已知的抑制所有主要蛋白激酶亚家族的激酶的化合物,为了简单起见,所有化合物在10 µM ATP存在下以0.5 µM的浓度进行测试。尽管这些化合物对其主要靶标的平均IC50报告为66 nM,但仍选择了0.5 µM,以捕获较弱的脱靶抑制活性.每对激酶抑制剂都进行了一式两份的测试,结果以平均底物磷酸化占溶剂控制反应的百分比表示(以下称为"剩余激酶活性").每个激酶抑制剂对的平均剩余激酶活性被提出。激酶活性数据表示为与车辆(二甲基亚砜)反应相比,测试样品中剩余激酶活性的百分比。


结核病:更新有目标的药物和线索

发布者结核病:有靶点的药物和线索--更新分子。38

发表于:6/14/2013

从最近的结核病文献中发表的具有已知靶点的化合物,也将作为结核病移动应用程序的更新内容。

KINASE:GSK发布的激酶抑制剂集(PKIS)

发布者:Kinome2 Molecules:364

发布时间:6/6/2013

GSK发表的激酶抑制剂集(PKIS)是一套由367种蛋白激酶抑制剂组成的集子,该集子已经注释了蛋白激酶家族的活性,可供公众筛选工作使用。关于筛选集的详细信息可以在下面所示的链接中找到。ChEMBL数据库一直是该集生物分析数据的"首选"网站。本着改善对重要数据的访问的精神,我们已经收集了ChEMBL已经友好地提供的PKIS数据,并对其进行了处理,因此它可以在合作药物发现(CDD)网站上进行访问(就像我们以前对激酶SARfari数据库所做的那样)。

转移到CDD后,数据的获取方式更加"医学化学家"友好。我们还对数据集进行了一些整理。例如,实际上只有364个化合物(一些重复是由于盐的形式或同一分子的交替名称)。我们还尽可能地将目标名称标准化(例如,在UNC的数据集中,激酶IKKA、IKKB和IKKE被称为IKK-α、IKK-β、IKK-epsilon)。并不是说我们是完美的......我们也感谢任何对我们的数据集的修正!

综上所述,有364种化合物已经针对225个目标在0.1和1uM的测试。在这个数据集中,只有一个协议,但225个目标被列在一个读出。浓度也是一个读出,所以很容易将搜索限制在1和/或0.1uM运行的屏幕上。

链接:

1)更多关于GSK PKIS的信息。

http://www.maggichurchouseevents.co.uk/bmcs/Downloads/CBDD%20-%20Zuercher%20Bill.pdf

http://www.chordomafoundation.org/wp-content/uploads/2013/04/2013-Flanagan-Drewry.pdf

http://chembl.blogspot.co.uk/2013/05/pkis-data-in-chembl.html

2)之前关于CDD的ChEMBL激酶数据

//www.aslsw.com.cn/buzz/2013/04/04/kinome-sar-for-collaborative-drug-discoverers/

KINASE: ChEMBL激酶SARfari化合物和生物分析数据。


发布者:CDD金库CDD Vault Molecules:54211

PI:CDD

发布时间:3/27/2013

ChEMBL提供的一个宝贵资源是Kinase SARfari,"一个以激酶为重点的综合化学基因组学工作台。该系统整合并链接了激酶序列、结构、化合物和筛选数据"。这个数据库是一个非常有用的资源,它提供了大量的激酶活性化合物在广泛的检测中的SAR数据,其中大部分数据都是从文献中手工挖掘和整理出来的。为了在CDD界面中提供这些数据,我们将激酶SARfari的核心表与ChEMBL数据库中的另一个关键表合并,提供了一个字段,描述每个记录中使用的检测方法,比原生SARfari中的更详细。我们现在已经通过CDD接口提供了这个合并的数据集。详细的体外数据是可用的400个激酶。此外,在体内的功能,以及ADMET数据也被发布。


TB:ARRA

发布者:TB ARRA Molecules:1924

PI:Bob Reynolds

发布日期:2013年3月15日

SRI(Bob Reynolds)和Scott Franzblau小组提供的数据-Ekins等人提交的文件。

从以前的SRI筛选中的点击率被用来寻找供应商库中的类似化合物,在一系列公认的新药发现候选物筛选小组中进行聚类和体外测试。这些化合物还被用作之前生成的用生物活性和细胞毒性信息建立的贝叶斯模型的测试集。


TB:GSK

发布者TB GSK Molecules:177

PI:Sean Ekins, PhD

发布日期:2013年8月2日

补充数据来自Ballell等人2013年发表的ChemMedChem论文"fueling open-source drug discovery: 177 small-molecule leads against tuberculosis"。

原始数据集托管在//www.ebi.ac.uk/chemblntd,这里只显示了M.tb数据,但更多的卡介苗数据可在ChEMBL上获得。


TRYPANOSOME:恰加斯病文献化合物

发布单位:。查加斯公共数据分子。531

发布时间: 12/21/2012

在已发表的文献中,对531个在体外或体内进行过抗锥虫试验的分子进行了化合物结构和文献参考资料的整理。


非洲锥虫病。优化防治人类非洲锥虫病(HAT)的特定化学系列。

发布单位:。查加斯公共数据分子。5559

发布时间: 12/12/2012

SCYNEXIS Inc作为DNDi HAT铅优化联盟的成员,开发并筛选了4926种化合物的抗布氏杆菌活性。包括化合物结构和对布鲁氏锥虫的体外活性数据。34个化合物子集的细胞毒性数据和对相关真核寄生虫T.brucei rhodesiense、L.donavani和P.falciparum的活性。所有已报告的化合物系列都不再开发用于HAT,因为发现它们的选择性差或特性与体内活性不相容。http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1011-hat-001。


