公共访问

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EDASA COVID-19化合物库可以共享

已出版。 Andrea Artieri,分子博士。 2733

发行:5/12/20

EDASA Scientific,小型MedChem组织http://www.edasascientific。通讯)正在COVID-19地区寻找生物伙伴。大约有2700种化合物库存,EDASA免费提供这些化合物(运费由接收者支付),进行测试,如果获得阳性结果,则为活性化合物我们准备部署化学家进行优化和进一步发展。 EDASA希望考虑对这些化合物进行incilico修饰,并合成(免费)有限数量的修饰化合物作为这一概念的证明。所有这些化合物均为EDASA Scientific的财产,并根据我们开发的有效合成方案进行合成。


COVID-19 Mpro活性片段

发行人:亚历克斯·克拉克亚历克斯·克拉克分子1003

发行日期:2020/3/28

具有抗Mpro / COVID 19活性的片段的晶体结构由英国国家放射科学设施Diamond Light Source与Dectris(Diamond的MX实验中使用的检测器)合作提供。我会。对于原始数据,//www.diamond.ac.uk/covid-19/for-scientists/Main-protease-structure-and-XChem/Downloads.html请参阅。


佩拉拉方舟

出版商Perlstein Lab Molecules.56756

高级研究员伊桑·珀尔斯坦(Ethan Pearlstein)

发布时间:2019年10月27日

基于生物的完全开放源代码模型,包括酵母,蠕虫,果蝇和具有先天性代谢错误(如溶酶体疾病和先天性糖基化疾病)的人细胞模型中的药物再利用和铅发现筛选筛选数据语料库。这些数据发表在Journal G3(Lao et al。 //www.g3journal.org/内容/9/2/413.long)和疾病模型&机制(Iyer等人,2019a。 //dmm.biologists.org/内容/早期/ 2019/09/18 / dmm。040576.长Iyer等。 //dmm.biologists.org/内容/早期/ 2019/10/19 / dmm。040584.long)。


血清素受体的体外和体内活性

发行者:Nichols Nichols Molecular 84

资深研究员Dave Nichols

发布日期:2019年10月14日

该数据集中在利用多巴胺或5-羟色胺作为神经递质的大脑系统上。这包括仅对五个常见的多巴胺受体(D1-D5)之一具有特异性的分子探针,以及5-羟色胺5-HT1A,5-HT2A,5-HT2C受体的数据集。它包括在内。这些项目包括系统的结构修饰和药理分析,目的是揭示这些受体中配体结合域的结构决定因素。这项研究的一个主题是阐明如何将不同化学类别的分子容纳在相同的受体结合位点中。


多发性沙门氏菌病。区分OL

出版商Mierin恢复基金会Molecular 710

高级研究员塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布日期:2016年10月21日

急性少突胶质细胞分化测定将O4免疫纯化的OPC铺板于5 k /孔。铺板后1小时添加测试物质,孵育4天后,将细胞固定,并对MBP和全核(DAPI)进行免疫染色。通过对MBP染色/细胞数量(通过DAPI核染色确定)进行定量,确定OPC向OL的分化。在两种浓度下进行化合物筛选(10)& 2 uM; 2 & 0.4 uM; 0.4 &0.08 uM)分为4次。将数据归一化为DMSO(0%差异)和40 ng / ml T3(100%差异)。相对于测试产品的EMax确定EC50。有关技术细节,请参阅Lariosa-Willingham等人,BMC Res Notes。 2016 Sep 5; 9(1):419,或查看详细协议,[电子邮件 protected] 请联系我们。


多重SCLEROSIS.OL的保护

出版商Mierin恢复基金会Molecular。 723

高级研究员塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布日期:2016年10月21日

少突胶质细胞保护测定活力(TNF + IFNg)铺装的OPC以10 K /孔接种。在铺板后24小时添加测试产物,并且在添加测试产物1小时后注射10U / mlIFN​​-γ/ 1ng / mlTNF-α。孵育1天,添加Alamar Blue并孵育4小时。定量AlamarBlue的荧光并读取细胞活力。数据按DMSO(0%活性)和1.1 uM喹硫平(100%活性)定标。有关技术细节,请参见Rossler等,Al,BMC Res Notes。 2016 Sep 5; 9(1):444有关该协议的更多信息, [电子邮件 protected] 请联系我们。


多发性颅脑疾病。髓鞘测定

出版商Mierin恢复基金会Molecular。 715

高级研究员塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布日期:2016年10月21日

皮质髓质分析E18制备了来自大脑皮层的细胞,并将其铺在神经基底培养基中。 4天后,将培养基切换为MyM培养基。在第5天,加入测试产物,并进行髓样化8天。在体外第13天,固定细胞并对其进行MBP和Olig2免疫染色。通过定量MBP / Olig2 +核染色和MBP形态的变化(连续MBP染色比对纤维长度)确定髓鞘形成。 OL分化由MBP密度x面积/ Olig2 +核定量确定。以4个图像/孔以2个浓度(5和1uM)重复筛选化合物。将数据归一化为DMSO(0%分化/髓鞘化)和DAPT(100%分化/髓鞘化)。相对于对1uM DAPT的应答确定EC 50。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等人,Al,BMC Neurosci.2016 Apr 22; 17:16或了解详细协议,[电子邮件 protected] 请联系我们。


多发性颅骨发炎。 HEK293衣霉素保护试验

出版商Mierin恢复基金会Molecular 740

高级研究员塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布日期:2016年10月7日

HEK-293保护测定

 

将HEK-293细胞(10K /孔)孵育24小时后,添加测试产物。 1小时后,加入100 ng / ml衣霉素。再孵育48小时后,添加Alamar Blue,并在4小时后对荧光进行定量。将数据归一化为DMSO(0%活性)和5 uM Guanavents(100%活性)。相对于测试产品的EMax确定EC50。有关详细的协议,[电子邮件 protected] 请联系我们。


多发性颅骨发炎。 OL毒性筛选

出版商Mierin恢复基金会Molecular 709

高级研究员塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布日期:2016年10月7日

少突石毒性试验(TNF + IFNg)

 

将大鼠OPC后的毒性试验以10k /孔接种,并与药物一起温育2天。孵育4小时后,引出液为Alamar Blue荧光。数据显示为针对DMSO的存活率(100%)。最大杀伤力为5 ng / ml衣霉素,可使约15%的细胞存活。有关技术细节,请参阅Lariosa-Willingham等人的BMC Res Notes。 2016 Sep 5; 9(1):419,或查看详细协议,[电子邮件 protected] 请联系我们。


绿色溶剂

发行人:亚历克斯·克拉克亚历克斯·克拉克Sandbox Molecular 117

发布日期:2016年9月20日

モバイルアプリ(http://molmatinf.com/greensolvents.html)で使用されているグリーンソルベントスのデータです。ACS Green Chemical InstituteとGSK Solvent Guideで公開されている情報をもとに作成。http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/sc3000509 に掲載されています。


寄生虫。 GSK Kinect Box点击pIC50

出版商GSK Kinect Box Project(TCAKS)分子。 592

PI。支柱曼萨诺

发布日期:2016年6月16日

全細胞表現型アッセイを用いて、グラクソ・スミスクライン社のハイスループット・スクリーニング(HTS)の180万化合物の多様性セットを、ヒトの疾患に最も関連する3つのキネトプラストロイド、すなわちLeishmania donovani、Trypanosoma cruzi、Trypanosoma bruceiに対してスクリーニングしました。二次確認的および直交的な細胞内抗寄生虫活性アッセイを実施し、非特異的な細胞毒性の可能性を判定した。ヒットした化合物は化学的にクラスター化され、望ましい物理化学的特性のためにトリアージされた。これらの多様性セットがカバーする仮説的な生物学的標的空間をバイオインフォマティクスの手法を用いて調査した。その結果、約200種類の化合物からなる3つの抗キネトプラスチド化学ボックスが構築された。このデータセットには、ヒットした化合物と関連するすべてのスクリーニング結果が含まれています。 http://www.nature.com/articles/srep08771


供应商:ASINEX PPI库

出版商Asinex Molecular 8400

资深研究员Mark Parisi

发布日期:2016年3月3日

自2008年以来,Ainex一直致力于蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)库的设计和合成。最新一代的Asinex PPI库由各种大小,构架和形状的分子组成,从片段到大型环状衍生物均被设计为二级结构模拟物和表位模拟物。


