公共访问

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EDASA COVID-19复合存储库可用于合作

编辑:安德里亚·阿尔铁里(Andrea Altieri),分子博士:2733

发布时间:2020年5月12日

EDASA Scientific,小型MedChem组织(http://www.edasascientific.com)正在寻找COVID-19领域的生物伙伴。 EDASA拥有大约2,700种化合物,可以随时免费提供这些化合物进行测试(运输是收件人的责任),如果结果令人满意,可以聘请化学家来优化活性成分并取得进一步的进展。 EDASA准备研究其中一种化合物的硅内修饰,并合成有限数量的修饰化合物作为概念验证(免费)。收到的全部或部分数据将与IF一起提交给科学期刊>3出版。请注意,所有这些化合物都是EDASA Scientific的内部化合物,我们已经为每种化合物开发了经过验证的合成方案。


COVID-19 Mpro活性片段

发布者:亚历克斯·克拉克分子:1003

发布时间:2020年3月28日

根据英国国家同步加速器科学设施Diamond Light Source与Dectris合作提供的晶体结构,发现对Mpro / COVID19具有活性的片段(在Diamond的所有MX实验中都使用了检测器) 。原始数据可以在以下位置找到: //www.diamond.ac.uk/covid-19/for-scientists/Main-protease-structure-and-XChem/Downloads.html


佩拉拉方舟

发布者:Perlstein实验室分子:56756

PI:Ethan Perlstein

发行:10/27/2019

一个完全开源的表型筛选数据集,包括针对先天性代谢疾病(如溶酶体疾病和先天性糖基化疾病)的酵母,蠕虫,果蝇和人细胞模型中的药物重新定位和先导发现筛选。这些数据汇总在G3期刊的三个案例研究中(Lao等,2019 //www.g3journal.org/内容/ 9/2 / 413.long)和疾病模型&机制(Iyer等,2019a //dmm.biologists.org/内容/早期/ 2019/09/18 / dmm。040576.长; Iyer等人,2019b //dmm.biologists.org/内容/早期/ 2019/10/19 / dmm。040584.long)。


血清素受体的体外和体内活性

发布者:尼科尔斯分子:84

PI:Dave Nichols

发行:10/14/2019

数据集关注使用多巴胺或5-羟色胺作为神经递质的大脑系统。这包括仅对五种通用类型的多巴胺受体(D1-D5)中的一种具有特异性的分子探针,以及有关血清素5-HT1A,5-HT2A和5-HT2C受体的数据集。这些项目包括系统的结构修饰和药理分析,以鉴定这些受体中配体结合结构域的结构决定簇。这项工作的主题是确定如何将不同化学类别的分子容纳在同一受体结合位点内。


多发性硬化症:OL分化

发布者:髓磷脂修复基金会分子:710

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月21日

急性少突胶质细胞分化测定将O4免疫纯化的OPC铺板于5 k /孔。铺板后一小时,添加测试物品并将细胞孵育四天,之后将细胞固定并免疫染色MBP和总核(DAPI)。通过量化MBP染色/细胞数量(通过DAPI核染色确定)来确定OL中的OPC分化。在2种浓度下对化合物进行了四次筛选(第10& 2 uM; 2 & 0.4 uM; 0.4 &0.08 uM)。将数据归一化为DMSO(0%差异)和40 ng / ml T3(100%差异)。相对于测试物品的EMax确定EC 50。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等。等BMC Res Notes。 2016年9月5日; 9(1):419或联系 [电子邮件保护] 有关详细的日志。


多发性硬化症:OL保护

发布者:髓磷脂修复基金会分子:723

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月21日

少突胶质细胞保护测定-生存力(TNF + IFNg)将扩展的OPCs以10K /孔接种。在铺板后24小时,在添加测试物1小时后,添加测试物,加入10U / mlIFN​​-γ/ 1ng / mlTNF-α。孵育2天,添加AlamarBlue并孵育4小时。定量AlamarBlue荧光以确定细胞活力。数据按DMSO(0%活性)和1.1 µM喹硫平(100%活性)定标。有关技术细节,请参阅Rosler等。 BMC Res Notes。 2016年9月5日; 9(1):444联系人 [电子邮件保护] 有关详细的日志。


多发性硬化症:髓鞘形成测试

发布者:髓磷脂修复基金会分子:715

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月21日

制备来自E18皮质的皮质髓鞘化测定细胞,并将其铺板在神经基础培养基中。四天后,将介质切换为MyM介质。在第5天,添加测试物品,并且髓鞘化持续八天。在体外第13天,固定细胞并对其进行MBP和Olig2免疫染色。通过量化MBP / Olig2 +核心染色并改变MBP形态(连续MBP染色的排列-纤维长度)来确定髓鞘形成。通过定量MBP密度x面积/ Olig2 +核心来确定OL分化。化合物以2个浓度(每孔5个)以4张图像/孔重复复制&1 µM)。将数据归一化为DMSO(0%分化/髓鞘)和DAPT(100%分化/髓鞘)。相对于对1 µM DAPT的响应确定的EC50。有关技术细节,请参见Lariosa-Willingham等。等BMC Neurosci。 2016四月22; 17:16或联系 [电子邮件保护] 有关详细的日志。


多发性硬化:HEK293衣霉素保护试验

发布者:髓磷脂修复基金会分子:740

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月7日

HEK-293保护性测定

 

将HEK-293细胞(10K /孔)孵育24小时,然后添加测试物品。 1小时后,加入100ng / ml衣霉素。再孵育48小时后,添加AlamarBlue,并在4小时后对荧光进行定量。将数据标准化为DMSO(0%活性)和5 µM guanabenz(100%活性)。相对于测试物品的EMax确定EC 50。联系 [电子邮件保护] 有关详细的日志。


多发性硬化症:OL毒性筛查

发布者:髓磷脂修复基金会分子:709

PI:塔西·柯林斯(Tassie Collins)

