公众接触

作为一项社区服务,CDD托管着世界领先的研究小组与药物发现有关的公共访问数据。

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EDASA COVID-19可用于合作的化合物存储库

出版者:Andrea Altieri,博士学位分子:2733

发布时间:2020年5月12日

EDASA Scientific,小型MedChem组织(http://www.edasascientific.com)正在COVID-19区域寻找生物伙伴。 EDASA拥有大约2700种化合物的库存,愿意免费提供这些化合物(由收件人支付运费)进行测试,如果结果是肯定的,则准备指派化学家进行活性化合物的优化和进一步的开发。 。 EDASA愿意探索这些化合物中任何一种的计算机修饰,并免费合成有限数量的修饰化合物作为概念验证。接收到的数据的全部或部分将与IF以联合提交的形式发表在科学期刊上>3.请注意,所有这些化合物都是EDASA Scientific拥有的内部化合物,我们已经为所有化合物开发了经过验证的合成方案。


COVID-19活性片段Mpro

发布者:亚历克斯·克拉克分子:1003

发布时间:2020年3月28日

被发现对Mpro / COVID19有活性的碎片是由Diamond Light Source提供的,该晶体结构是由英国国家同步加速器科学实验室与Dectris合作提供的(Diamond在所有MX实验中都使用了检测器)。有关原始数据,请参见: //www.diamond.ac.uk/covid-19/for-scientists/Main-protease-structure-and-XChem/Downloads.html


佩拉拉方舟

发布者:Perlstein实验室分子:56756

PI:Ethan Perlstein

发行:10/27/2019

基于开源模型的完全开源的表型筛选表型数据,包括酵母,蠕虫,果蝇和人体细胞模型中先天性代谢错误的药物再利用和前导发现筛选,例如溶酶体疾病和先天性糖基化疾病。这些数据已在G3期刊的三个案例研究中发表(Lao等,2019 //www.g3journal.org/内容/ 9/2 / 413.long)和疾病模型与机制(Iyer等,2019a //dmm.biologists.org/内容/开始/ 2019/09/18 / dmm。040576.长Iyer等人,2019b //dmm.biologists.org/内容/开始/ 2019/10/19 / dmm。040584.长)。


体外血清素受体和体内活性

发布者:尼科尔斯分子:84

PI:Dave Nichols

发行:10/14/2019

数据集关注使用多巴胺或5-羟色胺作为神经递质的大脑系统。这包括仅对五种通用类型的多巴胺受体(D1-D5)中的一种具有特异性的分子探针,以及关于5-羟色胺5-HT1A,5-HT2A和5-HT2C受体的数据集。这些设计包括系统的结构修饰以及药理学分析,以鉴定这些受体中配体结合域的结构决定簇。这项工作的主题是确定如何将不同化学类别的分子全部容纳在同一受体结合位点内。


多发性硬化症:OL分化

发布者:髓磷脂修复基础分子:710

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月21日

免疫纯化的O4急性少突胶质细胞分化测定OPC接种于5k /孔。铺板后1小时,加入测试物品并将细胞温育四天,其中将细胞固定并针对MBP和总核(DAPI)进行免疫染色。 OL中的OPC分化是通过对MBP染色/细胞数(通过DAPI核染色确定)进行定量来确定的。化合物筛选以2种浓度一式四份进行(10& 2 uM; 2 & 0,4 uM; 0,4 &0.08 µM)。将数据标准化为DMSO(0%差异)和40 ng / mL T3(100%差异)。 EC50是相对于被测物品的EMax来确定的。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等。等BMC Res Notes。 2016 Sep 5; 9(1):419或联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多发性硬化症:OL保护

发布者:髓磷脂修复基金会分子:723

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月21日

少突胶质细胞保护测试-生存力(TNF + IFNg)将扩增的OPCs以10K /孔接种。电镀后24小时,添加测试物品,添加1小时后,添加10U / mlIFN​​-γ/ 1ng / mlTNF-α的侮辱。孵育2天,添加AlamarBlue并孵育4小时。定量AlamarBlue荧光以读取细胞活力。数据按DMSO(0%活性)和1.1 uM喹硫平(100%活性)定标。有关技术细节,请参阅Rosler等。等BMC Res Notes。 2016年9月5日; 9(1):444联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多发性硬化症:髓鞘形成测试

发布者:髓磷脂修复基础分子:715

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月21日

制备大脑皮质E18皮质髓鞘形成测试细胞,并将其铺板在神经基底培养基中。四天后,媒体切换到MyM媒体。在第五天,添加测试项目,并且髓鞘化可以进行八天。在体外第13天,固定细胞并免疫MBP和Olig2。通过量化MBP / Olig2 +细胞核染色和MBP形态的变化(MBP连续染色排列-纤维长度)来确定髓鞘形成。 OL分化是通过对MBP密度x面积/ Olig2 +核的定量来确定的。一式两份以2个浓度(4图像/孔)筛选化合物&1 uM)。将数据归一化为DMSO(0%分化/髓鞘形成)和DAPT(100%分化/髓鞘形成)。确定相对于对1 uM DAPT的反应的EC50。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等。等,BMC Neurosci。 2016 2016年4月22日; 17:16或联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多发性硬化:HEK293衣霉素保护试验

发布者:髓磷脂修复基金会分子:740

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月7日

HEK-293防护测试

 

将HEK-293细胞(10K /孔)孵育24小时,然后添加测试物品。 1小时后,加入100ng / ml的衣霉素。再孵育48小时后,添加AlamarBlue,并在4小时后对荧光进行定量。将数据标准化为DMSO(0%活性)和5 uM guanabenz(100%活性)。 EC50是根据所考虑物品的EMax确定的。联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


多发性硬化症:OL毒性筛查

发布者:髓磷脂修复基金会分子:709

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月7日

少突胶质细胞毒性试验(TNF + IFNg)

 

大鼠OPC毒性测试通过,以10k /孔接种于药物中孵育2天。孵育4小时后,读数为AlamarBlue荧光。数据以相对于DMSO(100%)的存活百分比表示。最大杀伤力是5 ng / ml衣霉素,可使约15%的细胞存活。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等人,BMC Res Notes。 2016 Sep 5,2016; 9(1):419或联系 [电子邮件 protected] 有关详细的协议。


绿色溶剂

发布者:亚历克斯·克拉克·沙盒分子:117

发布时间:2016年9月20日

I dati dei Green Solvents, utilizzati dall'omonima applicazione mobile (http://molmatinf.com/greensolvents.html). Compilati da informazioni pubblicate dall'ACS Green Chemical Institute e dalla GSK Solvent Guide. Pubblicato in http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/sc3000509.


帕拉西迪:GSK Kineto Box搭配pIC50

发布者:GSK Kineto Box Project(TCAKS)GSK分子:592

PI:皮拉尔·曼萨诺(Pilar Manzano)

发布时间:2016年6月16日

Utilizzando saggi fenotipici a cellule intere, il set di diversità di GlaxoSmithKline high-throughput screening (HTS) di 1,8 milioni di composti è stato sottoposto a screening contro i tre cinetoplastidi più rilevanti per la malattia umana, cioè Leishmania donovani, Trypanosoma cruzi e Trypanosoma brucei. Sono stati condotti saggi secondari di conferma e test antiparassitari intracellulari ortogonali e si è determinato il potenziale di citotossicità non specifica. Hit composti sono stati raggruppati chimicamente e triaged per le proprietà fisico-chimiche desiderabili. L'ipotetico spazio target biologico coperto da questi insiemi di diversità è stato studiato attraverso metodologie bioinformatiche. Di conseguenza, sono state assemblate tre scatole chimiche anti-kinetoplastide di circa 200 composti ciascuna. Questo set di dati include i composti colpiti e tutti i risultati di screening associati. http://www.nature.com/articles/srep08771


供应商:ASINEX PPI库

发布者:ASINEX分子:8400

PI:Marco Parisi

发布时间:2016年3月3日

自2008年以来,ASINEX一直致力于蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)库的设计和合成。最新一代的ASINEX PPI库包含各种大小,结构和形状的分子,范围从片段实体到被设计为结构模拟物的大环衍生物次要的或模仿的表位。


供应商:ASINEX Elite库

发布者:ASINEX分子:12960

PI:Marco Parisi

发布时间:2016年3月3日

最初的“打击”之后有什么问题? Asinex通过广泛的ADME配置文件,可轻松进行药物化学修饰的最佳设计以及可确保新颖性的知识产权评估来解决这些问题。


供应商:ASINEX表型库

发布者:ASINEX分子:9840

PI:Marco Parisi

发布时间:2016年3月3日

Asinex在内部执行靶向和表型分析,并使用收集到的实验信息创建靶向和多样化的筛选集。通过这种经验,Ainex创建了一个表型筛选集。该集合的过滤器如下:

MW:200-450,clogP:-1.0-7.0,clogD(pH 7.4):-5.0-4.0,Rot.Bond:0-10,HA:1-10,HD:1-5,TPSA:15-135 A ,N + O:2-10,HAC:19-34,偶极子:0.3-3.30,SHP2:0.240-0.450。


提供者:ASINEX多样性库

发布者:ASINEX分子:9968

PI:Marco Parisi

发布时间:2016年3月3日

多样性仍然是一种强大的筛选工具,尤其是在药物发现的早期“探针”阶段。在创建此集合时,Ainex应用了计算工具以确保充分体现化学空间,同时还结合了其“精英”和“生物设计”概念的元素。


供应商:ASINEX BioDesign

发布者:ASINEX分子:8041

PI:Marco Parisi

发布时间:2016年3月3日

ASINEX的BioDesign方法将已知和与药理相关的天然产物(例如生物碱和其他次生代谢产物)的关键结构特征整合到可合成的医学化学货架中。


产品目录:分布式药物发现(D3)-IUPUI

发布者:IUPUI-D3枚举73K N-酰基AAA-OH,-OMe,-NH2分子:73234

PI:M. J. O'Donnell和W. L. Scott

发布时间:2016年2月24日

免费开放的虚拟目录/库>73,000个分子:(a)N-酰基非天然α-氨基酸,(b)N-酰基非天然α-氨基酸的甲基酯,和(c)N-酰基非天然α-氨基酸的伯酰胺。目录中的分子是通过基于等效的甘氨酸阴离子与100 R1X的组合固相烷基化,然后与100 R2CO2H进行N-酰化以及树脂裂解(分别为TFA,MeOH / Et3N或TFA)的列举而获得的)。 2009年1月1日发布了48,818个分子的遗留数据集(在集合a和b之上以及输入R1X和R2CO2H)。我们鼓励同事与我们交流有关D3项目的兴趣(电子邮件: [电子邮件 protected]<mailto:[电子邮件 protected]>o<mailto:[电子邮件 protected]>[电子邮件 protected])。参考文献:J. Comb。化学。 2009,11,3-13,14-33,34-43; J.Org。化学2014,79,3140-51; J.化学教育。 2015,92,819-26。</mailto:[电子邮件 protected]></mailto:[电子邮件 protected]>


疟疾:针对GSK TCAMS的5 P.恶性疟原虫激酶的生化筛选

发布者:Gregory J. Crowther分子:13451

PI:Gregory J. Crowther

发布时间:2016年2月3日

筛选了约13,500种celi活性化合物对五种不同蛋白激酶的活性。葛兰素史克(GlaxoSmithKline)的Tres Cantos抗疟疾套装(TCAMS)已在恶性疟原虫钙依赖性蛋白激酶1和4(CDPK1 / PF3D7_0217500和CDPK4 / PF3D7_0717500),蛋白激酶_ 211K2 / MAP713K2与MAP相关的MAP的生化测试中进行了测试,蛋白激酶6(PK6 / PF3D7_1337100)和蛋白激酶7(PK7 / PF3D7_0213400)。已发现新的有效抑制剂(IC50<三种激酶:CDPK1,CDPK4和PK6:1 µM)。 PK6抑制剂是有史以来针对该酶发现的最有效的药物,值得进一步研究。


暗物质的公共化合物

发布者:暗物质化合物分子:139352

PI:吉列尔莫·莫拉莱斯(Guillermo Morales)

发布时间:2015年12月7日

诺华发现,至少有100项诺华测试已测试了803,990种化合物,其中112,872种化合物没有活性(占14.0%)。对NIH数据的分析表明,在至少100种测定中测试了363,598种化合物,其中131,726种化合物无效(36.2%)。

安妮·迈·瓦瑟曼(Anne Mai Wassermann),尤金·伦肯(Eugen Lounkine),多米尼克·霍普夫纳(Dominic Hoepfner),盖勒·勒高夫(Gaelle Le Goff),弗雷德里克·金(Frederick J King),克里斯蒂安·斯图德尔(Christian Studer),约翰·佩尔帖(John M Peltier),梅利莎·拉·格里波(Mirissa L Grippo),薇薇安·普林德尔(Vivian Prindle),陶剑石,安斯加·舒芬豪尔(Ianin M Wallace),陈妮(Shanni Chen),菲利普·克拉斯特(Philipp Krastel),阿曼达·科沃斯(Amanda Cobos) -Correa,Christian N Parker,John W Davies &梅尔·格里克(Meir Glick)。深色化学物质是发现铅的有希望的起点。 Nature Chemical Biology 2015,第11卷,第pp。 958-966(doi:10.1038 / nchembio.1936)


ADME:公共数据AZ ChEMBL

发布者:AZ Public ChEMBL数据分子:5799

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2015年10月5日

关于在阿斯利康测定的一组公开披露的化合物的DMPK体外实验数据和理化数据。为测定提供的参考举例说明了用于产生数据的实验程序。

//www.ebi.ac.uk/chembl/doc/inspect/CHEMBL3301361% legato al plasma per dialisi di equilibrio. Il composto viene incubato con plasma di cavia intero a 37C per >5 ore. Metodo descritto in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Strategie biologiche, fisico-chimiche e computazionali, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Intervallo sperimentale dal 10% al 99,95% legato al plasma mediante dialisi di equilibrio. Il composto viene incubato con plasma di cane intero a 37C per >5 ore. Metodo descritto in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Strategie biologiche, fisico-chimiche e computazionali, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Intervallo sperimentale dal 10% al 99,95% legato al plasma mediante dialisi di equilibrio. Il composto viene incubato con plasma di ratto intero a 37C per >5 ore. Metodo descritto in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Strategie biologiche, fisico-chimiche e computazionali, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Intervallo sperimentale dal 10% al 99,95% legato al plasma mediante dialisi di equilibrio. Il composto viene incubato con plasma di topo intero a 37C per >5 ore. Metodo descritto in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Strategie biologiche, fisico-chimiche e computazionali, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Intervallo sperimentale dal 10% al 99,95% legato.clearance intrinseca misurata in epatociti umani dopo l'incubazione a 37C. Intervallo sperimentale <3 a >150 microL/min/1E6 cellule. Comunicazioni rapide. Spettrometro di massa. 2010, 24, 1730-1736.Valore pKa più elementare (pKa B1) determinato mediante assorbimento e titolazione potenziometrica utilizzando la metodologia standard di Sirius Analytical. Gamma sperimentale Basi: >= 2.Secondo valore pKa più acido (pKa A2) determinato mediante assorbimento e titolazione potenziometrica utilizzando la metodologia standard di Sirius Analytical. Intervallo sperimentale Acidi: <= 11.

用标准Sirius分析方法通过吸收和电位滴定法确定三阶pKa值(pKa B3)。实验范围基准:>= 2.

使用标准Sirius分析方法通过吸收和电位滴定确定的第二个基本pKa值(pKa B2)。实验范围基准:>= 2.

使用标准Sirius分析方法通过吸收和电位滴定确定更多的酸pKa值(pKa A1)。实验范围酸:<= 11.


