公共访问

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EDASA COVID-19复合存储库可用于协作

发布者:Andrea Altieri博士分子:2733

发布时间:2020年5月12日

EDASA Scientific,小型MedChem组织(http://www.edasascientific.com)正在COVID-19区域寻找生物伙伴。 EDASA拥有大约2700种化合物,愿意免费提供这些化合物(装运是接收者的责任),如果有任何阳性结果,则准备派遣化学家以优化活性化合物并进一步发展。 EDASA愿意探索对这些化合物中的任何一种进行计算机内修饰,并合成(不收费)有限数量的修饰化合物作为概念证明。所有接收到的数据或部分数据将与IF一起以联合提交的形式发布给科学期刊>3.请注意,所有这些化合物均为EDASA Scientific专有的内部专利,我们已为所有化合物开发了经过验证的合成方案。


COVID-19 Mpro活性片段

发布者:亚历克斯·克拉克分子:1003

发布时间:2020年3月28日

由英国国家同步加速器科学机构Diamond Light Source与Dectris合作提供的晶体结构,发现对Mpro / COVID19具有活性的片段(Diatris的所有MX实验均使用了其检测器)。有关原始数据,请参见: //www.diamond.ac.uk/covid-19/for-scientists/Main-protease-structure-and-XChem/Downloads.html


佩拉拉方舟

发布者:Perlstein实验室分子:56756

PI:Ethan Perlstein

发行:10/27/2019

一个完全开放源代码的基于模型生物的表型筛选数据集,包括针对酵母,蠕虫,果蝇和先天性代谢错误(如溶酶体疾病和先天性糖基化疾病)的人细胞模型中的药物再利用和铅发现筛选。这些数据已在G3期刊的三个案例研究中发表(Lao等,2019 //www.g3journal.org/内容/9/2/413.long)和疾病模型&机制(Iyer等,2019a //dmm.biologists.org/内容/早期/ 2019/09/18 / dmm。040576.长; Iyer等人,2019b //dmm.biologists.org/内容/早期/ 2019/10/19 / dmm。040584.long)。


血清素受体的体外和体内活性

发布者:尼科尔斯分子:84

PI:Dave Nichols

发行:10/14/2019

数据集集中在利用多巴胺或5-羟色胺作为神经递质的大脑系统上。这包括仅对五种通用类型的多巴胺受体(D1-D5)中的一种具有特异性的分子探针,以及关于5-羟色胺5-HT1A,5-HT2A和5-HT2C受体的数据集。这些项目包括系统的结构修饰和药理学测定,目的是鉴定这些受体中配体结合域的结构决定簇。这项工作的主题之一是确定如何将不同化学类别的分子全部容纳在同一受体结合位点内。


多发性硬化症:OL分化

发布者:髓磷脂修复基金会分子:710

PI:塔西·柯林斯

发布时间:2016年10月21日

急性少突胶质细胞分化测定将O4免疫纯化的OPC铺板于5k /孔。铺板后1小时,加入测试物品并将细胞温育四天,随后将细胞固定并对MBP和总核(DAPI)进行免疫染色。通过量化MBP染色/细胞数量(通过DAPI核染色确定)确定OPC分化为OL。化合物的筛选以2种浓度一式四份进行(10& 2 uM; 2 & 0.4 uM; 0.4 &0.08 uM)。将数据标准化为DMSO(0%差异)和40 ng / ml T3(100%差异)。相对于测试物品的EMax确定EC 50。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等。等BMC Res Notes。 2016 Sep 5; 9(1):419或联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多发性硬化症:OL保护

发布者:髓磷脂修复基金会分子:723

PI:塔西·柯林斯

发布时间:2016年10月21日

少突胶质细胞保护测定-生存力(TNF + IFNg)将扩增的OPC以10K /孔接种。铺板后24小时,加入测试物品,在加入测试物品1小时后,加入10U / mlIFN​​-γ/ 1ng / mlTNF-α。孵育2天,添加AlamarBlue并孵育4小时。定量AlamarBlue荧光以读取细胞活力。数据按DMSO(0%活性)和1.1 uM喹硫平(100%活性)定标。有关技术细节,请参阅Rosler等。等BMC Res Notes。 2016年9月5日; 9(1):444联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多发性硬化症:髓鞘形成测定

发布者:髓磷脂修复基金会分子:715

PI:塔西·柯林斯

发布时间:2016年10月21日

皮质髓鞘化测定制备来自E18大脑皮层的细胞,并将其铺板在神经基底培养基中。四天后,媒体切换到MyM媒体。在第5天,添加测试物品,并使髓鞘化进行八天。在体外第13天,固定细胞并对其进行MBP和Olig2免疫染色。通过量化MBP / Olig2 +细胞核染色和MBP形态变化(连续MBP染色的排列-纤维长度)来确定髓鞘形成。 OL分化是通过对MBP密度x面积/ Olig2 +核的定量来确定的。一式两份,每孔4幅图像以2种浓度筛选化合物(5& 1 uM)。将数据归一化至DMSO(0%分化/髓鞘)和DAPT(100%分化/髓鞘)。相对于对1 uM DAPT的反应确定EC50。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等。等,BMC Neurosci。 2016年4月22日; 17:16或联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多发性硬化:HEK293衣霉素保护试验

发布者:髓磷脂修复基金会分子:740

PI:塔西·柯林斯

发布时间:2016年10月7日

HEK-293保护测定

 

将HEK-293细胞(10K /孔)孵育24小时,然后添加测试物品。 1小时后,加入100ng / ml衣霉素。再孵育48小时后,添加AlamarBlue,并在4小时后对荧光进行定量。将数据标准化为DMSO(0%活性)和5 uM guanabenz(100%活性)。相对于测试物品的EMax确定EC 50。联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多发性硬化症:OL毒性筛查

发布者:髓磷脂修复基金会分子:709

PI:塔西·柯林斯

发布时间:2016年10月7日

少突胶质细胞毒性试验(TNF + IFNg)

 

对以10k /孔接种的传代大鼠OPC的毒性测定,与药物孵育2天。孵育4小时后,读数为AlamarBlue荧光。数据显示为相对于DMSO(100%)的存活百分比。用5 ng / ml衣霉素最大杀伤力,可使约15%的细胞存活。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等人的BMC Res Notes。 2016 Sep 5; 9(1):419或联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


绿色溶剂

发布者:亚历克斯·克拉克·桑德伯(Alex Clark Sandbox)分子:117

发布时间:2016年9月20日

绿色溶剂 data, used by the eponymous mobile app (http://molmatinf.com/greensolvents.html). Compiled fr om information published by the ACS Green Chemical Institute and GSK Solvent Guide. Published in http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/sc3000509.


寄生虫:GSK Kineto Box搭配pIC50

发布者:GSK Kineto Box Project(TCAKS)分子:592

PI:皮拉尔·曼萨诺(Pilar Manzano)

发布时间:2016年6月16日

Using whole-cell phenotypic assays, the GlaxoSmithKline high-throughput screening (HTS) diversity set of 1.8 million compounds was screened against the three kinetoplastids most relevant to human disease, i.e. Leishmania donovani, Trypanosoma cruzi and Trypanosoma brucei. Secondary confirmatory and orthogonal intracellular anti-parasiticidal assays were conducted, and the potential for non-specific cytotoxicity 德termined. Hit compounds were chemically clustered and triaged for 德sirable physicochemical properties. The hypothetical biological target space covered by these diversity sets was investigated through bioinformatics methodologies. Consequently, three anti-kinetoplastid chemical boxes of approximately 200 compounds each were assembled. This data-set includes hit compounds and all associated screening results. http://www.nature.com/articles/srep08771


供应商:ASINEX PPI库

发布者:ASINEX分子:8400

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

自2008年以来,ASINEX一直致力于蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)库的设计和合成。最新一代的ASINEX PPI库包含各种大小,框架和形状的分子,范围从片段状实体到被设计为二级的大环衍生物结构模拟物或作为表位模拟物。