发布时间:2016年10月7日

少突胶质细胞毒性试验(TNF + IFNg)

 

对以10k /孔接种的传代大鼠OPCs的毒性试验,与药物孵育2天。孵育4次后读取AlamarBlue荧光。数据以相对于DMSO(100%)的存活百分比表示。最大杀伤浓度为5 ng / ml衣霉素,可使约15%的细胞存活。有关技术细节,请参阅Lariosa-Willingham等人的BMC Res Notes。 2016年9月5日; 9(1):419或联系 [电子邮件保护] 有关详细的日志。


绿色溶剂

发表者:亚历克斯·克拉克(Alex Clark Sandbox)分子:117

发布时间:2016年9月20日

Daten zu grünen Lösungsmitteln, die von 德r gleichnamigen mobilen App verwendet werden (http://molmatinf.com/greensolvents.html). Zusammengestellt aus Informationen 德s ACS Green Chemical Institute und 德s GSK Solvent Guide. Veröffentlicht in http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/sc3000509.


寄生虫:GSK Kineto盒符合pIC50

发布者:GSK Kineto Box Project(TCAKS)分子:592

PI:皮拉尔·曼萨诺(Pilar Manzano)

发布时间:2016年6月16日

Unter Verwendung von phänotypischen Ganzzelltests wurde 德r GlaxoSmithKline-Satz von 1.8-Millionen-Verbindungen für das Hochdurchsatz-Screening (HTS) auf die drei für die menschliche Krankheit wichtigsten Kinetoplastiden, dh Leishmania donovani, Trypanosoma cruzi und Trypanosoma brucei, gescreent. Sekundäre bestätigende und orthogonale intrazelluläre Antiparasitizidtests wurden durchgeführt und das Potential für nicht-spezifische Zytotoxizität bestimmt. Hit-Verbindungen wurden chemisch geclustert und auf wünschenswerte physikalisch-chemische Eigenschaften untersucht. Der hypothetische biologische Zielraum, 德r von diesen Diversity-Sets abgedeckt wird, wurde mit bioinformatischen Methoden untersucht. Folglich wurden drei antikinetoplastische Chemikalienboxen mit jeweils ungefähr 200-Verbindungen zusammengebaut. Dieser Datensatz 恩thält Treffer-Verbindungen und alle zugehörigen Screening-Ergebnisse. http://www.nature.com/articles/srep08771


提供者:ASINEX PPI库

发布者:ASINEX分子:8400

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

自2008年以来,ASINEX一直在设计和合成蛋白质-蛋白质相互作用文库(PPI)。最新一代的ASINEX PPI库包括从片段实体到被设计为二级结构或表位模拟物的大环衍生物的各种大小,骨架和形状的分子。


供应商:ASINEX Elite库

发布者:ASINEX分子:12960

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

第一次“命中”后有什么问题? Asinex通过广泛的ADME配置文件,可轻松修改Medchem的最佳设计和IP等级来确保新颖性,从而解决了这些问题。


供应商:ASINEX表型库

发布者:ASINEX分子:9840

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

Asinex内部进行靶向和表型测试,并使用收集到的实验信息创建靶向和多样化的筛查集。基于这一经验,Ainex创建了一个表型筛选试剂盒。该集合的过滤器如下:

MW:200-450,堵塞:-1.0-7.0,堵塞(pH 7.4):-5.0-4.0,红色,N + O:0-10,HAC:1-10,偶极:1-5,SHP15:135- 2。


供应商:ASINEX多样性库

发布者:ASINEX分子:9968

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

多样性仍然是一种强大的筛选工具,尤其是在药物发现的早期阶段。在创建此集合时,Ainex使用计算工具来确保正确表示化学空间,包括“精英”和“生物设计”概念的元素。


提供者:ASINEX BioDesign

发布者:ASINEX分子:8041

PI:Mark Parisi

发布时间:2016年3月3日

ASINEX的BioDesign方法将已知药理相关的天然物质(例如生物碱和其他次生代谢物)的重要结构特征整合到可合成实现的支架中,用于药物化学。


目录:分布式药物发现(D3)-IUPUI

发布者:IUPUI-D3枚举73K N-AcylAA-OH,-OMe,-NH2分子:73234

PI:MJ O'Donnell和WL Scott

发布时间:2016年2月24日

免费的虚拟开放访问目录/库,带有>73,000个分子:(a)N-酰基非天然α-氨基酸,(b)N-酰基非天然α-氨基酸的甲酯,和(c)N-酰基非天然α-氨基酸的伯酰胺。目录中的分子是通过基于与100 R1X等效的甘氨酸阴离子的组合固相烷基化和随后与100 R2CO2H进行N-酰化以及树脂裂解(TFA,MeOH / Et3N或TFA)的列表获得的。 1月发布了包含48,818个分子(在集合a和b之上以及R1X和R2CO2H输入)的旧数据集。我们鼓励同事与我们交流有关他们对D1项目的兴趣(电子邮件: [电子邮件保护]<mailto:[电子邮件保护]> oder [电子邮件保护]<mailto:[电子邮件保护]>)。参考文献:J. Comb。化学,2009,11,3-13,14-33,34-43; J.组织化学.2014,79,3140&ndash; 51; J.化学教育。 2015、92、819& ndash; 26.


