公共访问

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EDASA COVID-19复合仓库可用于协作

出版者:Andrea Altieri,博士学位3d捕鱼达人:2733

发布时间:2020年5月12日

EDASA Scientific,小型MedChem组织(http://www.edasascientific. 通讯 )正在COVID-19区域寻找生物伙伴。 EDASA拥有大约2700种化合物,愿意免费提供这些化合物(装运是接收者的责任),如果有任何阳性结果,则准备指派化学家来优化活性化合物并进一步发展。 EDASA愿意探索对这些化合物中的任何一种进行计算机内修饰,并合成(不收费)有限数量的修饰化合物作为概念证明。收到的全部或部分信息将与IF一起以联合提交的形式发布给科学期刊>请注意,所有这些化合物都是EDASA Scientific专有的内部专利,我们已经为所有这些化合物开发了经过验证的合成方案。


COVID-19 Mpro活性片段

发布者:亚历克斯·克拉克3d捕鱼达人:1003

发布时间:2020年3月28日

由英国国家同步加速器科学机构Diamond Light Source与Dectris合作提供的晶体结构对Mpro / COVID19片段具有活性(已在所有Diamond MX实验中使用了这些探测器)。有关原始信息,请参见: //www.diamond.ac.uk/covid-19/for-scientists/Main-protease-structure-and-XChem/Downloads.html


佩拉拉ArkBas

发布者:Perlstein实验室3d捕鱼达人:56756

PI:Ethan Perlstein

发布时间:2019年10月27日

一个完全开放源代码的基于模型生物的表型筛选数据语料库由酵母,蠕虫,果蝇和人类细胞模型中的先天代谢疾病(如溶酶体疾病和先天性糖基化疾病)的药物再利用和铅检测筛选组成。这些数据已在G3期刊的三个案例研究中发表(Lao等,2019 //www.g3journal.org/内容/ 9/2 / 413.long)和疾病模型&机制(Iyer等人,2019a //dmm.biologists.org/内容/早期/ 2019/09/18 / dmm。040576.长; Iyer等人,2019b //dmm.biologists.org/内容/早期/ 2019/10/19 / dmm。040584.long )。


血清素受体的体外和体内活性

出版者:尼科尔斯3d捕鱼达人:84

PI:Dave Nichols

发行:10/14/2019

数据集集中在利用多巴胺或5-羟色胺作为神经递质的大脑系统上。这包括仅对五种通用类型的多巴胺受体(D1-D5)中的一种具有特异性的3d捕鱼达人探针,以及关于5-羟色胺5-HT1A,5-HT2A和5-HT2C受体的数据集。这些项目包括系统的结构修饰以及药理学分析,以鉴定这些受体中配体结合域的结构决定因素。这项工作的一个主题是确定如何将不同化学类别的3d捕鱼达人全部容纳在同一受体结合位点内。


多个SCLEROS:OL差异

出版者:髓磷脂修复基金会3d捕鱼达人:710

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月21日

急性少突胶质细胞分化测定将O4免疫纯化的OPC铺板于5k /孔。铺板后1小时,加入测试物品并将细胞温育四天,之后将细胞固形并对MBP和总核(DAPI)进行免疫染色。通过量化MBP染色/细胞数(通过DAPI核染色确定)确定OPC分化为OL。化合物的筛选以2种浓度一式四份进行(10& 2 uM; 2 & 0,4 uM; 0,4 &0.08μM)。将数据标准化为DMSO(0%差异)和40 ng / ml T3(100%差异)。相对于测试物品的EMax确定EC 50。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等。等BMC Res Notes。 2016 Sep 5; 9(1):419或联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多个SCLEROS:OL保护

出版者:髓磷脂修复基金会3d捕鱼达人:723

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月21日

少突胶质细胞保护测定-生存力(TNF + IFNg)将扩增的OPC以10K /孔接种。电镀后24小时,添加测试物品,添加测试物品1小时后,添加10U / mlIFN​​-γ/ 1ng / mlTNF-α。孵育2天,添加AlamarBlue并孵育4小时。定量AlamarBlue荧光以读取细胞活力。将数据缩放为DMSO(0%活性)和1.1μM喹硫平(100%活性)。有关技术细节,请参阅Rosler等。等BMC Res Notes。 2016年9月5日; 9(1):444 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多发性硬化症:髓鞘形成测定

出版者:髓磷脂修复基金会3d捕鱼达人:715

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月21日

皮质髓鞘化测定制备来自E18大脑皮层的细胞,并将其铺板在神经基底培养基中。四天后,该媒体更改为MyM媒体。添加第5天的测试文章,并使髓鞘化持续八天。在体外第13天,细胞是固体,并且对MBP和Olig2进行了免疫染色。通过定量MBP / Olig2 +原子核染色和修改MBP形态(相干MBP染色适应-纤维长度)来确定髓鞘形成。通过定量MBP密度x面积/ Olig2 +原子核确定OL分化。一式两份以2种浓度(5孔/ 4孔)筛选化合物&1μM)。将数据归一化为DMSO(0%分化/髓鞘形成)和DAPT(100%分化/髓鞘形成)。确定EC50与1μMDAPT的响应有关。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等。等,BMC Neurosci。 2016年4月22日; 17:16或联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多发性硬化:HEK293衣霉素保护试验

出版者:髓磷脂修复基金会3d捕鱼达人:740

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月17日

HEK-293保护分析

 

将HEK-293细胞(10K /孔)孵育24小时,然后添加测试物品。 1小时后,加入100 ng / ml衣霉素。再孵育48小时后,添加AlamarBlue,并在4小时后对荧光进行定量。将数据标准化为DMSO(0%活性)和5μMguanabenz(100%活性)。相对于测试物品的EMax确定EC 50。联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多菌种:OL毒性筛查

出版者:髓磷脂修复基金会3d捕鱼达人:709

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月17日

少突胶质细胞毒性试验(TNF + IFNg)

 

对传代的大鼠OPC进行毒性测定,以10k /孔接种,与药物孵育2天。孵育4小时后,读数为AlamarBlue荧光。数据显示为相对于DMSO(100%)的存活百分比。最大杀伤浓度为5 ng / ml衣霉素,可使约15%的细胞存活。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等人,BMC Res Notes。 2016 Sep 5; 9(1):419或联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


绿色溶剂

出版者:亚历克斯·克拉克(Alex Clark Sandbox)3d捕鱼达人:117

发布时间:2016年9月20日

Green Solvents data, som används av den självbetitlade mobilappen (http://molmatinf.com/greensolvents.html). Sammanställts från information som publicerats av ACS Green Chemical Institute och GSK Solvent Guide. Publicerad i http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/sc3000509.


寄生虫:GSK Kineto Box搭配pIC50

发布者:GSK Kineto Box Project(TCAKS)3d捕鱼达人:592

PI:皮拉尔·曼萨诺(Pilar Manzano)

发布时间:2016年6月16日

Med hjälp av helcells fenotypiska analyser, GlaxoSmithKline hög genomströmning screening (HTS) mångfald uppsättning av 1,8 miljoner föreningar var screenas mot de tre kinetoplastids mest relevanta för mänskliga sjukdomar, dvs Leishmania donovani, Trypanosoma cruzi och Trypanosoma brucei. Sekundära bekräftande och ortogonal intracellulära anti-parasiticidal analyser genomfördes, och potentialen för icke-specifika cytotoxicitet bestäms. Hit föreningar var kemiskt klustrade och triaged för önskvärda fysikaliska kemiska egenskaper. Det hypotetiska biologiska målutrymme som omfattas av dessa mångfaldsuppsättningar undersöktes genom bioinformatikmetoder. Följaktligen tre anti-kinetoplastid kemiska lådor av cirka 200 föreningar vardera monterades. Denna data-set innehåller hit föreningar och alla tillhörande screening resultat. http://www.nature.com/articles/srep08771


供应商:ASINEX PPI库

发布者:ASINEX3d捕鱼达人:8400

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

自2008年以来,ASINEX一直致力于蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)库的设计和合成。最新一代的ASINEX PPI库由不同大小,框架和形状的3d捕鱼达人组成,范围从片段样单元到被设计为二级结构模拟物的大环衍生物或作为表位仿制药。


供应商:ASINEX Elite库

发布者:ASINEX3d捕鱼达人:12960

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

第一次“击中”后有什么问题? Asinex已通过全面的ADME分析,可轻松进行药物化学修饰的最佳设计以及可确保新颖性的IP评估解决了这些问题。


供应商:ASINEX表型库

发布者:ASINEX3d捕鱼达人:9840

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

Asinex内部进行靶向分析和表型分析,并使用收集到的实验信息来创建基于目标的筛选集和各种筛选集。通过这种经验,Ainex创建了一个表型筛选集。此集合的过滤器如下:

MW:200-450,堵塞:-1.0–7.0,再次堵塞(pH 7.4):-5.0–4.0,Rot.Bond:0-10,HA:1-10,HD:1-5,TPSA:15-135 A,N + O:2-10,HAC:19-34,偶极子:0.3–3.30,SHP2:0.240–0.450。


供应商:ASINEX多样性库

发布者:ASINEX3d捕鱼达人:9968

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

多样性仍然是一种强大的筛选工具,尤其是在药物发现的早期“探针”阶段。在创建此集合时,Ainex应用了计算工具来确保在合并其“精英”和“生物设计”概念的一部分的同时正确表示化学空间。


供应商:ASINEX BioDesign

发布者:ASINEX3d捕鱼达人:8041

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

ASINEX的BioDesign方法在合成可行的药物化学配方中,在已知与药理相关的天然产物(如生物碱和其他次生代谢产物)中包含重要的结构功能。


产品目录:分布式药物发现(D3)-IUPUI

发布者:IUPUI-D3枚举73K N-AcylAA-OH,-OMe,-NH23d捕鱼达人:73234

PI:M. J. O'Donnell和W. L. Scott

发布时间:2016年2月24日

一个免费的,开源的虚拟目录/库>73,000个3d捕鱼达人:(a)N-酰基非天然α-氨基酸的甲基,b)N-酰基非天然α-氨基酸的甲基,和(c)N-酰基非天然α-氨基酸的伯酰胺。目录中的3d捕鱼达人是通过基于相当于100 R1X的甘氨酸阴离子的固相组合烷基化,然后用100 R2CO2H进行N-酰化和树脂裂解(分别为TFA,MeOH / Et3N或TFA)进行枚举而获得的。 2009年1月1日发布了具有48,818个3d捕鱼达人的较早数据集(超过a和b集以及R1X和R2CO2H输入)。我们鼓励同事就D3项目的兴趣与我们进行沟通(电子邮件: [电子邮件 protected]<mailto:[电子邮件 protected]> eller [电子邮件 protected]<mailto:[电子邮件 protected]>)。参考文献:J. 通讯 b。化学2009,11,3-13,14-33,34-43; J.Org。化学2014,79,3140-51; J.化学教育。 2015,92,819-26。</mailto:[电子邮件 protected]> </mailto:[电子邮件 protected]>


疟疾:5种恶性疟原虫激酶与GSK的TCAMS的生化筛选

发布者:Gregory J. Crowther3d捕鱼达人:13451

PI:Gregory J. Crowther

发布时间:2016年2月3日

筛选了约13,500种细胞活性化合物对五种不同蛋白激酶的活性。在恶性疟原虫钙依赖性蛋白激酶1和4(CDPK1 / PF3D7_0217500和CDPK4 / PF3D7_0717500),有丝分裂原相关的PAPK3 / P3的生化测定中筛选了GlaxoSmithKline的Tres Cantos抗疟疾药物套装(TCAMS) ,以及蛋白激酶7(PK7 / PF3D7_0213400)。新型强效抑制剂(IC50<对于三种激酶:CDPK1,CDPK4和PK6发现1 µM)。 PK6抑制剂是目前针对该酶发现的最有效的抑制剂,值得进一步研究。


公共暗物质协会

出版者:暗物质协会3d捕鱼达人:139352

PI:吉列尔莫·莫拉莱斯(Guillermo Morales)

发布时间:2015年12月7日

诺华发现,至少在诺华100次检测中已经测试了803,990种化合物,而112,872种化合物没有活性(占14.0%)。 NIH数据分析表明,在至少100种测定中测试了363,598种化合物,其中131,726种化合物无效(36.2%)。

安妮·迈·瓦瑟曼(Anne Mai Wassermann),尤金·伦肯(Eugen Lounkine),多米尼克·霍普夫纳(Dominic Hoepfner),盖勒·勒高夫(Gaelle Le Goff),弗雷德里克·金(Frederick J King),克里斯蒂安·斯图德尔(Christian Studer),约翰·佩尔帖(John M Peltier),梅利莎·L·格里波(Melissa L Grippo),薇薇安·普林德尔(Vivian Prindle),陶剑石,安斯加·舒芬豪尔(Ianin M Wallace),陈妮(Shanni Chen),菲利普·克拉斯特(Philipp Krastel),阿曼达·科沃斯(Amanda Cobos) -Correa,Christian N Parker,John W Davies&更多Glick。深色化学物质是药物发现的有希望的起点。 《自然化学生物学》 2015年,第11卷,第958–966页(doi:10.1038 / nchembio.1936)


ADME:AZ公开ChEMBL数据

发布者:AZ Public ChEMBL数据3d捕鱼达人:5799

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2015年10月5日

关于阿斯利康建立的一组公开标记化合物的体外DMPK实验和理化数据。为测定提供的参考举例说明了数据生成中使用的实验程序。

//www.ebi.ac.uk/chembl/doc/inspect/CHEMBL3301361% bundna till plasma genom jämviktsdialys. 通讯 pound inkuberas med hela marsvinsplasma vid 37C för >5hrs. Metod som beskrivs i B. Testa et al (Eds.), Farmakokinetisk profilering inom läkemedelsforskning: Biologiska, fysikalkemiska, och beräkningsstrategier, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimentellt intervall 10% till 99,95% bunden.% bunden till plasma genom jämvikt dialys. Förening inkuberas med hela hundplasma vid 37C för >5hrs. Metod som beskrivs i B. Testa et al (Eds.), Farmakokinetisk profilering inom läkemedelsforskning: Biologiska, fysikalkemiska, och beräkningsstrategier, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimentellt intervall 10% till 99,95% bunden.% bunden till plasma genom jämvikt dialys. 通讯 pound inkuberas med hel råttplasma vid 37C för >5hrs. Metod som beskrivs i B. Testa et al (Eds.), Farmakokinetisk profilering inom läkemedelsforskning: Biologiska, fysikalkemiska, och beräkningsstrategier, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimentellt intervall 10% till 99,95% bunden.% bunden till plasma genom jämvikt dialys. Förening inkuberas med hela musplasma vid 37C för >5hrs. Metod som beskrivs i B. Testa et al (Eds.), Farmakokinetisk profilering inom läkemedelsforskning: Biologiska, fysikalkemiska, och beräkningsstrategier, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimentellt område 10% till 99,95% bundet. Inneboende clearance mätt i humana hepatocyter efter inkubation vid 37C. Experimentellt <3 to="">område 150 microL/min/1E6-celler. Snabb kommun. Massa Spectrom. 2010, 24, 1730-1736.Most basic pKa value (pKa B1) som bestäms genom absorption och potentiometrisk titrering med hjälp av standardmetodik från Sirius Analytical. Experimentellt intervall Baser: >= 2.Andra suraste pKa-värde (pKa A2) som bestäms genom absorption och potentiometrisk titrering med hjälp av standardmetodik från Sirius Analytical. Experimentellt spänner <= 11. Syror:</3>

使用标准Sirius分析方法通过吸收和电位滴定确定的第三最基本的pKa值(pKa B3)。实验范围广泛的基础:>= 2.

使用标准Sirius分析方法通过吸收和电位滴定确定的第二最基本的pKa值(pKa B2)。实验范围广泛的基础:>= 2.

使用标准Sirius分析方法通过吸收和电位滴定法测定的大多数酸性pKa值(pKa A1)。实验范围内的酸:<= 11.


PDB配体

发布者:Protein Data Bank(PDB)3d捕鱼达人:16826

PI:Dale R. Cameron,博士,M.C.I.C.,P.Chem。

发布时间:2015年8月3日

从初步预算系统中提取配体信息,进行过滤以除去“聚合物”和其他相关的“非游离”配体,以及金属或与金属结合的配体。可以在不发出警告的情况下完成对过滤过程的更新。提供的数据无需进一步处理或纠错。到PDB的链接由RCSB PBD提供,可能列为:

H.M. Berman,J.Westbrook,Z.Feng,G.Gilliland,T.N。 Bhat,H.Weissig,I.N.辛达洛夫(PE) Bourne(2000)蛋白质数据库核酸研究,28:235-242。

请向保管库管理员报告断开的链接,对其他数据的请求等。


埃博拉病毒:小型埃博拉病毒3d捕鱼达人抑制剂

出版者:纳迪亚的沙盒3d捕鱼达人:55

PI:Nadia Litterman博士

发布时间:2015年2月2日

该共享数据集包含来自文献(截至2015年1月)的55个小3d捕鱼达人,这些小3d捕鱼达人具有针对埃博拉病毒和多种疾病模型的体外和/或体内活性。我们包括了经验丰富的药物化学家的评估以及PAINS过滤的结果。 (这项工作已由Nadia Litterman,Christopher Lipinski和Sean Ekins提交给F1000Research出版)。