供应商:ASINEX Elite库

发布者:ASINEX分子:12960

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

最初的“打击”之后有哪些问题? Asinex通过广泛的ADME分析,易于医学化学修饰的最佳设计以及确保新颖性的IP评估解决了这些问题。


供应商:ASINEX表型库

发布者:ASINEX分子:9840

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

Asinex在内部运行基于靶标和表型的检测,并利用收集到的实验信息来创建基于靶标和多样化的筛查集。通过这种经验,Ainex创建了一个表型筛选集。此集合的过滤器如下:

MW:200-450,clogP:-1.0–7.0,clogD(pH 7.4):-5.0–4.0,Rot.Bond:0-10,HA:1-10,HD:1-5,TPSA:15-135 A ,N + O:2-10,HAC:19-34,偶极子:0.3–3.30,SHP2:0.240–0.450。


供应商:ASINEX多样性库

发布者:ASINEX分子:9968

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

多样性仍然是一种强大的筛选工具,尤其是在药物发现的早期“探针”阶段。在创建此集合时,Ainex应用了计算工具以确保正确表示化学空间,同时还结合了其“精英”和“生物设计”概念的元素。


供应商:ASINEX BioDesign

发布者:ASINEX分子:8041

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

ASINEX的BioDesign方法将已知药理相关天然产物(例如生物碱和其他次生代谢产物)的关键结构特征整合到可合成的可行药物化学支架中。


目录:分布式药物发现(D3)-IUPUI

发布者:IUPUI-D3 Enum 73K N-AcylAA-OH,-OMe,-NH2分子:73234

PI:M. J. O'Donnell和W. L. Scott

发布时间:2016年2月24日

免费的开放式虚拟目录/图书馆>73,000个分子:(a)N-酰基非天然α-氨基酸,(b)N-酰基非天然α-氨基酸的甲基酯,和(c)N-酰基非天然α-氨基酸的伯酰胺。目录中的分子是通过基于与100 R1X等效的甘氨酸阴离子的固相组合烷基化,然后与100 R2CO2H进行N-酰化和树脂裂解(分别为TFA,MeOH / Et3N或TFA)进行枚举而获得的。 2009年1月1日发布了48,818个分子的旧数据集(a和b组以及R1X和R2CO2H输入)。我们鼓励同事就D3项目的兴趣与我们进行沟通(电子邮件: [电子邮件 protected]<mailto:[电子邮件 protected]> or [电子邮件 protected]<mailto:[电子邮件 protected]>)。参考文献:J. Comb。化学2009,11,3-13,14-33,34-43; J.Org。化学2014,79,3140-51; J.化学教育。 2015,92,819-26。


疟疾:5种恶性疟原虫激酶与GSK TCAMS的生化筛选

发布者:格里高里·克劳瑟(Gregory J.Crowther)分子:13451

PI:Gregory J. Crowther

发布时间:2016年2月3日

筛选了约13,500种细胞活性化合物对五种不同蛋白激酶的活性。在恶性疟原虫钙依赖性蛋白激酶1和4(CDPK1 / PF3D7_0217500和CDPK4 / PF3D7_0717500),促分裂原相关蛋白激酶2(MAPK2 / MAP2 / 113 / PF3D7)的生化分析中筛选了GlaxoSmithKline的Tres Cantos抗疟疾药物套装(TCAMS) 6(PK6 / PF3D7_1337100)和蛋白激酶7(PK7 / PF3D7_0213400)。新型强效抑制剂(IC50<对于三种激酶:CDPK1,CDPK4和PK6发现1 µM)。 PK6抑制剂是目前针对该酶发现的最有效的抑制剂,值得进一步研究。


公共暗物质化合物

出版者:暗物质化合物:139352

PI:吉列尔莫·莫拉莱斯

发布时间:2015年12月7日

诺华发现,至少在诺华100次检测中已经测试了803,990种化合物,而112,872种化合物没有活性(占14.0%)。 NIH数据分析表明,在至少100种测定中测试了363,598种化合物,其中131,726种化合物无效(36.2%)。

安妮·迈·瓦瑟曼(Anne Mai Wassermann),尤金·伦肯(Eugen Lounkine),多米尼克·霍普夫纳(Dominic Hoepfner),盖勒·勒高夫(Gaelle Le Goff),弗雷德里克·金(Frederick J King),克里斯蒂安·斯图德尔(Christian Studer),约翰·佩尔帖(John M Peltier),梅利莎·L·格里波(Melissa L Grippo),薇薇安·普林德尔(Vivian Prindle),陶剑石,安斯加·舒芬豪尔(Ianin M Wallace),陈妮(Shanni Chen),菲利普·克拉斯特(Philipp Krastel),阿曼达·科沃斯(Amanda Cobos) -Correa,Christian N Parker,John W Davies&梅尔·格里克(Meir Glick)。暗化学物质是发现药物线索的有前途的起点。 《自然化学生物学》 2015年第1期。 11,pp。958–966(doi:10.1038 / nchembio.1936)


ADME:AZ公开ChEMBL数据

发布者:AZ Public ChEMBL数据分子:5799

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2015年10月5日

在阿斯利康确定的一组公开披露的化合物的体外DMPK实验和理化数据。为测定提供的参考举例说明了用于产生数据的实验程序。

//www.ebi.ac.uk/chembl/doc/inspect/CHEMBL3301361% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole guinea pig plasma at 37C for >5hrs. Method 德scribed in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole dog plasma at 37C for >5hrs. Method 德scribed in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole rat plasma at 37C for >5hrs. Method 德scribed in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole mouse plasma at 37C for >5hrs. Method 德scribed in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.Intrinsic clearance measured in human hepatocytes following incubation at 37C. Experimental range <3 to >150 microL/min/1E6 cells. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2010, 24, 1730-1736.Most basic pKa value (pKa B1) 德termined by absorption and potentiometric titration using standard methodology fr om Sirius Analytical. Experimental range Bases: >= 2.Second most acidic pKa value (pKa A2) 德termined by absorption and potentiometric titration using standard methodology fr om Sirius Analytical. Experimental range Acids: <= 11.

使用Sirius Analytical的标准方法通过吸收和电位滴定法确定的第三最基本pKa值(pKa B3)。实验范围基准:>= 2.

第二最基本的pKa值(pKa B2)是使用Sirius Analytical的标准方法通过吸收和电位滴定法确定的。实验范围基准:>= 2.

使用Sirius Analytical的标准方法,通过吸收和电位滴定确定最酸性的pKa值(pKa A1)。实验范围酸:<= 11.


PDB配体

发布者:蛋白质数据库(PDB)分子:16826

PI:Dale R. Cameron,博士,M.C.I.C.,P.Chem。

发布时间:2015年8月3日

从PDB中提取配体信息,进行过滤以除去“聚合物”和其他相关的“非游离”配体以及金属或金属结合配体。可能会在没有警告的情况下更新过滤过程。数据按原样提供,没有其他管理或纠错。到PDB的链接由RCSB PBD提供,可以引用为

H.M. Berman,J.Westbrook,Z.Feng,G.Gilliland,T.N。 Bhat,H.Weissig,I.N.辛达洛夫(PE) Bourne(2000),蛋白质数据库核酸研究,28:235-242。

请向保管库管理员报告断开的链接,对其他数据的请求等。


EBOLA:埃博拉病毒的小分子抑制剂

发布者:纳迪亚的沙盒分子:55

PI:Nadia Litterman博士

发布时间:2015年2月2日

这个共享的数据集包含来自文献(截至2015年1月)的55个小分子,这些小分子具有针对埃博拉病毒和各种疾病模型的体外和/或体内活性。我们包括了经验丰富的药物化学家的评估以及PAINS过滤的结果。 (这项工作已由Nadia Litterman,Christopher Lipinski和Sean Ekins提交给F1000Research出版)。


供应商:Synthonix-建立更好的债券

Published By: http://www.synthonix.com     Molecules: 10286

发布时间:2015年1月2日

Synthonix通过提供10286个构建基块的目录,帮助药物化学家突破药物发现的界限,使他们能够探索更具挑战性的化学空间,并扩大治疗世界慢性病和可治愈疾病的潜在重要治疗靶点的范围。 Synthonix,Inc:919-875-9277;普通电子邮件: [电子邮件 protected]; Synthonix Ltd(欧洲办事处):办公室:+44 1223 597934;电子邮件: [电子邮件 protected]