疟疾:针对GSK TCAMS的5种恶性疟原虫激酶的生化筛选

发布者:Gregory J. Crowther分子:13451

PI:Gregory J. Crowther

发布时间:2016年2月3日

测试了约13,500种细胞活性化合物对五种不同蛋白激酶的活性。在恶性疟原虫钙依赖性蛋白激酶1和4(CDPK1 / PF3D7_0217500和CDPK4 / PF3D7_0717500),促分裂原相关蛋白激酶2(MAPK2 / MAP2)的生化测试中检查了GlaxoSmithKline的Tres Cantos抗疟药材(TCAMS)。 PF1113900D6_6)和蛋白激酶3(PK7 / PF1337100D7_7)。对于三种激酶,新型有效抑制剂(IC 3<7 µM):CDPK0213400,CDPK50和PK1。迄今为止,PK1抑制剂是针对该酶最有效的抑制剂,值得进一步研究。


公共暗物质关系

发布者:暗物质化合物分子:139352

PI:吉列尔莫·莫拉莱斯(Guillermo Morales)

发布时间:2015年12月7日

诺华发现至少在诺华100次测试中测试了803,990种化合物,而112,872种化合物没有活性(占14.0%)。对NIH数据的分析发现,在至少100个测试中测试了363,598个化合物,其中131,726个化合物无效(36.2%)。

安妮·迈·沃瑟曼(Anne Mai Wassermann),尤金·伦肯(Eugen Lounkine),多米尼克·霍普夫纳(Dominic Hoepfner),盖勒·勒高夫(Gaelle Le Goff),弗里德里希·金(Friedrich J. Krastel,Amanda Cobos -Correa,Christian N.Parker,John W.Davies &梅尔·格里克(Meir Glick)。暗化学物质是发现铅的有希望的起点。 Nature Chemical Biology 2015年,第11卷,第958-966页(doi:10.1038 / nchembio.1936)


ADME:AZ公开ChEMBL数据

发布者:AZ Public ChEMBL数据分子:5799

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2015年10月5日

在阿斯利康测定的许多公开披露的化合物的体外实验DMPK和理化数据。为化验提供的参考资料说明了用于生成数据的实验程序。

//www.ebi.ac.uk/chembl/doc/inspect/CHEMBL3301361% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole guinea pig plasma at 37C for >5hrs. Method 德scribed in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole dog plasma at 37C for >5hrs. Method 德scribed in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole rat plasma at 37C for >5hrs. Method 德scribed in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole mouse plasma at 37C for >5hrs. Method 德scribed in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.Intrinsic clearance measured in human hepatocytes following incubation at 37C. Experimental range <3 to >150 microL/min/1E6 cells. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2010, 24, 1730-1736.Most basic pKa value (pKa B1) 德termined by absorption and potentiometric titration using standard methodology fr om Sirius Analytical. Experimental range Bases: >= 2.Second most acidic pKa value (pKa A2) 德termined by absorption and potentiometric titration using standard methodology fr om Sirius Analytical. Experimental range Acids: <= 11.

使用标准Sirius分析方法通过吸光度和电位滴定法确定的第三大基线pKa(pKa B3)。研究领域基础:> = 2.

使用标准Sirius分析方法通过吸收和电位滴定法确定的第二大pKa基准值(pKa B2)。研究领域基础:> = 2.

使用标准Sirius分析方法通过吸光度和电位滴定法测定最酸性的pKa(pKa A1)。酸测试区:<= 11.


PDB配体

发布者:Protein Data Bank(PDB)分子:16826

PI:Dale R. Cameron博士,MCIC,P.Chem。

发布时间:2015年8月3日

从PDB中提取配体信息,进行过滤以除去“聚合物”和其他相关的“非游离”配体,以及金属或与金属结合的配体。可以在没有警告的情况下更新过滤程序。数据按原样提供,没有其他管理或纠错。到PDB的链接由RCSB PBD提供,可以引用为

HM Berman,J.Westbrook,Z.Feng,G.Gilliland,TN Bhat,H.Weissig,IN Shindyalov,PE Bourne(2000)蛋白质数据库核酸研究,28:235-242。

请向保管箱管理员报告断开的链接,对其他数据的请求等。


EBOLA:埃博拉病毒的低分子量抑制剂

发表者:纳迪亚的沙盒分子:55

PI:Dr.娜迪亚·里特曼(Nadia Litterman)

发布时间:2015年2月2日

该共享数据集包含来自文献(截至2015年1月)的55个小分子,它们在体外和/或体内对埃博拉病毒和各种疾病模型均有效。我们包括了一名熟练的药物化学家进行的评估,以及PAINS过滤的结果。 (这项工作已提交给Nadia Litterman,Christopher Lipinski和Sean Ekins出版的F1000Research。)


供应商:Synthonix-建立更好的联系

Veröffentlicht von: http://www.synthonix.com Moleküle: 10286

发布时间:2015年1月2日

Synthonix提供了10286个构建基块的目录,可帮助药用化学家突破药物发现的领域,可用于探索更具挑战性的化学领域,并扩大潜在的重要治疗靶标的范围,以治疗世界上慢性病和可治愈的疾病。 Synthonix,Inc.:919-875-9277;一般电子邮件: [电子邮件保护]; Synthonix Ltd(欧洲办事处):办公室:+ 44 1223 597934;电子邮件: [电子邮件保护]


问题:NIH化学探针

发布者:Probes Vault分子:319

PI:Christopher Lipinski

发布时间:2014年11月12日

美国国立卫生研究院(NIH)通过分子图书馆筛选中心网络(MLSCN)和分子图书馆探针生产中心网络( MLPCN)。基于效价,选择性,溶解性和可利用性的组合,已将各种定义用于选择化合物作为探针。迄今为止,由美国国立卫生研究院(NIH)资助的学术筛选中心已经发现了576多种化学探针。该集合包含测试结构,目标,反目标,IC300值和其他参考。它还包括各种药物相似性测量,包括Dr.克里斯·利宾斯基(Chris Lipinski)分配了理想分数,如“化学探针的计算机预测和专家评估”中所述。 Litterman NK,Lipinski CA,Buinin BA,Ekins S J Chem Inf Model。 (50)


供应商:Azepine Ltd.积木收藏

发布者:Azepine Ltd.分子:600

PI:朱莉娅

发布时间:2014年10月8日

600砖,现货供应,价格具有竞争力。联系 [电子邮件保护]


