NIMH精神药物筛选程序和合作药物发现为整个药物发现社区提供了化学可搜索的GPCR结构-活性关系数据库

2008年10月15日

与NIMH合作的协作药物发现公司(CDD) 精神药物筛查计划 北卡罗来纳大学教堂山分校的Bryan L. Roth博士领导的PDSP(PDSP)今天宣布,基于CDD的基于Web的软件现在拥有最大的开放式化学子结构和相似性可搜索的G蛋白偶联受体(GPCR) Ki数据库。现在可以在CDD Web 2.0协作研究信息系统中以结构搜索数据库的形式获得699个受体目标的47,312个抑制剂平衡解离常数(Ki值)的PDSP Ki数据库。

PDSP Ki数据库是公共领域中的唯一资源,可提供有关药物与越来越多的分子靶标相互作用的能力的信息。 Ki数据库用作已发布的和内部衍生的Ki值(或亲和力)的数据仓库,该值是越来越多的G蛋白偶联受体,离子通道,转运蛋白和酶的大量药物和候选药物的值。

“由北卡罗来纳大学医学中心托管的PDSP Ki数据库网站在去年获得了约100万次点击,”PDSP项目总监兼药理学教授Bryan Roth博士说。现在可以在CDD系统中通过化学结构搜索获得此数据,以供所有人查看。罗斯博士补充说,“CDD数据库是一个非常优雅的平台。我强烈建议任何生成药物发现数据的人使用它。”

“很荣幸与Bryan Roth博士一起通过CDD平台提供对PDSP Ki数据的开放访问,”合作药物发现公司总裁Barry Bunin博士说。“CDD以传统结构提供PDSP Ki数据/SAR 可挖掘的数据库,结合了新颖的安全,协作的公共和私有数据集成功能。约有40%的小分子药物可作用于GPCR靶标,这将有助于研究团体开发新药,并更好地预测与靶标相关的潜在药物副作用以及可能的药物-药物干扰。”

PDSP Ki数据库将CDD系统中的其他12个公共可用数据源与40,000多种化合物的化学和生物学数据结合在一起,包括:

  • 1,700种FDA批准的带有适应症和申办者的药物
  • 来自5个公共数据源的超过15,000种化合物具有疟疾检测数据
  • 超过850种具有结核菌抗菌活性信息的化合物
  • 大约3500种天然产物和衍生物的数据集
  • 可购买25,000多种化合物

关于NIMH精神药物筛查计划

NIMH精神药物筛查计划(PDSP)– http://pdsp.med.unc.edu –提供了对新型精神活性化合物的筛选,这些化合物具有作为国家心理健康研究所(NIMH)承包商的克隆人或啮齿动物CNS受体,通道和转运蛋白的药理和功能活性。使用大量用于CNS受体,通道和转运蛋白的克隆人或啮齿动物cDNA的测定法以及用于确定对第二信使系统,通道活性和转运蛋白功能的作用的功能测定法,免费向合格的学术研究人员提供化合物的筛选。 Ki值将被计算并注册到PDSP数据库中。合格的研究人员也可以免费获得克隆的受体。有关当前受体/转运蛋白的列表,请访问 http://pdsp.med.unc.edu/pdspw/clones.php.

欲了解更多信息,请联系

巴里·布宁博士
总统& CEO
协作药物发现(CDD)
Gilbreth Road 1818号套房220
伯林格姆,加利福尼亚94010
电话:650-204-3084
[电子邮件 protected]

Bryan Roth,医学博士,博士
北卡罗来纳大学教堂山分校
医学院药理学系
CB 7365,8032伯内特-沃马克大楼
教堂山,NC 27599
电话:919-966-7535
传真:919-843-5788
[电子邮件 protected]