供应商:ASINEX Elite库

出版商Asinex Moleculars 12960

资深研究员Mark Parisi

发布日期:2016年3月3日

第一次“打击”之后面临的挑战是什么? Acinex已通过广泛的ADME分析,优化设计以促进药物化学修饰以及IP评估以确保新颖性来解决这些问题。


发布者:ASINEX表达库

出版商Asinex Molecular 9840

资深研究员Mark Parisi

发布日期:2016年3月3日

Asinex在内部进行基于靶标的检测和表型检测,并利用收集到的实验信息创建基于靶标的多样化筛选集。根据这些经验,Ainex创建了一个表型筛选集。

MW:200-450,clogP:-1.0-7.0,clogD(pH7.4):-5.0-4.0,Rot.Bond:0-10,HA:1-10,HD:1-5,TPSA:15-135A ,N + O:2-10,HAC:19-34,双极性:0.3-3.30,SHP2:0.240-0.450。


供应商:ASINEX多样性库

出版商ASINEX Molecules.9968

资深研究员Mark Parisi

发布日期:2016年3月3日

多样性仍然是一种强大的筛选工具,尤其是在药物发现的早期阶段,即“探针”阶段。在创建此集合时,Ainex应用了计算工具来正确表示化学空间并结合了“ Elite”和“ BioDesign”概念的元素。


发行人:Asinex Biodesign

出版商Asinex Molecular 8041

资深研究员Mark Parisi

发布日期:2016年3月3日

ASINEX的BioDesign方法将已知的与药理相关的天然产物(如生物碱和其他次生代谢产物)的关键结构特征整合到可合成的药学化学支架中。是。


目录分布式药物发现(D3)-IUPUI

发布者:IUPUI --D3枚举73K N-酰基AA-OH,-OMe,-NH2分子.73234

高级研究员M. J. O'Donnell,W. L. Scott

发布日期:2016年2月24日

免费开放访问的虚拟目录/库,包含超过73,000个分子。 (a)N-酰基非天然α-氨基酸甲酯,(b)N-酰基非天然α-氨基酸甲酯,(c)N-酰基非天然α-氨基酸伯酰胺。目录中的分子基于甘氨酸阴离子当量与100 R1X的固相组合烷基化,然后与100 R2CO2H进行N-酰化,以及树脂裂解(分别为TFA,MeOH / Et3N或TFA)。通过枚举获得。 2009年1月1日发布了48,818个分子的遗留数据集(上面的集合a和b加上R1X和R2CO2H的输入)。如果您对D3项目感兴趣,请与我们联系(电子邮件: [电子邮件 protected]<mailto:[电子邮件 protected]>または [电子邮件 protected]<mailto:[电子邮件 protected]>)</mailto:[电子邮件 protected]></mailto:[电子邮件 protected]>。<mailto:[电子邮件 protected]><mailto:[电子邮件 protected]>参考文献J. Comb。这类研究不是讨论的主题吗? 2009,11,3-13,14-33,34-43; J. Org。Chem。2014,79,3140-51; J.Chem.Educ。2015,92,819-26。</mailto:[电子邮件 protected]></mailto:[电子邮件 protected]>


疟疾:5种恶性疟原虫激酶和GSK TCAMS生化筛选

发行人:Gregory J. Clauser Gregory J. Clauser Mole。13451

资深研究员Gregory J. Clauser

发布日期:2016年2月3日

筛选了约13,500种细胞活性化合物对5种蛋白激酶的活性。通过生化分析筛选了GlaxoSmithKline的Tres Cantos抗疟药套装(TCAMS),用于恶性疟原虫钙依赖性蛋白激酶1和4(CDPK1 / PF3D7_0217500和CDPK4 / PF3D7_0717500)。一种新的有效抑制剂(IC50),针对三种激酶,有丝分裂原相关蛋白激酶2(MAPK2 / MAP2 / PF3D7_1113900),蛋白激酶6(PK6 / PF3D7_1337100)和蛋白激酶7(PK7 / PF3D7_0213400)。<1 µM)被发现。 3种激酶的新型有效抑制剂(IC50)<1 µM)被发现。一种针对三种激酶CDPK1,CDPK4和PK6的新型有效抑制剂(IC50)<1 µM)被发现。 PK6抑制剂是该酶最有效的抑制剂,需要进一步研究。


公共暗物质化合物

出版商黑暗物质复合分子.139352

吉列尔莫·莫拉莱斯(Guillermo Morales)高级研究员

发布时间:2015年12月7日

诺华发现,至少在诺华100次检测中测试了803,990种化合物,其中112,872种没有活性(占14.0%)。 NIH数据分析还显示,至少进行了100次测定,测试了363,598种化合物,其中131,726种化合物无效(36.2%)。

安妮·迈·瓦瑟曼(Anne Mai Wasserman),尤金·伦肯(Eugen Lunkeen),多米尼克·霍普夫纳(Dominique Hopefner),盖尔·勒高夫(Gael Le Goff),弗雷德里克·J·金(Frederick J.King),克里斯汀·史都德(Christian Studer),约翰·佩尔帖(John M.Peltier),梅利莎·L·格里波(Melissa L. ,Sugar Schuffenhower,Ian M. Wallace,Shani Chen,Philip Crustel,Amanda Cobos-Korea,Christian N.Parker,John W.Davis和Mayer Glick。深色化学物质是发现药物线索的有前途的起点。 Nature Chemical Biology 2015年,第11卷,第958-966页(doi:10.1038 / nchembio.1936)


ADME.AZ公共ChEMBL数据

出版商AZ Public ChEMBL数据分子.5799

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2015年10月5日

在阿斯利康测定的一系列已发表化合物的体外DMPK和理化数据。为测定提供的参考举例说明了用于产生数据的实验程序。

//www.ebi.ac.uk/chembl/doc/inspect/CHEMBL3301361% 平衡透析により血漿に結合します。化合物を全モルモット血漿と37℃で5時間以上インキュベートする。B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research.B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141.実験範囲 10%~99.95%の平衡透析により血漿に結合。化合物を全犬血漿と37℃で5時間以上インキュベートする。B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Researchに記載されている方法。B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141に記載の方法。実験範囲 10%~99.95%の平衡透析により血漿に結合。化合物をラット全血漿と37℃で5時間以上インキュベートする。B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Researchに記載されている方法。B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141.実験範囲 10%~99.95%の平衡透析により血漿に結合。化合物をマウス全血漿と37℃で5時間以上インキュベートする。B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Researchに記載されている方法。B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141.実験範囲10%~99.95%結合.37℃でのインキュベーション後のヒト肝細胞で測定した固有クリアランス。実験範囲<3から>150マイクロL/min/1E6細胞。ラピッドコミューン。マススペクトル。2010年、24、1730-1736.Most basic pKa値(pKa B1)は、シリウス分析からの標準的な方法を使用して吸収および電位差滴定によって決定されます。実験範囲の塩基。シリウスの分析的なからの標準的な方法を使用して吸収と電位差滴定によって決定される >= 2.Second 最も酸性の pKa の値 (pKa A2)。実験範囲 酸: <= 11。

第三最基本的pKa值(pKa B3)是使用Sirius Analytical的标准方法通过吸收和电位差滴定法确定的。实验范围基准。>= 2.

第二最基本的pKa值(pKa B2)是使用Sirius分析的标准方法通过吸收和电位差滴定法确定的。实验范围基准。>= 2.

最酸性的pKa值(pKa A1)是使用Sirius Analysis的标准方法通过吸收和电位差滴定法确定的。实验范围酸:<= 11。


PDB配体

出版者蛋白质数据库(PDB)分子1686

资深研究员Dale R.Cameron博士,M.C.I.C.,P.C.I.C.,P.C.C.,P.C.C.