NEW-CSIC-GSK激酶靶向的HTS

发布者:Pollastri Lab-东北大学分子:78

PI:Michael Pollastri

发布时间:2014年9月25日

该数据集包含东北大学(Pollastri实验室),CSIC(Navarro实验室)和葛兰素史克·特雷斯·坎托斯实验室(发展中国家DPU的疾病)之间合作进行的高通量筛选的公开结果。该文章是Diaz等人的PLoS-NTD:

 

DOI:10.1371 / journal.pntd.0003253

 

请联系 [电子邮件保护] 问问题。


卖方:Vitas-M Labor Stock HTS系列

发布者:Vitas-M实验室分子:388375

发布时间:2014年7月11日

维塔斯M实验室有限公司HTS化合物的集合是库存的400,000个单分子。它们都有多种形式可以快速交付,包括毫克,微摩尔,干粉,DMSO溶液和干膜。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件保护]


供应商:Vitas-M实验室构建基块

发布者:Vitas-M实验室分子:33297

发布时间:2014年7月10日

维塔斯M实验室有限公司有机构件块集合包含超过33,000个已识别和测试的项目。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件保护]


供应商:Vitas-M实验室脚手架

发布者:Vitas-M实验室分子:2898

发布时间:2014年7月8日

维塔斯M实验室有限公司脚手架系列(杜鹃花项目)。合成类似毒品的小型图书馆的先进方法。最好的选择是获得没有其他提供商提供的全新连接。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件保护]


卖方:Vitas M实验室碎片

发布者:Vitas-M实验室分子:18631

发布时间:2014年7月8日

维塔斯M实验室有限公司收集碎片(通过“ 3条规则”的化学物质和其他特殊过滤器),以用于基于碎片的药物发现。 www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [电子邮件保护]


供应商:Life Chemicals GPCR库

发布者:生命化学分子:15948

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Die Suche nach Ähnlichkeiten / Pharmakophoren basierte auf 德r Vorhersage 德r Topomersuche, die von Sybyl-X bereitgestellt wurde. Erster Schritt - Bei einer Ähnlichkeitssuche wurde ein Vergleich 德r gesamten Stammverbindungen mit bekannten Inhibitoren aus BindingeDB und ChemblDB vorausgesetzt. Zweiter Schritt - Erzeugung von 3D-Strukturen bekannter Inhibitoren und 德ren Co-Alignment. Dieser chemische Raum diente als Vorlage für die Anpassung 德r übrigen "ähnlichen" Verbindungen. Diese Methode wurde jedoch für das "Cherry-Picking" 恩twickelt und eine alternative Bibliothek kann mit virtuellen Screening-Methoden (alle Screening-Modelle sind mit Trainingssets erhältlich) gegen solche Rezeptoren - Adenosin, Chemokin, Dopamin, Gaba-, Histamin, Muskarin, Opioid, Sphingosin. http://www.lifechemicals.com/


供应商:Life Chemicals Kinase通过相似性

发布者:生命化学分子:62467

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Ähnlichkeitssuche mit öffentlichen MDL-Schlüsseln und 德r Tanimoto-Ähnlichkeitsgrenze von 90%. Fast 25K-Referenzverbindungen, die in biologischen 168-Assays (mehr als 100-verschiedene Kinaseziele) als aktiv getestet wurden, wurden für die Ähnlichkeitssuche verwendet. Alle diese Verbindungen können bis zur Kundenbestellung auf ein spezifischeres Ziel untersucht werden. http://www.lifechemicals.com/


供应商:Life Chemicals Kinase通过对接

发布者:生命化学分子:15174

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Die Kinase-Bibliothek wurde basierend auf 德m virtuellen Andocken in einer Sybyl-Umgebung erstellt. Zu diesem Zweck wurde eine Reihe von Bindungsstellen 德r Kinasestrukturen (etwa 20) ausgerichtet und analysiert. Solche überlagerten Stellen wurden für die strukturbasierte Pharmakophormodellierung über das Unity-Modul von Sybyl-X verwendet. Nach allen Vorbereitungen wurde ein ganzer 3D-Stamm gegen dieses Multi-Pharmakophor-Modell gescreent und am Ende ein Top-Ranking durchgeführt. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学品-核受体

发布者:生命化学分子:9896

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Life Chemicals. Virtuelles Andocken und Ähnlichkeits- / Pharmakophorensuche. http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学-CNS库

发布者:生命化学分子:16535

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

In 德r Literatur beschriebene ZNS-Filter wurden als Sieb für unseren gesamten Bestand verwendet. Wie gezeigt wurde, können die einzigen Verbindungen mit solchen Parametern geeignete Eigenschaften für die Permeabilität von Nervengewebe aufweisen. Alle Deskriptoren wurden aus Spreadsheets- und Volsurf-Modulen von Sybyl erhalten. (MW 200 = 350 cLogP = <3.6 H-Bindungsakzeptoren = <8 H-Bindungsspender = <5 tPSA = <120 drehbare Bindungen = <5 LogBB1 = -3.0 bis 1.0) http://www.lifechemicals.com/


供应商:生命化学品-天然产物库

发布者:生命化学分子:7808

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Die erste Methode basierte auf 德r statistischen Analyse von Deskriptoren. Zuvor wurde eine große Datenbank von NPs analysiert, um NP-Gerüste zu untersuchen, indem sie in Form eines Baums angeordnet wurden. Daher wurde eine Analyse 德r Eigenschaftsverteilung von mehr als 130 000 NP-Strukturen sowie die Identifizierung von Substrukturen durchgeführt, die für bestimmte Klassen von Naturstoffen typisch sind, um einen Satz von Fragmenten zu erzeugen, die normalerweise in Naturstoffen vorhanden sind. Diese Methode wurde mit 德m CRC Dictionary of Natural Products (DNP) und synthetischen Molekülen (SMs) getestet. Eine andere Methode basiert auf 德r Bewertung 德r Gerüstähnlichkeit. Die Anzahl 德r für ein Molekül erzeugten Atomsignaturen (aus Fragmenten) 恩tspricht 德r Anzahl 德r Atome, aus 德nen das Molekül besteht. Jede Atomsignatur stellt unabhängig ein Strukturmerkmal / Fragment 德s Moleküls dar und 它 wird eine individuelle Punktzahl dafür berechnet. höhere Anzahl von Atomen aus 德m Erreichen einer höheren Punktzahl. Um ein solches Experiment zu reproduzieren, verwendeten wir ein implementiertes Modul Chemistry Development Kit in CDK-Taverna 2.0. Es 恩thält einen NP-Ähnlichkeitszähler v1.4.1, 德r die Naturprodukt- (NP-) Ähnlichkeit eines Moleküls berechnet, dh die Ähnlichkeit 德s Moleküls mit 德m von bekannten Naturprodukten abgedeckten Strukturraum. Alle Ergebnisse wurden bewertet und lagen im Bereich von -3 bis + 3. http://www.lifechemicals.com/