TRYPANOSOME。DNDi-非那莫尔系列治疗南美锥虫病的最佳化方案。

发布单位:。查加斯公共数据分子。743

发布时间: 12/9/2012

包括Epichem、Murdoch大学和CDCO在内的DNDi铅优化联盟开发并筛选了一个基于植物杀菌剂fenarimol的SAR系列。DNDi在ChEMBL-NTD中公开了该系列743个化合物的化合物结构、T.cruzi活性数据和L-6细胞毒性数据。在CDD公开中,化合物和生物测定数据都包含在这里。http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1012-chagas-001。


TRYPANOSOME。确定克鲁兹病毒复制抑制剂的广泛的原发性HTS。

发布单位:。查加斯公共数据分子。303230

发布时间: 12/6/2012

布罗德研究所在与宿主细胞--小鼠成纤维细胞NIH3T3共培养的稳定表达β-半乳糖苷酶报告的重组图拉胡恩菌株中,对303,224个化合物进行了高通量的重复筛选。在4,394个命中物中,有4,063个被进一步评估了抑制活性和宿主细胞毒性。最后,选出27个化合物作为潜在的探针化合物并进一步验证。一级筛选和后续二级检测的数据被存入PubChem。这里将PubChem中初筛和6个二次检测的化合物和生物检测数据收录到CDD公众号中,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21634083。


TB:Guzman等,M.tb.MurE连接酶抑制剂

发布者:CDD - Sean Ekins Molecules:CDD--肖恩-艾金斯分子公司:8

PI:Sean Ekins

发布时间: 12/6/2012

来自以下结核病出版物的全细胞和基于目标的筛选数据。Guzman JD, Gupta A, Evangelopoulos D, Basavannacharya C, Pabon LC, Plazas EA, Muñoz DR, Delgado WA, Cuca LE, Ribon W, Gibbons S, Bhakta S. J Antimicrob Chemother.2010年10月;65(10):2101-7.哥伦比亚植物天然产品的抗结核筛选。3-methoxynordomesticine,结核分枝杆菌MurE连接酶的抑制剂。


供应商:美国国立卫生研究院临床收集2阵列(281个分子)

发布单位:美国国立卫生研究院NIH Clinical Collections Molecules:281

PI:项目经理:Mei Steele

发布时间: 11/21/2012

NIH临床收藏2是电镀阵列281个小分子,这些小分子有在人类临床试验中使用的历史。该集合由美国国立卫生研究院(NIH)通过"分子图书馆路线图倡议"收集,作为其在生物医学研究中使用化合物筛选的使命的一部分。


销售商:美国国立卫生研究院临床收集阵列(446个分子)

发布单位:美国国立卫生研究院NIH Clinical Collections Molecules:446

PI:项目经理:Mei Steele

发布时间: 11/21/2012

NIH临床收藏是由446个小分子组成的镀层阵列,这些小分子有在人类临床试验中使用的历史。该收藏由美国国立卫生研究院(NIH)通过"分子图书馆路线图倡议"收集,作为其在生物医学研究中使用化合物筛选的使命的一部分。


肺结核:有目标的药物和线索--移动应用中使用的数据。

发布者SRI分子和靶点的手机应用Molecules:707

发布时间: 10/23/2012

更新的结核病目标数据策划,具有体内本质性。

来自TBDB、Biocyc、Metacyc、PDB和Pubmed的信息,以及。

Malabika Sarker在斯坦福研究所的其他参考资料。

约翰-霍普金斯大学的Gyanu Lamichhane提供了基本的

information.ref.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22477069

在手机上探索这个数据集://itunes.apple.com/app/tb-mobile/id567461644


毒物:按肝毒性分类的药物和化学品。

发布者:CDD金库CDD Vault Molecules:83072

PI:CDD

发布时间: 7/16/2012

辉瑞公司(Hu,2008年)先前已根据肝毒性的临床数据收集了一份具有分类方案的药物和化学品清单,以评估体外人类肝细胞成像检测技术(HIAT),结果与临床肝毒性的一致性达到75%。这个相同的化合物数据集,不管是否引起药物诱导的肝损伤(DILI),都已经和分子描述符一起,通过贝叶斯模型进行了硅片预测。


结核病:具有抗结核病全细胞活性的SRI分子。

发布者SRI集团金库分子。 23

PI:Sean Ekins, PhD

发布时间: 4/24/2012

Molecules evaluated in Pharm Res.2012 Apr 4.PMID: 22477069

结合化学信息学方法和路径分析来识别具有抗结核分枝杆菌全细胞活性的分子。

Sarker M,Talcott C,Madrid P,Chopra S,Bunin BA,Lamichhane G,Freundlich JS,Ekins S。


MALARIA:MMV疟疾箱

发布者:公开发表。疟疾箱分子。400

发布时间: 3/29/2012

Molecules from MMV Malaria Box, ChEMBL-NTD (//www.ebi.ac.uk/chemblntd) : MMV Malaria Box, Simon Macdonald, Paul Willis, Paul Kowalczyk, Thomas Spangenberg, Jeremy Burrows and Tim Wells.Medicines for Malaria Venture (MMV), PO Box 1826, 20, rte de Pré-Bois, 1215 Geneva 15, Switzerland and SCYNEXIS Inc.P.O. Box 12878 Research Triangle Park, North Carolina 27709-2878 USA。