问题:NIH化学探针

发布者:Probes Vault分子:319

PI:Christopher Lipinski

发布时间:2014年11月12日

美国国立卫生研究院(NIH)在壁画内和学术中心资助了HTS广泛的工作,估计超过5.76亿美元,用于通过分子库筛选中心网络(MLSCN)和分子库来鉴定小分子化学探针或工具化合物图书馆探针生产中心网络(MLPCN)。对于要被选作探针的化合物,已经根据效价,选择性,溶解性和可利用性的组合使用了各种定义。迄今为止,由美国国立卫生研究院资助的学术筛选中心已经发现了300多种化学探针。该集合包括探针结构,靶标,抗靶标,IC50值和其他参考。它还包括各种药物相似性度量,包括Chris Lipinski博士分配的“理想分数”,如“化学探针专家评估的计算预测和验证”中所述。 Litterman NK,Lipinski CA,Buinin BA,Ekins S.J Chem Inf Model。 (2014年)


供应商:Azepine Ltd.积木收藏

发布者:Azepine Ltd.分子:600

PI:朱莉娅

发布时间:2014年10月8日

600个积木,现货供应,价格具有竞争力。联系 [电子邮件 protected]


NEU-CSIC-GSK激酶靶向的HTS

发布者:东北大学Pollastri实验室分子:78

PI:Michael Pollastri

发布时间:2014年9月25日

该数据集包含由东北大学(Pollastri实验室),CSIC(Navarro实验室)和葛兰素史克·特雷斯·坎托斯实验室(发展中国家DPU疾病)合作进行的高通量筛选结果。本文是Diaz等人的PLoS-NTD:

 

DOI:10.1371 / journal.pntd.0003253

 

请联系 [电子邮件 protected] 有问题


供应商:Vitas-M实验室库存HTS系列

发布者:Vitas-M Laboratory分子:388375

发布时间:2014年7月11日

维塔斯M实验室有限公司存有大约40万个HTS化合物分子。它们都可以以各种形式快速交付,包括毫克,微摩尔,干粉,DMSO溶液和干膜。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Vitas-M实验室构建基块

发布者:Vitas-M Laboratory分子:33297

发布时间:2014年7月10日

维塔斯M实验室有限公司有机构建基块的集合包含超过33000个已识别和测试的项目。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Vitas-M实验室支架

发布者:Vitas-M Laboratory分子:2898

发布时间:2014年7月8日

维塔斯M实验室有限公司脚手架的收藏(杜鹃花项目)。合成类似毒品的小型图书馆的先进想法。获得无其他供应商提供的绝对新颖的化合物是最好的选择。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Vitas-M实验室碎片

发布者:Vitas-M Laboratory分子:18631

发布时间:2014年7月8日

维塔斯M实验室有限公司碎片收集(通过“ 3条规则”的化学物质和其他特殊过滤器),用于基于碎片的药物发现。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Life Chemicals- GPCR库

出版者:生命化学(Life Chemicals)分子:15948

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Similarity/pharmacophore search was based on Topomer Search prediction provided by Sybyl-X. First step - a similarity search assumed a comparison of 恩tire stock compounds to known inhibitors 德rived fr om BindingeDB and ChemblDB. Second step - generation of 3D structures of known inhibitors and their co-alignment. This chemical spatial space was used as a template for fitting of the rest of "similar" compounds. However this is method was 德signed for "cherry-picking" and an alternative library can be done with virtual screening methods (all screening models a ready and proved with training sets) against such receptors - adenosine, chemokine, dopamine, gaba-, histamine, muscarinic, opioid, sphingosine. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学-相似激酶

发布者:生命化学(Life Chemicals)分子:62467

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Similarity search using MDL public keys and the Tanimoto similarity cut-off of 90%. Almost 25K reference compounds that tested active in 168 biological assays (more than 100 different kinase targets), were used for similarity search. All this compounds could be screened against more specific target up to the customer order. http://www.lifechemicals.com/


供应商:Life Chemicals-激酶对接

发布者:生命化学(Life Chemicals)分子:15174

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Kinase library was prepared basing on virtual docking in a Sybyl 恩vironment. For this purpose a set of kinase structures' binding sites (about 20) were aligned and analyzed. Such superposed sites were used for structure-based pharmacophore modelling via Unity module fr om Sybyl-X. After all preparation an 恩tire 3D stock was screened against this multi-pharmacophore model and in the 恩d a top-ranking was performed. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学-核受体

发布者:生命化学(Life Chemicals)分子:9896

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Life Chemicals. Virtual docking and similarity/pharmacophore search. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学-CNS库

发布者:生命化学(Life Chemicals)分子:16535

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

CNS filters which are 德scribed in the literature were used as a sieve for our 恩tire stock. As 它 was shown the only compounds with such parameters can have appropriate characteristics for nervous tissue permeability. All 德scriptors were obtained fr om Spreadsheets and Volsurf modules of Sybyl. (MW 200 = 350 cLogP =< 3.6 H-Bond Acceptors =< 8 H-Bond Donors =< 5 tPSA =< 120 Rotatable Bonds =< 5 LogBB1 = -3.0 to 1.0) http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学产品-类似于天然产物的图书馆

发布者:生命化学(Life Chemicals)分子:7808

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

First method was based on statistical anlysis of 德scriptors. Previously a large database of NPs was analyzed to study NP scaffolds by arranging them in the form of a tree. Thus analysis of property distribution of more than 130 000 NP structures as well as identification of substructures typical for particular classes of natural compounds were carried out to generate a set of fr agments usually present in natural compounds. This method was tested on CRC Dictionary of Natural Products (DNP) and synthetic molecules (SMs). Another method is based on scaffold similarity assessment. The number of atom signatures (from fr agmnets) generated for a molecule is equal to the number of atoms that make up the molecule. Every atom signature independently represent a structural feature/fragment of the molecule, and an individual score for 它 is calculated. higher number of atoms fr om gaining higher score. To reproduce such experiment we used an implemented module Chemistry Development Kit in CDK-Taverna 2.0. It contains a NP-Likeness scorer v1.4.1 which calculates Natural Product(NP)-likeness of a molecule, i.e. the similarity of the molecule to the structure space covered by known natural products. All results were scored and ranged fr om -3 to +3. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学品-筛选产品

发布者:生命化学(Life Chemicals)分子:371998

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Carefully 德signed, novel, drug-like small molecules with Lipinski rule of 5 and the only reason for 德viation fr om the set of this parameters is a unique scaffold or non-standard chemistry. It is ready for application of medicinal chemistry filters like PAIN or any target-focused filters (solubility, permeability, BBB). http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学品-具有保证溶解度的碎片

发布者:生命化学(Life Chemicals)分子:8241

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Fragment compounds were selected by filtering of 恩tire LC-stock with modified “Rule of three”. Fragments have been tested for solubility in analytical laboratory. Solubility is guaranteed at 200mM concentration in DMSO, and 75% of fr agments are soluble in pH7.5 buffer at 1mM concentration. http://www.lifechemicals.com/


TB:文献中的体内小鼠功效

发布者:TB体内数据2分子:778

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2014年4月10日

展望未来:预测小分子与结核分枝杆菌的体内功效。在疾病的动物模型中,将疾病的体外选择和翻译转化为具有体内活性的分子是一项挑战,需要花费大量时间和金钱。我们演示了使用包含773种化合物的机器学习分类模型(贝叶斯,支持向量机和递归分区)从体内有活性和无活性的化合物中进行学习。贝叶斯模型预测该模型中未包含的11种其他体内活性物质中的8种作为外部测试集。因此,治疗70年的Mtb数据可以提供统计上可靠的计算模型,以将资源集中在体内活性的小分子抗结核药上。这突显了在其他疾病中进行体内测试的经济有效的预测因子。 PMID:24665947


TB:TB Mobile 2的数据

发布者:TB Mobile 2.0更新分子:79

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2014年3月19日

从最新论文中选择了79种化合物,其中TB具有一个或多个目标。该应用程序的版本2已添加到TB Mobile。使用另外20个分子作为测试集。论文已提交。


寄生虫:曼氏血吸虫的MMV疟疾框屏

发布者:CDIPD Vault分子:400

发布时间:2013年11月6日

Whole-organism screens of Schistosoma mansoni somules (post-infective larvae) and adults with the 400 compounds that comprise the MMV Malaria Box (http://www.mmv.org/malariabox). Only those Malaria box 'Drug-like' compounds yielding the most severe phenotypes vs. somules were tested against adults. The data are also uploaded to ChEMBL. Contact Conor Caffrey, Center for Discovery and Innovation in Parasitic Diseases (www.cdipd.org/), UCSF ([电子邮件 protected])。