发布时间:2015年8月3日

从PDB中提取配体信息并过滤以除去“聚合物”和其他相关的“非游离”配体,金属和金属结合配体。过滤过程可能会更新,恕不另行通知。数据按原样提供,但没有管理或错误纠正。到PDB的链接由RCSB PBD提供,可以引用如下:

H.M. Berman,J.Westbrook,Z.Feng,G.Gililand,T.N.Bat,H.Weissrig,I.N. Cindialov,P.E. Bourne(2000)蛋白质数据库核酸研究,28:235-242。

向库管理员报告断开的链接,对其他数据的请求等。


EBOLA:埃博拉病毒的小分子抑制剂

发布者。纳迪亚的沙场分子55

资深研究员Nadia Ritterman博士

发布时间:2015年2月2日

这个共享的数据集包含来自文献(截至2015年1月)的55个小分子,这些小分子具有针对埃博拉病毒和各种疾病模型的体外和体内活性。由经验丰富的药物化学家发布评估和PAINS过滤的结果。这项工作由Nadia Litterman,Christopher Lipinski和Sean Ekins发布到F1000 Research。


供应商:Synthonix-建立更好的纽带

Published By: http://www.synthonix.com Molecules.10286

发布时间:2015年1月2日

通过提供10286个构建基块的目录,Synthonix是药物发现研究人员探索更困难的化学空间并治疗全球慢性和可治愈疾病的重要治疗目标。您可以扩大范围。 Synthonix,Inc.:919-875-9277;常规电子邮件: [电子邮件 protected]Synthonix Ltd(欧洲办事处),办公室:电话:+44 1223 597934电话:+44 1223 597934,电子邮件:[电子邮件 protected]


问题:NIH化学探针

发布者探针金库分子319

资深研究员Christopher Lipinsky

发布时间:2014年11月12日

美国国立卫生研究院(NIH)在校园和学术中心都通过分子库筛选中心网络(MLSCN)和分子库探针生产中心网络(MLPCN)来识别小型化学探针或工具化合物。已为大型HTS计划提供了超过5.76亿美元的资助。基于效价,选择性,溶解性和可利用性的组合,已选择了各种定义作为探针的化合物。迄今为止,在NIH资助的学术筛查中心已经发现了300多种化学探针。该集合包含探针结构,靶标,抗靶标,IC50值和其他参考。它还包括各种药物相似性度量,包括Chris Lipinski博士分配的合意性得分,如“化学探针专家评估的计算预测和验证”中所述。 Litterman NK,Lipinski CA,Buinin BA,Ekins S.J Chem Inf Model。(2014年)


卖方:Azepin Co.,Ltd.堆叠收藏

出版商Azepin有限公司,分子。 600

朱莉娅资深研究员

发行日期:2014年10月8日

我们以有竞争力的价格提供600个构建基块。联系信息 [电子邮件 protected]


NEU-CSIC-GSK激酶靶向HTS

东北大学分子研究室(Polastic Laboratory)出版78

资深研究员Michael Porastri

发布时间:2014年9月25日

该数据集包含与东北大学(Pollastri实验室),CSIC(Navarro实验室)和葛兰素史克·特雷斯·坎托斯实验室(发展中国家DPU疾病)合作进行的高通量筛选出版物的结果。该论文是Diaz等人的PLoS-NTDs。

 

DOI:10.1371 / journal.pntd.0003253

 

如果你有任何问题 [电子邮件 protected] 请联系我们。


供应商:Vitas-M实验室库存HTS系列

出版商维塔斯M实验室分子388375

发布时间:2014年7月11日

Vitas M Laboratory Co.,Ltd.收集的HTS化合物约有40万个单个分子和储备。我们可以快速交付各种格式,例如毫克,微摩尔,干粉,DMSO溶液,干膜等。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Vitas-M实验室构建基块

出版商Vitas M实验室分子33297

发布时间:2014年7月10日

Vitas-M Laboratory,LTD。有机构件的集合包含33,000多个经过鉴定和测试的项目。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Vitas-M实验室支架

出版商维塔斯M实验室分子2898

发布时间:2014年7月8日

Vitas M实验室支架收藏(杜鹃花项目)。合成类似毒品的小型图书馆的先进方法。这是获得其他任何供应商都没有的全新化合物的最佳选择。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Vitas-M实验室碎片

出版商Vitas M实验室分子18331

发布时间:2014年7月8日

Vitas-M Laboratory,LTD。用于基于片段的药物发现的片段收集(已通过特殊过滤器(例如“ 3条规则”)的化学物质)www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:Life Chemicals-GPCR库

出版商Life Chemicals Molecular 15948

资深研究员Alexander Kucherak

发布时间:2014年6月20日

類似性/ファーマコフォア検索は、Sybyl-Xが提供するトポマー検索予測に基づいて行った。第一段階 - 類似性検索では、ストック化合物全体とBindingeDBおよびChemblDBから得られた既知の阻害剤との比較を想定しています。第二段階では、既知の阻害剤の3次元構造とそのコ・アライメントを生成した。この化学的空間空間は、残りの「類似」化合物のフィッティングのためのテンプレートとして使用されました。また、アデノシン、ケモカイン、ドーパミン、ギャバ、ヒスタミン、ムスカリン、オピオイド、スフィンゴシンなどの受容体を対象としたバーチャルスクリーニング法(すべてのスクリーニングモデルは準備ができており、トレーニングセットで証明されている)を用いて、代替ライブラリを作成することができる。 http://www.lifechemicals.com/


卖方:生命化学-相似激酶

Publisher Life Chemicals分子62467

资深研究员Alexander Kucherak

发布时间:2014年6月20日

MDL公開鍵と谷本類似度カットオフ90%を用いて類似度検索を行った。168の生物学的アッセイで活性が確認された約25Kの参照化合物(100種類以上のキナーゼターゲット)を用いて類似性検索を行いました。これらの化合物は、お客様のご要望に応じて、より特定のターゲットに対してスクリーニングすることができます。 http://www.lifechemicals.com/


分销商:生命化学品对接激酶

出版商生命化学分子15174

资深研究员Alexander Kucherak

发布时间:2014年6月20日

キナーゼライブラリは、Sybyl環境での仮想ドッキングに基づいて作成された。この目的のために、キナーゼ構造体の結合部位のセット(約20個)をアラインメントし、解析した。このような重畳サイトは、Sybyl-XのUnityモジュールを介して、構造ベースのファーマコフォアモデリングに使用された。また、3Dストック全体をこのマルチファーマコフォアモデルに照らし合わせてスクリーニングを行い、最終的にはトップランキングを行いました。 http://www.lifechemicals.com/


分销商:生命化学-核受体

出版商生命化学分子9896

资深研究员Alexander Kucherak

发布时间:2014年6月20日

ライフケミカルズバーチャルドッキングと類似性・ファルマコフォア検索 http://www.lifechemicals.com/。


供应商:Life Chemicals-CNS库

出版商生命化学分子16535

资深研究员Alexander Kucherak

发布时间:2014年6月20日

文献に記載されているCNSフィルターを、我々の全ストックのふるいとして使用した。このようなパラメータを有する化合物のみが神経組織透過性に適切な特性を有し得ることが示された。すべての記述子は、SybylのSpreadsheetsおよびVolsurfモジュールから得た。(MW 200 = 350 cLogP =< 3.6 H-Bond Acceptors =< 8 H-Bond Donors =< 5 tPSA =< 120 Rotatable Bonds =< 5 LogBB1 = -3.0〜1.0) http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学类天然图书馆

出版商生命化学分子7808

资深研究员Alexander Kucherak

发布时间:2014年6月20日

第一の方法は、記述子の統計的な分解に基づくものである。これまでは、NPの大規模なデータベースを解析して、NPの足場を木の形に配置して研究してきました。そこで、13万以上のNP構造の特性分布を解析し、天然化合物の特定のクラスに典型的な部分構造を同定することで、天然化合物に通常存在するフラグメントのセットを生成しました。この方法は、CRC Dictionary of Natural Products (DNP)と合成分子(SM)でテストされました。別の方法は、足場類似性評価に基づくものである。分子に対して生成される(フラグメントネットからの)原子シグネチャの数は、その分子を構成する原子の数に等しい。各原子シグネチャはそれぞれ独立して分子の構造的特徴/フラグメントを表し、それに対する個別のスコアを計算します。このような実験を再現するために、CDK-Taverna 2.0に実装されているモジュールChemistry Development Kitを使用しました。これにはNP-Likenessスコアラーv1.4.1が含まれており、これは分子の天然物(NP)類似度、すなわち既知の天然物がカバーする構造空間に対する分子の類似度を計算します。すべての結果はスコア化され、-3から+3までの範囲で評価されました。 http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学品筛选馆藏

出版商Life Chemicals Molecular 37 1998

资深研究员Alexander Kucherak

发布时间:2014年6月20日

慎重に設計された、新規の、リピンスキールール5の薬物のような低分子で、このパラメータのセットからの逸脱の唯一の理由は、ユニークな足場または非標準的な化学である。PAINのような薬効化学フィルターや、ターゲットに焦点を当てたフィルター(溶解度、透過性、BBB)のアプリケーションに対応しています。 http://www.lifechemicals.com/


分销商:Life Chemicals-片段,保证溶解度

Publisher Life Chemicals分子8241

资深研究员Alexander Kucherak

发布时间:2014年6月20日

フラグメント化合物は、LCストック全体のフィルターを用いて、Rule of threeを用いて選択しました。フラグメントは分析室で溶解性を試験しました。溶解度はDMSOで200mMの濃度で保証されており、フラグメントの75%は1mMの濃度でpH7.5の緩衝液に溶解しています。http://www.lifechemicals.com/。