疟疾箱中的所有化合物均已针对3D7(对氯喹(CQ)敏感但对磺胺多辛耐药的恶性疟原虫菌株)进行体外筛选,并对人类胚胎肾细胞系(HEK-293)进行了细胞毒性测定。恶性疟原虫的数据以EC50表示,单位为nM。


ADME.com - 高质量ADME数据的商业存储库ADMEdata.com - 高质量ADME数据的商业存储库。

发布者:G2 Research ADMEdataG2研究ADMEdata.com分子。1760

PI:George Grass

发布时间: 1/13/2012

例子。Caco-2渗透性、5pH值下的平衡溶解度、人类蛋白质结合率、大鼠蛋白质结合率、兔肠道渗透率、人类血浆分割和血细胞比容。如需了解完整的数据集和模型,请直接联系George Glass, Pharm.D. Ph.D. [email protected] (通过CDD分发) 。


供货商:Porse积木系列

发布者:CDD金库CDD Vault Molecules:29241

PI:CDD

发布时间: 1/13/2012

波仕档化工公司致力于为药物研发定制新型化合物合成,产品种类丰富,价格有竞争力,质量好。目前,该套产品精选了Morpholine、Piperidine、Piperazine、Pyrimidine、氨基酸和原料药家族的1554个多样化新化合物和构件子集。www.porsefinechemical.com,[email protected] +86-20-28069055。


寄生虫:曼氏血吸虫。微源光谱和杀手收集

出版者:Brian Suzuki布莱恩・铃木的沙盒分子。119

发布时间: 10/5/2011


曼氏血吸虫。微源谱和杀手收集的表型筛选。

PI:Conor R. CaffreyConor R. Caffrey

发布时间: 10/5/2011

CDD:公共数据 119次点击

作为加州大学旧金山分校桑德勒药物发现中心确定新型抗寄生虫药的药物再利用(re-positioning)策略的一部分,我们开发了一个部分自动化的全生物体(表型)筛选,以筛选导致传染性热带疾病血吸虫病的血流虫。我们筛选了上述集合的1260个化合物,其中包括药物、类药物化合物、天然产物和杂项化合物。我们报告了曼氏血吸虫幼虫阶段(血吸虫)的表型改变,使用简单的描述符来表达寄生虫对复合侮辱的多重和动态反应。对表型反应的全面量化正在进行中。所提供的数据仅与"命中"化合物有关;可从Microsource Discovery Systems Inc.获得各集合中化合物的完整清单。联系 [email protected] 了解更多详情。血吸虫病的药物发现:通过中通量表型筛选在已知药物库中发现的命中化合物和主导化合物。Abdulla MH, Ruelas DS, Wolff B, Snedecor J, Lim KC, Xu F, Renslo AR, Williams J, McKerrow JH, Caffrey CR.PLoS Negl Trop Dis.2009年7月14日;3(7):e478.PMID: 19597541


肺结核:SRI激酶库表型筛选

发布者:CDD金库CDD Vault Molecules:23823

PI:CDD

发布日期:2011年8月29日

激酶靶点在各种疾病中的应用,除此之外,还包括

癌症,包括免疫和代谢以及病毒、寄生虫。

真菌和细菌。特别是最近有一个比较

杆菌中的激酶和ATP结合靶点的兴趣。

以确定抑制剂和潜在的药物,以治疗结核病。

目前的药物方案没有针对的重要蛋白质。

在此,我们报告了一个针对性的高通量筛选结果。

的约26,000个化合物的库,该库是根据当前的激酶抑制剂支架和已知的激酶结合位点设计的。这里提出的表型数据可以构成选择支架/化合物的基础,以便根据体外对整个细菌的明显活性,对结核分枝杆菌中的特定激酶或其他ATP结合靶点进行进一步的酶学筛选.PMID: 21708485。

结核病(爱丁堡)。2011 Jun 25.[Epub ahead of print]

Copyright © 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.保留所有权利。

详情请联系Melinda Sosa。[email protected]

基于激酶抑制剂的高通量筛选文库。

对结核杆菌H37Rv的支架。

Reynolds RC, Ananthan S, Faaleolea E, Hobrath JV, Kwong CD, Maddox C, Rasmussen L, Sosa MI, Thammasuvimol E, White EL, Zhang W, Secrist JA 3rd.