激酶:激酶的催化活性(Theonie Anastassiadis在《自然生物技术》中的出版物)

发布者:激酶催化活性分子:178

PI:Theonie Anastassiadis

发布时间:2013年8月30日

激酶催化活性

Nature Biotechnology 2011年10月30日; 29(11):1039–1045。测试的文库包含178种已知抑制所有主要蛋白激酶亚家族激酶的化合物。为简单起见,所有化合物在10 µM ATP存在下的浓度为0.5 µM。尽管捕获的这些化合物的平均IC50接近其主要目标66 nM,但仍选择了0.5 µM,以捕获较弱的脱靶抑制活性。每个激酶抑制剂对均进行了两次测试,结果表示为平均底物磷酸化百分比溶剂控制反应的量(以下称为“剩余激酶活性”)。给出了每个激酶抑制剂对的平均剩余激酶活性。激酶活性数据表示为与媒介物(二甲亚砜)反应相比,测试样品中剩余激酶活性的百分比。


结核病:更新药物和潜在客户的目标

发布人:结核病:具有靶点的药物和铅-更新分子:38

发布时间:2013年6月14日

TB的最新文献中具有已知目标的已发表化合物已被用作TB Mobile App的更新

激酶:GSK发表的激酶抑制剂套装(PKIS)

发布者:Kinome2分子:364

发布时间:2013年6月6日

GSK已发布的激酶抑制剂套装(PKIS)是一套367种蛋白激酶抑制剂,已针对蛋白激酶家族活性进行了注释,可用于公共筛选工作。可以在下面显示的链接中找到有关筛选集的详细信息。 ChEMBL数据库一直是该组生物测定数据的“理想去处”站点。本着改善对重要数据的访问的精神,我们收集了ChEMBL善意提供的PKIS数据,并对其进行了处理,以便可以在此处通过协作药物发现(CDD)站点进行访问(就像我们之前为激酶SARfari数据库)。

转移到CDD可以使数据更加“医学化学家”友好。我们还整理了数据集。例如,实际上只有364种化合物(某些重复是由于盐的形式或同一分子的替代名称)。我们还尝试在可能的情况下标准化目标名称(例如,对于UNC数据集,激酶IKKA,IKKB和IKKE被称为IKK-alpha,IKK-beta,IKK-epsilon)。并不是说我们很完美……我们也感谢对我们的数据集所做的任何更正!

总而言之,已经针对225个目标(0.1和1 uM)测试了364种化合物。在此数据集中,只有一个协议,但是在一个读数中列出了225个目标。浓度也是一种读数,因此很容易将搜索限制在运行于1和/或0.1 uM的屏幕上。

链接:

1)有关GSK PKIS的更多信息

http://www.maggichurchouseevents.co.uk/bmcs/Downloads/CBDD%20-%20Zuercher%20Bill.pdf

http://www.chordomafoundation.org/wp-content/uploads/2013/04/2013-Flanagan-Drewry.pdf

http://chembl.blogspot.co.uk/2013/05/pkis-data-in-chembl.html

2)CDD上的先前ChEMBL激酶数据

//www.aslsw.com.cn/buzz/2013/04/04/kinome-sar-for-collaborative-drug-discoverers/

激酶:ChEMBL激酶SARfari化合物& BioAssay Data


发布者:CDD Vault分子:54211

PI:CDD

发布时间:2013年3月27日

ChEMBL上可利用的宝贵资源是Kinase SARfari,“一种专注于激酶的综合化学基因组学工作台。该系统整合并链接了激酶序列,结构,化合物和筛选数据。该数据库是非常有用的资源,可在广泛的测定中针对大量激酶针对激酶活性化合物提供大量SAR数据,其中许多是从文献中手动提取和整理的。为了使此数据在CDD界面中可用,我们采用了Kinase SARfari的核心表,并将其与ChEMBL数据库中的另一个关键表合并,从而提供了一个字段,该字段描述了每个记录中使用的测定法,其细节比本地SARfari中的信息更为详尽。 。现在,我们可以通过CDD界面使用此合并的数据集。详细的体外数据可用于400种激酶。此外,还发布了体内功能以及ADMET数据。


TB:ARRA

发布人:TB ARRA分子:1924

PI:鲍勃·雷诺兹

发布时间:2013年3月15日

来自SRI(Bob Reynolds)和Scott Franzblau小组的数据-Ekins等人提交的论文。

以前的SRI筛选中的命中被用于在供应商库中寻找相似的化合物,并在一系列接受筛选的新药物发现候选物筛选面板中进行聚类和体外测试。这些化合物还用作先前生成的具有生物活性和细胞毒性信息的贝叶斯模型的测试集。


TB:GSK

发布人:TB GSK分子:177

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2013年2月8日

来自Ballell等人的论文ChemMedChem 2013的补充数据,“为开放源代码药物的研究提供动力:177种抗结核的小分子药物”

Original datasets are hosted at //www.ebi.ac.uk/chemblntd only M.tb data is shown here but more BCG data is available at ChEMBL


三角锥:南美锥虫病文献化合物

发布者:查加斯公共数据分子:531

发布时间:2012年12月21日

针对已发表的文献中体外或体内针对克鲁氏锥虫测试的531个分子,对化合物的结构和文献参考进行了整理。


TRYPANOSOME:针对人类非洲锥虫病(HAT)的特定化学系列的优化

发布者:Chagas Public Data分子:5559

发布时间:2012年12月12日

SCYNEXIS Inc, as a member of the DNDi HAT Lead Optimization Consortium 德veloped and screened 4926 compounds for activity against T. brucei. Compound structures and in vitro activity data against T. brucei brucei are included. Cytotoxicity data and activity against the related eukaryotic parasites T. brucei rhodesiense, L. donavani, and P. falciparum for a subset of 34 compounds. All of the reported compound series are no longer in 德velopment for HAT as they were found to have poor selectivity or properties incompatible with in vivo activity. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1011-hat-001


TRYPANOSOME:用于治疗南美锥虫病的DNari-芬那莫系列的优化

发布者:Chagas Public Data分子:743

发布时间:2012年12月9日

The DNDi Lead Optimization Consortium, including Epichem, Murdoch University, and CDCO, 德veloped and screened an SAR series based on the plant fungicide fenarimol. DNDi made public compound structures, T. cruzi activity data, and L-6 cell toxicity data for 743 compounds fr om this series in ChEMBL-NTD. Compounds and biological assay data are included here in CDD Public. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1012-chagas-001


TRYPANOSOME:广泛的主要HTS来识别T.Cruzi复制的抑制剂

发布者:Chagas Public Data分子:303230

发布时间:2012年12月6日

The Broad Institute performed a high-throughput screen of 303,224 compounds in duplicate in the recombinant Tulahuen strain of Trypanosoma cruzi stably expressing beta-galactosidase reporter co-cultured with host cell, mouse fibroblast NIH3T3. Of the 4,394 hits, 4,063 were further evaluated for inhibitory activity and host cell toxicity. Finally, 27 compounds were selected as potential probe compounds and further validated. Data fr om the primary screen and subsequent secondary assays were 德posited PubChem. Chemical compounds and biological assay data for the primary screen and six secondary assays fr om PubChem are included here in CDD Public. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21634083


TB:Guzman等人,M.tb。 MurE连接酶抑制剂

发布者:CDD-肖恩·埃金斯(Sean Ekins)分子:8

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2012年12月6日

来自以下结核病出版物的基于全细胞和靶标的筛选数据:Guzman JD,Gupta A,Evangelopoulos D,Basavannacharya C,Pabon LC,Plazas EA,MuñozDR,Delgado WA,Cuca LE,Ribon W,Gibbons S,Bhakta S. J抗微生物化学试剂。 2010年10月; 65(10):2101-7。哥伦比亚植物天然产物的抗结核病筛查:3-甲氧基正十二烷,结核分枝杆菌的MurE连接酶抑制剂。