TB:文献中的体内小鼠功效

由TB体内data2分子.778发布

高级研究员Sean Ekins博士

发布时间:2014年4月10日

展望未来。预测小分子与分枝杆菌在体内对结核病的体内疗效。在疾病的动物模型中,体外选择疾病导致其转化为具有体内活性的分子是一项耗时且成本高昂的重大任务。我们已经证明了使用由773种化合物组成的机器学习分类模型,可以从体内有活性和无活性的化合物中进行学习(Basian,支持向量机,递归分区)。 Basian模型将模型中未包括的11种其他体内活性化合物中的8种预测为外部测试集。因此,长达70年的Mtb数据管理提供了一个统计上可靠的计算模型,该模型允许资源集中于在体内具有活性的小分子抗结核药。这表明它是其他疾病的体内试验的经济有效的预测指标。 PMID:24665947


TB:TB Mobile 2数据

Publisher TB Mobile 2.0更新分子.79

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发行日期:2014年3月19日

从最新论文中选择了79种化合物,它们在TB中具有一个或多个目标。该应用程序的版本2已添加到TB Mobile。添加的20个分子用作测试集。我提交了一篇论文。


寄生虫:MMV疟疾盒式筛查曼氏血吸虫

发布者。 CDIPD保险库分子400

发布时间:2013年11月6日

MMVマラリアボックスを構成する400種類の化合物を用いて、Schistosoma mansoniのソミュール(感染後の幼虫)と成虫を全組織でスクリーニングした(http://www.mmv.org/malariabox)。マラリアボックスの「薬剤に似た」化合物のうち、ソミュールに対して最も重篤な表現型を示す化合物のみが成虫に対して試験された。データはChEMBLにもアップロードされている。問い合わせは、寄生虫疾患発見・イノベーションセンター(www.cdipd.org/)、UCSF([电子邮件 protected])致Conor Caffrey。


激酶激酶的催化活性(Theonie Anastasiadis的自然生物技术)

Publisher激酶催化的活性分子.178

高级研究员Theony Anastasiadis

发布时间:2013年8月30日

激酶催化活性

Nature Biotechnology 2011年10月30日; 29(11):1039-1045。测试的文库由178种已知抑制所有主要蛋白激酶亚家族中的激酶的化合物组成。在10μMATP存在下,所有化合物的浓度均为0.5μM。双重测试每对激酶抑制剂,结果以平均底物磷酸化表示为溶剂控制反应的百分比(以下称为“残余激酶活性”)。激酶活性数据表示为与载体(二甲亚砜)反应相比,测试样品中残留激酶活性的百分比。


结核:更新的靶标药物和线索

出版人:结核病:具有靶点的药物和线索更新分子。 38

发布时间:2013年6月14日

从TB的最新文献中发布的具有已知目标的化合物,也可用于TB移动应用程序的更新

激酶:关于GSK出版的激酶抑制剂套装(PKIS)

出版商Kinome 2分子。 364

发布时间:2013年6月6日

GSK发布的激酶抑制剂套装(PKIS)是一组367种蛋白激酶抑制剂,其注释蛋白激酶家族活性,可用于已发表的筛选工作。可以在下面的链接中找到有关筛选集的详细信息。 ChEMBL数据库是该组生物测定数据的“理想”站点。为了改善对重要数据的访问,我们将收集ChEMBL提供的PKIS数据并进行处理,以便可以在此处的协作药物发现(CDD)站点上进行访问。我做到了(就像我之前在Kinases SARfari数据库中所做的一样)。

随着CDD的使用,数据现在以一种更加“医学化学家”友好的方式提供。我们还组织了数据集。例如,实际上只有364种化合物(某些重叠是由于盐的形式或同一分子的别名)。我还尝试了尽可能标准化目标名称(例如,在UNC,IKKA,IKKB,IKKE的数据集中被称为IKK-α,IKK-β,IKK-epsilon)。这并不完美,但是...我希望对数据集进行任何修改!

总之,针对225个目标在0.1和1 uM下测试了364种化合物。在此数据集中,只有一个协议,但一次读取中列出了225个目标。浓度也是一种读数,因此很容易将搜索范围限制为1和/或0.1 uM的屏幕。

这是一个链接。

1)有关GSK PKIS的详细信息

http://www.maggichurchouseevents.co.uk/bmcs/Downloads/CBDD%20-%20Zuercher%20Bill.pdf

http://www.chordomafoundation.org/wp-content/uploads/2013/04/2013-Flanagan-Drewry.pdf

http://chembl.blogspot.co.uk/2013/05/pkis-data-in-chembl.html

2)CDD上的先前ChEMBL激酶数据

//www.aslsw.com.cn/buzz/2013/04/04/kinome-sar-for-collaborative-drug-discoverers/

激酶:ChEMBL激酶SARfari复合生物测定数据


发行人:CDD Vault Molecules.CDD Vault Molecules.54211

光盘

发布时间:2013年3月27日

ChEMBL上有价值的资源是Kinase SARfari,这是“激酶特定的化学基因组学集成工作台”。它整合并链接激酶序列,结构,化合物和筛选数据。该数据库支持广泛的具有SAR数据的激酶活性化合物的SAR激酶检测方法,其中许多是从文献中手动开采和收集的。为了使该数据在CDD界面中可用,我们将Kinase SARfari核心表与ChEMBL数据库中的另一个关键表合并,并提供了一个详述每个记录中使用的测定的字段。现在可以通过CDD界面使用此合并的数据集。可获得有关400种激酶的详细体外数据。它还包含体内功能数据和ADMET数据。


TB:ARRA

发行人TB ARRA分子.1924

资深研究员Bob Reynolds

发布时间:2013年3月15日

来自SRI(Bob Reynolds)和Ekins等人提交的Scott Franzblau Group-A论文的数据。

以前的SRI筛选中的命中数据用于在供应商库中查找相似的化合物,进行聚类,并在一系列可接受的新药筛选屏幕中进行体外测试。该化合物还用作使用生物活性和细胞毒性信息构建的先前生成的贝叶斯模型的测试集。


TB:GSK

出版人TB GSK Molecular 177

高级研究员Sean Ekins博士

发布时间:2013年2月8日

Ballell等人的论文ChemMedChem 2013年版“为开放源代码药物提供燃料:177种抗结核的小分子引线”的补充数据。

オリジナルのデータセットは //www.ebi.ac.uk/chemblntd で公開されていますが、ここでは M.tb のデータのみを掲載していますが、より多くの BCG データは ChEMBL で入手可能です。


Tripanosome Shagas病文献信息化合物

出版商Chagas Public Data Molecular 531

发布时间:2012年12月21日

我们整理了针对克鲁氏锥虫的体外或体内测试的531个分子的化合物的结构和文献。


Tripanosoma人类非洲优化用于Tripanosoma疾病(HAT)的特定化学品

出版商Chagas Public Data Molecular 5559

发布时间:2012年12月12日

SCYNEXIS Inc.は、DNDi HAT Lead Optimization Consortiumのメンバーとして、T. bruceiに対する活性について4926化合物を開発し、スクリーニングしました。化合物の構造とT. brucei bruceiに対するin vitro活性データが含まれています。34 化合物のサブセットについて、関連する真核生物寄生虫 T. brucei rhodesiense、L. donavani、および P. falciparum に対する細胞毒性データと活性が記載されています。報告されている化合物シリーズはすべて、選択性が低いか、in vivo 活性とは相容れない特性を有することが判明したため、HAT 用の開発は終了しました。 http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1011-hat-001


DNDi优化Fenalimol系列用于治疗三联体Shagas病

出版商Chagas Public Data Molecular 743

发布时间:2012年12月9日

Epichem、Murdoch大学、CDCOを含むDNDi Lead Optimization Consortiumは、植物殺菌剤フェナリモールをベースとしたSARシリーズを開発し、スクリーニングしました。DNDiは、このシリーズから743化合物の化合物の構造、T. cruzi活性データ、およびL-6細胞毒性データをChEMBL-NTDで公開しました。化合物と生物学的アッセイデータはCDD Publicに掲載されています。 http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1012-chagas-001