卖方:生命化学品筛选馆藏

发布者:生命化学分子:371998

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Sorgfältig 恩tworfene, neuartige, arzneimittelähnliche kleine Moleküle mit 德r Lipinski-Regel von 5 und 德m einzigen Grund für die Abweichung von diesem Parametersatz ist ein einzigartiges Gerüst oder eine nicht standardisierte Chemie. Es kann mit Filtern für die medizinische Chemie wie PAIN oder mit beliebigen zielgerichteten Filtern (Löslichkeit, Permeabilität, BBB) verwendet werden. http://www.lifechemicals.com/


供应商:Life Chemicals片段具有保证的溶解度

发布者:生命化学分子:8241

PI:Alexandr Kucherak

发布时间:2014年6月20日

Fragmentverbindungen wurden durch Filtration 德s gesamten LC-Stamms mit modifizierter "Dreierregel" selektiert. Fragmente wurden im analytischen Labor auf Löslichkeit getestet. Die Löslichkeit ist bei 200mM-Konzentration in DMSO garantiert, und 75% 德r Fragmente sind in pH7.5-Puffer bei 1mM-Konzentration löslich. http://www.lifechemicals.com/


TB:文献中对小鼠的体内功效

发布者:TB体内数据2分子:778

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2014年4月10日

展望未来:预测小分子对结核分枝杆菌的体内功效。在疾病的动物模型中选择疾病的体外衍生物并将其翻译成具有体内活性的分子是一项时间和金钱的挑战。我们演示了使用包含773种化合物的机器学习分类模型(贝叶斯,支持向量机和递归分区)从体内有活性和无活性的化合物中进行学习。贝叶斯模型预测了11种额外的体内药物中的8种,这些药物未作为外部测试集包含在模型中。因此,来自70年的Mtb数据管理可以提供统计上可靠的计算模型,以将资源集中在体内活性的低分子量抗结核上。这强调了在其他部位进行其他疾病的体内测试的低成本预测指标。 PMID:24665947


TB:TB Mobile 2的数据

发布者:TB Mobile 2.0更新分子:79

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2014年3月19日

从最新出版物中选择的具有一个或多个TB目标的79个连接已添加到TB Mobile的应用程序第二版。使用20个附加分子作为测试套件。论文已提交。


寄生虫:曼氏血吸虫的MMV疟疾框屏

发布者:CDIPD保管库分子:400

发布时间:2013年11月6日

Ganzkörper-Screenings von Schistosoma mansoni-Somules (postinfektiösen Larven) und Erwachsenen mit 德n 400-Verbindungen, aus 德nen die MMV-Malaria-Box besteht (http://www.mmv.org/malariabox). Nur die Malaria-Box-Verbindungen, die die schwerwiegendsten Phänotypen im Vergleich zu einigen Exemplaren aufwiesen, wurden gegen Erwachsene getestet. Die Daten werden auch in ChEMBL hochgeladen. Kontakt Conor Caffrey, Zentrum für Entdeckung und Innovation bei parasitären Krankheiten (www.cdipd.org/), UCSF ([电子邮件保护])。


激酶:激酶催化活性(《自然生物技术》中的Theonie Anastassiadis论文)

发布者:激酶催化活性分子:178

PI:Theonie Anastassiadis

发布时间:2013年8月30日

激酶催化活性

Natural Biotechnology 2011年10月30日; 29(11):1039-1045。测试的文库包含178种已知抑制所有主要蛋白激酶亚家族激酶的化合物。为简单起见,所有化合物在10 µM ATP存在下的浓度为0.5 µM。 0.5 &mgr;尽管捕获这些化合物的主要目标的平均IC50为66 nM,但还是选择了M,以便捕获较弱的脱靶抑制活性。每个激酶抑制剂对重复测试两次,结果表示为平均底物磷酸化,以溶剂控制反应的百分比表示(以下称为“剩余激酶活性”):报道了每个激酶抑制剂对的平均剩余激酶活性。激酶活性数据表示为与媒介物反应(二甲亚砜)相比,测试样品中剩余激酶活性的百分比。


结核病:更新药物治疗并制定目标

发表者:结核病:具有靶点的药物和线索-更新分子:38

发布时间:2013年6月14日

TB的最新文献中已发布的具有已知目标的联系也将用作TB Mobile App的更新

激酶:激酶抑制剂试剂盒(PKIS),由GSK发布

发布者:Kinome2分子:364

发布时间:2013年6月6日

GSK发行的激酶抑制剂试剂盒(PKIS)是一套367种蛋白激酶抑制剂,已经注释了蛋白激酶家族的活性,可用于公众筛查。有关筛选集的详细信息,请参见下面的链接。 ChEMBL数据库是该组生物测定数据的联系点。为了改善对重要数据的访问,我们收集并处理了ChEMBL提供的PKIS数据,以便可以在此处通过协作药物发现(CDD)网站(类似于以前的Kinase SARfari数据库)进行访问。 。

转移到CDD可以使数据更加“医学友好”。我们还清理了记录。例如,实际上只有364种化合物(某些重复是由于盐的形式或同一分子的替代名称)。我们还尝试尽可能地标准化目标名称(例如,UNC数据集的激酶IKKA,IKKB和IKKE被命名为IKK-alpha,IKK-beta,IKK-epsilon)。并不是说我们是完美的……我们也感谢对数据集的更正!