供应商:Synthonix-建立更好的联系

Publicerad av: http://www.synthonix.com Molecules: 10286

发布时间:2015年1月2日

Synthonix通过提供10,286个构建基块的目录来帮助医学化学家突破药物发现的界限,使他们能够探索更具挑战性的化学空间,并扩大治疗世界慢性病和可治愈疾病的潜在重要治疗靶点的范围。 Synthonix,Inc.:919-875-9277;一般电子邮件: [电子邮件 protected]; Synthonix Ltd(欧洲办事处):办公室:+44 1223 597934;电子邮件: [电子邮件 protected]


探针:NIH化学探针

发布者:Probes Vault3d捕鱼达人:319

PI:Christopher Lipinski

发布时间:2014年11月12日

美国国立卫生研究院(NIH)已在壁内和学术中心为HTS的广泛研究提供了资金,估计超过5.76亿美元,以通过3d捕鱼达人库筛选中心网络(MLSCN)和3d捕鱼达人库鉴定小3d捕鱼达人化学探针或工具化合物探针生产中心网络(MLPCN)。对于要选择作为探针的化合物,已经使用了基于效价,选择性,溶解性和可利用性的不同定义。迄今为止,NIH资助的学术筛选中心已经发现了300多种化学探针。该集合包含扫描结构,目标,反目标,IC50值和其他参考。它还包括各种类似药物的措施,包括Chris Lipinski博士授予的“合意性得分”,如“由专家评估化学探针进行的计算预测和验证”所述。 Litterman NK,Lipinski CA,Bunin BA,Ekins S.J Chem Inf模型。 (2014年)


供应商:Azepine Ltd Building Blocks收藏

发布者:Azepine Ltd.3d捕鱼达人:600

PI:朱莉娅

发布时间:2014年10月8日

600个积木,现货供应,价格具有竞争力。联系 [电子邮件 protected]


NEU-CSIC-GSK激酶靶向的HTS

发布者:Pollastri Lab-东北大学3d捕鱼达人:78

PI:Michael Pollastri

发布时间:2014年9月25日

该数据集包含通过东北大学(Pollastri实验室),CSIC(Navarro实验室)和葛兰素史克·特雷斯·坎托斯实验室(发展中国家DPU的疾病)合作进行的高通量筛选结果。本文是Diaz等人的PLoS-NTD:

 

DOI:10.1371 / journal.pntd.0003253

 

随时联系 [电子邮件 protected] 有问题


供应商:Vitas-M实验室库存HTS系列

发布者:Vitas-M实验室3d捕鱼达人:388375

发行时间:2014年11月7日

维塔斯M实验室有限公司HTS化合物的库存量约为400,000个单个3d捕鱼达人。它们都可以以各种形式快速交付,包括毫克,微摩尔,干粉,DMSO溶液和干膜。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Vitas-M实验室构建基块

发布者:Vitas-M实验室3d捕鱼达人:33297

发布时间:2014年10月7日

维塔斯M实验室有限公司有机构建基块的集合包含超过33,000个已识别和测试的对象。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Vitas-M实验室脚手架

出版者:Vitas-M实验室3d捕鱼达人:2898

发布时间:2014年7月8日

维塔斯M实验室有限公司脚手架系列(杜鹃花项目)。合成类似毒品的小型图书馆的先进方法。这是获得其他供应商无法提供的全新协会的最佳选择。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Vitas-M实验室片段

发布者:Vitas-M实验室3d捕鱼达人:18631

发布时间:2014年7月8日

维塔斯M实验室有限公司碎片(基于“ 3规则”的化学物质和其他特殊过滤器)的收集,用于基于碎片的药物发现。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Life Chemicals- GPCR库

出版者:生命化学3d捕鱼达人:15948

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Likhet/farmakofor sökning baserades på Topomer Sök förutsägelse som tillhandahålls av Sybyl-X. Första steget - en likhet sökning antas en jämförelse av hela lager föreningar till kända hämmare som härrör från BindingeDB och ChemblDB. Andra steget - generering av 3D-strukturer av kända hämmare och deras samjustering. Denna kemiska rumsliga utrymme användes som en mall för montering av resten av "liknande" föreningar. Men detta är metoden utformades för "cherry-picking" och ett alternativt bibliotek kan göras med virtuella screeningmetoder (alla screeningmodeller en klar och bevisad med utbildning uppsättningar) mot sådana receptorer - adenosin, chemokine, dopamin, gaba-, histamin, muscarinic, opioid, sfingosin. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学-平等的激酶

出版者:生命化学3d捕鱼达人:62467

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Likhet sökning med hjälp av MDL offentliga nycklar och Tanimoto likhet cut-off på 90%. Nästan 25K referensföreningar som testats aktiva i 168 biologiska analyser (mer än 100 olika kinas mål), användes för likhet sökning. Allt detta föreningar kan screenas mot mer specifika mål upp till kundordern. http://www.lifechemicals.com/


供应商:Life Chemicals-激酶,通过对接

出版者:生命化学3d捕鱼达人:15174

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Kinase bibliotek var beredd att basera på virtuell dockning i en Sybyl miljö. För detta ändamål en uppsättning av Kinas strukturer' bindning platser (ca 20) var inriktade och analyseras. Sådana superposed platser användes för struktur-baserade farmakofor modellering via Unity modul från Sybyl-X. Efter alla förberedelser en hel 3D-lager var screenas mot denna multi-farmakofor modell och i slutändan en top-ranking utfördes. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学-核受体

出版者:生命化学3d捕鱼达人:9896

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Liv Kemikalier. Virtuell dockning och likhet/farmakoforsökning. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学-CNS库

出版者:生命化学3d捕鱼达人:16535

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

CNS-filter som beskrivs i litteraturen användes som en sikt för hela vårt lager. Som det visades de enda föreningarna med sådana parametrar kan ha lämpliga egenskaper för nervvävnad permeabilitet. Alla deskriptorer erhölls från Kalkylblad och Volsurf moduler av Sybyl. (MW 200 = 350 cLogP =< 3.6 H-Bond Acceptors =< 8 H-Bond Donors =< 5 tPSA =< 120 Rotatable Bonds =< 5 LogBB1 = -3.0 to 1.0) http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学品-类似于天然产物的图书馆

出版者:生命化学3d捕鱼达人:7808

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Första metoden baserades på statistisk anlys av deskriptorer. Tidigare en stor databas med NPs analyserades för att studera NP byggnadsställningar genom att ordna dem i form av ett träd. Således analys av egendom distribution av mer än 130 000 NP strukturer samt identifiering av understrukturer typiska för särskilda klasser av naturliga föreningar genomfördes för att generera en uppsättning fragment som vanligtvis finns i naturliga föreningar. Denna metod testades på CRC Dictionary of Natural Products (DNP) och syntetiska molekyler (SMs). En annan metod bygger på byggnadsställning likhet bedömning. Antalet atomsignaturer (från fragmnets) som genereras för en molekyl är lika med det antal atomer som utgör molekylen. Varje atom signatur självständigt representerar en strukturell funktion / fragment av molekylen, och en individuell poäng för det beräknas. högre antal atomer från att få högre poäng. För att reproducera sådant experiment använde vi en implementerad modul Chemistry Development Kit i CDK-Taverna 2.0. Den innehåller en NP-Likhetscorer v1.4.1 som beräknar Natural Product(NP)-likhet av en molekyl, dvs molekylens likhet med det strukturutrymme som täcks av kända naturprodukter. Alla resultat gjordes och varierade från -3 till +3. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学品-筛选产品

出版者:生命化学3d捕鱼达人:371998

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Noggrant utformade, nya, drogliknande små molekyler med Lipinski regel av 5 och den enda anledningen till avvikelse från uppsättningen av dessa parametrar är en unik byggnadsställning eller icke-standard kemi. Det är redo för tillämpning av läkemedelskemi filter som SMÄRTA eller något målfokuserat filter (löslighet, permeabilitet, BBB). http://www.lifechemicals.com/


供应商:具有保证溶解度的生命化学碎片

出版者:生命化学3d捕鱼达人:8241

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Fragment föreningar valdes genom filtrering av hela LC-lager med modifierade "Regel om tre". Fragment har testats för löslighet i analytiskt laboratorium. Löslighet garanteras vid 200mM koncentration i DMSO, och 75% av fragment är lösliga i pH7.5 buffert vid 1mM koncentration. http://www.lifechemicals.com/


TB:文献中的体内小鼠效应

发布者:TB体内数据23d捕鱼达人:778

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2014年4月10日

展望未来:预测小3d捕鱼达人与结核分枝杆菌的体内作用。在疾病的动物模型中体外选择和翻译该疾病导致具有体内活性的3d捕鱼达人是一项挑战,需要花费大量时间和金钱。我们展示了使用包含773种化合物的机器学习分类模型(贝叶斯,支持向量机和递归分区)从体内有活性和无活性的化合物中学习。贝叶斯模型预测该模型中未包含的11种其他体内活性物质中的8种作为外部测试集。因此,治疗70年的Mtb数据可以提供统计上可靠的计算模型,以将资源集中在体内活性的小3d捕鱼达人抗结核药上。这突显了其他疾病中体内测试的经济有效的预测指标。 PMID:24665947