资料来源:南方研究所,南第九大道2000号。资料来源:南方研究所,南第九大道2000号。

美国阿拉巴马州伯明翰市35205。


FDA批准。国家药典委员会药典(NPC)V1.1.0。

发布者NCGC医药集合NPC V1.1.0分子。14579

PI:Noel Southall

发布日期:2011年8月8日

国家基因组委员会药物集。临床批准药物的综合资源,以实现再利用和化学基因组学。Huang, R., Southall, N., Wang, Y., Yasgar, A., Shinn, P., Jadhav, A., Nguyen, D., Austin, C. Sci Transl Med 27 April 2011:Vol. 3, Issue 80, p. 80ps16.

http://stm.sciencemag.org/content/3/80/80ps16.abstract


供应商:BioBlocks目录与定价信息

发布者:BioBlocks Molecules:2971

PI:Doug Murphy

发布时间:2011年3月8日

2989种化合物。

BioBlocks提供超过2200种支架、构件和片段的集中收集,这些构件已被预先认证为药物成分。这些化合物大多由BioBlocks独家提供,其应用范围从药物发现的中间体到多肽化学中的代用氨基酸。

有关BioBlocks积木的最新详情,请访问www.bioblocks.com。


毒物:药物引起的肝损伤数据 (DILI)

发布者BBB分子公司:519

发布时间: 4/29/2011

药物诱导的肝损伤数据--训练集为徐墉的实验数据,测试集代表文献数据。

发表于《药物代谢处置》。2010年12月;38(12):2302-8。2010年9月15日发表。A predictive ligand-based Bayesian model for human drug-induced liver injury.

Ekins S, Williams AJ, Xu JJ.

TB:体内基本基因的目标数据库。


发布者:SRI结核病目标数据库分子。314

PI:Sean Ekins

发布日期:2011年4月21日

TB靶点的数据策划与体内本质性信息来自TBDB、Biocyc、Metacyc、PDB和Pubmed以及斯坦福研究所Malabika Sarker博士整理的其他参考文献。Johns Hopkins大学的Gyanu Lamichhane博士提供了本质性信息,特此致谢。

**请注意,本数据集没有与小分子相关的数据**。


供應商:Enamine 代表性多元化篩選庫

出版社:Enamine Molecules:200000

PI:Dmytro MykytenkoDmytro Mykytenko

发布日期:2011年12月4日

特别为合作药物生成了原始的20万种筛选库。

从世界上最大的市售筛选化合物库存中发现用户。

超过170万种)。该文库的特点是具有精制ADME的独家类药化合物。

的特性。我们的高品质化合物可以挑选,并立即供应给您。

不同的格式。


再利用,FDA批准。使用HTS方法重新使用的药物

发布单位:体外再利用分子。 109

发布日期:2011年3月18日

使用HTS方法确定的新用途药物。该表极大地扩展了以前发表的版本"Ekins S,Williams AJ,Krasowski MD,Freundlich JS.In silico repositioning approved drugs for rare and neglected diseases Drug Discov Today"。罕见和被忽视疾病的批准药物的硅科重新定位 Drug Discov Today.2011年3月1日。PMID: 21376136 doi:10.1016/j.drudis.2011.02.016 该表列出了分子、旧用途/靶点、新用途/靶点、如何发现和参考文献。

缩写词:CCR5,化学因子受体5;DHFR,二氢叶酸还原酶。CCR5,化学因子受体5;DHFR,二氢叶酸还原酶;DOA,滥用药物,FDA,食品和药物管理局;GLT1,谷氨酸转运体1;HSP-90,热休克蛋白90;JHCCL,约翰-霍普金斯临床化合物库;Mtb,结核杆菌;NK-1,神经激肽- 1受体;OCTN2。


重置,FDA批准。指定为孤儿的产品

发布者罕见病再利用分子。 76

发布日期:2011年3月18日

FDA 表 2 - 来自 FDA 资源,即罕见病研究数据库 (RDRD),其中列出了"孤儿"指定产品 (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm),至少有一个罕见病适应症的上市批准。Ekins和Williams对该数据进行了分析(提交的论文)。


重置,FDA批准。指定为孤儿的产品

发布者罕见病再利用分子。 105

发布日期:2011年3月18日

FDA表1--来自FDA资源--罕见病研究数据库(RDRD),其中列出了"孤儿"指定产品(http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm),至少有一个常见疾病适应症的上市批准。

FDA没有将这些数据与分子结构联系起来。


发售商:科罗拉多州药物发现试点图书馆中心

发布者C2D2 Public Molecules:2240

PI:Greg Miknis,副主任Greg Miknis,副主任

发布日期:2011年7月3日

该库包含结构多样的小分子,符合药物标准。有几种化学类型,该库的设计是为了适用于各种潜在的目标。

如欲索取有关收藏品的资料,请发送请求至 [email protected]


LIPID:脂质图结构数据库

发布者:脂质地图数据库分子。22215

PI:脂质组学网关

发布日期:2011年11月2日

脂质地图(http://www.lipidmaps.org/)结构用5种常见离子(H+,2H++,K+,Na+,NH4+)进行注释,包括哺乳动物脂肪酰、甘油脂、甘油磷脂、鞘脂、甾醇脂和前醇脂。其结构和离子可通过结构和MW进行检索,便于鉴定新型脂类。


结核病:分枝杆菌药物组。

发布者:虚拟代谢物分子。 274

发布时间: 11/5/2010

来自Kinnings等人发表的274种药物(在美国和欧洲被批准用于人类使用)的数据集,PLoS计算生物学第6卷:e1000976(2010)。

在PDB中至少有一种结构的药物共同结晶.这个数据集可以与CDD中的其他结核病筛选数据集一起使用,以确定这些已批准的药物中哪些对Mtb有活性(来自文献。

TB:从文献看非复制性Mtb的抑制剂


发布者:CDD - Sean Ekins Molecules:CDD--肖恩-伊金斯分子公司。26

PI:Sean Ekins

发布时间: 10/28/2010

已发表论文的结构和数据。

Darby and Nathan J Antimicrob Chemother 2010:65: 1424-1427

Bryk等人,Cell Host and Microbe 2008:3: 137-145

Lin等,Arch Biochem Biophys.2010 501: 214-220。

Lin等人,J Biol Chem 2008: 283: 34423-34431。

de Cavalho等人:J Med Chem 2009:52: 5789-5792

Lin等人,《自然》2009。461: 621-626


厂商:Astatech, Inc.积木系列

发布者:Astatech, Inc:Astatech, Inc. Molecules:6140

发布时间: 10/15/2010

AstaTech, Inc.提供先进和新颖的中间体,以促进药物发现过程。我们的产品种类繁多,包括构件、新型胺、受保护胺、非天然氨基酸、酮、醛、杂环、异酸酐、硼英酸和手性中间体。请联系 [email protected] 了解订购信息。