总而言之,针对1个靶标,在225和0.1 µM下测试了364种化合物。该记录中只有一个日志,但是显示屏上列出了225个目标。浓度也是一个指标,因此很容易将搜索范围缩小到1和/或0.1 µM以下的屏幕。

剩下:

1)有关GSK PKIS的更多信息

http://www.maggichurchouseevents.co.uk/bmcs/Downloads/CBDD%20-%20Zuercher%20Bill.pdf

http://www.chordomafoundation.org/wp-content/uploads/2013/04/2013-Flanagan-Drewry.pdf

http://chembl.blogspot.co.uk/2013/05/pkis-data-in-chembl.html

2)CDD上的先前ChEMBL激酶数据

//www.aslsw.com.cn/buzz/2013/04/04/kinome-sar-for-collaborative-drug-discoverers/

激酶:ChEMBL激酶SARfari化合物和生物测定数据


发布者:CDD Vault     Moleküle: 54211

PI:CDD

发布时间:2013年3月27日

ChEMBL上有价值的资源是Kinase SARfari,“一种专注于激酶的综合化学基因组学工作台。该系统包含并链接激酶序列,结构,连接和筛选数据。 “作为一种极其有用的资源,该数据库在各种测定中提供了针对多种激酶的激酶试剂的大量SAR数据,其中许多是从文献中手动获得并整理的。为了使此数据在CDD界面中可用,我们将Kinase SARfari的核心表与ChEMBL数据库的另一个关键表合并,并提供了一个字段,其中比本地SARfari更详细地描述了每个数据集中使用的测定。现在,我们可以通过CDD接口使用此合并数据集。详细的体外数据可用于400种激酶。此外,体内功能和ADMET数据也已发布。


TB:ARRA

出版者:TB ARRA分子:1924

PI:鲍勃·雷诺兹

发布时间:2013年3月15日

由Ekins等人提交的SRI(Bob Reynolds)和Scott Franzblau Group Paper的数据。

先前SRI筛选的结果用于搜索供应商库以寻找相似的化合物,这些化合物在许多公认的体外筛选新药物发现候选物中进行汇总和测试。这些化合物还用作先前建立的贝叶斯模型的测试试剂盒,该模型建立了有关生物活性和细胞毒性的信息。


TB:GSK

发布者:TB GSK分子:177

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2013年2月8日

来自Ballell等人的出版物的补充数据,ChemMedChem 2013,新闻稿“鼓舞开源药物的发现:177种抗结核分子”

Ursprüngliche Datensätze werden unter //www.ebi.ac.uk/chemblntd gehostet. Hier werden nur M.tb-Daten angezeigt, während bei ChEMBL weitere BCG-Daten verfügbar sind


三角锥:恰加斯病文献链接

发布者:查加斯公共数据分子:531

发布时间:2012年12月21日

已经针对公开文献中针对克鲁氏锥虫的体外或体内测试的531个分子设计了链接结构和参考。


TRYPANOSOM:优化针对人类非洲锥虫病(HAT)的特定化学系列

发布者:查加斯公共数据分子:5559

发布时间:2012年12月12日

SCYNEXIS Inc hat als Mitglied 德s DNDi HAT Lead Optimization Consortium 4926-Verbindungen 恩twickelt und auf 活动gegen T. brucei untersucht. Verbindungsstrukturen und In-vitro-Aktivitätsdaten gegen T. brucei brucei sind 恩thalten. Daten zur Zytotoxizität und 活动gegen die verwandten eukaryotischen Parasiten T. brucei rhodesiense, L. donavani und P. falciparum für eine Untergruppe von 34-Verbindungen. Alle berichteten Verbindungsreihen befinden sich nicht mehr in 德r Entwicklung für HAT, da festgestellt wurde, dass sie eine schlechte Selektivität oder Eigenschaften aufweisen, die mit 德r in vivo-Aktivität nicht kompatibel sind. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1011-hat-001


TRYPANOSOM:芬那莫尔范围的DNDi优化治疗南美锥虫病

发布者:查加斯公共数据分子:743

发布时间:2012年12月9日

Das DNDi Lead Optimization Consortium, zu 德m auch Epichem, die Murdoch University und CDCO gehören, hat eine SAR-Serie 恩twickelt und getestet, die auf 德m Pflanzenfungizid Fenarimol basiert. DNDi veröffentlichte in ChEMBL-NTD öffentliche Verbindungsstrukturen, T. cruzi-Aktivitätsdaten und L-6-Zelltoxizitätsdaten für 743-Verbindungen aus dieser Reihe. Verbindungen und biologische Testdaten sind hier in CDD Public 恩thalten. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1012-chagas-001


TRYPANOSOME:广泛的主要HTS,以鉴定T. Cruzi复制的抑制剂

发布者:查加斯公共数据分子:303230

发布时间:2012年12月6日

Das Broad Institute führte ein Hochdurchsatz-Screening von 303,224-Verbindungen in zweifacher Ausfertigung in 德m rekombinanten Tulahuen-Stamm von Trypanosoma cruzi durch, 德r 德n Beta-Galactosidase-Reporter stabil exprimierte, 德r mit 德r Wirtszelle Maus-Fibroblast NIH3T3 kultiviert wurde. Von 德n 4,394-Treffern wurden 4,063 weiter auf inhibitorische 活动und Wirtszelltoxizität untersucht. Schließlich wurden 27-Verbindungen als potentielle Sondenverbindungen ausgewählt und weiter validiert. Daten vom primären Screen und nachfolgenden sekundären Assays wurden in PubChem hinterlegt. Chemische Verbindungen und biologische Testdaten für das Primärscreening und sechs Sekundärtests von PubChem sind hier in CDD Public 恩thalten. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21634083