TB:TB Mobile 2的数据

发布者:TB Mobile 2.0更新3d捕鱼达人:79

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2014年3月19日

从最新的杂志中选择的79个与TB具有一个或多个目标的协会已添加到TB Mobile的应用程序第二版。使用另外20个3d捕鱼达人作为测试集。论文已提交。


寄生虫:曼氏血吸虫的MMV疟疾框屏幕

发布者:CDIPD保管库3d捕鱼达人:400

发布时间:2013年11月6日

Helorganism skärmar av Schistosoma mansoni somules (post-infective larver) och vuxna med 400 föreningar som omfattar MMV Malaria Box (http://www.mmv.org/malariabox). Endast de Malaria box "Drug-liknande" föreningar ger de allvarligaste fenotyper vs somules testades mot vuxna. Uppgifterna laddas också upp till ChEMBL. Kontakta Conor Caffrey, Centrum för upptäckt och innovation inom parasitsjukdomar (www.cdipd.org/), UCSF ([电子邮件 protected] )。


中国:中国的催化活性(Theonie Anastassiadi在《自然生物技术》上的出版物)

出版者:中国催化活性3d捕鱼达人:178

PI:Theonie Anastassiadis

发布时间:2013年8月30日

中国的催化活性

Nature Biotechnology 2011年10月30日; 29(11):1039–1045。测试的文库由178种已知抑制所有主要蛋白激酶亚家族的激酶组成,为简单起见,所有化合物在10μMATP存在下的浓度为0.5μM。尽管平均报导这些化合物的IC50相对其主要目标值为66 nM,但仍选择了0.5μM,以捕获较弱的抑制活性。每个激酶抑制剂对均进行两次测试,结果表示为平均底物磷酸化水平,以溶剂控制反应的百分比表示(以下称为“残留激酶活性”)。给出了每个激酶抑制剂对的平均残留激酶活性。中国活性数据表示为样品样品中残留激酶活性相对于媒介物(二甲亚砜)的百分比。


结核病:更新药物和潜在客户目标

发布者:结核病:具有目标的药物和关节-更新3d捕鱼达人:38

发布时间:2013年6月14日

已发布的有关结核病的最新文献中具有已知目标的协会也将用作结核病移动应用程序的更新

中国:葛兰素史克发布中国抑制剂套装(PKIS)

发布者:Kinome23d捕鱼达人:364

发布时间:2013年6月6日

GSK发布的激酶抑制剂套装(PKIS)是一套367种蛋白激酶抑制剂,已针对该蛋白激酶家族的活性进行了评论,可用于公众筛选。可以在下面显示的链接上找到有关筛选集的详细信息。 ChEMBL数据库一直是该组生物测定数据的“理想去处”站点。本着改善对重要数据的访问的精神,我们收集了ChEMBL友善提供的PKIS数据,并对其进行了处理,以便可以在此处通过协作药物发现(CDD)站点进行访问(就像我们之前对Kinase SARfari所做的一样)数据库)。

转移到CDD可以使数据更加“友好”。我们还清理了数据量。例如,实际上只有364种化合物(某些双倍的盐由于相同3d捕鱼达人的名称或替代名称而形成)。我们还尝试在可能的情况下标准化目标名称(例如,对于来自UNC的数据集,激酶称为IKKA,IKKB和IKKE IKK-alfa,IKK-beta,IKK-epsilon)。不是因为我们是完美的……我们也感谢对我们的数据集所做的任何修正!

总而言之,针对225个目标物(0.1和1μM)测试了364种化合物。在此数据集中,只有一个协议,但是在一个读数中列出了225个目标。浓度也是一个读数,因此很容易将搜索限制在运行于1和/或0.1μM的屏幕上。

链接:

1)有关GSK PKIS的更多信息

http://www.maggichurchouseevents.co.uk/bmcs/Downloads/CBDD%20-%20Zuercher%20Bill.pdf

http://www.chordomafoundation.org/wp-content/uploads/2013/04/2013-Flanagan-Drewry.pdf

http://chembl.blogspot.co.uk/2013/05/pkis-data-in-chembl.html

2)CDD上的先前ChEMBL激酶数据

//www.aslsw.com.cn/buzz/2013/04/04/kinome-sar-for-collaborative-drug-discoverers/

中文:ChEMBL激酶SARfari协会& BioAssay Data


发布者:CDD Vault3d捕鱼达人:54211

PI:CDD

发布时间:2013年3月27日

ChEMBL上有价值的资源是Kinase SARfari,“专注于激酶的综合化学基因组学工作台。该系统整合并链接了激酶阵列,结构,组成和筛选数据”。该数据库是非常有用的资源,可在各种测定中为大量针对各种激酶的中国活性化合物提供大量SAR数据,其中许多是从文献中手动提取并治愈的。为了使这些数据在CDD界面中可用,我们采用了Kinase SARfari的核心表,并将其与ChEMBL数据库中的另一个关键表合并,从而提供了一个字段,该字段描述了每条记录中使用的分析,其详细程度远远超过可用的分析。和本地SARfari。现在,我们可以通过CDD接口使用此合并数据集。有400种激酶的详细体外数据。此外,还记录了体内功能以及ADMET数据。


TB:ARRA

发行人:TB ARRA3d捕鱼达人:1924

PI:鲍勃·雷诺兹

发布时间:2013年3月15日

来自SRI(Bob Reynolds)和Scott Franzblau小组的数据-Ekins等人提交的论文。

以前的SRI筛选中的命中被用于在供应商库中寻找相似的化合物,并在一系列接受筛选的新药物发现候选筛选物中进行了分组和体外测试。这些化合物还用作先前生成的具有生物活性和细胞毒性信息的贝叶斯模型的测试集。


TB:GSK

发布人:TB GSK3d捕鱼达人:177

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2013年8月2日

来自Ballell等论文ChemMedChem 2013的补充数据,“为开放源代码药物的研究提供动力:177种抗结核的小3d捕鱼达人药物”

Ursprungliga datauppsättningar finns på //www.ebi.ac.uk/chemblntd endast M.tb data visas här men mer BCG-data finns på ChEMBL


三角锥:南美锥虫病文献化合物

发布者:查加斯公共数据3d捕鱼达人:531

发布时间:2012年12月21日

对于已发表文献中体外或体内针对克鲁氏锥虫测试的531个3d捕鱼达人,化合物结构和文献参考文献进行了固化。


TRYPANOSOME:针对人类非洲锥虫病(HAT)的特定化学系列的优化

发布者:查加斯公共数据3d捕鱼达人:5559

发布时间:2012年12月12日

SCYNEXIS Inc, som medlem i DNDi HAT Lead Optimization Consortium utvecklat och screenat 4926 föreningar för aktivitet mot T. brucei. Sammansatta strukturer och in vitro-aktivitetsdata mot T. brucei brucei ingår. Cytotoxicitetsdata och aktivitet mot de relaterade eukaryota parasiterna T. brucei rhodesiense, L. donavani och P. falciparum för en delmängd av 34 föreningar. Alla de rapporterade sammansatta serien är inte längre under utveckling för HAT som de befanns ha dålig selektivitet eller egenskaper oförenliga med in vivo verksamhet. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1011-hat-001


TRYPANOSOME:用于治疗恰加斯氏病的芬那莫尔系列的DNDi优化

发布者:查加斯公共数据3d捕鱼达人:743

发布时间:2012年12月9日

DNDi Lead Optimization Consortium, inklusive Epichem, Murdoch University och CDCO, utvecklade och visade en SAR-serie baserad på växten fungicid fenarimol. DNDi gjorde offentliga sammansatta strukturer, T. cruzi aktivitetsdata, och L-6 celltoxicitetsdata för 743 föreningar från denna serie i ChEMBL-NTD. Föreningar och biologiska analysdata ingår här i CDD Public. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1012-chagas-001


TRYPANOSOME:广泛的主要HTS,以鉴定T.Cruzi复制的抑制剂

发布者:查加斯公共数据3d捕鱼达人:303230

发布时间:2012年12月6日

Broad Institute utförde en hög genomströmningsskärm av 303.224 föreningar i två exemplar i rekombinanta Tulahuen stam av Trypanosoma cruzi stabilt uttrycker beta-galactosidase reporter co-odlade med värdcell, mus fibroblast NIH3T3. Av de 4 394 träffarna utvärderades 4 063 ytterligare för hämmande aktivitet och värdcellstoxicitet. Slutligen valdes 27 föreningar som potentiella sondföreningar och validerades ytterligare. Data från den primära skärmen och efterföljande sekundära analyser sattes in PubChem. Kemiska föreningar och biologiska analysdata för den primära skärmen och sex sekundära analyser från PubChem ingår här i CDD Public. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21634083