广泛的主要HTS鉴定TRYPANOSOME.T.Cruzi复制抑制剂

出版商Chagas公共数据分子303230

发布时间:2012年12月6日

ブロード研究所は、宿主細胞であるマウス線維芽細胞NIH3T3と共培養したβ-ガラクトシダーゼレポーターを安定的に発現させたTrypanosoma cruziの組換えTulahuen株を用いて、30万3,224化合物のハイスループットなスクリーニングを重複して行った。4,394ヒットのうち、4,063ヒットをさらに阻害活性と宿主細胞毒性を評価した。最後に、27 化合物をプローブ化合物として選択し、さらに検証を行った。一次スクリーニングおよびその後の二次アッセイのデータは、PubChemに掲載された。PubChemからの一次スクリーニングと6つの二次アッセイの化合物と生物学的アッセイデータは、CDD Publicに掲載されています。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21634083。


TB:Guzman等人,M.tb。MurE连接酶抑制剂

发行人:CDDCDD-肖恩·埃金斯分子.8

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2012年12月6日

来自以下结核病出版物的全细胞和基于靶标的筛查数据。 Guzman JD,Gupta A,Evangelopoulos D,Basavannacharya C,Pabon LC,Plazas EA,MuñozDR,Delgado WA,Cuca LE,Ribon W,Gibbons S,Bhakta S.J Antimicrob Chemother.2010年10月,65(10): 2101-7。哥伦比亚植物天然产物的抗结核病筛查。 3-甲氧基正十二烷胺,结核分枝杆菌中MurE连接酶的抑制剂。


供应商:NIH Clinical Collection 2阵列(281个分子

发行人:NIH Clinical Collections NIH Clinical Collections Molecules.281

高级研究员(PI)。专案经理。五月钢

发布时间:2012年11月21日

NIH Clinical Collection 2是镀有281个历史小分子的阵列,已在人类临床试验中使用。美国国立卫生研究院(NIH)通过分子图书馆路线图计划收集了此馆藏,这是使化合物筛选在生物医学研究中得以使用的使命的一部分。


供应商:NIH Clinical Collection阵列(446个分子)

发行者:NIH Clinical Collections NIH Clinical Collections Molecules.446

高级研究员(PI)。专案经理。五月钢

发布时间:2012年11月21日

NIH Clinical Collection是446种低分子量平板序列,具有在人类临床试验中使用的历史。美国国立卫生研究院(NIH)通过分子图书馆路线图计划收集了此馆藏,这是使化合物筛选在生物医学研究中得以使用的使命的一部分。


结核:针对目标药物和潜在客户的数据在移动应用中使用

用于发布商移动应用程序的.SRI分子和目标分子.707

发布时间:2012年10月23日

更新数据更新结核病目标的体内必需性精选数据

来自TBDB,Biocyc,Metacyc,PDB,Pubmed和

斯坦福研究所的马拉比卡·萨克(Malabika Sarker)的其他参考文献

约翰·霍普金斯大学的Gyanu Lamichhane提供了必需品。

インフォメーション.ref.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22477069

このデータセットをモバイルで閲覧する: //itunes.apple.com/app/tb-mobile/id567461644


毒物:按肝毒性分类的药物和化学品

发行人:CDD Vault Molecules.CDD Vault Molecules.83072

光盘

发布时间:2012年7月16日

辉瑞(Hu 2008)先前根据肝毒性临床数据创建了具有分类方案的药物和化学品清单,以评估体外人肝细胞成像测定技术(HIAT)和临床肝脏。毒性的符合率为75%。导致或不引起药物引起的肝损伤(DILI)的同一组化合物与分子描述符一起用于贝叶斯模型的incilico预测。


结核:具有完整细胞抗结核活性的SRI分子

出版商SRI Group Vault Molecules.23

高级研究员Sean Ekins博士

发布时间:2012年4月24日

通过德国共振评估的分子。 PMID:22477069

结合化学信息学技术和途径分析,鉴定具有抗结核总细胞活性的分子。

Sarker M,Talcott C,Madrid P,Chopra S,Buinin BA,Lamichhane G,Freundlich JS,Ekins S.


疟疾:MMV疟疾盒

发行者:NTT Docomo Co.,Ltd.发行。疟疾框分子。 400

发布时间:2012年3月29日

MMV Malaria Boxからの分子、ChEMBL-NTD (//www.ebi.ac.uk/chemblntd) : MMV Malaria Box、Simon Macdonald、Paul Willis、Paul Kowalczyk、Thomas Spangenberg、Jeremy Burrows、Tim Wells。Medicines for Malaria Venture (MMV), PO Box 1826, 20, rte de Pré-Bois, 1215 Geneva 15, Switzerland and SCYNEXIS Inc.P.O. Box 12878 Research Triangle Park, North Carolina 27709-2878 USA.

体外对疟疾箱中包含的所有化合物进行了3D7(氯喹(CQ)敏感但对磺胺类抗性的恶性疟原虫菌株敏感)的体外筛选,并对人胚胎肾细胞菌株(HEK-293)进行了细胞毒性测定。 )进行。对于数据,恶性肿瘤数据的EC50以nM表示。


ADME.ADMEdata.com-高质量ADME数据的商业存储库

出版商G2 Research ADMEdata.com分子.1760

资深研究员乔治·格拉斯

发布时间:2012年1月13日

示例包括以下内容: Caco-2渗透性,平衡溶解度@ 5pH值,人结合蛋白,大鼠结合蛋白,兔肠道通透性,人血浆分裂和血细胞比容。有关完整的数据集和模型,请直接联系Pharma博士的George Glass。[电子邮件 protected] (通过CDD分发)


供应商:孔砌块集合

发行人:CDD Vault Molecules.CDD Vault Molecules.29241

光盘

发布时间:2012年1月13日

Posefile Chemical致力于合成用于药物发现的定制新化合物,以具有竞争力的价格和质量提供广泛的产品。当前集是选自1554种新颖多样的化合物和吗啉,哌啶,哌嗪,哌嗪,嘧啶,氨基酸,API家族的组成部分的子集。 www.porsefinechemical.com, [电子邮件 protected], [电子邮件 protected]


寄生虫:曼氏血吸虫血吸虫。微源光谱和杀手collection

出版社Brian Suzuki Sandbox Molecular 119

发布时间:2011年10月5日


曼氏血吸虫(Schistosoma mansoni schistosomula),Microsource Spectrum和Killer Collection的表达屏幕。

资深研究员Connor R. Caffrey

发布时间:2011年10月5日

CDD:公开数据119次点击

UCSF Sandler药物发现中心采用部分自动化的吸血剂负责传染性热带病的囊肿病,作为药物重排策略的一部分,用于鉴定新的抗寄生虫药开展了完整的生物体(表型)筛选。筛选了上述集合中的1,260种化合物,包括药物,类药物化合物,天然产物和其他化合物。在这项研究中,我们报告了曼氏血吸虫在幼虫期(血吸虫)的表型变化,方法是使用简单的描述符来表达寄生虫对复杂侵害的多重动态响应。目前正在对表型反应进行完全定量。有关每个集合中化合物的完整列表,请参见Microsource Discovery Systems Inc.以获取更多信息。[电子邮件 protected] 请联系我们。化合物鉴定:通过中等通量表型筛选,鉴定已知药物库中的命中和先导化合物。 Abdullah MH,Rueras DS,Wolf B,Snedekor J,Lim KC,Xu F,Renslo AR,Williams J,McKello JH,Caffrey CR.PLoS Negur Tropical Disease。 2009年7月14日; 3(7):e478.PMID:19597541


TB:SRI激酶文库表型筛选

发行人:CDD Vault Molecules.CDD Vault Molecules.23823

光盘

发布时间:2011年8月29日

激酶靶标正在超越多种疾病。

癌症包括病毒和寄生虫以及免疫和新陈代谢。

真菌和细菌。特别是相对较新的

对分枝杆菌激酶和ATP结合靶标感兴趣

鉴定结核病的抑制剂和潜在药物

当前药物方案未靶向的必需蛋白。

这是目标

该文库是基于当前激酶抑制剂支架和已知激酶结合位点设计的大约26,000种化合物的文库。根据这项研究中获得的表型数据,有可能选择可以作为针对结核激酶和ATP结合靶标进行酶筛查的立足点的化合物。

结核病(爱丁堡)。 2011年6月25日。 [Epub提前发布]

版权所有©2011 ElsevierLtd。保留所有权利。

请联系Melinda Sosa以获取更多信息。[电子邮件 protected]

基于激酶抑制剂的文库的高通量筛选

结核分枝杆菌H37Rv的支架。

雷诺(Reynolds)RC,阿纳森(Anathan S),法莱欧拉(Faaleolea E),霍布拉斯(Hobrath)合资公司,权CD,马多克斯(Maddox)C,拉斯穆森(Rasmussen)L,索萨(Sosa)密西西比,间苯三酚E,白色EL,张W,塞克莉斯JA第3次