TB:Guzman等人,M。tb。 MurE连接酶抑制剂

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:8

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2012年12月6日

来自以下结核病出版物的全细胞和基于靶点的筛选数据:Guzman JD,Gupta A,Evangelopoulos D,Basavannacharya C,Pabon LC,Plazas EA,MuñozDR,Delgado WA,Cuca LE,Ribon W,Gibbons S.,Bhakta SJ Antimicrob Chemother 。 2010年10月; 65(10):2101-7。哥伦比亚植物天然产物的抗结核筛选:3-甲氧基降磷霉素,一种结核分枝杆菌的MurE连接酶的抑制剂。


供应商:NIH Clinical Collection 2阵列(281个分子)

发布者:NIH Clinical Collections分子:281

PI:项目经理:Mei Steele

发布时间:2012年1月1日

NIH Clinical Collection 2由281种镀层小分子组成,这些小分子过去曾在人类临床试验中使用。该馆藏是由美国国立卫生研究院(NIH)编制的,是分子图书馆路线图计划的一部分,目的是使化合物筛选能够在生物医学研究中使用。


供应商:NIH临床采集阵列(446个分子)

发布者:NIH Clinical Collections分子:446

PI:项目经理:Mei Steele

发布时间:2012年1月1日

NIH Clinical Collection由过去用于人类临床试验的446个小分子组成。该馆藏是由美国国立卫生研究院(NIH)编制的,是分子图书馆路线图计划的一部分,目的是使化合物筛选能够在生物医学研究中使用。


TB:具有目标的药物和潜在客户-移动应用中使用的数据

发布者:SRI分子和移动应用目标分子:707

发布时间:2012年10月23日

精选了具有体内重要性的结核病靶点的更新数据

来自TBDB,Biocyc,Metacyc,PDB和Pubmed的信息

斯坦福研究所的Malabika Sarker提供了更多参考。

约翰·霍普金斯大学的Gyanu Lamichhane照顾了要点

information.ref.http: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22477069

Erkunden Sie diesen Datensatz auf Mobilgeräten: //itunes.apple.com/app/tb-mobile/id567461644


毒物:根据肝毒性分类的药品

发布者:CDD Vault     Moleküle: 83072

PI:CDD

发布时间:2012年7月16日

辉瑞公司以前曾根据肝毒性的临床数据编制了具有分类方案的药物和化学品清单(Hu 2008),以评估发现符合标准的体外人肝细胞成像(HIAT)测试技术。 75%的临床肝毒性结果。导致或不引起药物性肝损伤(DILI)的化合物的同一数据集与分子描述符一起用于通过贝叶斯模型进行计算机模拟预测。


TB:具有针对TB的全细胞活性的SRI分子

发表者:SRI Group Vault分子:23

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2012年4月24日

The in Pharm Res。2012 Apr 4. PMID:22477069

化学信息学方法与途径分析相结合,以鉴定具有针对结核分枝杆菌的全细胞活性的分子。

Sarker M.,Talcott C.,Madrid P.,Chopra S.,Bunin BA,Lamichhane G.,Freundlich J.S.,Ekins S.


疟疾:MMV疟疾框

发布者:公众:疟疾盒分子:400

发布时间:2012年3月29日

Moleküle von MMV Malaria Box, ChEMBL-NTD (//www.ebi.ac.uk/chemblntd): MMV Malaria Box, Simon MacDonald, Paul Willis, Paul Kowalczyk, Thomas Spangenberg, Jeremy Burrows und Tim Wells. Arzneimittel für Malaria Venture (MMV), Postfach 1826, 20, Vorbois, 1215 Genf 15, Schweiz und SCYNEXIS Inc. Postfach 12878 Research Triangle Park, North Carolina 27709-2878 USA.

疟疾盒中的所有化合物均经过体外3D7测试(对氯喹(CQ)敏感,但对恶性疟原虫耐磺胺多辛的菌株),并对人胚胎肾细胞系(HEK-293)进行了细胞毒性测试。数据以恶性肿瘤数据的nM EC50表示。


ADME:ADMEdata.com-用于高质量ADME数据的商业存储库

发布者:G2 Research ADMEdata.com分子:1760

PI:乔治·格拉斯

发布时间:2012年1月13日

例如:Caco-2渗透性,在5个pH值下的平衡溶解度,与人结合的蛋白,与大鼠结合的蛋白,兔的肠道渗透性,人血浆和血细胞比容的分配。有关完整的数据集和模型,请联系Pharm.D。的George Glass。博士学位 [电子邮件保护] (通过CDD分发)


供应商:孔砌块集合

发布者:CDD Vault     Moleküle: 29241

PI:CDD

发布时间:2012年1月13日

Porse File Chemical Co.致力于用于药物发现的新型化合物的定制合成,以具有竞争力的价格和高质量提供广泛的产品。当前组是1554种新的,多样的化合物和吗啉,哌啶,哌嗪,嘧啶,氨基酸和API家族的组成部分的选定子集。 www.porsefinechemical.com, [电子邮件保护] + 86-20-28069055


寄生虫:曼氏血吸虫血吸虫病:微源光谱& Killer Collections

发表者:Brian Suzuki的Sandbox分子:119

发布时间:2011年10月5日


曼氏血吸虫血吸虫:微源光谱的表型筛选 & Killer Collections.