TB:Guzman等人,M.tb。 MurE连接酶抑制剂

发布者:CDD-肖恩·埃金斯3d捕鱼达人:8

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2012年12月6日

来自以下结核病出版物的基于细胞和靶标的完整筛选数据:Guzman JD,Gupta A,Evangelopoulos D,Basavannacharya C,Pabon LC,Plazas EA,MuñozDR,Delgado WA,Cuca LE,Ribon W,Gibbons S,Bhakta S.J Antimicrob化学药剂师。 2010年10月; 65(10):2101-7。哥伦比亚植物天然产物的抗结核病筛查:3-methoxinordomesticine,结核分枝杆菌的MurE连接酶抑制剂。


供应商:NIH Clinical Collection 2阵列(281个3d捕鱼达人)

发布者:NIH Clinical Collections3d捕鱼达人:281

PI:项目负责人:Mei Steele

发行时间:2012年11月11日

NIH Clinical Collection 2是由281个小3d捕鱼达人组成的镀膜阵列,具有人类临床试验中的使用历史。该馆藏是由美国国立卫生研究院(NIH)通过3d捕鱼达人图书馆路线图计划收集的,这是其使生物医学研究中使用复合屏幕的使命的一部分。


供应商:NIH Clinical Collection阵列(446个3d捕鱼达人)

发布者:NIH Clinical Collections3d捕鱼达人:446

PI:项目负责人:Mei Steele

发行时间:2012年11月11日

NIH Clinical Collection是由446个小3d捕鱼达人组成的镀膜阵列,具有在人类临床试验中使用的历史。该馆藏是由美国国立卫生研究院(NIH)通过3d捕鱼达人图书馆路线图计划收集的,这是其使生物医学研究中使用复合屏幕的使命的一部分。


TB:具有目标的毒品和潜在客户-移动应用中使用的数据

发布者:移动应用程序的SRI3d捕鱼达人和目标3d捕鱼达人:707

发布时间:2012年10月23日

精选了具有体内必需性的针对结核病靶标的数据

来自TBDB,Biocyc,Metacykla,PDB和Pubmed的信息

斯坦福研究所的Malabika Sarker的其他参考。

约翰·霍普金斯大学的Gyanu Lamichhane有所作为

information.ref.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22477069

Utforska den här datauppsättningen på mobilen: //itunes.apple.com/app/tb-mobile/id567461644


TOX:归类为肝毒性的药物

发布者:CDD Vault3d捕鱼达人:83072

PI:CDD

发布时间:2012年7月16日

辉瑞(Hu 2008)以前已经基于肝毒性的临床数据对分类的药物和化学药品清单进行了评估,目的是评估体外人肝细胞显像分析技术(HIAT),与临床肝毒性。通过或不通过药物引起的肝损伤(DILI)的相同数据集已与3d捕鱼达人描述符一起用于通过贝叶斯模型进行计算机预测。


TB:具有针对TB的全细胞活性的SRI3d捕鱼达人

发布者:SRI Group Vault3d捕鱼达人:23

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2012年4月24日

在Pharm Res中评估了3d捕鱼达人。 2012年4月4日。PMID:22477069

结合化学信息学方法和途径分析来鉴定具有抗结核分枝杆菌全细胞活性的3d捕鱼达人。

Sarker M,Talcott C,Madrid P,Chopra S,Buinin BA,Lamichhane G,Freundlich JS,Ekins S.


疟疾:MMV疟疾框

出版者:公众:疟疾盒3d捕鱼达人:400

发布时间:2012年3月29日

Molekyler från MMV Malaria Box, ChEMBL-NTD (//www.ebi.ac.uk/chemblntd) : MMV Malaria Box, Simon Macdonald, Paul Willis, Paul Kowalczyk, Thomas Spangenberg, Jeremy Burrows och Tim Wells. Läkemedel för Malaria Venture (MMV), PO Box 1826, 20, rte de Pré-Bois, 1215 Genève 15, Schweiz och SCYNEXIS Inc. P.O. Box 12878 Research Triangle Park, North Carolina 27709-2878 USA.

已在体外针对3D7(氯喹(CQ)敏感但恶性疟原虫对磺胺多辛的抗性菌株)筛选了疟疾盒子中的所有化合物,并在人胚胎肾细胞系(HEK-293)上进行了细胞毒性试验。数据以恶性肿瘤数据的nM EC50表示。


ADME:ADMEdata.com-高质量ADME数据的商业存储库

出版者:G2 Research ADMEdata.com3d捕鱼达人:1760

PI:乔治·格拉斯

发布时间:2012年1月13日

示例:Caco-2渗透性,@ 5PH值的平衡溶解度,蛋白结合人,蛋白结合大鼠,兔肠渗透性,人血浆分配&分血器。有关完整的数据集和模型,请直接联系Pharm.D的George Glass。博士学位 [电子邮件 protected] (通过CDD分发)


供应商:Porse Building Blocks集合

发布者:CDD Vault3d捕鱼达人:29241

PI:CDD

发布时间:2012年1月13日

Porse File Chemical Co.致力于开发用于药物发现的定制新型复合材料合成,并提供具有竞争力的价格和优良品质的广泛产品系列。当前组是吗啉,哌啶,哌嗪,嘧啶,氨基酸和API系列的1554种新化合物和构建基块的选定子集。 www.porsefinechemical.com, [电子邮件 protected] + 86-20-28069055


寄生虫:曼氏血吸虫血吸虫病:微源光谱& Killer Samlingar

发布者:Brian Suzuki的Sandbox3d捕鱼达人:119

发布时间:2011年10月5日


曼氏血吸虫血吸虫:微源光谱的表型筛选& Killer Samlingar.

PI:Conor R. Caffrey

发布时间:2011年10月5日

CDD:公开数据119次点击

作为在UCSF桑德勒药物发现中心发现新的抗寄生虫药物的重新定位(重新定位)策略的一部分,我们开发了部分自动化的全生物(表型)筛查,以筛查引起传染性热带病的血流,血吸虫病。我们筛选了上述集合中的1,260种化合物,包括药物,类药物化合物,天然产物和各种化合物。我们报告曼氏血吸虫的幼虫阶段(血吸虫)的表型变化,使用简单的描述符来表达寄生虫对复合物侵害的多重和动态响应。目前正在对表型反应进行完全定量。提供的信息仅适用于“热门”关联;可以从Microsource Discovery Systems Inc.获得化合物在各自集合中的完整列表。 [电子邮件 protected] 更多细节。蜗牛热的药物发现:通过平均流表型筛选在已知药物库中鉴定出的命中和先导化合物。阿卜杜拉MH,鲁埃拉斯DS,沃尔夫B,Snedecor J,林KC,徐F,伦斯洛AR,威廉姆斯J,麦考罗JH,卡弗里CR。 PLoS Negl Trop Dis。 2009年7月14日; 3(7):e478。 PMID:19597541


TB:SRI激酶库表型筛选

发布者:CDD Vault3d捕鱼达人:23823

PI:CDD

发布时间:2011年8月29日

除了各种疾病,中国的目标也在追求

癌症,包括免疫和代谢以及病毒,寄生虫,

真菌和细菌。特别是有一个相对较新的

对分枝杆菌中激酶和ATP结合靶标的兴趣

鉴定结核病的抑制剂和潜在药物

当前药物方案未靶向的必需蛋白。

在这里,我们报告了针对目标人群的高通量筛选结果

基于当前激酶抑制位点和已知激酶结合位点设计的大约26,000种化合物的文库此处提供的表型数据可能构成选择支架/化合物以进行针对结核分枝杆菌中特定激酶或其他ATP结合靶标的其他酶促筛选的基础,基于对整个细菌的体外表观活性。 PMID:21708485

结核病(爱丁堡)。 2011年6月25日。[印刷前为EPUB]

版权所有©2011 Elsevier Ltd.版权所有。

有关更多信息,请联系Melinda Sosa: [电子邮件 protected]

基于中国抑制剂的图书馆的高通量筛选

对结核分枝杆菌H37Rv的定位。

雷诺(Reynolds)RC,安南斯坦(Ananthan S),法莱奥莱(Ea Faaleolea)E,霍布拉斯(Hobrath)合资,K CD,马多克斯(Maddox)C,拉斯穆森(Rasmussen)L,索萨(Sosa)密西西比(Thammasuvimol E),白EL,张W,塞克莉斯(Secrist)JA第三名。