资料来源:“南方研究院”(2000年9月9日,南方研究院,南九大街2000号。

美国伯明翰市35205。


FDA批准。 NCGC药品收藏(NPC)V1.1.0

发行人NCGC药物收藏NPC V1.1.0分子.14579

资深研究员Noel Southall

发布时间:2011年8月8日

NCGC药物收集您可以根据疾病类型选择治疗方法。 Huang,R.,South All,N.,Wang,Y.,Yasuga,A.,Shin,P.,Jadhav,A.,Nguyen,D.,Austin,C.Sci Transl Med 2011年4月27日。第3卷,第80期,第80ps16。

http://stm.sciencemag.org/content/3/80/80ps16.abstract


卖方:BioBlocks目录(含价格信息)

出版商Bioblock Molecular 2971

高级研究员道格·墨菲

发布时间:2011年8月3日

2989种化合物。

BioBlocks有2200多个支架,构件和片段,这些化合物已被预先鉴定为药物成分。这些化合物中的大多数是由BioBlocks独特提供的,并被广泛应用于各种领域,从药物开发的中间体到肽化学中的氨基酸替代。

有关BioBlocks构建块的最新信息,请访问www.bioblocks.com。


TOX:药物性肝损伤数据(DILI)

发布者BBB分子.519

发布时间:2011年4月29日

药物性肝损伤数据-训练集是Jim Xu的实验数据,测试集是文献数据。

它发表在《药物代谢杂志》上。 2010年12月; 38(12):2302-8。 Epub 2010年9月15日。使用基于配体的贝叶斯模型对人类药物诱发的肝损伤进行预测。

埃金斯S,威廉姆斯AJ,徐继杰。

TB:体内必需基因的目标数据库


Publisher SRI TB目标数据库分子314

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2011年4月21日

结核目标的数据包含TBDB,Biocyc,Metacyc,PDB,PDB,TBDB出版的生物特征信息,Biocyc,Metacyc,PDB,PDB,Pubmed以及斯坦福研究所的Malabika Sarker博士收集的其他文献。被收集。约翰·霍普金斯大学的Gyanu Lamichhane博士感谢提供必要的信息。

**没有与该数据集相关的小分子。


供应商:Enamin代表多元化筛选库

发行人Enamine Molecule 200,000

穆基坚科高级研究员

发布时间:2011年4月12日

我们已经创建了一个原始的200K多样化筛选库,用于协作药物发现。

从全球最大的商业筛选化合物库存中查找发现用户

170万种或更多)。该库具有独家的类药物化合物和复杂的ADME。

您可以了解其特点。我们的优质化合物可以樱桃般的状态立即提供。

我使用的是其他格式。


报告,FDA批准。使用HTS方法重复使用的药物

发布者:体外重用分子109

发布时间:2011年3月18日

使用HTS方法为新应用确定的药物。该表是先前发布的“ Ekins S,Williams AJ,Krasowski MD,Freundlich JS”版本的重要扩展。当今用计算机进行药物定位的Discov。PMID:21376136 doi:10.1016 / j.drudis.2011.02.016该表显示了用于罕见和无礼疾病的分子,古老用途和已获批准的药物。 /目标,新用途/目标,发现方式,参考。

缩写。 CCR5,趋化因子受体5; DHFR,二氢叶酸还原酶; DOA,滥用药物,FDA,食品和药物管理局; GLT1,谷氨酸转运蛋白1; HSP-90,热休克蛋白90; JHCCL,约翰·霍普金斯临床化合物库Mtb,结核分枝杆菌; NK-1,神经激肽-1受体; OCTN2。


更换,经FDA批准。孤儿指定商品

出版者:罕见疾病的再生分子。 76

发布时间:2011年3月18日

FDAの表2 - FDAのリソースである希少疾患研究データベース(RDRD)から、希少疾患の適応で少なくとも1つの販売承認を得ている希少疾患指定製品(http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm)をリストアップしています。このデータは、EkinsとWilliamsによって分析されました(論文提出)。


更换,经FDA批准。孤儿指定商品

发行人:罕见病的再生分子105

发布时间:2011年3月18日

FDAの表1 - FDAのリソースである希少疾患研究データベース(RDRD)から、一般的な疾患の適応症で少なくとも1つの販売承認を得ているオーファン指定製品(http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm)をリストアップしています。

FDA没有将数据与分子结构相关联。


供应商:科罗拉多州药物发现试验图书馆

出版商C2D2已出版分子2240

高级研究员Greg Miknis(副主任)

发布时间:2011年3月7日

该库包含符合药物标准的结构多样的小分子。代表并设计了几种化学型,可应用于多种潜在靶标。

索取资料[电子邮件 protected] 谢谢。


LIPID:脂质映射结构数据库

出版者:脂质图数据库分子22215

脂质组学高级研究员网关

发布时间:2011年2月11日

脂質マップ(http://www.lipidmaps.org/)の構造は、哺乳類の脂肪アシル、グリセロ脂質、グリセロリン脂質、スフィンゴ脂質、ステロール脂質、プレノール脂質を含む5つの共通イオン(H+,2H++,K+,Na+,NH4+)でアノテーションされています。構造とイオンは構造とMWで検索可能で、新規脂質の同定を容易にしている。


结核:德拉贡分枝杆菌

发行者:虚拟代谢物分子.274

发布时间:2010年11月5日

来自Kinnings等人的数据集(在欧洲和美国已批准274种人类使用的药物),《公共科学图书馆·计算生物学》(Vol.6):e1000976(2010)

该数据集可与CDD的其他TB筛查数据集结合使用,以确定哪些药物具有抗Mtb活性(来自文献)。

TB:从文献中可以看出,非复制型Mtb的抑制剂


发行人:CDDCDD-Shaun Ekins Molecular .26

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年10月28日

已发表论文的结构和数据。

Derby and Nathan J Antimicrob Chemother 2010. 65:1424-1427

Bryk et al。,Cell Host and Microbe 2008.3:137-145

Hayashi等人,Arch Biochem Biophys.2010 501:214-220

Lin et al。,J Biol Chem 2008:283:34423-34431。

De Cavallo等:J Med Chem 2009. 52:5789-5792

Hayashi等人,Nature 2009.461:621-626


供应商:Astetic积木收藏

出版商阿斯特奇分子。 6140

发布时间:2010年10月15日

AstaTech,Inc.提供先进和新颖的中间体,以促进药物发现过程。我们的广泛选择包括结构单元,新型胺,受保护的胺,非天然氨基酸,酮,醛,杂环,等位酸酐,硼酸,手性中间体等。订购 [电子邮件 protected] 请联系我们。


卖方:Chemic 2010目录

发行人:CDD Vault Molecules.CDD Vault Molecules.3889

光盘

发布时间:2010年10月5日

Chemic已成功支持Weiss等药物发现公司的早期项目。我们提供从克到吨的原料以及主要中间体。拥有10年在该领域的经验,Chemic可以帮助客户在4-6周内以具有竞争力的价格,出色的质量和持续的服务开发新的中间体。 ..


疟疾:菲和蒽氨基乙醇

发行人:CDD Vault Molecules.CDD Vault Molecules.35

光盘

发布时间:2010年9月21日

我们将抗疟疾药物与卤素取代的蒽和菲N-di和单烷基取代的氨基醇盐酸盐的小鼠的数据进行了比较。有27种化合物具有活性(平均生存期增加> 6天);有8种化合物具有治愈性(IMST> 60天)。该表包含有关详细信息和综合的PubMed ID。


TB:BCG / MTB活动

发行人:诺华(Novartis)诺华:TB Data Molecules.283

老研究员Surinibasa Lao

发布时间:2010年9月15日

有氧BCG活性(MIC50)-274化合物

有氧山地车活性(MIC50)-283

厌氧BCG ATP活性(IC50)283种化合物

厌氧MTB ATP活性(IC50)283种化合物

细胞毒性(CC50)-223复合关键字。分枝杆菌/结核,分枝杆菌/牛,结核


疟疾:JHU JHCCL原生动物恶性疟疾抑制剂

发行人:John's Hopkins-Sullivan John's Hopkins-Sullivan(2008)分子。 2693

发布时间:2010年6月4日

10 microM下2663种批准药物的抑制率

结核,疟疾:GSK疟疾流行的贝叶斯预测


出版商GSK数据贝叶斯模型(Ekins等人13355

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年5月28日

使用贝叶斯模型(Gamo等人,Nature 465:305-310(2010))(Ekins等人,Mol BioSyst 6:840-851(2010))预测GSK疟疾发病率。