供应商:NIH Clinical Collection 2阵列(281个分子)

发布者:NIH Clinical Collections分子:281

PI:项目经理:Mei Steele

发布时间:2012年1月1日

NIH Clinical Collection 2是具有281个小分子的镀膜阵列,这些小分子在人类临床试验中已有使用历史。该馆藏是由美国国立卫生研究院(NIH)通过分子图书馆路线图倡议组织的,作为其使命的一部分,以使复合筛选能够在生物医学研究中使用。


供应商:NIH Clinical Collection阵列(446个分子)

发布者:NIH Clinical Collections分子:446

PI:项目经理:Mei Steele

发布时间:2012年1月1日

NIH Clinical Collection是446个小分子的电镀阵列,在人类临床试验中已有使用历史。该馆藏是由美国国立卫生研究院(NIH)通过分子图书馆路线图倡议组织的,作为其使命的一部分,以使复合筛选能够在生物医学研究中使用。


TB:具有目标的药物和潜在客户-移动应用中使用的数据

发布者:用于移动应用程序的SRI分子和靶标分子:707

发布时间:2012年10月23日

精选了具有体内必需性的针对结核病靶标的数据

来自TBDB,Biocyc,Metacyc,PDB和Pubmed的信息以及

斯坦福研究所的Malabika Sarker的其他参考。

约翰·霍普金斯大学的Gyanu Lamichhane提供了必要条件

information.ref.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22477069

Explore this dataset on mobile: //itunes.apple.com/app/tb-mobile/id567461644


毒物:按肝毒性分类的药物和化学品

发布者:CDD Vault分子:83072

PI:CDD

发布时间:2012年7月16日

辉瑞(Hu 2008)以前已经组装了一种基于肝毒性临床数据分类方案的药物和化学药品清单,目的是评估体外人肝细胞成像测定技术(HIAT),结果与75%的一致性临床肝毒性。通过贝叶斯模型在计算机模拟预测中使用了不会或不会引起药物诱发的肝损伤(DILI)的相同化合物数据集以及分子描述符。


TB:具有针对TB的全细胞活性的SRI分子

发布者:SRI Group Vault分子:23

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2012年4月24日

在Pharm Res中评估了分子。 2012年4月4日。PMID:22477069

结合化学信息学方法和途径分析,鉴定具有抗结核分枝杆菌全细胞活性的分子。

Sarker M,Talcott C,Madrid P,Chopra S,Buinin BA,Lamichhane G,Freundlich JS,Ekins S.


疟疾:MMV疟疾框

发布者:公众:疟疾信箱分子:400

发布时间:2012年3月29日

Molecules fr om MMV Malaria Box, ChEMBL-NTD (//www.ebi.ac.uk/chemblntd) : MMV Malaria Box, Simon Macdonald, Paul Willis, Paul Kowalczyk, Thomas Spangenberg, Jeremy Burrows and Tim Wells. Medicines for Malaria Venture (MMV), PO Box 1826, 20, rte 德 Pré-Bois, 1215 Geneva 15, Switzerland and SCYNEXIS Inc. P.O. Box 12878 Research Triangle Park, North Carolina 27709-2878 USA.

已在体外针对3D7(氯喹(CQ)敏感但恶性疟原虫对磺胺多辛的抗性菌株)筛选了疟疾盒子中的所有化合物,并在人胚胎肾细胞系(HEK-293)上进行了细胞毒性试验。数据以恶性肿瘤数据的nM EC50表示。


ADME:ADMEdata.com-高质量ADME数据的商业存储库

发布者:G2 Research ADMEdata.com分子:1760

PI:乔治·格拉斯

发布时间:2012年1月13日

实例:Caco-2渗透性,5pH值时的平衡溶解度,蛋白质结合人,蛋白质结合大鼠,兔肠渗透性,人血浆分配&分血器。有关完整的数据集和模型,请直接联系Pharm.D。的George Glass。博士学位 [电子邮件 protected] (通过CDD分发)


供应商:孔砌块集合

发布者:CDD Vault分子:29241

PI:CDD

发布时间:2012年1月13日

Porse File Chemical Co.致力于开发用于药物发现的定制新型化合物合成,并提供具有竞争力的价格和优良品质的广泛产品系列。当前的化合物是吗啉,哌啶,哌嗪,嘧啶,氨基酸和API家族中1554种新的化合物和结构单元的选定子集。 www.porsefinechemical.com, [电子邮件 protected] + 86-20-28069055


寄生虫:曼氏血吸虫血吸虫病:微源光谱& Killer Collections

发布者:Brian Suzuki的Sandbox分子:119

发布时间:2011年10月5日


曼氏血吸虫血吸虫:微源光谱的表型筛选。& Killer Collections.

PI:Conor R. Caffrey

发布时间:2011年10月5日

CDD:公开数据119次点击

作为在UCSF桑德勒药物发现中心发现新的抗寄生虫药物的重新定位(重新定位)策略的一部分,我们针对导致传染性热带病的血吸虫病开发了部分自动化的全生物(表型)筛选,血吸虫病。我们筛选了上述集合中的1,260种化合物,包括药物,类药物化合物,天然产物和其他化合物。我们报告使用简单的描述符表达曼氏血吸虫的幼虫阶段(血吸虫)的表型改变,以传达寄生虫对复合污染的多重和动态响应。目前正在对表型反应进行完全定量。呈现的数据仅与“命中”化合物有关;可以从Microsource Discovery Systems Inc.获得相应集合中化合物的完整列表。 [电子邮件 protected] 更多细节。血吸虫病的药物发现:通过中通量表型筛选在已知药物库中鉴定的命中和先导化合物。阿卜杜拉MH,鲁埃拉斯DS,沃尔夫B,Snedecor J,林KC,徐F,伦斯洛AR,威廉姆斯J,麦考罗JH,卡弗里CR。 PLoS Negl Trop Dis。 2009年7月14日; 3(7):e478.PMID:19597541


TB:SRI激酶库表型筛选

发布者:CDD Vault分子:23823

PI:CDD

发布时间:2011年8月29日

激酶靶点正在针对除

癌症,包括免疫和代谢以及病毒,寄生虫,

真菌和细菌。特别是最近

对分枝杆菌中激酶和ATP结合靶标的兴趣

结核病以鉴定抑制剂和潜在药物

当前药物方案未靶向的必需蛋白。

在此,我们报告了针对目标人群的高通量筛选结果

基于当前激酶抑制剂支架和已知激酶结合位点设计的大约26,000种化合物的文库本文提供的表型数据可以构成基础,用于选择支架/化合物以进一步针对结核分枝杆菌中的特定激酶或其他ATP结合靶标进行酶促筛选,基于对整个细菌的体外表观活性.PMID:21708485

结核病(爱丁堡)。 2011年6月25日。[Epub提前发行]

版权所有©2011 ElsevierLtd。保留所有权利。

有关更多详细信息,请联系Melinda Sosa: [电子邮件 protected]

高通量筛选基于激酶抑制剂的文库

抗结核分枝杆菌H37Rv的支架。

雷诺(Reynolds)RC,安南斯坦(Ananthan S),法莱奥莱(Ea Faaleolea E),霍布拉斯(Hobrath)合资,K CD,马多克斯(Maddox)C,拉斯穆森(Rasmussen)L,索萨(Sosa)密西西比(Thammasuvimol E),白EL,张W,塞克莉斯(Secrist)JA第三名。

资料来源:南方研究所,第九大道南2000号,

美国伯明翰市35205。


FDA批准:NCGC药品收藏(NPC)V1.1.0

发布者:NCGC Pharmaceutical Collection NPC V1.1.0分子:14579

PI:Noel Southall

发布时间:2011年8月8日

NCGC药品收藏:全面的临床批准药物资源,可实现再利用和化学基因组学。 Huang,R.,Southall,N.,Wang,Y.,Yasgar,A.,Shinn,P.,Jadhav,A.,Nguyen,D.,Austin,C.Sci Transl Med 2011年4月27日。第3期,第80页。 80ps16。

http://stm.sciencemag.org/content/3/80/80ps16.abstract


供应商:带有定价信息的BioBlocks目录

发布人:BioBlocks分子:2971

PI:道格·墨菲

发布时间:2011年8月3日

2989种化合物。

BioBlocks提供了超过2200种支架,构建基块和片段的重点收藏,这些支架已被预先鉴定为药物成分。这些化合物中的大多数是由BioBlocks独特提供的,已发现其应用范围从药物开发的中间体到肽化学中的氨基酸替代物。