资料来源:南方研究所,第九大道南2000号,

美国伯明翰市35205。


FDA批准:NCGC药品收藏(NPC)V1.1.0

发布者:NCGC Pharmaceutical Collection NPC V1.1.03d捕鱼达人:14579

PI:Noel Southall

发布时间:2011年8月8日

NCGC药物收藏:临床批准药物的全面资源可实现重新用途和化学基因组学。 Huang,R.,Southall,N.,Wang,Y.,Yasgar,A.,Shinn,P.,Jadhav,A.,Nguyen,D.,Austin,C.Sci Transl Med 2011年4月27日。 3,第80期,第80ps16页。

http://stm.sciencemag.org/content/3/80/80ps16.abstract


供应商:带有价格信息的BioBlocks目录

发布者:BioBlocks3d捕鱼达人:2971

PI:道格·墨菲

发布时间:2011年8月3日

2989个协会。

BioBlocks提供了2200多种预先合格的可药用成分的脚手架,构件和片段的集中集合。这些化合物中的大多数是由BioBlocks独特提供的,并已发现其应用范围从药物发现中间体到肽化学中的替代氨基酸。

有关BioBlocks构建基块的最新详细信息,请访问www.bioblocks.com。


TOX:药物性肝损伤数据(DILI)

发布者:BBB3d捕鱼达人:519

发布时间:2011年4月29日

药物性肝损伤数据-训练集是Jim Xu的实验数据,测试集代表文献数据。

发表在《药物代谢研究》上。 2010年12月; 38(12):2302-8。 Epub 2010年9月15日。一种基于预测的基于配体的贝叶斯模型,用于人类药物诱发的肝损伤。

埃金斯S,威廉姆斯AJ,徐继杰。

TB:体内重要基因的目标数据库


发布人:SRI TB目标数据库3d捕鱼达人:314

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2011年4月21日

针对结核病靶标的数据具有来自TBDB,Biocyc,Metacyc,PDB和Pubmed的体内必需性信息,以及斯坦福研究院的Malabika Sarker博士汇编的其他参考资料。约翰·霍普金斯大学的Gyanu Lamichhane博士因提供基本信息而受到公认。

**请注意,没有与该数据集相关的小3d捕鱼达人**


供应商:Enamine代表杂项筛选库

发布者:Enamine3d捕鱼达人:200000

PI:Dmytro Mykytenko

发布时间:2011年4月12日

原始200K不同的筛选库是专门为协作药物生成的

来自全球最大的商业筛选协会库存中的发现用户

(超过170万个物种)。该图书馆与精致的ADME有独家的类似毒品的关联

特性。我们的优质化合物可与樱桃一起采摘,并立即在

不同的格式。


FDA批准重新定位:使用HTS方法重新定位的药物

发布者:体外再利用3d捕鱼达人:109

发布时间:2011年3月18日

使用HTS方法鉴定出新用途的药物。该表大大扩展了以前发布的版本“ Ekins S,Williams AJ,Krasowski MD,Freundlich JS。对已批准的罕见和被忽视疾病的药物进行计算机重新定位。今日药物Discov。2011年3月1日。PMID:21376136 doi:10.1016 / j.drudis .2011.02.016下表列出了3d捕鱼达人,旧用途/目标,新用途/目标,如何发现和引用。

缩写:CCR5,趋化因子受体5; DHFR,二氢叶酸还原酶; DOA,成瘾药物,FDA,食品和药物管理局; GLT1,谷氨酸转运蛋白1; HSP-90,热激蛋白90; HSP-90。 JHCCL,约翰·霍普金斯临床协会图书馆; Mtb,结核分枝杆菌; NK-1,神经激肽-1受体; OCTN2。


FDA批准重新定位:孤儿药

出版者:罕见疾病改变3d捕鱼达人用途:76

发布时间:2011年3月18日

FDA Tabell 2 - från FDA resurs, den sällsynta sjukdomen forskningsdatabasen (RDRD), som listar Orphan-utsedda produkter (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) med minst ett godkännande för försäljning för en sällsynt sjukdom indikation. Dessa data analyserades av Ekins och Williams (papper in).


FDA批准重新定位:孤儿药

出版者:罕见疾病改变3d捕鱼达人水平:105

发布时间:2011年3月18日

FDA Tabell 1 - från FDA resurs, den sällsynta sjukdomen forskningsdatabasen (RDRD), som listar Orphan-utsedda produkter (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) med minst ett godkännande för marknadsföring för en vanlig sjukdom indikation.

FDA没有将数据与3d捕鱼达人结构相关联。


供应商:科罗拉多州药物发现中心试验图书馆

发布者:C2D2公共3d捕鱼达人:2240

PI:Greg Miknis,副总监

发布时间:2011年3月7日

该文库包含符合药物样标准的结构不同的小3d捕鱼达人。代表了几种化学型,并且该文库被设计为适用于多种潜在靶标。

要请求有关集合的信息,请发送请求至 [电子邮件 protected]


LIPID:脂质图结构数据库

发布者:Lipid Maps数据库3d捕鱼达人:22215

PI:Lipidomics网关

发布时间:2011年2月11日

De Lipid Kartor (http://www.lipidmaps.org/) strukturer var kommenterade med 5 gemensamma joner (H +,2H ++, K +, Na +, NH4 +) inklusive däggdjur feta acyls, glycerolipider, glycerophospholipids, sphingolipids, sterol lipider och prenol lipider. Strukturerna och jonerna är sökbara efter struktur och MW för att underlätta identifiering av nya lipider.


结核分枝杆菌

发布者:虚拟代谢物3d捕鱼达人:274

发布时间:2010年11月5日

Kinnings等人的出版物《 PLoS 通讯 putational Biology vol 6:e1000976(2010)》中发布的274种药物(在美国和欧洲已批准用于人类)的数据集

药物在PDB中与至少一种结构共结晶。该数据集可与CDD中的其他TB筛查数据集一起使用,以确定哪些批准的药物具有抗Mtb活性(来自文献)。

TB:文献中非复制型Mtb的抑制剂


发布者:CDD-肖恩·埃金斯3d捕鱼达人:26

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年10月28日

来自已发表论文的结构和数据:

Darby和Nathan J Antimicrob Chemother 2010:65:1424-1427

Bryk et al。,Cell Host and Mikrob 2008:3:137-145

Lin等,Arch Biochem Biophys。 2010 501:214-220

Lin et al。,J Biol Chem 2008:283:34423-34431

de Cavalho et al:J Med Chem 2009:52:5789-5792

Lin et al。,Natur 2009:461:621-626


供应商:Astatech,Inc. Building Block Collection

出版者:Astatech,Inc.3d捕鱼达人:6140

发布时间:2010年10月15日

AstaTech,Inc.提供先进和新的中间体以促进药物发现过程。我们的产品范围广泛,包括结构单元,新胺,受保护的胺,非天然氨基酸,酮,醛,杂环,等位酸酐,硼酸和手性中间体。联系 [电子邮件 protected] 用于订购信息。


供应商:Chemik 2010目录

发布者:CDD Vault3d捕鱼达人:3889

PI:CDD

发布时间:2010年10月5日

Chemics已成功帮助惠氏(Wyeth)等药物发现公司开展了早期项目。我们提供从克到几吨的原料和关键中间体。凭借在该领域10年的经验,我们可以帮助我们的客户在4-6周内以具有竞争力的价格,优质的产品和持续的服务开发新的中间体。


疟疾:Fenantrhren和蒽氨基醇

发布者:CDD Vault3d捕鱼达人:35

PI:CDD

发布时间:2010年9月21日

卤素取代的蒽和菲N-二烷基和单烷基取代的氨基醇盐酸盐在小鼠中的抗疟数据与伯氏疟原虫的关系。二十七种化合物表现出活性(平均生存时间增加>6天);八个化合物可治愈(IMST>60天)。该表包含PubMed ID,以获取详细信息和综合信息。


TB:BCG / MTB活动

发布者:诺华公司:TB数据3d捕鱼达人:283

PI:Srinivasa Rao

发布时间:2010年9月15日

有氧BCG活性(MIC50)-274种化合物

有氧山地车活性(MIC50)-283种化合物

厌氧BCG ATP活性(IC50)-283种化合物

厌氧MTB ATP活性(IC50)-283种化合物

细胞毒性(CC50)-223种化合物关键词:结核分枝杆菌,牛分枝杆菌,结核


疟疾:JHU JHCCL恶性疟原虫抑制作用

发行人:约翰·霍普金斯-沙利文(2008)3d捕鱼达人:2693

发布时间:2010年6月4日

10 microM时2663种批准药物的抑制百分比

Tb,疟疾:贝叶斯对GSK疟疾流行的预测


发布者:GSK数据贝叶斯模型(Ekins等)3d捕鱼达人:13355

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年5月28日

使用贝叶斯模型(Ekins等人,Mol BioSyst 6:840-851(2010))对GSK疟疾的预后(由Gamo等人,Nature 465:305-310(2010)发布)。