活动截止(220,000型号>0.31、2,200モデル>-1.37在整个细胞筛选中被归类为活性物质。

疟疾:圣裘德儿童研究医院全细胞疟疾数据集


发布者。圣裘德-疟疾/ Tripanosoma生物活性分子。 1524

资深研究员Kip Guy

发布时间:2010年5月26日

八种方案的其他数据,包括St.Jude CRH(Guiguemde,W等人,《恶性疟原虫的化学遗传学》,自然465,311-315(2010年5月20日)),在初次筛选中测试的1524个结构。进行Bland-Altman分析,计算出的ADMET特性,系统化学生化筛选,灵敏度,协同效应,酶分析以及热熔体分析。


疟疾:诺华GNF-Pf数据集

发行人:Novartis Novartis疟疾分子5695

发布时间:2010年5月21日

使用基于红细胞的感染测定法从MR4获得的3d7菌株(药物敏感性)和W2菌株(氯喹,奎宁,嘧啶,环鸟嘌呤和磺胺类抗性)对所选化合物的生长抑制敏感性已检查。


弯机:Asinex新抗疟疾筛查设备

出版商Asinex Molecular 1

资深研究员Mark Parisi

发布时间:2010年5月20日

机密数据集:从Asinex获得了594种新化合物。请参阅附件,其中详细说明了ASINEX的设计。

供访问。在授予对数据集的访问权限之前,新的CDD用户您的注册需要经过批准过程。现有的CDD用户- [电子邮件 protected] 请联系。


分销商:Asinex Trescantos(GSK)抗疟疾药物子集

出版商ASINEX Molecules.278

资深研究员Mark Parisi

发布时间:2010年5月20日

278 ASINEX与活性抗疟药GSK的数据一致。

对应的数据集归ASINEX所有。

电话号码1-877-Acinex 1

传真:1-336-721-1618


疟疾:Trescantos抗疟疾药物套装(TCAMS)

出版商GSK抗疟数据分子。 13471

PI。哈维尔·加莫

发布时间:2010年5月19日

在GlaxoSmithkline筛选库中筛选了大约200万种化合物,确定了人类红细胞中超过13,500种恶性疟原虫的生长抑制剂。这项研究是在28760 Tres Cantos的Severa Ochoa 2的Glaxo Smith Klein的Tres Cantos医学发展校区进行的。

结核病:Sacchettini等人的评论-其他抗结核药

发行人PK分子。 18岁

发布时间:2010年2月5日

来自Sacchettini J.C.,Rubin E.J.和Freundlich J.S.图1的未经批准的抗结核药:追求永久性捕食性结核分枝杆菌,《自然评论微生物学》(Nature Reviews Microbiology),6,41-52,(2008)。


结核:小分子专利数据

出版者TB专利数据分子20775

联合药物发现高级研究员

发布时间:2010年1月27日

美国专利商标局,欧洲专利局和世界知识产权组织提供的结核病研究的结构和专利信息。


TB:Makarov等,NM4TB联盟

发行人:CDDCDD --Shaun Ekins Molecular .32

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年1月21日

1,3-苯并噻嗪-4-one(BTZ)的结构活性相关数据。这些数据是从Makarov等人在《科学》杂志上发表的论文“通过阻断阿拉伯合成来杀死苯并噻嗪酮杀死结核分枝杆菌”获得的,该数据于2009年在NM4TB联盟上发表(PMID:19299584)。


供应商:Tim Tech Diversity Set

出版商Tim Tec Molecules.9998

PI。供应商

发布时间:2010年1月5日

10,000种多样的类药物化合物的筛选库


发行人:Timtech OGT抑制剂类似物套装

出版商Tim Tec Molecules.334

PI。供应商

发布时间:2010年1月5日

O-GlcNAc转移酶抑制剂类似物SET


供应商:TimTec ActiTarg-K,激酶调制器

发行人Tim Tec Molecules.6212

PI。供应商

发布时间:2010年1月5日

ActiTarg-K可计数6,000多种化合物,并提供了一种高价值的药物发现样分子筛选库,可识别新型蛋白激酶抑制剂的合成方向。

供应商:Tim Tech Natural Products衍生产品库

出版商Tim Tec Molecules.3001

PI。供应商

发布时间:2010年1月5日

Timtech的NDL-3000天然衍生物


供应商:TimTec天然产品资料库

出版商Tim Tec Molecules.479

PI。供应商

发布时间:2010年1月5日

Tim Tech的NPL纯天然产品


卖方:筛选库

出版商Asis Chem Molecules.43121

发布时间:2009年10月26日

我们有40,000多种类药物的低分子量化合物。所有化合物的库存量最高为25 mg。


卖方:积木

出版商Asis Chem Molecules.176

发布时间:2009年10月26日

可用于药物发现的化合物的集合。如果没有库存,所有化合物都将在几周内提供,最大数量为10克。


TB:TAACF --NIAID CB2库

南方化学研究院分子出版社102634

高级研究员罗伯特·戈德曼

发布时间:2009年9月30日

使用市售化合物库(ChemBridge)筛选抑制结核分枝杆菌菌株H37Rv的生长的能力的结果,发现具有抑制结核分枝杆菌菌株H37Rv的生长的能力。 PMID:19758845。


TB:EthR抑制剂(Willand等)

发行人:CDDCDD-Shaun Ekins Nume.5

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2009年9月28日

转录抑制因子EthR的药物样抑制剂。遗传信息的分子和数据Nature Medicine 15:537-544(2009)PMID:19412174


VENDOR,ADME:来自结构多样的非处方药的基准数据。

发行人NM4TB:Karen Group网站Molecular。二十四

资深研究员Anders Karen

发布时间:2009年6月11日

我们对瑞典市场上出售的药物进行了多变量分析,并选择了24种理化性质不同的化合物。在选择时,要考虑到诸如结构多样性,商业产品的可获得性,价格以及适合量化的分析技术等因素。对于选定的数据集,测量了在人Caco-2细胞单层中的亲脂性,pKa,溶解度和渗透性。该数据集有望作为测试新实验技术和计算机模型的基准。它也可以用作数据集,作为开发新计算模型的起点。

数据源。

为相关性和基准研究提供了结构多样且可商购的药物的数据集。

缩放比例C,Winiwarter S,Wernevik J,BergströmF,EngströmL,Allen R,Box K,Comer J,Mol J,Hallberg,LennernäsH,Lundstedt T,Ungell AL,KarlénA.

J Med Chem.2006年11月16日; 49(23):6660-71。


TB:已发表文献的吸收数据

发行商CDD:TB精选文学分子24

发布时间:2009年5月28日

参考文献中的结核吸收数据

5'-O- [N-(saltl)氨磺酰基]腺苷的2-三唑取代类似物对铁载体生物合成的抑制:一种有效的抗结核菌核苷类似物。

A.Gupte; H.I. Boshoff; D.J. Wilson; N.P. Labello; R.V. Somu; R.V. Xing; C.E. Barry; C.C. Aldrich

J Med Chem(2008)第51卷,第23期,第7495-7507页渗透性数据。


TB:公开文献中的药代动力学数据

发行商CDD:TB精选文学分子28。

发布时间:2009年5月28日

TB药代动力学数据来自已发表的文献资料。 28种独特和常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引文,靶标,细胞和受测生物,生物利用度,Vm,Vd,Cmax等。


TB:已发表文献的毒性数据

发行商CDD:TB精选文学分子638

发布时间:2009年5月28日

结核毒性数据来自已发表的文献资料。来自PubMed参考文献的638种独特和常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed报价,靶标,细胞和生物睾丸,细胞生存力,LD50,CC50,MNTD等。


TB:来自公开文献的有效性数据

发行人CDD:TB策划的文学分子。 6768

发布时间:2009年5月28日

从公开文献来源获得的结核病有效性数据。来自300多种PubMed参考文献的6771种独特和常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引文,靶标,细胞和生物睾丸,MIC,%抑制,EC50-EC100,IC50等。


TB:MLSMR

南方化学研究院分子出版社.214507

高级研究员罗伯特·戈德曼

发布时间:2009年5月8日

在2008年春季,由分子图书馆小分子知识库(MLSMR)收集的200,000多种化合物被提供给南方研究分子图书馆筛选中心,用于Mtb H37Rv的初步测试。从该初次筛选中选择最具活性的化合物,并在H37Rv的剂量反应分析和Vero细胞的细胞毒性反筛选中以10的浓度进行测试。