供应商:Chemik 2010目录

发布者:CDD金库CDD Vault Molecules:3889

PI:CDD

发布时间: 10/5/2010

Chemik已成功地协助惠氏等药物研发公司开展早期项目。我们为他们提供从克级到多吨级的原料和关键中间体。凭借在该领域10年的经验,我们能以有竞争力的价格、优质的产品和持续的服务,帮助客户在4-6周内开发出新的中间体。


马拉里亚:菲和蒽的氨基酒精

发布者:CDD金库CDD Vault Molecules:35

PI:CDD

发布时间: 9/21/2010

卤素取代的蒽类和苯并芘N-二和单烷基取代的氨基醇盐酸盐对小鼠的抗疟数据。27种化合物显示出活性(平均存活时间增加>6天);8种化合物是治愈性的(IMST>60天)。表中包括PubMed IDs的细节和合成。


肺结核:卡介苗/卡介苗活动

发布者诺华公司:结核病数据分子公司。283

PI:Srinivasa RaoSrinivasa Rao

发布时间: 9/15/2010

好氧卡介苗活性(MIC50)-274种化合物

需氧MTB活性(MIC50)-283种化合物。

厌氧卡介苗ATP活性(IC50) - 283种化合物。

厌氧MTB ATP活性(IC50)-283种化合物。

细胞毒性(CC50)--223种化合物关键词。结核分枝杆菌,结核分枝杆菌,TB


马拉西亚:JHU JHCCL 恶性疟原虫抑制剂

出版者:约翰-霍普金斯大学-沙利文(2008)。Johns Hopkins - Sullivan (2008) Molecules:2693

发表于: 6/4/2010

10微摩尔时对2663种核定药物的抑制百分比

结核病、疟疾:GSK疟疾的贝叶斯预测命中了


发布者:GSK数据贝叶斯模型GSK数据贝叶斯模型(Ekins,等)分子。13355

PI:Sean Ekins

发布时间: 5/28/2010

使用贝叶斯模型对GSK疟疾命中率进行预测(由Gamo等人发表,《自然》465:305-310(2010年))(由Ekins等人发表,《Mol BioSyst》6:840-851(2010年))。

活性的截止点(22万模型>0.31,2200模型>-1.37在整个细胞屏幕上被归为活性物)。

马拉西亚:圣裘德儿童研究医院全细胞疟疾数据集。


发布者:圣犹达--疟疾/曲霉菌生物活性分子St.Jude - Malaria/Trypanosome Bioactives Molecules:1524

PI:Kip Guy

发布时间: 5/26/2010

圣裘德CRH发表的《自然》文章的补充数据(Guiguemde,W,等人,恶性疟原虫的化学遗传学。Nature 465,311-315(2010年5月20日)),包括1524个结构在初级筛选中测试,8个协议中的补充数据。Bland-Altman分析、计算出的ADMET特性、系统化学遗传学筛选、灵敏度、协同作用和酶分析以及热熔分析。


马拉西亚:诺华公司GNF-Pf数据集

发布者:诺华公司诺华疟疾分子公司。5695

发布日期:5/21/2010

从MR4中获得的恶性疟原虫菌株3d7(药物敏感)和W2(氯喹、奎宁、嘧菌胺、环瓜尼和磺胺多辛耐药),在基于红细胞的感染试验中测试了对选定化合物抑制增殖的敏感性。


销售商:ASINEX新型抗疟疾筛查试剂盒

出版社:ASINEX Molecules:1

PI:Mark Parisi

发布时间: 5/20/2010

机密数据集:594种来自ASINEX的新型化合物。请看附件,其中详细说明了ASINEX的设计。

访问。新的CDD用户--您的注册将通过一个审批程序,然后才会被允许访问数据集。现有的CDD用户--请联系:[email protected]


销售商:ASINEX Tres Cantos (GSK) 抗疟药物子集。

出版社:ASINEX Molecules:278

PI:Mark Parisi

发布时间: 5/20/2010

278 ASINEX活性抗疟数据与GSK数据匹配。

可供即时筛选。相应的数据集是ASINEX专有的,并由ASINEX所有。更多信息,请联系Mark Parisi:电子邮件:[email protected]

电话:1-877-ASINEX11-877-ASINEX1

传真:1-336-721-1618


马拉西亚:三套抗疟药具(TCAMS)。

发布者:GSKGSK抗疟数据分子公司。13471

PI:Javier GamoJavier Gamo

发布日期: 5/19/2010

对葛兰素史克公司筛选库中约200万个化合物进行筛选,确定了13500多个恶性疟原虫在人红细胞中增殖的抑制剂。该工作在葛兰素史克公司Tres Cantos医药开发园区进行,地址为Severa Ochoa 2,28760 Tres Cantos,西班牙。