PDB配体

发布者:Protein Data Bank(PDB)分子:16826

PI:Dale R. Cameron,博士,M.C.I.C.,P.Chem。

发布时间:2015年8月3日

从PDB中提取配体信息,进行过滤以除去“聚合物”和其他相关的“非游离”配体以及金属或金属配体。可能会在不通知的情况下更新过滤过程。数据按原样提供,无需进一步护理或纠错。到PDB的链接由RCSB PBD提供,可以称为

H.M. Berman,J.Westbrook,Z.Feng,G.Gilliland,T.N。 Bhat,H.Weissig,I.N.辛达洛夫(PE) Bourne(2000),蛋白质数据库核酸研究,28:235-242。

请向保管库管理员报告断开的链接,对其他数据的请求等。


EBOLA:埃博拉病毒的小分子抑制剂

出版者:纳迪亚的沙盒分子:55

PI:Nadia Litterman博士

发布时间:2015年2月2日

该共享数据集包含来自文献(截至2015年1月)的55个小分子,这些小分子具有针对埃博拉病毒和多种疾病模型的体外和/或体内活性。我们已经包括了医学化学家的评估以及PAIN过滤的结果。 (这项工作由Nadia Litterman,Christopher Lipinski和Sean Ekins提交给F1000Research出版)。


供应商:Synthonix-建立更好的债券

Pubblicato da: http://www.synthonix.com Molecules: 10286

发布时间:2015年1月2日

Synthonix通过提供10286个构建基块的目录来帮助药物化学家突破药物发现的界限,使他们能够探索最具挑战性的化学领域,并扩大用于治疗慢性和可治疗疾病的潜在重要治疗靶标的范围。世界的。 Synthonix,Inc:919-875-9277;普通电子邮件: [电子邮件 protected]; Synthonix Ltd(欧洲办事处):办公室:+44 1223 597934;电子邮件: [电子邮件 protected]


问题:NIH化学探针

发布者:探针分子库:319

PI:Christopher Lipinski

发布时间:2014年11月12日

美国国立卫生研究院(NIH)在壁画内和学术中心资助了大型HTS努力,估计费用超过5.76亿美元,用于通过以下方式识别小分子化学探针或仪器化合物分子图书馆筛选中心网络(MLSCN)和分子图书馆探针生产中心网络(MLPCN)。对于要用作探针的化合物,根据效价,选择性,溶解性和有效性的组合使用了各种定义。迄今为止,NIH资助的学术筛选中心已经发现了300多种化学探针。该集合包括探针结构,靶标,抗靶标,IC50值和其他参考。它还包括各种药物相似性度量,包括Chris Lipinski博士分配的合意性得分,如“专家化学探针评估的计算预测和验证”中所述。 Litterman NK,Lipinski CA,Buinin BA,Ekins S.J Chem Inf Model。 (2014年)


供应商:Azepine Ltd.积木系列

出版者:Azepine Ltd.分子:600

PI:朱莉娅

发布时间:2014年10月8日

600块,现货供应,价格具有竞争力。联系 [电子邮件 protected]


NEU-CSIC-GSK激酶靶HTS

发布者:Laboratorio Pollastri-东北大学分子:78

PI:Michael Pollastri

发布时间:2014年9月25日

该数据集包含由东北大学(Laboratorio Pollastri),CSIC(Laboratorio Navarro)和葛兰素史克(GlaxoSmithKline Tres Cantos Laboratory)(发展中国家DPU疾病)合作创建的高通量屏幕的发布结果。本文是Diaz等人的PLoS-NTD:

 

DOI:10.1371 / journal.pntd.0003253

 

请联系 [电子邮件 protected] 有问题


卖方:Vitas-M Laboratory Stock HTS Collection

发布者:Vitas-M实验室分子:388375

发布时间:2014年7月11日

维塔斯M实验室有限公司HTS化合物的库存量约为400,000个单分子。所有产品都可以以各种形式快速交付,包括毫克,微摩尔,干粉,DMSO溶液和干膜。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


卖方:Vitas-M实验室构建块

发布者:Vitas-M实验室分子:33297

发布时间:2014年7月10日

维塔斯M实验室有限公司有机块收集包含超过33,000个已识别和测试的项目。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


卖方:Vitas-M实验室脚手架

出版者:Vitas-M实验室分子:2898

发布时间:2014年7月8日

维塔斯M实验室有限公司脚手架系列(杜鹃花项目)。合成药物微型库的高级想法。这是获得其他任何供应商都无法提供的全新化合物的最佳选择。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


卖方:Vitas-M实验室碎片

发布者:Vitas-M实验室分子:18631

发布时间:2014年7月8日

维塔斯M实验室有限公司用于基于片段的药物发现的片段收集(化学物质通过“ 3条规则”和其他特殊过滤器)。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件 protected]


供应商:生命化学-GPCR库

出版者:生命化学分子:15948

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

La ricerca per similarità/farmacoforo si basava sulla previsione di Topomer Search fornita da Sybyl-X. Primo passo - una ricerca per similarità presupponeva un confronto di interi composti di stock con inibitori noti derivati da BindingeDB e ChemblDB. Secondo passo - generazione di strutture 3D di inibitori noti e loro coallineamento. Questo spazio spaziale chimico è stato usato come modello per il montaggio del resto dei composti "simili". Tuttavia questo è metodo è stato progettato per "cherry-picking" e una libreria alternativa può essere fatto con metodi di screening virtuale (tutti i modelli di screening un pronto e dimostrato con set di formazione) contro tali recettori - adenosina, chemochina, dopamina, gaba, istamina, muscarinico, oppioide, sfingosina. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学品-相似激酶

发布者:生命化学分子:62467

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Ricerca per similarità utilizzando le chiavi pubbliche MDL e il cut-off di similitudine Tanimoto del 90%. Per la ricerca per similarità sono stati utilizzati quasi 25K composti di riferimento che sono stati testati attivi in 168 saggi biologici (più di 100 diversi bersagli chinasi). Tutti questi composti hanno potuto essere analizzati rispetto a target più specifici fino all'ordine del cliente. http://www.lifechemicals.com/


卖方:生命化学品-激酶对接

发布者:生命化学分子:15174

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

La libreria Kinase è stata preparata basandosi su un docking virtuale in ambiente Sybyl. A questo scopo sono stati allineati e analizzati una serie di siti di binding delle strutture chinasi (circa 20). Tali siti sovrapposti sono stati utilizzati per la modellazione farmacocorporea basata su strutture tramite il modulo Unity di Sybyl-X. Dopo tutta la preparazione è stato sottoposto a screening un intero stock 3D rispetto a questo modello multifarmacoforo e alla fine è stato eseguito un top-ranking. http://www.lifechemicals.com/


卖方:生命化学物质-核受体

出版者:生命化学分子:9896

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Life Chemicals. Docking virtuale e ricerca per similarità/farmacoforo. http://www.lifechemicals.com/


卖方:终身化学制品-Biblioteca del SNC

发布者:生命化学分子:16535

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

I filtri CNS descritti in letteratura sono stati utilizzati come setaccio per tutto il nostro stock. Come è stato dimostrato, gli unici composti con tali parametri possono avere caratteristiche appropriate per la permeabilità del tessuto nervoso. Tutti i descrittori sono stati ottenuti da fogli di calcolo e moduli Volsurf di Sybyl. (MW 200 = 350 cLogP =< 3,6 H-Bond Acceptors =< 8 H-Bond Donors =< 5 tPSA =< 120 Rotatable Bonds =< 5 LogBB1 = -3,0 a 1,0) http://www.lifechemicals.com/


供应商:生活用化学药品-天然产品-像图书馆一样

出版者:生命化学分子:7808

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Il primo metodo si basava sull'analisi statistica dei descrittori. In precedenza è stato analizzato un ampio database di NP per studiare le impalcature NP disponendole a forma di albero. Così l'analisi della distribuzione delle proprietà di più di 130 000 strutture NP così come l'identificazione delle sottostrutture tipiche per particolari classi di composti naturali sono state effettuate per generare un insieme di frammenti di solito presenti nei composti naturali. Questo metodo è stato testato su CRC Dictionary of Natural Products (DNP) e su molecole sintetiche (SM). Un altro metodo si basa sulla valutazione della somiglianza delle impalcature. Il numero di firme di atomi (da frammenti di rete) generate per una molecola è uguale al numero di atomi che compongono la molecola. Ogni firma di atomo rappresenta in modo indipendente una caratteristica strutturale/frammento della molecola, e viene calcolato un punteggio individuale per essa. più alto numero di atomi dall'ottenere un punteggio più alto. Per riprodurre tale esperimento abbiamo utilizzato un modulo implementato Chemistry Development Kit in CDK-Taverna 2.0. Esso contiene un marcatore NP-Likeness v1.4.1 che calcola la probabilità di prodotto naturale (NP) di una molecola, cioè la somiglianza della molecola con lo spazio della struttura coperto da prodotti naturali noti. Tutti i risultati sono stati valutati e vanno da -3 a +3. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学品-收集化学品进行筛选

出版者:生命化学分子:371998

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Piccole molecole di piccole dimensioni accuratamente progettate, innovative, simili a quelle della droga, con la regola del 5 di Lipinski e l'unica ragione per la deviazione dall'insieme di questi parametri è un'impalcatura unica o una chimica non standard. E' pronto per l'applicazione di filtri per la chimica medicinale come il DOLORE o qualsiasi filtro mirato (solubilità, permeabilità, BBB). http://www.lifechemicals.com/