疟疾:约翰霍普金斯大学临床化合物图书馆

发行人:John's Hopkins-Sullivan John's Hopkins-Sullivan(2008)分子。 1878年

发布时间:2009年4月28日

以10μM的浓度筛选药物。在含有10%人血清的RPMI 1640培养基中培养对chlorokin敏感的3D7或耐多药的Dd2的同步环阶段寄生虫,并在药物和[3H]-黄嘌呤存在下孵育48或96小时。在每孔0.2 mL培养物,0.2%寄生虫病和2-4%血细胞比容的96孔板中,背景计数小于500 cpm,在48小时时小于10,000 cpm,在96小时时小于20,000。获得了cpm无线电摄取信号。筛选实验加倍,抑制百分比报告为两次实验的平均值。


TB:文献综述

出版商结核病文献数据分子。 49

PI。桶等

发布时间:2009年4月17日

结核病SAR数据是由对结核分枝杆菌有活性的药物调查得出的,包括具有已知作用机制和未知作用机制的药物(Ballel等人,“新型小分子合成抗分枝杆菌药”中的抗菌药物和化疗,2005年6月)。在4/17中更新了TubercuList / TBDB /其他目标链接和改进的参考。


TB:Sacchettini等人,评论

发行人:CDDCDD --Shaun Ekins Molecular .14

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2009年2月18日

Sacchettini JC,Rubin EJ和Freundlich JS药物与bug:追求顽固的结核分枝杆菌,《自然评论微生物学》(Nature Reviews Microbiology),第6卷,第41-52页,(2008年),表1和2的一线和二线抗药性。结核剂。


供应商:IUPUI分布式药物发现(D3)公共数据

发布者:IUPUI --D3枚举73K N-酰基AA-OH,-OMe,-NH2分子.48818

高级研究员M. J. O'Donnell,W. L. Scott

发布日期:2009年1月1日

酰化非天然氨基酸及其甲酯的开放式虚拟目录。我们鼓励您就您对“分布式药物发现”项目和合成方法的兴趣与我们的同行联系,这三篇论文在《组合化学杂志》上发表。


发行人:Asinex Building Block

出版商Asinex Molecular 6745

资深研究员Mark Parisi

发布时间:2008年12月23日

如果您正在考虑一项潜在客户优化计划,我们的构建基块可能会证明您正在寻找的正是这些。


寄生虫:香水

发行人:CDDCDD-Shaun Ekins Molecule .228

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月21日

我们从罗曼·凯瑟(Roman Kaiser)于2006年在Wiley-VCH上出版的《世界的有意义的气味》一书中获得了有关气味的分子名称和结构名称的数据。分子编号与书中的编号有关。


毒物:毒物演员

发行人:CDDCDD-肖恩·埃金斯分子.306

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月18日

EPAの化合物(主に殺虫剤)のトックスキャストライブラリは、http://www.epa.gov/ncct/dsstox/DataFiles.html から入手可能です。

http://www.epa.gov/ncct/toxcast/


FDA批准的TOX:每日最大推荐剂量

发行人:CDDCDD-肖恩·埃金斯分子.1215

资深研究员肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月10日

FDA数据库包含超过1200种药物的每日最大推荐剂量。该数据集表示以下出版物中使用的一些分子: Matthews,E.J.等人,Current Drug Discovery Technologies,1(1):61-76。(2004)


本德尔:阿育吠陀传统与当前医疗保健需求之间的关系

发行者:Falguni Dasgupta:个人数据编辑分子。 37

Falgunidas Gupta高级研究员

发布时间:2008年10月30日

寻找共同点,重新评估索赔,创造符合法规要求的医疗保健和保健机会,新药,以及对印度药用植物及其提取物的传统使用的现代看法目的是发现“线索”。


寄生虫:Sandler-UCSF Celera半胱氨酸蛋白酶抑制剂库

出版商McKello Group分子。 1860年

资深研究员Jim McKello

发布时间:2008年10月23日

体外克氏锥虫和布氏锥虫寄生虫及特异性酶筛选。


FDA批准。批准药品

出版商Johns Hopkins Clinical Compound Library Molecular 2815

高级研究员David Sullivan

发布时间:2008年10月16日

FDA已经批准了具有明确分子结构的药物,包括Physicians'Desk Desk Reference中的763个分子,DrugBank中的780个分子,Orange Book 2007中的1151个分子以及Chris Lipinski博士的FDA名单中的1007个分子。


供应商:ASINEX GPCR重点库

出版商Asinex Molecular 3502

资深研究员Mark Parisi

发布时间:2008年10月2日

以优惠的价格向CDD社区提供了面向GPCR的高质量套装。该库结合了我们在药物化学方面的专业知识以及从文献中鉴定特权片段并以前所未有的方式组装它们的能力。


GPCR.PDSP Ki数据库

发布者。 PDSP Ki数据库分子20026

资深研究员Brian Ross

发布时间:2008年9月16日

NIMH精神药物筛查计划(PDSP)数据库中的699个GPCR目标的超过47,000 Ki值


供应商:ASINEX Synergy库

出版商ASINEX Molecules.25008

资深研究员Mark Parisi

发布时间:2008年4月26日

Asinex开发了一个新的高多样性文库,该文库富含药物样药效团。该库的设计基于两种协同形式。首先是多样化和面向目标技术之间的相互关系,其次是多步关键中间体(6-9步)的融合,以生产复杂的化合物。手段。有关详细信息,请参见下面的PDF。


TOX:具有确定的毒性特征的结构的公共数据

已知对发布者有毒的结构使分子轮廓化。 135

高级研究员Sean Ekins博士

发布时间:2008年3月28日

参考已知化合物的组织特异性毒性特征


Shoishe宣布了Promise Cure抑制剂Promise Cure抑制剂

发布者:Promise Inhibitor Mole。111

资深研究员Brian Shoiche

发布时间:2008年3月26日

由于水溶液中有机分子的自组装而产生“假阳性”的聚集体


TOX:UC Davis-吊床的公开数据

出版商加州大学戴维斯分校-吊床分子。 714

布鲁斯·汉莫克(Bruce Hammock)高级研究员

发布时间:2008年3月17日

可溶性环氧水解酶(sEH)的抑制剂-这些酶具有三个主要功能:解毒,分解代谢和调节信号分子。


疟疾,TRYPANOSOME。圣裘德公共数据

发布者。圣裘德-疟疾/ Tripanosoma生物活性分子。 2426

资深研究员Kip Guy

发布时间:2008年3月5日

圣裘德儿童研究医院Kip Guy实验室开放获取的结果,包括HTS(一种用于疟疾和布鲁氏杆菌的生物活性剂)


疟疾:Drexel公共数据

出版商:德雷克塞尔大学德雷克塞尔大学分子学院。 195

高级研究员让·克劳德·布拉德利

发布时间:2008年3月2日

正在进行的开放数据合作的结果

Drexel(Ugi-4CC产品)和UCSF(抗疟疾药物筛选)。该数据集显示了一个示例,说明研究人员如何选择公开发布他们选择的结果。 (相反,默认情况下,所有组都是私有的)。


疟疾:美国军事调查

出版商美国陆军疟疾文献检索分子。 12318

 

发布时间:2008年2月29日

抗疟疾药物的大量动物SAR数据,包括化学结构,生理活性数据,药理学数据和毒性数据(由美国陆军于1946年以“疟疾药物调查”的形式发布。


疟疾:PlasmoDB

出版商UPenn-Malaria文献数据分子。 120

高级研究员David Ruth

发布时间:2008年2月19日

PlasmoDB是一种疟疾抑制药,已从文献中汇编而成,可作为化学结构,PlasmoDB基因标识符,目标基因名称以及恶性疟原虫,间日疟原虫,伯氏疟原虫,yoelii疟原虫,chabaudi疟原虫的参考。包括文献。


疟疾:天然产物(NPPDB)

出版商国家自然产品研究中心分子.426

高级研究员Bab Techwani

发布时间:2008年2月15日

含有黄酮天然产物的抗疟疾和细胞毒性数据的抗疟疾数据库(密西西比大学,国家天然产物研究中心)


TB:TAACF分析结果

结核病早期药物发现者计划分子.812

资深研究员Bernard Munos

发布时间:2008年2月12日

Alamar Blue全细胞测定法中812种化合物对肺结核(H37Rv)的抗菌活性


FDA批准。孤儿药

出版商1721已知的药物分子

资深研究员Christopher Lipinsky

发布时间:2007年10月26日

FDA批准的具有指定适应症,保荐人姓名,化学结构(如果有)的药物