结核病:Sacchettini等人审查----额外的抗结核病剂。

发布者:PK Molecules:18

发布时间:2010年5月2日

图1中的非批准抗结核病剂,载于Sacchettini J.C.、Rubin E.J.和Freundlich J.S.Drugs versus bugs: in pursuit of the persistent predator Mycobacterium tuberculosis, Nature Reviews Microbiology, 6, 41-52, (2008)。


TB:结核病小分子专利数据。

发布者TB专利数据分子公司。20775

PI:协作药物发现

发布时间: 1/27/2010

美国专利商标局、欧洲专利局和世界知识产权组织提供的有关结核病研究的结构和专利信息。


结核病:Makarov等人,NM4TB联营体。

发布者:CDD - Sean Ekins Molecules:CDD-肖恩-艾金斯分子公司:32

PI:Sean Ekins

发布时间: 1/21/2010

1,3-苯并噻嗪-4-酮(BTZ)的结构活性关系数据。数据来源于Makarov等人2009年和NM4TB联盟的同事在《科学》杂志上发表的论文"Benzothiazinones Kill Mycobacterium tuberculosis by Blocking Arabinan Synthesis"(PMID:19299584)。


供应商:TimTec多元化套装

发布者:TimTec MoleculesTimTec Molecules:9998

PI:供应商

发布时间: 1/5/2010

筛选10,000种不同的药物类化合物的库。


供應商:TimTec OGT-Inhibitors Analogs SET.

发布者:TimTec MoleculesTimTec Molecules:334

PI:供应商

发布时间: 1/5/2010

O-GlcNAc转移酶抑制剂类似物SET


供应商:TimTec ActiTarg-K, 激酶调节剂

发布者:TimTec MoleculesTimTec Molecules:6212

PI:供应商

发布时间: 1/5/2010

ActiTarg-K,拥有超过6000个化合物,提供了一个高价值的药物类分子筛选库,用于确定新的蛋白激酶抑制剂的合成方向。

供應商:TimTec天然產品衍生品圖書館

发布者:TimTec MoleculesTimTec Molecules:3001

PI:供应商

发布时间: 1/5/2010

来自TimTec的NDL-3000天然衍生物。


销售商:TimTec天然产品库

发布者:TimTec MoleculesTimTec Molecules:479

PI:供应商

发布时间: 1/5/2010

TimTec的NPL纯天然产品


卖家:放映图书馆

发布者:AsisChem MoleculesAsisChem Molecules:43121

发表于: 10/26/2009

超过40,000种药物类小分子化合物的集合,可供您定制选择。所有化合物的库存量都在25毫克以下。


卖方:积木公司

发布者:AsisChem MoleculesAsisChem Molecules:176

发表于: 10/26/2009

收集了对药物发现有用的化合物。所有化合物如果没有库存,可在几周内提供,数量不超过10克。


TB:TAACF - NIAID CB2图书馆

发布者:南方研究院南方研究院分子所。102634

PI:Robert Goldman

发布日期:2009年9月30日

筛选商业(ChemBridge)化合物库抑制M.结核病菌株H37Rv生长能力的结果。见PMID:19758845


TB:EthR抑制剂(Willand等人)。

发布者:CDD - Sean Ekins Molecules:CDD--肖恩-艾金斯分子公司。5

PI:Sean Ekins

发表于:9/28/2009

转录抑制器EthR的药物样抑制剂。分子和数据来自Willand等人Nature Medicine 15: 537-544(2009) PMID: 19412174。


VENDOR、ADME:一组结构多样的商业药物的基准数据。

发布者:NM4TB:Karlen Group Site MoleculesNM4TB:Karlen Group Site Molecules:24

PI:Anders Karlen

发布日期:2009年11月6日

对瑞典市场上的药物进行的多变量分析是选择一套小规模、物理化学多样化的24种药物化合物的基础。在选择过程中,考虑了结构多样性、商业可用性、价格和合适的定量分析技术等因素。编制的数据集测量了亲脂性、pKa、溶解度和跨人Caco-2细胞单层的渗透性。我们预计,这个数据集可以作为一个基准集,用于验证新的实验技术或在硅模型。它也可以作为一个多样化的起始数据集,用于开发新的计算模型。

数据来自:

介绍一个结构多样、可供商业使用的药物数据集,用于相关性和基准研究。

Sköld C, Winiwarter S, Wernevik J, Bergström F, Engström L, Allen R, Box K, Comer J, Mole J, Hallberg A, Lennernäs H, Lundstedt T, Ungell AL, Karlén A.

J Med Chem.2006 Nov 16;49(23):6660-71.


TB:已发表文献的吸收数据

发布者CDD:结核病策划文献分子。24

发表于:5/28/2009

TB吸收数据来自参考文章

抑制5'-O-[N-(水杨基)磺胺酰]腺苷的2-三唑取代的类似物的侧枝体生物合成:对结核杆菌有效的抗菌核苷。

Gupte, A.; Boshoff, H. I.; Wilson, D. J.; Neres, J.; Labello, N. P.; Somu, R. V.; Xing, C.; Barry, C. E.; Aldrich, C. C..