供应商:终身使用的化学品-具有保证溶解度的碎片

发布者:生命化学分子:8241

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

I composti dei frammenti sono stati selezionati filtrando l'intero stock di LC con la "Regola del tre" modificata. I frammenti sono stati testati per la solubilità in laboratorio di analisi. La solubilità è garantita a 200mM di concentrazione in DMSO, e il 75% dei frammenti sono solubili in tampone a pH7.5 a 1mM di concentrazione. http://www.lifechemicals.com/


TB:文献中的体内小鼠功效

发布者:TB体内数据2分子:778

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2014年4月10日

展望未来:预测小分子对抗结核分枝杆菌的体内功效。在疾病的动物模型中将疾病的线索进行体外选择并将其翻译成具有体内活性的分子是一项耗时且昂贵的挑战。我们演示了使用773种化合物组成的机器学习分类模型(贝叶斯,支持向量机和递归分区),从体内有活性和无活性的化合物中学习。贝叶斯模型包括11种额外的活体内活性中的8种,未作为外部测试集包含在模型中。因此,治疗70年的Mtb数据可以提供统计上可靠的计算模型,以将资源集中在体内活性小分子抗结核病上。这突显了用于其他疾病的体内测试的经济有效的预测因子。 PMID:24665947


TB:TB Mobile 2的数据

发布者:TB Mobile 2.0分子更新:79

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2014年3月19日

从最新版的卡中选择了79种化合物,其中一个或多个TB目标已添加到TB Mobile应用程序的版本2。使用另外20个分子作为测试集。卡已出示。


PARASITE:MMV曼氏血吸虫疟疾疟疾框屏

发布者:CDIPD保管库分子:400

发布时间:2013年11月6日

Schermi interi di somuli di Schistosoma mansoni (larve post-infettive) e adulti con i 400 composti che compongono la MMV Malaria Box (http://www.mmv.org/malariabox). Solo quei composti di Malaria box 'Drug-like' composti che producono i fenotipi più gravi vs. somuli sono stati testati contro gli adulti. I dati sono anche caricati su ChEMBL. Contattare Conor Caffrey, Center for Discovery and Innovation in Parasitic Diseases (www.cdipd.org/), UCSF ([电子邮件 protected])。


激酶:激酶的催化活性(Theonie Anastassiadis在《自然生物技术》上的出版物)

出版者:催化活性分子激酶:178

PI:Theonie Anastassiadis

发布时间:2013年8月30日

激酶催化活性

Nature Biotechnology 2011年10月30日; 29(11):1039-1045。测试的文库包含178种已知抑制所有主要蛋白激酶亚家族的激酶的化合物。为简单起见,在10 µM的乙醇存在下,所有化合物的浓度为0.5 µM。 ATP。每对激酶抑制剂均一式两份进行测试,结果表示为平均底物磷酸化水平,以溶剂控制反应的百分比表示(以下称为“残留激酶活性”),并显示了激酶活性。每对激酶抑制剂的平均残留量。激酶活性数据表示为相对于赋形剂(二甲亚砜)反应,测试样品中剩余的激酶活性的百分比。


结核病:更新药物和潜在客户目标

出版者:结核病:具有目标的药物和线索-更新分子:38

发布时间:2013年6月14日

已发布,其中包括近期的结核病文献以及已知目标,这些资料也将被用作TB移动应用程序的更新

激酶:激酶抑制剂套装(PKIS),由GSK发布

发布者:Kinome2分子:364

发布时间:2013年6月6日

GSK发布的激酶抑制剂套装(PKIS)是一套367种蛋白激酶抑制剂,已被注释为蛋白激酶家族活性,可用于公众筛查工作。有关筛选设置的详细信息,请参见下面的链接。 ChEMBL数据库是该集合上生物测定数据的“理想”站点。本着改善对重要数据的访问的精神,我们收集了ChEMBL友好提供的PKIS数据,并对其进行了处理,以便可以在此处通过协作药物发现(CDD)站点进行访问(就像我们以前所做的那样) Kinase SARfari数据库)。

转移到CDD可以使数据更加具有化学意义。我们还按顺序排列数据集。例如,实际上只有364种化合物(某些重复是由于盐的形式或同一分子的替代名称)。我们还尝试在可能的情况下标准化目标名称(例如,对于UNC数据集,IKKA,IKKB和IKKE激酶分别命名为IKK-alpha,IKK-beta,IKK-epsilon)。并不是说我们是完美的……我们还感谢对数据集的更正!

总而言之,已经针对225个目标(0.1和1 uM)测试了364种化合物。在此数据集中,只有一个协议,但是以只读方式列出了225个目标。浓度也是一个读数,因此很容易将搜索限制在以1和/或0.1 uM运行的屏幕上。

链接:

1)有关GSK PKIS的更多信息

http://www.maggichurchouseevents.co.uk/bmcs/Downloads/CBDD%20-%20Zuercher%20Bill.pdf

http://www.chordomafoundation.org/wp-content/uploads/2013/04/2013-Flanagan-Drewry.pdf

http://chembl.blogspot.co.uk/2013/05/pkis-data-in-chembl.html

2)CDD上的先前ChEMBL激酶数据

//www.aslsw.com.cn/buzz/2013/04/04/kinome-sar-for-collaborative-drug-discoverers/

激酶:ChEMBL激酶SARfari化合物& BioAssay Data


发布者:CDD Vault分子:54211

PI:CDD

发布时间:2013年3月27日

ChEMBL上有价值的资源是Kinase SARfari,“专注于激酶的综合化学基因组学工作台”。该系统整合并链接了激酶的序列,结构,化合物和筛选数据。“该数据库非常有用,它为活性激酶化合物提供了大量的SAR数据,可针对多种激酶进行分离。为了使这些数据在CDD界面中可用,我们采用了Kinase SARfari基表并将其与ChEMBL数据库中的另一个关键表合并,提供了一个字段来描述每条记录中使用的测定法,其细节要比天然SARfari中的信息要详细得多。我们现在可以通过CDD接口使用此合并的数据集,其中有400种激酶的详细体外数据。此外,体内功能数据和ADMET数据也是可用的。


TB:ARRA

发行人:TB ARRA分子:1924

PI:鲍勃·雷诺兹

发布时间:2013年3月15日

来自SRI(Bob Reynolds)和Scott Franzblau小组的数据-Ekins等人的论文。

先前SRI筛选的结果用于在供应商库中搜索相似的化合物,在一系列公认的筛选候选药物的筛选面板中进行汇总和体外测试。这些化合物还用作先前生成的贝叶斯模型的测试集,该模型使用生物活性和细胞毒性信息构建。


TB:GSK

发布者:TB GSK分子:177

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2013年2月8日

Ballell等人在ChemMedChem 2013年出版的文章“补充开放源代码药物发现:177个小分子导致结核病”中的补充数据。

I dataset originali sono ospitati su //www.ebi.ac.uk/chemblntd qui vengono mostrati solo i dati M.tb ma altri dati BCG sono disponibili su ChEMBL


三角恐龙:南美锥虫病文献的化合物

发布者:查加斯公共数据分子:531

发布时间:2012年12月21日

编辑了化合物结构和文献参考,涉及已发表文献中体外或体内针对克鲁氏锥虫测试的531个分子。


三角锥:针对人类非洲锥虫病(HAT)的特定化学系列的优化

发布者:查加斯公共数据分子:5559

发布时间:2012年12月12日

SCYNEXIS Inc, in qualità di membro del DNDi HAT Lead Optimization Consortium ha sviluppato e vagliato 4926 composti per l'attività contro il T. brucei. Sono incluse le strutture dei composti e i dati di attività in vitro contro il T. brucei brucei. Dati di citotossicità e attività contro i parassiti eucariotici correlati T. brucei rhodesiense, L. donavani e P. falciparum per un sottoinsieme di 34 composti. Tutte le serie di composti segnalati non sono più in fase di sviluppo per l'HAT in quanto si è riscontrato che hanno una scarsa selettività o proprietà incompatibili con l'attività in vivo. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1011-hat-001


三角锥:芬那莫尔系列的DNDi优化治疗南美锥虫病

发布者:查加斯公共数据分子:743

发布时间:2012年12月9日

Il DNDi Lead Optimization Consortium, che comprende Epichem, l'Università di Murdoch e CDCO, ha sviluppato e vagliato una serie SAR basata sul fungicida fenarimol. Il DNDi ha reso pubbliche le strutture dei composti, i dati sull'attività del T. cruzi e i dati sulla tossicità delle cellule L-6 per 743 composti di questa serie in ChEMBL-NTD. Composti e dati di analisi biologica sono inclusi qui in CDD Public. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1012-chagas-001