有关BioBlocks构建块的最新详细信息,请访问www.bioblocks.com。


TOX:药物性肝损伤数据(DILI)

发布者:BBB分子:519

发布时间:2011年4月29日

药物性肝损伤数据-训练集是Jim Xu的实验数据,测试集代表文献数据。

发表在《药物代谢研究》上。 2010 Dec; 38(12):2302-8。 Epub 2010年9月15日。基于预测性配体的贝叶斯模型用于人类药物诱发的肝损伤。

埃金斯S,威廉姆斯AJ,徐继杰。

TB:体内必需基因的目标数据库


发布者:SRI TB目标数据库分子:314

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2011年4月21日

针对结核病靶标的数据具有来自TBDB,Biocyc,Metacyc,PDB和Pubmed的体内必需性信息,以及斯坦福研究所的Malabika Sarker博士整理的其他参考资料。约翰·霍普金斯大学的Gyanu Lamichhane博士因提供必要性信息而倍受赞誉。

**请注意,没有与该数据集相关的小分子**


供应商:Enamine代表性多元筛选库

发布者:恩胺分子:200000

PI:Dmytro Mykytenko

发布时间:2011年4月12日

最初为合作药物生成了200K多样化筛选库

全球最大的商业筛选化合物库存中的发现用户

(超过170万个物种)。该库具有独家的类药物化合物和精致的ADME

属性。我们的高品质复合材料可以精心挑选并立即提供

不同的格式。


FDA批准的重新定位:使用HTS方法重新定位的药物

发布者:体外再利用分子:109

发布时间:2011年3月18日

使用HTS方法鉴定出新用途的药物。该表大大扩展了先前发布的版本“ Ekins S,Williams AJ,Krasowski MD,Freundlich JS。对已批准的罕见和被忽视疾病的药物进行计算机重新定位。今日药物Discov。2011年3月1日。PMID:21376136 doi:10.1016 / j.drudis .2011.02.016该表列出了分子,旧用途/目标,新用途/目标,如何发现和引用。

缩写:CCR5,趋化因子受体5; DHFR,二氢叶酸还原酶; DOA,滥用药物,FDA,食品和药物管理局; GLT1,谷氨酸转运蛋白1; HSP-90,热激蛋白90; JHCCL,约翰·霍普金斯大学临床化合物图书馆; Mtb,结核分枝杆菌; NK-1,神经激肽-1受体; OCTN2。


FDA批准的重新定位:孤儿指定的产品

发布者:罕见疾病的新用途分子:76

发布时间:2011年3月18日

FDA Table 2 - fr om the FDA resource, the rare disease research database (RDRD), which lists Orphan-designated products (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) with at least one marketing approval for a rare disease indication. This data was analyzed by Ekins and Williams (paper submitted).


FDA批准的重新定位:孤儿指定的产品

发布者:罕见疾病的新用途分子:105

发布时间:2011年3月18日

FDA Table 1 - fr om the FDA resource, the rare disease research database (RDRD), which lists Orphan-designated products (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) with at least one marketing approval for a common disease indication.

FDA没有将数据与分子结构相关联。


供应商:科罗拉多州药物发现中心试点图书馆

发布者:C2D2公共分子:2240

PI:Greg Miknis,副总监

发布时间:2011年3月7日

该文库包含结构多样的小分子,它们符合类似药物的标准。代表了几种化学型,并且该文库旨在适用于多种潜在靶标。

要请求有关收藏的信息,请发送请求至 [电子邮件 protected]


LIPID:脂质映射结构数据库

发布者:Lipid Maps Database分子:22215

PI:Lipidomics网关

发行时间:2/11/2011

The Lipid Maps (http://www.lipidmaps.org/) structures were annotated with 5 common ions (H+,2H++, K+, Na+, NH4+) including mammalian fatty acyls, glycerolipids, glycerophospholipids, sphingolipids, sterol lipids, and prenol lipids. The structures and ions are searchable by structure and MW to facilitate identification of novel lipids.


结核分枝杆菌

发布者:虚拟代谢物分子:274

发布时间:2010年11月5日

Kinnings等人的出版物《 PLoS Computational Biology vol 6:e1000976(2010)》中发布的274种药物的数据集(已在美国和欧洲批准用于人类)

药物与PDB中的至少一种结构共结晶,该数据集可与CDD中的其他TB筛查数据集一起使用,以确定哪些批准的药物对Mtb具有活性(来自文献。

TB:文献中非复制型Mtb的抑制剂


发布者:CDD-肖恩·埃金斯(Sean Ekins)分子:26

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年10月28日

来自已发表论文的结构和数据:

Darby和Nathan J Antimicrob Chemother 2010:65:1424-1427

Bryk et al。,Cell Host and Microbe 2008:3:137-145

Lin等,Arch Biochem Biophys。 2010 501:214-220

Lin et al。,J Biol Chem 2008:283:34423-34431

德 Cavalho et al:J Med Chem 2009:52:5789-5792

Lin et al。,Nature 2009:461:621-626


供应商:Astatech,Inc.积木收藏

发布者:阿斯特奇公司(Astatech,Inc.)分子:6140

发布时间:2010年10月15日

AstaTech,Inc.提供先进和新颖的中间体,以促进药物发现过程。我们的广泛选择包括结构单元,新型胺,受保护的胺,非天然氨基酸,酮,醛,杂环,等角酸酐,硼酸和手性中间体。联系 [电子邮件 protected] 用于订购信息。


供应商:Chemik 2010目录

发布者:CDD Vault分子:3889

PI:CDD

发布时间:2010年10月5日

Chemik已成功帮助惠氏(Wyeth)等药物发现公司开展了早期项目。我们提供从克到数吨的原料和关键中间体。凭借在该领域10年的经验,我们可以帮助客户在4-6周内以具有竞争力的价格,优质的产品和持续的服务开发新的中间体。


疟疾:菲和蒽氨基醇

发布者:CDD Vault分子:35

PI:CDD

发布时间:2010年9月21日

卤素取代的蒽和菲N-二烷基和单烷基取代的氨基醇盐酸盐在小鼠中的抗疟数据与伯氏疟原虫的关系。二十七种化合物显示出活性(平均生存时间增加>6天);八个化合物可治愈(IMST>60天)。该表包含PubMed ID,以获取详细信息和综合信息。


TB:BCG / MTB活动

发布者:诺华公司:TB数据分子:283

PI:Srinivasa Rao

发布时间:2010年9月15日

有氧BCG活性(MIC50)-274种化合物

有氧MTB活性(MIC50)-283种化合物

厌氧BCG ATP活性(IC50)-283种化合物

厌氧MTB ATP活性(IC50)-283种化合物

细胞毒性(CC50)-223种化合物关键字:结核分枝杆菌,牛分枝杆菌,TB


疟疾:JHU JHCCL恶性疟原虫抑制作用

出版者:约翰·霍普金斯-沙利文(2008)分子:2693

发布时间:2010年6月4日

10 microM时2663种批准药物的抑制百分比

TB,疟疾:GSK疟疾流行的贝叶斯预测


发布者:GSK数据贝叶斯模型(Ekins等)分子:13355

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年5月28日

使用贝叶斯模型(Ekins等人,Mol BioSyst 6:840-851(2010))对GSK疟疾发病率的预测(Gamo等人,Nature 465:305-310(2010))。

活动截止(220,000型号>0.31, 2,200 model >-1.37在整个单元格屏幕中被归类为有效项。

疟疾:圣裘德儿童研究医院全细胞疟疾数据集


发布人:圣裘德-疟疾/锥虫生物活性物质分子:1524

PI:Kip Guy

发布时间:2010年5月26日

由St. Jude CRH发布的《自然》杂志的补充数据(Guiguemde,W等人,《恶性疟原虫的化学遗传学》,《自然》 465,311-315(2010年5月20日)),包括在主屏幕中测试的1524个结构,以及其他数据共有八种方案:Bland-Altman分析,计算出的ADMET特性,化学生化筛选,灵敏度,协同作用和酶含量测定以及热熔分析。