J Med Chem (2008) Vol 51, No 23, pp 7495-7507渗透性数据。


肺结核:已发表文献中的药代动力学数据

发布者CDD:结核病策划文献分子。28

发表于:5/28/2009

来自已发表文献来源的结核病药代动力学数据。28种独特和常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引用、目标、测试的细胞和生物体、生物利用率、Vm、Vd、Cmax等。


肺结核:已发表的文献中的毒性数据

发布者CDD:结核病策划文献分子。638

发表于:5/28/2009

来自已发表文献的结核病毒性数据。来自PubMed参考文献的638种独特和常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引用、靶点、细胞和生物体睾丸、细胞活力、LD50、CC50、MNTD等。


结核病:发表的文献中的疗效数据

发布者CDD:结核病策划文献分子。6768

发表于:5/28/2009

来自已发表文献来源的结核病疗效数据。从300多篇PubMed参考文献中获得的6771种独特和常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引用、靶点、细胞和生物体睾丸、MIC、抑制率、EC50-EC100、IC50等。


TB:MLSMR

发布者:南方研究院南方研究院分子所。214507

PI:Robert Goldman

发布日期: 5/8/2009

分子图书馆小分子库(MLSMR)收集的200,000多种化合物于2008年春季提供给南方研究分子图书馆筛选中心,用于针对Mtb H37Rv的初级测试。从这次初级筛选中选出了最有活性的化合物,并以10个浓度对H37Rv进行了剂量反应试验和使用vero细胞的细胞毒性反筛选。


马拉里亚:约翰-霍普金斯大学临床化合物图书馆。

出版者:约翰-霍普金斯大学-沙利文(2008)。Johns Hopkins - Sullivan (2008) Molecules:1878

发表于:4/28/2009

药物以10μM的浓度进行筛选。将对氯喹敏感的3D7或对多药耐药的Dd2的同步环期寄生虫在RPMI 1640培养基中培养,并在药物和[3H]-黄嘌呤存在下培养48或96小时。96孔板,在寄生虫血症0.2%、血细胞比容2-4%的条件下,每孔取0.2 mL培养物,48 h时放射性加入信号约为10 000 cpm,96 h时约为20 000 cpm,背景计数小于500 cpm。筛选实验一式两份,抑制百分数为两次实验的平均值。


TB:文献审查

发布单位:。 TB文献数据分子。 49

PI。 Ballel, et al.

发表于:4/17/2009

结核病SAR数据,汇编于一项针对M. tuberculosis的活性药物调查,包括那些已知和未知作用模式的药物(Ballel等人,"New Small-Molecule Synthetic Antimycobacterials",载于Antimicrobial agents and chemotherapy,2005年6月)。4/17更新,加入了TubercuList/TBDB/其他目标链接和改进的参考文献。


TB:Sacchettini等人,审查。

发布者:CDD - Sean Ekins Molecules:CDD--肖恩-伊金斯分子公司。14

PI:Sean Ekins

发表于:2/18/2009

表1和表2中的一线和二线抗结核剂,载于Sacchettini J.C.、Rubin E.J.和Freundlich J.S.Drugs versus bugs: in pursuit of the persistent predator Mycobacterium tuberculosis, Nature Reviews Microbiology, 6, 41-52, (2008)。


供应商:IUPUI - 分布式药物发现(D3)公共数据

发布者:IUPUI - D3 Enum 73K N-酰基AA-OH,-OMe,-NH2分子。48818

PI: M. J. ODonnell和W. L. ScottM.J.O'Donnell和W.L.Scott。

发布日期:2009年1月1日

酰化非天然氨基酸及其甲基酯的开放存取虚拟目录。我们鼓励我们的同事就对分布式药物发现项目和合成方法的兴趣与我们进行交流,这在《组合化学杂志》(正在出版)的三篇系列论文中有所描述。


销售商:ASINEX Building Blocks公司

出版社:ASINEX Molecules:6745

PI:Mark Parisi

发布时间:12/23/2008

如果您正在考虑一个潜在的优化计划,我们的Building Blocks可能证明正是您正在寻找的药物。


寄生虫:气味

发布者:CDD - Sean Ekins Molecules:CDD-肖恩-艾金斯分子公司:228

PI:Sean Ekins

发布时间:12/21/2008

气味的分子和结构名称数据来自Roman Kaiser所著的"全世界有意义的气味"一书,由Wiley-VCH于2006年出版。分子编号与书中的编号有关。


TOX: toxcast

发布者:CDD - Sean Ekins Molecules:CDD-肖恩-艾金斯分子公司:306

PI:Sean Ekins

发布时间:12/18/2008

环保局的化合物毒物库(大部分是农药),可在以下网站查阅:http://www.epa.gov/ncct/dsstox/DataFiles.html。

http://www.epa.gov/ncct/toxcast/


美国食品和药物管理局批准,毒性:最大建议日剂量。

发布者:CDD - Sean Ekins Molecules:CDD-肖恩-艾金斯分子公司:1215

PI:Sean Ekins

发布时间: 12/10/2008

美国食品和药物管理局的数据库,包含1200多种药品的最大推荐日剂量值。该数据集代表了以下出版物中使用的一些分子 Matthews, E.J., et al., Current Drug Discovery Technologies, 1(1): 61-76.(2004)