三角锥:大型初级HTS,用于鉴定T. Cruzi复制抑制剂

发布者:查加斯公共数据分子:303230

发布时间:2012年12月6日

Il Broad Institute ha eseguito uno schermo ad alto rendimento di 303.224 composti in duplicato nel ceppo ricombinante Tulahuen del Trypanosoma cruzi che esprime stabilmente il reporter beta-galattosidasi co-colturata con la cellula ospite, il fibroblasto del topo NIH3T3. Dei 4.394 colpi, 4.063 sono stati ulteriormente valutati per l'attività inibitoria e la tossicità delle cellule ospiti. Infine, 27 composti sono stati selezionati come potenziali composti della sonda e ulteriormente convalidati. I dati dello schermo primario e i successivi saggi secondari sono stati depositati PubChem. Composti chimici e dati del saggio biologico per lo schermo primario e sei saggi secondari da PubChem sono inclusi qui in CDD Public. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21634083


TB:Guzman等人,M.tb。 MurE连接酶抑制剂

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:8

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2012年12月6日

来自以下结核病出版物的基于全细胞和靶细胞的筛选数据:Guzman JD,Gupta A,Evangelopoulos D,Basavannacharya C,Pabon LC,Plazas EA,MuñozDR,Delgado WA,Cuca LE,Ribon W,Gibbons S,Bhakta S J Antimicrob Chemother。 2010年10月2010; 65(10):2101-7。天然哥伦比亚植物产品的抗结核病筛查:3-甲氧基降磷霉素,结核分枝杆菌MurE连接酶的抑制剂。


卖方:NIH Clinical Collection 2阵列(281个分子)

发布者:NIH Clinical Collections分子:281

PI:项目经理:Mei Steele

发行时间:2012年11月11日

NIH Clinical Collection 2是281个小分子镀膜阵列,在人类临床试验中已有使用历史。该馆藏是由美国国立卫生研究院(NIH)通过分子图书馆路线图倡议组织的,作为其使命的一部分,以使复合筛选能够在生物医学研究中使用。


卖方:NIH Clinical Collection阵列(446个分子)

发布者:NIH Clinical Collections分子:446

PI:项目经理:Mei Steele

发行时间:2012年11月11日

NIH Clinical Collection是由446个小分子组成的镀膜阵列,具有在人类临床试验中使用的历史。该馆藏是由美国国立卫生研究院(NIH)通过分子图书馆路线图倡议组织的,作为其使命的一部分,以使复合筛选能够在生物医学研究中使用。


TB:药物和潜在客户-移动应用中使用的数据

发布者:SRI分子和移动应用目标分子:707

发行:2012年10月23日

整理了针对结核病目标的体内重要数据

来自TBDB,Biocyc,Metacyc,PDB和Pubmed的信息

斯坦福研究所的Malabika Sarker的其他参考。

约翰·霍普金斯大学的Gyanu Lamichhane提供了必要的知识

informazioni.rif.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22477069

Esplora questo dataset su cellulare: //itunes.apple.com/app/tb-mobile/id567461644


毒物:按肝毒性分类的药物和化学品

发布者:CDD Vault分子:83072

PI:CDD

发布时间:2012年7月16日

辉瑞(Hu 2008)先前已汇编了具有临床数据的肝毒性分类方案的药物和化学药品清单,以评估用于人体肝细胞分析(HIAT)的体外成像技术),与临床肝毒性的一致性达到75%。使用贝叶斯模型,将导致或不引起药物诱发的肝损伤(DILI)的相同化合物数据集与分子描述符一起用于计算机预测中的计算机模拟。


TB:具有针对TB的全细胞活性的SRI分子

发布者:SRI Group Vault分子:23

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2012年4月24日

在Pharm Res。2012年4月4日评估了分子。PMID:22477069

结合化学信息学方法和途径分析,鉴定具有针对结核分枝杆菌的全细胞活性的分子。

Sarker M,Talcott C,Madrid P,Chopra S,Buinin BA,Lamichhane G,Freundlich JS,Ekins S.


疟疾:MMV疟疾框

发布者:受众:疟疾盒分子:400

发行日期:2012年3月29日

Molecole da MMV Malaria Box, ChEMBL-NTD (//www.ebi.ac.uk/chemblntd) : MMV Malaria Box, Simon Macdonald, Paul Willis, Paul Kowalczyk, Thomas Spangenberg, Jeremy Burrows e Tim Wells. Medicines for Malaria Venture (MMV), PO Box 1826, 20, rte de Pré-Bois, 1215 Ginevra 15, Svizzera e SCYNEXIS Inc. P.O. Box 12878 Research Triangle Park, North Carolina 27709-2878 USA.

疟疾盒中存在的所有化合物均在体外针对3D7(对氯喹(CQ)敏感,但对恶性疟原虫的磺胺多辛菌株具有抗性)进行了筛选,并对人肾胚胎细胞系(HEK-293)进行了细胞毒性测试)。数据以恶性肿瘤数据的nM EC50表示。


ADME:ADMEdata.com-高质量ADME数据的商业存储库

出版者:G2 Research ADMEdata.com分子:1760

PI:乔治·格拉斯

发布时间:2012年1月13日

例如:Caco-2渗透性,5pH的5pH值的平衡溶解度,人蛋白结合,蛋白结合大鼠,兔肠渗透性,人血浆和血细胞比容的分配。有关完整的数据集和模型,请直接联系Pharm.D的George Glass。博士学位 [电子邮件 protected] (通过CDD分发)


卖家:小马积木收藏

发布者:CDD Vault分子:29241

PI:CDD

发布时间:2012年1月13日

Porse File Chemical Co.致力于合成用于药物发现的创新和定制化合物,并提供具有竞争力的价格和高质量的多种产品。当前组是吗啉,哌啶,哌嗪,嘧啶,氨基酸和API家族中1554种不同新化合物和结构单元的选定子集。 www.porsefinechemical.com, [电子邮件 protected] + 86-20-28069055


寄生虫:曼氏血吸虫血吸虫:微源光谱图集& Killer

发布者:Brian Suzuki的Sandbox分子:119

发布时间:2011年10月5日


曼氏血吸虫血吸虫:Microsource Spectrum集合的表型筛选& Killer.

PI:Conor R. Caffrey

发布时间:2011年10月5日

CDD:公开数据119次访问

作为在UCSF桑德勒药物发现中心识别新农药的药物重新定向(重新定位)策略的一部分,我们已经开发了部分自动化的全生物(表型)筛选器来查找引起疾病的血流。传染性热带,血吸虫病。我们从上述集合中筛选了1,260种化合物,包括药物,类药物化合物,天然产物和其他化合物。我们报告使用简单的描述符来表达曼氏血吸虫幼虫阶段(血吸虫)的表型改变,以传达寄生虫对化合物侵害的多重和动态响应。表型反应的全面量化正在进行中。所提供的数据仅涉及“命中”化合物。可以从Microsource Discovery Systems Inc.获得相应集合中化合物的完整列表。 [电子邮件 protected] 更多细节。血吸虫病药物的发现:通过中通量表型筛选在已知药物库中鉴定的命中和先导化合物。阿卜杜拉MH,鲁埃拉斯DS,沃尔夫B,Snedecor J,林KC,徐F,伦斯洛AR,威廉姆斯J,麦考罗JH,卡弗里CR。 PLoS Negl Trop Dis。 2009年2009年7月14日; 3(7):e478.PMID:19597541


TB:激酶SRI库表型筛选

发布者:CDD Vault分子:23823

PI:CDD

发行时间:2011年8月29日

除了多种疾病,Kinase的目标也得到追求

癌症,包括免疫和代谢以及病毒,寄生虫,

真菌和细菌。特别是最近

对分枝杆菌中靶激酶和ATP结合的兴趣

结核病以鉴定抑制剂和潜在药物

当前药物方案未靶向的必需蛋白。

以下是针对目标分析的高通量筛选结果

根据已知的激酶抑制剂和激酶结合位点的当前支架设计的大约26,000种化合物的文库。这里展示的表型数据可能为选择支架/化合物提供基础,以进一步针对结核分枝杆菌中的特异性激酶或其他ATP结合靶标进行酶筛选,基于对整个细菌的体外表观活性PMID:21708485

结核病(爱丁堡)。 2011年6月25日。[印刷前为epub]

版权所有©2011 ElsevierLtd。保留所有权利。

有关更多详细信息,请联系Melinda Sosa: [电子邮件 protected]