活动截止(220,000型号>0.31, 2.200 modell >-1.37在整个单元格屏幕中被归类为有效。

疟疾:圣裘德儿童研究医院整个细胞疟疾数据集


发布者:圣裘德-疟疾/锥虫生物活性3d捕鱼达人:1524

PI:Kip Kille

发布时间:2010年5月26日

由St. Jude CRH(Guiguemde,W等人,《恶性疟原虫的化学遗传学》,自然465,311-315(2010年5月20日))发表的《自然》杂志的补充数据,包括在主屏幕中测试的1524个结构,以及八种方案:Bland-Altman分析,计算出的ADMET特性,化学生化筛选,灵敏度,协同作用和酶含量测定以及热熔测定。


疟疾:诺华GNF-Pf数据集

发布者:诺华疟疾3d捕鱼达人:5695

发布时间:2010年5月21日

在基于红细胞的感染试验中测试了从MR4获得的恶性疟原虫3d7菌株(对药物敏感)和W2菌株(对氯喹,奎宁,乙胺嘧啶,环鸟嘌呤和磺胺多辛具有抗药性)对所选繁殖的敏感性协会。


供应商:ASINEX新型抗疟疾筛查设备

发布者:ASINEX3d捕鱼达人:1

PI:Mark Parisi

发布时间:2010年5月20日

机密数据量:594个来自ASINEX的新型关联。请参阅开发ASINEX设计的附件。

访问:新的CDD用户-您的注册将通过批准过程发送,然后再授予对数据集的访问权限。现有CDD用户-联系人 [电子邮件 protected]


供应商:ASINEX Tres Cantos(GSK)抗疟亚组

发布者:ASINEX3d捕鱼达人:278

PI:Mark Parisi

发布时间:2010年5月20日

278 ASINEX有效的抗疟疾数据与GSK数据匹配。

可用于立即筛选。相应的数据量是ASINEX专有的和拥有的。有关更多信息,请联系Mark Parisi:电子邮件: [电子邮件 protected]

电话:1-877-ASINEX1

传真:1-336-721-1618


疟疾:Tres Cantos抗疟疾套装(TCAMS)

发布者:GSK反疟疾数据3d捕鱼达人:13471

PI:哈维尔·加莫

发布时间:2010年5月19日

在GlaxoSmithKline筛选库中筛选了大约200万种化合物,从而鉴定出超过13,500种人红细胞中恶性疟原虫增殖抑制剂。这项工作是在西班牙Tres Cantos的Severa Ochoa 2,GlaxoSmithKline的Tres Cantos医学开发园区进行的。

TB:Sacchettini等。等评论-其他抗结核药

发布者:PK3d捕鱼达人:18

发布时间:2010年2月5日

Sacchettini J.C.,Rubin E.J.的图1中未经批准的抗结核药。和Freundlich J.S.毒品与虫子:寻找持久性捕食者结核分枝杆菌,《自然评论微生物学》(Nature Reviews Microbiology),第6卷,第41-52页,(2008年)。


TB:结核小3d捕鱼达人专利数据

发布人:TB专利数据3d捕鱼达人:20775

PI:协作药物发现

发布时间:2010年1月27日

美国专利商标局,欧洲专利局和世界知识产权组织提供的有关结核病研究的结构和专利信息。


TB:Makarov等人,NM4TB联盟

发布者:CDD-肖恩·埃金斯3d捕鱼达人:32

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年1月21日

1,3-苯并噻嗪-4-醚(BTZ)的结构活性相关数据。数据摘自Makarov等人于2009年在Science上发表于NM4TB财团的论文《通过阻断阿拉伯合成来杀死苯并噻嗪酮杀死结核分枝杆菌》(PMID:19299584)。


供应商:TimTec分集

发布者:TimTec3d捕鱼达人:9998

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

筛选10,000种不同化合物的化合物库


供应商:TimTec OGT抑制剂类似物设置

发布者:TimTec3d捕鱼达人:334

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

O-GlcNAc转移抑制剂类似物SET


供应商:中国的调制器TimTec ActiTarg-K

发布者:TimTec3d捕鱼达人:6212

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

ActiTarg-K可以计数6,000多种化合物,这些化合物提供了高价值的药物样3d捕鱼达人筛选库,可确定新型蛋白激酶抑制剂的合成方向

供应商:TimTec天然产物衍生物库

发布者:TimTec3d捕鱼达人:3001

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

TimTec的NDL-3000天然衍生物


供应商:TimTec天然产品库

发布者:TimTec3d捕鱼达人:479

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

TimTec的NPL纯天然产品


供应商:筛选库

出版者:AsisChem3d捕鱼达人:43121

发布时间:2009年10月26日

超过40,000种类似药物的小3d捕鱼达人化合物的集合可用于您的自定义选择。所有化合物的库存量最高为25mg。


供应商:构建基块

出版者:AsisChem3d捕鱼达人:176

发布时间:2009年10月26日

可用于药物发现的化合物的集合。如果没有库存,则所有化合物都将在几周内提供,最大量为10克。


TB:TAACF-NIAID CB2库

出版者:南方研究院3d捕鱼达人:102634

PI:Robert Goldman

发布时间:2009年9月30日

筛选具有抑制结核分枝杆菌菌株H37Rv生长能力的商业(ChemBridge)复合文库的结果。参见PMID:19758845


TB:EthR抑制剂(Willand等)

发布者:CDD-肖恩·埃金斯3d捕鱼达人:5

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2009年9月28日

转录抑制因子EthR的药物样抑制剂。3d捕鱼达人和数据来自Willand et al Nature Medicine 15:537-544(2009)PMID:19412174


VENDOR,ADME:来自一组结构不同的商业药物的基准数据。

发布者:NM4TB:Karlen Group网站3d捕鱼达人:24

PI:安德斯·卡伦(Anders Karlen)

发布时间:2009年6月11日

在瑞典市场上对毒品进行多变量分析,是选择24种毒品协会的物理化学变化形式的基础。选择时考虑了诸如结构多样性,商业可用性,价格以及适当的定量分析技术等因素。对于编译的数据集,测量了跨人Caco-2细胞单层的脂丝性,pKa,溶解度和通透性。我们希望这些数据量可以作为验证新实验技术或计算机模型的基准。它也可以用作开发新计算模型的通用起始数据集。

从以下位置检索的数据:

介绍了为相关性和基准研究建立的结构上变化且可商购的药物数据。

SköldC,Winiwarter S,Wernevik J,BergströmF,EngströmL,Allen R,Box K,Comer J,Mole J,Hallberg A,LennernäsH,Lundstedt T,Ungell AL,KarlénA.

J Med化学2006年11月16日; 49(23):6660-71。


TB:已发表文献的吸收数据

出版者:CDD:结核病策展文学3d捕鱼达人:24

发布时间:2009年5月28日

参考文章中的TB吸收数据

5'-O- [N-(水杨基)氨磺酰基]腺苷的2-三唑取代类似物对铁载体生物合成的抑制:对结核分枝杆菌有效的抗菌核苷。

Gupte,A .; Boshoff,我。威尔逊,D.J .; Neres,J .; Labello,N.P .; Somu,R.V .;邢C;巴里(C. E.); Aldrich,C. C.

J Med Chem(2008)第51卷,第23号,第7495-7507页渗透率数据。


TB:公开文献中的药代动力学数据

出版者:CDD:结核病策展文学3d捕鱼达人:28

发布时间:2009年5月28日

TB药代动力学数据来自已发表的文献资料。 SAR数据包含28个唯一的和常规的关联。

数据包括PubMed引文,目标,测试的细胞和生物,生物利用度,Vm,CEO,Cmax等。


TB:已发表文献的毒性数据

出版者:CDD:结核病策展文学3d捕鱼达人:638

发布时间:2009年5月28日

TB毒性数据来自已发表的文献资料。来自pubMed参考文献的638种独特化合物以及常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引文,靶标,细胞和生物体的testimps,细胞活力,LD50,CC50,MNTD等。


TB:来自公开文献的影响数据

出版者:CDD:结核病策展文学3d捕鱼达人:6768

发布时间:2009年5月28日

结核病效应数据来自已发表的文献资料。来自300多种PubMed参考文献的6771种独特化合物以及常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引文,靶标,细胞和生物测试,MIC,抑制%,EC50-EC100,IC50等。


TB:MLSMR

出版者:南方研究所3d捕鱼达人:214507

PI:Robert Goldman

发布时间:2009年5月8日

由3d捕鱼达人图书馆小3d捕鱼达人知识库(MLSMR)收集的200,000种化合物的多样化集合已于2008年春季提供给Southern Research3d捕鱼达人图书馆筛选中心,以进行针对Mtb H37Rv的初步测试。从该初步筛选中选择最具活性的化合物,并在针对H37Rv的剂量反应测定和使用Vero细胞的细胞毒性对比筛选中以10种浓度进行测试。