卖方:阿育吠陀传统与当前的保健和健康需求的对比分析

发布者:Falguni DasguptaFalguni Dasgupta:个人资料汇编分子。37

PI:Falguni DasguptaFalguni Dasgupta

发布时间:10/30/2008

印度药用植物及其提取物的传统使用与现代观点进行了讨论,目的是寻找共同点,重新评估索赔,并在符合法规要求的医疗保健和健康领域创造机会,以及寻找新药"线索"。


寄生虫:Sandler-UCSF Celera半胱氨酸蛋白酶抑制剂库。

出版商:麦克罗集团McKerrow Group Molecules:1860

PI:Jim McKerrow

发布时间:10/23/2008

体外T.cruzi和T.brucei寄生虫和特异性酶筛选。


FDA批准的。已批准的药物

发布者:约翰-霍普金斯临床化合物库约翰-霍普金斯临床化合物库分子。2815

PI:David Sullivan

发布时间: 10/16/2008

FDA批准了具有明确分子结构的药物,包括来自《医生案头参考》的763个分子,来自DrugBank的780个分子,2007年橙皮书的1151个分子,以及Chris Lipinski博士的FDA名单中的1007个分子。


厂商:亚信GPCR聚焦库

出版社:ASINEX Molecules:3502

PI:Mark Parisi

发布时间:10/2/2008

高质量的、特别是以药物为导向的GPCR集,以优惠的价格提供给CDD社区。该库结合了我们的药物化学专业知识和我们从文献中识别特殊片段的能力,并以前所未有的方式将它们组合起来。


GPCR。 PDSP Ki数据库

发布者:PDSP基数据库PDSP基数据库分子。20026

PI:Bryan Roth

发布时间:9/16/2008

来自NIMH精神活性药物筛选计划(PDSP)数据库的699个GPCR目标的47,000多个Ki值。


厂商:ASINEX Synergy Libraries公司。

出版社:ASINEX Molecules:25008

PI:Mark Parisi

发布时间:4/26/2008

ASINEX开发了一个新的高多样性库,富含药物类药体片段。该库的设计基于两种形式的协同作用。第一种是多样性和定向技术之间的相互关系,第二种是涉及多步骤关键中间体(6-9个步骤)的融合,以创造复杂的化合物。详见下面的PDF文件。


TOX: 已知毒性曲线的结构的公开数据

发布者:已知毒性简介分子结构:135

PI:Sean Ekins, PhD

发布时间:3/28/2008

已知化合物的特定组织毒性简介,并附有参考资料。


滥竽充数的抑制剂。Shoichet发表的杂交抑制剂

发布者:ShoichetShoichet发表杂交抑制剂分子。111

PI:Brian Shoichet

发布时间:3/26/2008

有机分子在水溶液中的自我结合而产生"假阳性"的聚集物。


TOX:加州大学戴维斯分校 - Hammock的公共数据。

发布者:UC Davis加州大学戴维斯分校--Hammock分子公司。714

PI:Bruce Hammock

发布时间:3/17/2008

可溶性环氧水解酶(sEH)抑制剂--这些酶有3个主要功能:解毒、分解和调节信号分子。


MALARIA, TRYPANOSOME:St. Jude公共数据

发布者:圣犹达--疟疾/曲霉菌生物活性分子St.Jude - Malaria/Trypanosome Bioactives Molecules:2426

PI:Kip Guy

发布时间:3/5/2008

圣裘德儿童研究医院Kip Guy实验室的公开访问结果,包括针对疟疾和布鲁氏菌的生物活性HTS。


MALARIA:德雷塞尔公共数据

发布者:德雷塞尔大学德雷克塞尔大学分子。195

PI:Jean-Claude BradleyJean-Claude Bradley

发布时间:3/2/2008

两者之间正在进行的开放数据合作的结果

Drexel(Ugi-4CC产品)和UCSF(抗疟筛查)。这个数据集代表了研究人员如何选择公开发布选定结果的一个例子。相比之下,默认情况下,所有组都是私人的)。


马拉里亚:美国陆军调查部。

发布单位:美军疟疾文献调查美军疟疾文献调查分子。12318

 

发布时间:2/29/2008

广泛收集抗疟药物动物SAR数据,包括化学结构、生物活性数据、药理数据和毒性数据(美军最初于1946年出版的《疟疾药物调查》)。


MALARIA:PlasmoDB

发布者:UPenn - Malaria Literature Data MoleculesUPenn - Malaria Literature Data Molecules:120

PI:David Roos

发布日期:2/19/2008

疟疾抑制剂的PlasmoDB,包括化学结构、PlasmoDB基因标识符、靶基因名称以及对恶性疟原虫、恶性疟原虫、伯格海伊、恶性疟原虫、查巴迪、恶性疟原虫的参考文献。


马拉里亚:天然产品(NPPDB)。

发布单位:国家天然产物研究中心国家天然产物研究中心分子。426

PI:Babu Tekwani

发布日期:2/15/2008

黄酮天然产品抗疟数据库,包括抗疟和细胞毒性数据(密西西比大学,国家天然产品研究中心)。


TB:TAACF检测结果

发布者TB早期药物发现计划分子。812

PI:Bernard Munos

发布时间:2/12/2008

一个公开的812种化合物库在Alamar Blue全细胞试验中对结核分枝杆菌(H37Rv)的抗菌活性。


FDA批准的。孤儿药

发布者:已知药物分子。 1721

PI:Christopher Lipinski

发布日期:10/26/2007

美国食品和药物管理局批准的药品,有指定的适应症、赞助商名称和化学结构(如有)。