高通量筛选基于激酶抑制剂的文库

抗结核分枝杆菌H37Rv的支架。

雷诺(Reynolds)RC,安南斯坦(Ananthan S),法莱奥莱(Ea Faaleolea E),霍布拉斯(Hobrath)合资,K CD,马多克斯(Maddox)C,拉斯穆森(Rasmussen)L,索萨(Sosa)密西西比(Thammasuvimol E),白EL,张W,塞克莉斯(Secrist)JA第三。

资料来源:南方研究所,第九大道南2000号,

美国伯明翰市35205。


FDA批准:NCGC药品收藏(NPC)V1.1.0

发布者:NCGC Pharmaceutical Collection NPC V1.1.0分子:14579

PI:Noel Southall

发布时间:2011年8月8日

NCGC药物收藏:临床认可的药物的全面资源,可实现药物重复使用和化学基因组学。 Huang,R.,Southall,N.,Wang,Y.,Yasgar,A.,Shinn,P.,Jadhav,A.,Nguyen,D.,Austin,C.Sci Transl Med 2011年4月27日:第3卷,第80页80ps16。

http://stm.sciencemag.org/content/3/80/80ps16.abstract


供应商:带有价格信息的BioBlocks目录

发布者:BioBlocks分子:2971

PI:道格·墨菲

发布时间:2011年8月3日

2989种化合物。

BioBlocks有针对性地收集了2200多个预先被鉴定为药物成分的支架,模块和片段。这些化合物大多数是由BioBlocks独特提供的,并已发现其应用范围从药物开发的中间体到肽化学中的氨基酸替代物。

有关BioBlocks构建块的最新详细信息,请访问www.bioblocks.com。


TOX:药物引起的肝损伤数据(DILI)

发布者:BBB分子:519

发布时间:2011年4月29日

药物性肝损伤数据-训练集由Jim Xu实验数据组成,测试集代表文献数据。

发表在《药物代谢研究》上。 2010年12月; 38(12):2302-8。 Epub 2010,2010年9月15日。一种基于贝叶斯配体的药物诱发的人类肝损伤的预测模型。

埃金斯S,威廉姆斯AJ,徐继杰。

TB:体内必需基因的参考数据库


发布者:SRI TB目标数据库分子:314

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:21/04/2011

结核病靶标的整理数据,包括关于TBDB,Biocyc,Metacyc,PDB和Pubmed的必要性的体内信息,以及斯坦福研究所的Malabika Sarker博士收集的其他参考资料。约翰·霍普金斯大学的Gyanu Lamichhane博士因提供有关必要性的信息而受到嘉奖。

**请注意,没有与该数据集相关的小分子**


供应商:Enamine代表性多元筛选库

发布者:Enamine分子:200000

PI:Dmytro Mykytenko

发布时间:2011年4月12日

最初为合作药物生成了20万个原始筛选库

全球最大的商业筛选化合物库存中的发现用户

(超过170万个物种)。该库具有独特的类药物化合物和完善的ADME

属性。我们可以选择高质量的化合物并立即提供

不同的格式。


FDA批准重新定位:通过HTS方法重新定位的药物

发布者:体外再利用分子:109

发布时间:2011年3月18日

使用HTS方法鉴定出新用途的药物。该表大大扩展了先前发布的版本“ Ekins S,Williams AJ,Krasowski MD,Freundlich JS。对已批准的罕见和被忽视疾病的药物进行计算机重新定位。DrugDiscovToday。2011年3月1日。PMID:21376136 doi:10.1016 / j。 drudis.2011.02.016下表列出了发现的分子和参考文献:旧用途/目标,新用途/目标。

缩写:CCR5,趋化因子受体5; DHFR,二氢叶酸还原酶; DOA,滥用药物,FDA,食品和药物管理局; GLT1,谷氨酸转运蛋白1; HSP-90,热激蛋白90; JHCCL,约翰·霍普金斯大学临床化合物图书馆; Mtb,结核分枝杆菌; NK-1,神经激肽1受体; OCTN2。


FDA批准重新定位:孤儿产品

出版者:罕见病生殖分子:76

发布时间:2011年3月18日

Tabella 2 della FDA - dalla risorsa della FDA, il database di ricerca sulle malattie rare (RDRD), che elenca i prodotti designati come orfani (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) con almeno un'approvazione di marketing per l'indicazione di una malattia rara. Questi dati sono stati analizzati da Ekins e Williams (documento presentato).


FDA批准重新定位:孤儿产品

出版者:罕见病生殖分子:105

发布时间:2011年3月18日

Tabella 1 della FDA - dalla risorsa della FDA, il database di ricerca sulle malattie rare (RDRD), che elenca i prodotti designati come orfani (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) con almeno un'approvazione di marketing per una comune indicazione di malattia.

FDA没有将数据与分子结构相关联。


供应商:科罗拉多州药物发现中心试点图书馆

发布者:C2D2公共分子:2240

PI:Greg Miknis,副总监

发布时间:2011年3月7日

该文库包含符合药物样标准的结构多样的小分子。代表了几种化学型,并且该库已被设计为适用于多种潜在靶标。

要请求有关集合的信息,请向Pi发送请求[电子邮件 protected]


LIPID:脂质图结构数据库

发布者:脂质地图数据库分子:22215

PI:Lipidomics网关

发行时间:2/11/2011

Le strutture delle mappe lipidiche (http://www.lipidmaps.org/) sono state annotate con 5 ioni comuni (H+,2H+++, K+, K+, Na+, NH4+), compresi gli acili grassi dei mammiferi, i glicerolipidi, i glicerofosfolipidi, gli sfingolipidi, gli steroli lipidici e i prenol lipidi. Le strutture e gli ioni sono ricercabili per struttura e MW per facilitare l'identificazione di nuovi lipidi.


结核分枝杆菌

发布者:虚拟代谢物分子:274

发布时间:2010年11月5日

Kinnings等人在《公共科学图书馆·计算生物学》(Vol.6:e1000976)(2010)中发表的274种药物的数据集(已在美国和欧洲批准用于人类)

该数据集可与CDD中的其他TB筛查数据集一起使用,以确定哪些批准的药物对Mtb具有活性(来自文献)。

TB:文献中非复制型Mtb抑制剂


发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:26

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年10月28日

来自已发布文档的结构和数据:

Darby和Nathan J Antimicrob Chemother 2010:65:1424-1427

Bryk et al。,Cell Host and Microbe 2008:3:137-145

Lin等,Arch Biochem Biophys。 2010 501:214-220

Lin et al。,J Biol Chem 2008:283:34423-34431

de Cavalho et al:J Med Chem 2009:52:5789-5792

Lin et al。,Nature 2009:461:621-626


Astatech,Inc.建筑材料的集合

出版者:Astatech,Inc.分子:6140

发布时间:2010年10月15日

AstaTech,Inc.提供先进和创新的中间产品,以促进药物发现过程。我们的广泛选择包括结构单元,新胺,受保护的胺,非天然胺,酮,醛,杂环,等角酸酐,硼酸和手性中间体。联系 [电子邮件 protected] 获取订单信息。


卖方:Chemik Catalogue 2010

发布者:CDD Vault分子:3889

PI:CDD

发布时间:2010年10月5日

Chemik在开发的早期阶段就成功地帮助了惠氏等公司的项目。我们为他们提供原材料和主要中间体,从克到数吨。凭借在该领域10年的经验,我们可以帮助客户在4-6周内以具有竞争力的价格,优质的产品和持续的服务开发新的中间体。


疟疾:氨基醇菲和蒽

发布者:CDD Vault分子:35

PI:CDD

发行:21.09.2010

蒽和菲的N-二烷基和N-二烷基和单烷基取代的卤素氨基醇盐酸盐在小鼠中的抗疟疾和伯氏疟原虫数据。二十七种化合物显示出活性(平均生存时间增加了>6天);八个化合物可治愈(IMST>60天)。该表包含有关详细信息和摘要的PubMed ID。


TB:BCG / MTB活动

发布者:诺华公司:TB数据分子:283

PI:Srinivasa Rao

发布时间:2010年9月15日

有氧BCG活性(MIC50)-274种化合物

有氧山地车活性(MIC50)-283种化合物

BCG ATP无氧活性(IC50)-283种化合物

MTB ATP无氧活性(IC50)-283种化合物

细胞毒性(CC50)-223个复合关键词:结核分枝杆菌,牛分枝杆菌,TB


疟疾:JHU JHCCL抑制恶性疟原虫

发行人:约翰·霍普金斯-沙利文(2008)分子:2693

发布时间:2010年6月4日

10 microM下2663种批准药物的抑制率

TB,疟疾:GSK疟疾的贝叶斯预测


发布者:GSK数据贝叶斯模型(Ekins等)分子:13355

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年5月28日

使用贝叶斯模型(Ekins等人,Mol BioSyst 6:840-851(2010))对疟疾的GSK结果进行预测(由Gamo等人,Nature 465:305-310(2010)发布)。