疟疾:诺华GNF-Pf数据集

发布者:诺华疟疾分子:5695

发布时间:2010年5月21日

在基于红细胞的感染试验中测试了从MR4获得的恶性疟原虫菌株3d7(对药物敏感)和W2(对氯喹,奎宁,对乙胺嘧啶,对环鸟嘌呤和对磺胺多辛有抗药性)对通过抑制增殖抑制的敏感性选择的化合物。


供应商:ASINEX新型抗疟疾筛查套装

发布者:ASINEX分子:1

PI:Mark Parisi

发布时间:2010年5月20日

机密数据集:594种来自ASINEX的新型化合物。请参阅详细说明ASINEX设计的附件。

访问:新的CDD用户-您的注册将在批准访问数据集之前通过批准过程。现有CDD用户-请联系 [电子邮件 protected]


供应商:ASINEX Tres Cantos(GSK)抗疟亚种

发布者:ASINEX分子:278

PI:Mark Parisi

发布时间:2010年5月20日

278 ASINEX有效的抗疟疾数据与GSK数据匹配。

可供立即筛选。相应的数据集是ASINEX专有和拥有的。有关更多信息,请联系Mark Parisi:电子邮件: [电子邮件 protected]

电话:1-877-ASINEX1

传真:1-336-721-1618


疟疾:Tres Cantos抗疟疾套装(TCAMS)

发布者:葛兰素史克(GSK)反疟疾数据分子:13471

PI:哈维尔·加莫

发布时间:2010年5月19日

在GlaxoSmithKline筛选库中筛选了大约200万种化合物,发现了超过13,500种恶性疟原虫在人红细胞中的增殖抑制剂。这项工作是在西班牙Tres Cantos的Severa Ochoa 2,GlaxoSmithKline的Tres Cantos医学开发园区进行的。

TB:Sacchettini等。等评论-其他抗结核药

发布者:PK分子:18

发布时间:2010年2月5日

来自Sacchettini J.C.,Rubin E.J.的图1中未经批准的抗结核药。和Freundlich J.S.毒品与虫子:追求顽固的捕食者结核分枝杆菌,《自然评论微生物学》,第6卷,第41-52页,(2008年)。


TB:结核小分子专利数据

发布人:TB专利数据分子:20775

PI:协作药物发现

发布时间:2010年1月7日

美国专利商标局,欧洲专利局和世界知识产权组织提供的有关结核病研究的结构和专利信息。


TB:Makarov等人,NM4TB联盟

发布者:CDD-肖恩·埃金斯(Sean Ekins)分子:32

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年1月1日

1,3-苯并噻嗪-4-酮(BTZ)的结构活性关系数据。数据来自NM4TB联盟的Makarov等人,2009年及其同事在《科学》杂志上发表的论文“通过阻断阿拉伯合成来杀死苯并噻嗪酮杀死结核分枝杆菌”(PMID:19299584)。


供应商:TimTec多样性集

发布者:TimTec分子:9998

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

10,000种多样的类药物化合物的筛选库


供应商:TimTec OGT抑制剂类似物SET

发布者:TimTec分子:334

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

O-GlcNAc转移酶抑制剂类似物SET


供应商:TimTec ActiTarg-K,激酶调制器

发布者:TimTec分子:6212

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

ActiTarg-K可对6,000多种化合物进行计数,提供了高价值的药物样分子筛选库,可用于识别新型蛋白激酶抑制剂的合成方向

供应商:TimTec天然产物衍生物库

发布者:TimTec分子:3001

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

TimTec的NDL-3000天然衍生物


供应商:TimTec天然产品库

发布者:TimTec分子:479

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

TimTec的NPL纯天然产品


供应商:筛选库

发布者:AsisChem分子:43121

发布时间:2009年10月26日

超过40,000种类似药物的小分子化合物的集合可用于您的自定义选择。所有化合物的库存量最高为25mg。


供应商:构建基块

发布者:AsisChem分子:176

发布时间:2009年10月26日

可用于药物发现的化合物的集合。如果没有库存,则所有化合物都将在几周内提供,最大量为10克。


TB:TAACF-NIAID CB2库

发布者:南方研究院分子:102634

PI:Robert Goldman

发布时间:2009年9月30日

筛选具有抑制结核分枝杆菌菌株H37Rv生长能力的商业(ChemBridge)化合物库的结果。参见PMID:19758845


TB:EthR抑制剂(Willand等)

发布者:CDD-肖恩·埃金斯(Sean Ekins)分子:5

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2009年9月28日

转录抑制因子EthR的药物样抑制剂。分子和数据来自Willand et al Nature Medicine 15:537-544(2009)PMID:19412174


VENDOR,ADME:来自一组结构多样的商业药物的基准数据。

发布者:NM4TB:卡伦集团网站分子:24

PI:安德斯·卡伦(Anders Karlen)

发布时间:2009年6月11日

在瑞典市场上对药物进行多变量分析是选择少量,理化不同的24种药物化合物的基础。选择时要考虑诸如结构多样性,商业可用性,价格以及合适的定量分析技术等因素。测量汇编数据集的亲脂性,pKa,溶解度和跨人Caco-2细胞单层的通透性。我们希望该数据集可以用作验证新实验技术或计算机模型的基准集。它也可以用作开发新计算模型的各种初始数据集。

数据取自:

介绍结构多样且可商购的药物数据集,以进行相关性和基准研究。

SköldC,Winiwarter S,Wernevik J,BergströmF,EngströmL,Allen R,Box K,Comer J,Mole J,Hallberg A,LennernäsH,Lundstedt T,Ungell AL,KarlénA.

J Med化学2006年11月16日; 49(23):6660-71。


TB:已发表文献的吸收数据

发布人:CDD:结核病菌分子:24

发布时间:2009年5月28日

参考文章中的TB吸收数据

5'-O- [N-(水杨酰基)氨磺酰基]腺苷的2-三唑取代类似物对铁载体生物合成的抑制作用:对结核分枝杆菌有效的抗菌核苷。

古普特(A.) Boshoff,H. I .;威尔逊D.J. Neres,J .; N.P. Labello; R. V. Somu;邢丙;巴里(C. E.); Aldrich,C. C.

J Med Chem(2008)Vol 51,No 23,pp 7495-7507渗透率数据。


TB:公开文献中的药代动力学数据

发布人:CDD:结核病菌分子:28

发布时间:2009年5月28日

TB药代动力学数据来自已发表的文献资料。 28种独特化合物以及常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引文,目标,测试的细胞和生物,生物利用度,Vm,Vd,Cmax等。


TB:已发表文献的毒性数据

发布人:CDD:结核病策展分子:638

发布时间:2009年5月28日

TB毒性数据来自已发表的文献资料。来自pubMed参考文献的638种独特化合物以及常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引文,靶标,细胞和生物的睾丸,细胞活力,LD50,CC50,MNTD等。


TB:已发表文献的疗效数据

发布人:CDD:结核病管理分子(分子):6768

发布时间:2009年5月28日

结核病效力数据来自已发表的文献资料。来自300多种PubMed参考文献的6771种独特化合物以及常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引文,靶标,细胞和生物的睾丸,MIC,抑制百分数,EC50-EC100,IC50等。


TB:MLSMR

发布者:南方研究所分子:214507

PI:Robert Goldman

发布时间:2009年5月8日

由分子库小分子储存库(MLSMR)收集的200,000种化合物的多样化集合已于2008年春季提供给Southern Research Molecular Libraries Screening Center,以进行针对Mtb H37Rv的初步测试。从该初步筛选中选择最具活性的化合物,并在针对H37Rv的剂量反应测定以及使用Vero细胞的细胞毒性反筛选中以10种浓度进行测试。