疟疾:约翰霍普金斯大学临床协会图书馆

出版者:约翰·霍普金斯-沙利文(2008)3d捕鱼达人:1878

发布时间:2009年4月28日

以10μM的浓度筛选药物。在10%人血清的RPMI 1640培养基中培养对氯喹敏感的3D7或耐多药的Dd2的同步环期寄生虫,并在存在药物和[3 H]-次黄嘌呤的情况下孵育48或96小时。一个96孔板,每孔0.2 mL的寄生虫血药和2-4%的血细胞比容,在48 h时放射性掺入信号为10,000 cpm,在96 h时为20,000 cpm,背景计数小于500 cpm。一式两份进行筛选实验,将抑制百分比报告为两次实验的平均值。


TB:文学研究

发布人:结核病文献数据3d捕鱼达人:49

PI:Ballel等。

发布时间:2009年4月17日

结核病SAR数据是在对结核分枝杆菌有活性的药物的研究中收集的,包括具有已知和未知作用方式的药物(Ballel等人,《新型小3d捕鱼达人合成抗分枝杆菌药》,载于抗菌药物和化学疗法,2005年6月)。使用TubercuList / TBDB /其他目标链接和改进的参考文献更新了4/17。


TB:Sacchettini等人,评论

发布者:CDD-肖恩·埃金斯3d捕鱼达人:14

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2009年2月18日

来自Sacchettini J.C.,Rubin E.J.的表1和表2的第一和第二排抗结核药。和Freundlich J.S.药物与虫子:在寻找持久性捕食者结核分枝杆菌中,《自然》评论《微生物学》,第6期,第41-52页,(2008年)。


供应商:IUPUI-分布式药物发现(D3)公共数据

发布者:IUPUI-D3枚举73K N-AcylAA-OH,-OMe,-NH23d捕鱼达人:48818

PI:M. J. O'Donnell和W. L. Scott

发布时间:2009年1月1日

酰化非天然氨基酸及其甲酯的开放访问虚拟目录。我们鼓励我们的同事与我们交流有关分布式药物发现项目和合成方法的兴趣,《组合化学杂志》(印刷中)中的三篇文章对此进行了介绍。


供应商:ASINEX构建基块

发布者:ASINEX3d捕鱼达人:6745

PI:Mark Parisi

发布时间:2008年12月23日

作为构建基块绘制的,如果您正在考虑潜在客户优化程序,那么我们的构建基块可能恰恰是您所要的。


寄生虫:气味

发布者:CDD-肖恩·埃金斯3d捕鱼达人:228

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月21日

香气的3d捕鱼达人和结构名称数据摘自Roman Kaiser所著的《世界上有意义的香气》,该书由Wiley-VCH 2006出版。3d捕鱼达人编号与书中的编号有关。


TOX:toxcast

出版者:CDD-肖恩·埃金斯3d捕鱼达人:306

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月18日

EPA toxcast bibliotek av föreningar (mestadels bekämpningsmedel) finns på http://www.epa.gov/ncct/dsstox/DataFiles.html

http://www.epa.gov/ncct/toxcast/


FDA批准的TOX:建议的最大每日剂量

出版者:CDD-肖恩·埃金斯3d捕鱼达人:1215

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月10日

FDA数据库包含超过1200种药物的最大建议每日剂量值。该数据集代表以下出版物Matthews,E.J.等人,Current Drug Discovery Technologies,1(1):61-76中使用的一些3d捕鱼达人。 (2004年)


供应商:印度草药疗法对当前护理的传统& Wellness Behov

发布者:Falguni Dasgupta:个人数据编译3d捕鱼达人:37

PI:Falguni Dasgupta

发布时间:2008年10月30日

参照现代观点讨论了印度药用植物及其提取物的传统用法,目的是找到共同点,重新评估主张并根据法律要求创造健康和保健机会以及寻找新药“铅”。


寄生虫:桑德勒-UCSF Celera半胱氨酸蛋白酶抑制剂库

出版者:3d捕鱼达人3d捕鱼达人McKerrow组:1860

PI:Jim McKerrow

发布时间:2008年10月23日

体外克氏锥虫和布氏锥虫寄生虫和特定的酶筛选。


FDA批准:批准的药物

出版者:约翰霍普金斯大学临床化合物库3d捕鱼达人:2815

PI:David Sullivan

发布时间:2008年10月16日

FDA批准了具有明确3d捕鱼达人结构的药物,其中包括Doctors Desk Reference的763个3d捕鱼达人,DrugBank的780个3d捕鱼达人,Orange Book 2007中的1151个3d捕鱼达人和Chris Lipinski博士的FDA列表中的1007个3d捕鱼达人


供应商:ASINEX GPCR重点图书馆

发布者:ASINEX3d捕鱼达人:3502

PI:Mark Parisi

发布时间:2008年10月2日

作为面向GPCR的套装的高质量特殊药物,以折扣价提供给CDD社区。该库包含我们的化学化学专业知识以及我们从文献中识别特权片段并以前所未有的方式组装它们的能力。


GPCR:PDSP Ki数据库

发布者:PDSP Ki数据库3d捕鱼达人:20026

PI:布莱恩·罗斯(Bryan Roth)

发布时间:2008年9月16日

来自NIMH的用于精神药物筛查程序(PDSP)的数据库中的699 GPCR目标值超过47,000 Ki


供应商:ASINEX Synergy库

发布者:ASINEX3d捕鱼达人:25008

PI:Mark Parisi

发布时间:2008年4月26日

ASINEX开发了一个新的高多样性文库,其中富含作为药效基团片段的药物。库的设计基于两种形式的Synergy。第一个是不同技术和面向目标的技术之间的相互关系,第二个涉及多阶段关键中间体(6-9个步骤)的融合,以创建复杂的关联。有关更多信息,请参见下面的PDF文件。


TOX:具有已知毒性特征的结构公共数据

发布者:具有已知毒性特征的结构3d捕鱼达人:135

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2008年3月28日

已知化合物的组织特异性毒性特征与参考文献


混杂抑制剂:Shoichet发表了混杂抑制剂

出版者:Shoichet出版了混杂抑制剂3d捕鱼达人:111

PI:Brian Shoichet

发布时间:2008年3月26日

通过水溶液中有机3d捕鱼达人的自缔合产生“假阳性”的聚集体


TOX:加州大学戴维斯分校-吊床公共数据

发布者:加州大学戴维斯分校-吊床3d捕鱼达人:714

PI:布鲁斯·汉莫克

发布时间:2008年3月17日

可溶性环氧水合酶(sEH)的抑制剂-这些酶具有3个主要功能:解毒,分解代谢和调节信号3d捕鱼达人。


疟疾,锥虫病:圣。裘德公共数据

发布者:圣裘德-疟疾/锥虫生物活性3d捕鱼达人:2426

PI:Kip Kille

发布时间:2008年3月5日

圣裘德儿童研究医院Kip Guy实验室的开放获取结果,其中包括对疟疾和布鲁氏杆菌具有生物活性的HTS


疟疾:Drexel公共数据

出版者:德雷克塞尔大学3d捕鱼达人:195

PI:让-克洛德·布拉德利

发布时间:2008年3月2日

双方之间正在进行的开放数据协作的结果

Drexel(Ugi-4CC产品)和UCSF(动物筛查)。该数据集代表研究人员如何选择公开发布选定结果的一个示例。 (但是,默认情况下,所有组都是私有的。)


疟疾:美国陆军调查

发布者:美国陆军疟疾文献调查3d捕鱼达人:12318

 

发布时间:2008年2月29日

全面收集了抗疟药动物SAR数据,包括化学结构,生物活性数据,药理学数据和毒性数据(最初由美国陆军于1946年作为“疟疾药物研究”发表)


疟疾:PlasmoDB

出版者:UPenn-疟疾文学数据3d捕鱼达人:120

PI:David Roos

发布时间:2008年2月19日

从文献中汇编的疟疾抑制剂的PlasmoDB,包括化学结构,PlasmoDB基因标识符,目标基因名称,以及对恶性疟原虫,间日疟原虫,伯氏疟原虫,yoyoi疟原虫,chabaudi疟原虫,vinckei petteri petteri的引用


疟疾:天然产物(NPPDB)

出版者:国家天然产物研究中心3d捕鱼达人:426

PI:Babu Tekwani

发布时间:2008年2月15日

黄酮天然产物的抗疟疾数据库,包括抗疟疾和细胞毒性数据(密西西比大学,国家天然产物研究中心)


TB:TAACF分析结果

发布人:结核早期药物发现计划3d捕鱼达人:812

PI:Bernard Munos

发布时间:2008年2月12日

公开的812种化合物的库在Alamar Blue全细胞测定中对结核分枝杆菌(H37Rv)的抗菌活性


FDA批准:孤儿药

出版者:已知药物3d捕鱼达人:1721

PI:Christopher Lipinski

发行:26/10/2007

FDA批准的具有指定适应症,赞助商名称和化学结构的药物(如果有)