活动剪裁(220,000个模型>0,31, 2.200 modelli >-1.37在整个单元格屏幕中被归类为有效。

疟疾:圣裘德儿童研究医院全细胞疟疾数据集


发布者:San Giuda-疟疾/锥虫生物活性分子:1524

PI:Kip Guy

发布时间:2010年5月26日

由St. Jude CRH(Guiguemde,W等人,《恶性疟原虫的化学遗传学》,自然465,311-315(2010年5月20日))发表的自然文章的补充数据,包括在初次筛选中测试的1524个结构,并在八种方案中提供了附加数据:Bland-Altman分析,ADMET计算的特性,化学-化学筛选,灵敏度,协同作用和酶促测试以及热熔体分析。


疟疾:诺华GNF-Pf数据集

发布者:诺华疟疾分子:5695

发布时间:2010年2月1日

在基于红细胞的感染测试中测试了从MR4获得的恶性疟原虫3d7(对药物敏感)和W2(对氯喹,奎宁,乙胺嘧啶,环鸟嘌呤和磺胺多辛具有抗药性)的菌株对抑制增殖的敏感性通过选定的化合物。


供应商:ASINEX新型抗疟疾筛查套装抗疟疾

发布者:ASINEX分子:1

PI:Marco Parisi

发布时间:2010年5月2日

保留数据集:594种来自ASINEX的新化合物。请参阅详细说明ASINEX设计的附件。

访问:新的CDD用户-您的注册将在批准访问数据集之前经过批准过程。现有CDD用户-请联系 [电子邮件 protected]


供应商:ASINEX Tres Cantos(GSK)抗疟子集

发布者:ASINEX分子:278

PI:Marco Parisi

发布时间:2010年5月2日

278与GSK数据相对应的ASINEX疟疾活动数据。

可供立即筛选:相应的数据集是ASINEX专有和拥有的。有关更多信息,请联系Mark Parisi:电子邮件: [电子邮件 protected]

电话:1-877-ASINEX1

传真:1-336-721-1618


疟疾:Tres Cantos抗疟疾套装(TCAMS)

发布者:GSK反疟疾数据分子:13471

PI:哈维尔·加莫

发布时间:2010年5月19日

在葛兰素史克(GlaxoSmithKline)筛选库中筛选了大约200万种化合物,从而鉴定出人类红细胞中超过13,500种恶性疟原虫增殖抑制剂。这项工作是在28760 Tres Cantos的Severa Ochoa 2的GlaxoSmithKline的Tres Cantos医学发展校区进行的。

TBC:Sacchettini等。到了。评论-其他抗结核药

发布者:PK分子:18

发布时间:2010年2月5日

Sacchettini J.C.,Rubin E.J.的图1中未经批准的抗结核药。和Freundlich J.S.昆虫药物:寻找持久性捕食者结核分枝杆菌,《自然评论微生物学》,第6卷,第41-52页,(2008年)。


TB:结核小分子结核专利数据

发布人:TB专利数据分子:20775

PI:协作药物发现

发布时间:2010年1月7日

美国专利商标局,欧洲专利局和世界知识产权组织与结核病研究有关的专利结构和信息。


TB:Makarov等人,NM4TB联盟

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:32

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年1月1日

1,3-苯并噻嗪-4-oni(BTZ)的结构活性关系数据。从Makarov等人于2009年在《科学》杂志上发表的文章“ NMKTB协会从PM4TB联盟(PMID:19299584)”获得的数据“通过苄基阿拉伯合成来阻断苯并噻嗪酮杀死结核分枝杆菌”。


供应商:TimTec多样性集

发布者:TimTec分子:9998

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

筛选10,000种不同类型药物(例如化合物)的库


供应商:TimTec OGT抑制剂类似物SET

发布者:TimTec分子:334

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

O-GlcNAc转移酶类似物抑制剂


卖家:TimTec ActiTarg-K,激酶调节器

发布者:TimTec分子:6212

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

ActiTarg-K具有6,000多种化合物,可提供高价值的药物样分子筛选库,以识别新型蛋白激酶抑制剂的合成方向

供应商:TimTec天然产物衍生物库

发布者:TimTec分子:3001

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

NDL-3000 TimTec的天然衍生物


供应商:TimTec天然产品库

发布者:TimTec分子:479

PI:供应商

发布时间:2010年1月5日

TimTec纯天然不良贷款产品


卖方:筛选库

出版者:AsisChem分子:43121

发布时间:2009年10月26日

超过40,000种类似药物的小分子化合物的集合可用于您的自定义选择。所有化合物的库存量最高为25mg。


卖家:积木

出版者:AsisChem分子:176

发布时间:2009年10月26日

一组可用于药物发现的化合物。如果没有库存,则所有化合物都将在几周内提供,最大数量为10克。


TB:TAACF-NIAID CB2库

出版者:南方研究院分子:102634

PI:Robert Goldman

发布时间:2009年9月30日

筛选具有抑制结核分枝杆菌H37Rv菌株生长能力的商业化合物库(ChemBridge)的结果。参见PMID:19758845


TB:EthR抑制剂(Willand等)

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:5

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发行时间:09/28/2009

EthR转录阻遏药样抑制剂。分子和数据来自Willand et al Nature Medicine 15:537-544(2009)PMID:19412174


卖方:ADME:来自结构多样的商业药物的参考数据。

发布者:NM4TB:Karlen Group网站分子:24

PI:安德斯·卡伦(Anders Karlen)

发布时间:2009年6月11日

在瑞典市场上对这些药物进行多变量分析,是选择24种药物化合物组成的少量物理化学方法的基础。选择时要考虑到诸如结构多样性,商业可用性,价格和适当的定量分析技术等因素。测量汇编数据集的亲脂性,pKa,跨人Caco-2细胞单层的溶解度和通透性。我们预计该数据集可以用作验证新实验技术或计算机模型的参考集。它也可以用作开发新计算模型的多样化起始数据集。

数据取自:

介绍结构多样且可商购的药物数据集,以进行相关性和基准研究。

SköldC,Winiwarter S,Wernevik J,BergströmF,EngströmL,Allen R,Box K,Comer J,Mole J,Hallberg A,LennernäsH,Lundstedt T,Ungell AL,KarlénA.

J Med化学2006 2006年11月16日; 49(23):6660-71。


TB:已发表文献的吸收数据

出版者:CDD:结核病策展文学分子:24

发布时间:2009年5月28日

参考文献中的结核吸收数据

被5'-O- [N-(水杨基)氨磺酰基]腺苷类似物取代的2-三唑对铁载体生物合成的抑制:对结核分枝杆菌有效的抗菌核苷。

Gupte,A .; Boshoff,我。威尔逊,D.J .; Neres,J .; Labello,N.P .; Somu,R.V .;邢C;巴里(C. E.); Aldrich,C. C.