疟疾:约翰霍普金斯大学临床化合物图书馆

出版人:约翰·霍普金斯-沙利文(2008)分子:1878

发布时间:2009年4月28日

以10μM的浓度筛选药物。在10%人血清的RPMI 1640培养基中培养对氯喹敏感的3D7或耐多药的Dd2的同步环阶段寄生虫,并在存在药物和[3H]-次黄嘌呤的情况下孵育48或96 h。一个96孔板,每孔0.2 mL的寄生虫血药和2-4%的血细胞比容,在48 h时发出的放射性掺入信号大约为10,000 cpm,在96 h时为20,000 cpm,背景计数低于500 cpm。一式两份进行筛选实验,将抑制百分比报告为两次实验的平均值。


TB:文献评论

发布人:TB文献数据分子:49

PI:Ballel等。

发布时间:2009年4月17日

结核SAR数据汇总在对结核分枝杆菌有活性的药物的调查中,包括具有已知和未知作用方式的药物(Ballel等人,“新型小分子合成抗分枝杆菌药”,涉及抗菌剂和化学疗法,2005年6月)。使用TubercuList / TBDB /其他目标链接和改进的参考文献更新了4/17。


TB:Sacchettini等,评论

发布者:CDD-肖恩·埃金斯(Sean Ekins)分子:14

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2009年2月18日

表1和表2中的Sacchettini J.C.,Rubin E.J.和Freundlich J.S.毒品与虫子:追求顽固的捕食者结核分枝杆菌,《自然评论微生物学》,第6卷,第41-52页,(2008年)。


供应商:IUPUI-分布式药物发现(D3)公共数据

发布者:IUPUI-D3 Enum 73K N-AcylAA-OH,-OMe,-NH2分子:48818

PI:M. J. O'Donnell和W. L. Scott

发布时间:2009年1月1日

酰化非天然氨基酸及其甲酯的开放式虚拟目录。我们鼓励我们的同事就分布式药物发现项目和合成方法的兴趣与我们进行交流,这在《组合化学杂志》(印刷中)的三篇论文中进行了介绍。


供应商:ASINEX构建基块

发布者:ASINEX分子:6745

PI:Mark Parisi

发布时间:2008年12月23日

像Building Blocks这样的药物,如果您正在考虑潜在客户优化计划,那么我们的Building Blocks可能恰恰是您所要的。


寄生虫:气味

发布者:CDD-肖恩·埃金斯(Sean Ekins)分子:228

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月21日

气味的分子和结构名称数据来自Roman Kaiser所著的一本书,这是Wiley-VCH在2006年出版的“世界各地有意义的气味”。分子编号与书中的编号有关。


TOX:toxcast

发布者:CDD-肖恩·埃金斯(Sean Ekins)分子:306

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月18日

EPA toxcast library of compounds (mostly pesticides) available at http://www.epa.gov/ncct/dsstox/DataFiles.html

http://www.epa.gov/ncct/toxcast/


FDA批准的TOX:建议的最大每日剂量

发布者:CDD-肖恩·埃金斯(Sean Ekins)分子:1215

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月10日

FDA数据库包含超过1200种药物的最大推荐日剂量值。该数据集代表以下出版物Matthews,E.J.等人,Current Drug Discovery Technologies,1(1):61-76中使用的一些分子。 (2004年)


供应商:相对于当前医疗保健的印度草药传统& Wellness Needs

发布者:Falguni Dasgupta:个人数据汇编分子:37

PI:Falguni Dasgupta

发布时间:2008年10月30日

参照现代观点讨论了印度药用植物及其提取物的传统用法,目的是找到共同点,重新评估权利要求,并根据法规要求在医疗保健领域创造机会,并找到“新药”的领导者。 ”


寄生虫:Sandler-UCSF Celera半胱氨酸蛋白酶抑制剂文库

发布者:麦考罗集团分子:1860

PI:Jim McKerrow

发布时间:2008年10月23日

体外克氏锥虫和布氏锥虫寄生虫和特定的酶筛选。


FDA批准:批准药品

发布者:约翰霍普金斯大学临床化合物图书馆分子:2815

PI:David Sullivan

发布时间:2008年10月16日

FDA批准了具有明确分子结构的药物,其中包括Physicians'Desk Desk Reference中的763个分子,DrugBank中的780个分子,Orange Book 2007中的1151个以及Chris Lipinski博士的FDA名单中的1007个


供应商:ASINEX GPCR重点库

发布者:ASINEX分子:3502

PI:Mark Parisi

发布时间:2008年10月2日

高品质的例外药物,例如面向GPCR的药物,以折扣价出售给CDD社区。该库结合了我们的药物化学专业知识以及我们从文献中鉴定特权片段并以前所未有的方式组装它们的能力。


GPCR:PDSP Ki数据库

发布者:PDSP Ki数据库分子:20026

PI:布莱恩·罗斯(Bryan Roth)

发布时间:2008年9月16日

NIMH精神药物筛选计划(PDSP)数据库针对699个GPCR目标的超过47,000 Ki值


供应商:ASINEX Synergy库

发布者:ASINEX分子:25008

PI:Mark Parisi

发布时间:2008年4月26日

ASINEX开发了一个新的高多样性文库,其中包含类似药效团片段的药物。库的设计基于两种形式的Synergy。第一个是多样化技术和针对性技术之间的相互关系,第二个涉及多步关键中间体(6-9个步骤)的融合,以创建复杂的化合物。有关更多详细信息,请参见下面的PDF。


TOX:具有已知毒性概况的公共数据的结构

发布者:具有已知毒性概况的结构分子:135

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2008年3月28日

已知化合物的组织特异性毒性概况与参考文献


混杂抑制剂:Shoichet发表了混杂抑制剂

发布人:Shoichet发表了混杂抑制剂分子:111

PI:Brian Shoichet

发布时间:2008年3月26日

聚集体通过水溶液中有机分子的自缔合产生“假阳性”


TOX:加州大学戴维斯分校-Hammock的公共数据

发布者:UC Davis-Hammock分子:714

PI:布鲁斯·汉莫克

发布时间:2008年3月17日

可溶性环氧化物水解酶(sEH)的抑制剂-这些酶具有3个主要功能:解毒,分解代谢和调节信号分子。


疟疾,TRYPANOSOME:圣裘德公共数据

发布人:圣裘德-疟疾/锥虫生物活性物质:2426

PI:Kip Guy

发布时间:2008年3月5日

来自圣裘德儿童研究医院Kip Guy实验室的开放获取结果,包括针对疟疾和布鲁氏杆菌的生物活性物质的HTS


疟疾:Drexel公共数据

发布人:德雷克塞尔大学分子:195

PI:让-克洛德·布拉德利

发布时间:2008年3月2日

双方之间正在进行的开放数据协作的结果

Drexel(Ugi-4CC产品)和UCSF(动物筛查)。该数据集代表研究人员如何选择公开发布选定结果的一个示例。 (相反,默认情况下,所有组都是私有的。)


疟疾:美国陆军调查

发布者:美国陆军疟疾文献调查分子:12318

 

发布时间:2008年2月29日

广泛收集了抗疟药动物SAR数据,包括化学结构,生物活性数据,药理学数据和毒性数据(最初由美国陆军于1946年作为“疟疾药物调查”发布)


疟疾:PlasmoDB

发布者:UPenn-疟疾文献数据分子:120

PI:David Roos

发布时间:2008年2月19日

从文献中汇编的疟疾抑制剂的PlasmoDB,包括化学结构,PlasmoDB基因标识符,靶基因名称,以及针对恶性疟原虫,间日疟原虫,伯氏疟原虫,约氏疟原虫,沙巴迪氏疟原虫,文克特彼得对虾的参考


疟疾:天然产物(NPPDB)

发布者:国家天然产物研究中心分子:426

PI:Babu Tekwani

发布时间:2008年2月15日

黄酮天然产物的抗疟疾数据库,包括抗疟疾和细胞毒性数据(密西西比大学,国家天然产物研究中心)


TB:TAACF分析结果

发布者:结核早期药物发现计划分子:812

PI:Bernard Munos

发布时间:2008年2月12日

公开的812种化合物的库在Alamar Blue全细胞测定中对结核分枝杆菌(H37Rv)的抗菌活性


FDA批准:孤儿药

发布人:已知药物分子:1721

PI:Christopher Lipinski

发布时间:2007年10月26日

FDA批准的具有指定适应症,赞助商名称和化学结构的药物(如果有)