J Med Chem(2008)Vol 51,no。 23页。 7495-7507磁导率数据。


TB:公开文献中的药代动力学数据

出版者:CDD:结核病策展文学分子:28

发布时间:2009年5月28日

TB药代动力学数据来自已发表的文献资料。 28种独特和常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引文,目标,测试的细胞和生物,生物利用度,Vm,Vd,Cmax等。


TB:已发表文献的毒性数据

出版者:CDD:结核病策展文学分子:638

发布时间:2009年5月28日

TB毒性数据来自已发表的文献资料。来自PubMed参考文献的638种独特和常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引文,靶标,睾丸细胞和生物,细胞活力,LD50,CC50,MNTD等。


TB:有关已发表文献疗效的数据

出版者:CDD:结核病策展文学分子:6768

发布时间:2009年5月28日

结核病功效数据来自已发表的文献资料。来自300多种PubMed参考文献的6771种独特化合物以及常见化合物的SAR数据。

数据包括PubMed引文,靶标,睾丸细胞和生物,MIC,%抑制,EC50-EC100,IC50等。


TB:MLSMR

出版者:南方研究所分子:214507

PI:Robert Goldman

发布时间:2009年5月8日

从分子库小分子储存库(MLSMR)收集的200,000种化合物的多样化集合已于2008年春季提供给Southern Research Molecular Libraries Screening Center,用于抗Mtb H37Rv的初步测试。选择该主要筛选中活性最高的化合物,并在针对H37Rv的剂量反应测试和使用真实细胞的细胞毒性计数器筛选中以10个浓度进行测试。


疟疾:Johns Hopkins复合临床图书馆

出版者:约翰·霍普金斯-沙利文(2008)分子:1878

发布时间:2009年4月28日

将药物控制在10μM的浓度。在含10%人血清的RPMI 1640培养基中培养对氯喹敏感3D7或耐药多药Dd2的环形同步花环寄生虫,并在存在药物和[3H]-次黄嘌呤的情况下孵育48或96小时。 96孔板每孔含0.2 mL培养物,寄生虫血药浓度为0.2%,血细胞比容为2-4%,在48 h时放射性掺入信号为10,000 cpm,在96 h时为20,000 cpm。背景计数低于500 cpm。筛选实验一式两份进行,抑制百分比报告为两次实验的平均值。


TB:文献回顾

发布人:结核病文献分子数据:49

PI:Ballel等。

发布时间:2009年4月17日

在针对结核分枝杆菌的活性剂调查中收集的结核SAR数据,包括具有已知和未知作用方式的结核分枝杆菌(Ballel等人,“新型小分子合成抗分枝杆菌药”,涉及抗菌剂和化学疗法,2005年6月)。使用TubercuList / TBDB /其他目标链接和改进的引用更新了4/17。


TB:Sacchettini等人,评论

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:14

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2009年2月18日

表1和表2的一线和二线抗结核药在Sacchettini J.C.,Rubin E.J.和Freundlich J.S.昆虫药物:寻找持久性捕食者结核分枝杆菌,《自然评论微生物学》,第6卷,第41-52页,(2008年)。


供应商:IUPUI-分布式药物发现(D3)公共数据

发布者:IUPUI-D3枚举73K N-酰基AAA-OH,-OMe,-NH2分子:48818

PI:M. J. O'Donnell和W. L. Scott

发布时间:2009年1月1日

非天然酰化氨基酸及其甲酯的开放式虚拟目录。我们鼓励我们的同事与我们交流他们对“分布式药物发现”项目和合成方法的兴趣,《组合化学杂志》(印刷)中的三篇文章对此进行了介绍。


供应商:ASINEX构建基块

发布者:ASINEX分子:6745

PI:Marco Parisi

发行:23/12/2008

诸如Building Blocks之类的药物,如果您正在考虑进行潜在客户优化计划,我们的Building Blocks可能恰恰是您所要的。


寄生虫:香水

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:228

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:21/12/2008

香水的分子结构和数据结构由Roman Kaiser所著,是Wiley-VCH在2006年出版的“世界各地有意义的香水”。分子的数量指的是书中的编号。


TOX:toxcast

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:306

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月18日

EPA toxcast libreria di composti (per lo più pesticidi) disponibile all'indirizzo http://www.epa.gov/ncct/dsstox/DataFiles.html

http://www.epa.gov/ncct/toxcast/


FDA批准的TOX:建议的最高每日津贴

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:1215

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月10日

FDA数据库包含超过1200种药品的建议最大每日摄入量值。该数据集代表以下出版物Matthews,E.J.等人,Current Drug Discovery Technologies,1(1):61-76中使用的一些分子。 (2004年)


卖方:关于当前健康和保健需求的印度草药传统

发布者:Falguni Dasgupta:分子,用于编辑个人数据:37

PI:Falguni Dasgupta

发布时间:2008年10月30日

结合现代观点对印度药用植物及其提取物的传统用途进行了讨论,目的是在法规要求下寻找共同点,重新评估主张并在健康与保健领域创造机会,以及发现新药的新“导体”。


寄生虫:桑德勒-UCSF Celera半胱氨酸蛋白酶抑制剂库

发布者:McKerrow Group分子:1860

PI:Jim McKerrow

发布时间:2008年10月23日

体外克氏锥虫和布氏锥虫寄生虫和特定的酶促筛选。


FDA批准:药物批准

出版者:约翰霍普金斯大学临床化合物库分子:2815

PI:David Sullivan

发布时间:2008年10月16日

FDA批准的具有定义的分子结构的药物,包括Physicians'Desk Reference中的763个分子,DrugBank中的780个分子,2007年橙皮书中的1151个以及Chris Lipinski博士的FDA清单中的1007个


供应商:ASINEX GPCR重点库

发布者:ASINEX分子:3502

PI:Marco Parisi

发布时间:2008年10月2日

诸如CDP之类的高质量药物导向套装以CDD社区的折扣价出售。该库结合了我们在药物化学领域的专业知识,以及我们识别特权文献片段并以前所未有的方式进行组装的能力。


GPCR:PDSP Ki数据库

发布者:PDSP Ki数据库分子:20026

PI:布莱恩·罗斯(Bryan Roth)

发布时间:2008年9月16日

与NIMH精神药物筛查计划(PDSP)数据库的699 GPCR目标相比,超过47,000 Ki值


供应商:ASINEX Synergy库

发布者:ASINEX分子:25008

PI:Marco Parisi

发布时间:2008年4月26日

ASINEX开发了一个新的高多样性文库,其中包含诸如药效团之类的药物片段。库的设计基于两种协同形式。第一个是不同技术与目标技术之间的相互关系,第二个涉及关键中间体的融合,需要多个步骤(6-9个步骤)来创建复杂的化合物。有关更多详细信息,请参见下面的PDF。


TOX:具有已知毒性概况的公共数据的设施

发布者:具有已知毒性分布的结构分子:135

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2008年3月28日

已知化合物的组织特异性毒性特征与参考文献


可能的抑制剂:Shoichet释放了混杂抑制剂

出版者:Shoichet出版了混杂抑制剂分子:111

PI:Brian Shoichet

发行:26/03/2008

通过水溶液中有机分子的自缔合产生“假阳性”的聚集体


TOX:加州大学戴维斯分校-吊床公共数据

发布者:加州大学戴维斯分校-吊床分子:714

PI:布鲁斯·汉莫克

发布时间:2008年3月17日

可溶性环氧水解酶抑制剂(sEH)-这些酶具有3个主要功能:解毒,分解代谢和调节信号分子。


疟疾,TRIPANOSOMA:圣裘德的公共数据

发布者:San Giuda-疟疾/锥虫生物活性分子:2426

PI:Kip Guy

发布时间:2008年3月5日

圣裘德儿童研究医院Kip Guy实验室的开放获取结果,包括针对疟疾和布鲁氏杆菌的生物活性物质的高温超导


疟疾:公共数据Drexel

发布者:德雷克塞尔大学分子:195

PI:让-克洛德·布拉德利

发布时间:2008年3月2日

双方之间持续进行开放数据协作的结果

Drexel(Ugi-4CC产品)和UCSF(动物筛查)。该数据集代表研究人员如何选择公开发布选定结果的示例。 (默认情况下,所有组都是私有的)。


疟疾:美国陆军调查

发布者:美国陆军疟疾文献调查分子:12318

 

发布时间:2008年2月29日

广泛收集动物抗疟药SAR数据,包括化学结构,生物活性数据,药理学数据和毒性数据(最初由美国军方于1946年以“疟疾药物调查”的形式发布)


疟疾:PlasmoDB

出版者:UPenn-疟疾文献数据分子:120

PI:David Roos

发布时间:2008年2月19日

从文献中汇编的疟疾抑制剂的PlasmoDB,包括化学结构,PlasmoDB基因标识符,靶基因名称以及对恶性疟原虫,间日疟原虫,伯氏疟原虫,约氏疟原虫,查巴迪体育,温克特·彼得罗氏菌的引用


疟疾:天然产物(NPPDB)

出版者:国家天然产物分子研究中心:426

PI:Babu Tekwani

发布时间:2008年15月25日

黄酮类天然产物的抗疟疾数据库,包括抗疟疾和细胞毒性数据(密西西比大学,国家天然产物研究中心)


TB:TAACF测试结果

发布者:TBC早期药物发现计划分子:812

PI:Bernard Munos

发布时间:2008年2月12日

公开的812种化合物的库在Alamar Blue全细胞测定中对结核分枝杆菌(H37Rv)的抗菌活性


FDA批准:孤儿药

发布者:已知药物分子:1721

PI:Christopher Lipinski

发布时间:2007年10月26日

FDA批准的具有指定适应症,赞助商名称和化学结构的药物(如果有)