PI:Conor R. Caffrey

发布时间:2011年10月5日

CDD:公开数据119次点击

作为在UCSF桑德勒药物发现中心识别新的抗寄生虫药物的药物转化(重新定位)策略的一部分,我们开发了对整个生物体进行部分自动化(表型)筛查的方法,以检测引起传染性热带疾病的血流。血吸虫病。我们已经检查了上述集合中的1,260种化合物,包括药物,类药物化合物,天然产物和各种化合物。我们报告曼氏血吸虫的幼虫阶段(血吸虫)的表型变化,使用简单的描述符来表达寄生虫对复合物侵害的多样化和动态响应。表型反应的完全定量仍在进行中。给出的数据仅与“命中”化合物有关;相应集合中化合物的完整清单可从Microsource Discovery Systems Inc.获得。 [电子邮件保护] 更多细节。血吸虫病中的活性成分筛选:在已知活性成分库中以中等通量通过表型筛选鉴定的命中和先导化合物。 Abdulla MH,Ruelas DS,Wolff B.,Snedecor J.,Lim K.C.,Xu F.,Renslo AR,Williams J.,McKerrow J.H.,Caffrey CR。 PLoS Negl Trop Dis。 2009年7月14日; 3(7):e478.PMID:19597541


TB:SRI激酶库表型筛选

发布者:CDD Vault     Moleküle: 23823

PI:CDD

发布时间:2011年8月29日

在多种疾病中也追求激酶靶标

癌症,包括免疫和代谢以及病毒,寄生虫,

真菌和细菌。特别是有一个相对年轻的

对分枝杆菌中激酶和ATP结合靶标的兴趣

结核病的抑制剂和潜在药物

不受当前药物治疗方案影响的必需蛋白。

在这里,我们报告了针对目标人群的高通量筛选结果

基于当前的激酶抑制剂支架和已知的激酶结合位点设计的大约26,000种化合物的文库。本文呈现的表型数据可以构成选择支架/化合物的基础,以基于针对体外总细菌的表观活性,进一步针对结核分枝杆菌中的特定激酶或其他ATP结合靶标进行酶促筛选。 PMID:21708485

结核病(爱丁堡)。 2011年6月25日。[印刷前为EPUB]

版权所有©2011 Elsevier Ltd.版权所有。

有关更多信息,请联系Melinda Sosa: [电子邮件保护]

高通量筛选基于激酶抑制剂的文库

抗结核分枝杆菌H37Rv的支架。

雷诺(Reynolds RC),安南(Ananthan S.),法莱欧拉(Faaleolea E.),霍布拉斯(Hobrath JV),K CD,马多克斯(Maddox C.),拉斯穆森(Rasmussen L.)

资料来源:南方研究所,第九大道南2000号,

美国伯明翰市35205。


FDA批准:NCGC药品收藏(NPC)V1.1.0

发布者:NCGC Pharmaceutical Collection NPC V1.1.0分子:14579

PI:Noel Southall

发布时间:2011年8月8日

NCGC药物收藏:一系列经过临床批准的药物,可实现重新用途和化学基因组学。 Huang,R.,Southall,N.,Wang,Y.,Yasgar,A.,Shinn,P.,Jadhav,A.,Nguyen,D.,Austin,C.27,2011 edition,p.3ps80。

http://stm.sciencemag.org/content/3/80/80ps16.abstract


供应商:带有价格信息的BioBlocks目录

发布者:BioBlocks分子:2971

PI:道格·墨菲

发布时间:2011年8月3日

2989位联系人。

BioBlocks有针对性地收集了2200多个预先被鉴定为药物成分的支架,构件和片段。这些化合物中的大多数是由BioBlocks唯一提供的,并已发现其用途从药物发现中间体到肽化学中的置换氨基酸。

有关BioBlocks组件的最新信息,请访问www.bioblocks.com。


TOX:药物性肝损伤数据(DILI)

发布者:BBB分子:519

发布时间:2011年4月29日

药物引起的肝损伤数据-训练集包含来自Jim Xu的实验数据,而测试集包含文献数据。

发表在《药物代谢研究》上。 2010年12月; 38(12):2302-8。 Epub 2010年9月15日。一种基于预测的基于配体的贝叶斯模型,用于人体药物性肝损伤。

埃金斯S,威廉姆斯AJ,徐继杰。

TB:体内必需基因的目标数据库


发布者:SRI TB目标数据库分子:314

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2011年4月21日

来自TBDB,Biocyc,Metacyc,PDB和Pubmed以及其他来自Dr.斯坦福研究所的Malabika Sarker。博士约翰·霍普金斯大学的Gyanu Lamichhane因提供重要信息而受到认可。

**请注意,没有与该数据集相关的小分子**


供应商:Enamine代表性多元筛选库

发布者:Enamine分子:200000

PI:Dmytro Mykytenko

发布时间:2011年4月12日

最初用于协作筛查的200K库是专门为协作药物创建的

全球最大的商业筛选化合物库存中的发现用户

(超过170万个物种)。该库包含具有改进的ADME的独家药物样化合物

特性。我们的优质化合物可以立即收获并交付

不同的格式。


FDA批准重新定位:使用HTS方法重新定位的药物

发布者:分子的体外转化:109

发布时间:2011年3月18日

使用HTS方法鉴定出新用途的药物。该表大大扩展了已发布的“ Ekins S”,“ Williams AJ”,“ Krasowski MD”,“ Freundlich JS”的版本2011该表列出了分子,发现的旧用途/目标,新用途/目标和参考。

缩写:CCR5,趋化因子受体5; DHFR,二氢叶酸还原酶; DOA,药物滥用,FDA,食品和药物管理局; GLT1,谷氨酸转运蛋白1; HSP-90,热激蛋白90; JHCCL,约翰·霍普金斯大学临床化合物图书馆; Mtb,结核分枝杆菌; NK-1,神经激肽-1受体; OCTN2。


FDA批准转售:具有孤儿身份的产品

发表者:罕见病重用分子:76

发布时间:2011年3月18日

FDA-Tabelle 2 - Aus 德r FDA-Ressource, 德r Forschungsdatenbank für seltene Krankheiten (RDRD), in 德r von Orphan 德signierte Produkte (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) mit mindestens einer Vermarktung aufgeführt sind Zulassung für eine seltene Krankheit Indikation. Diese Daten wurden von Ekins und Williams (eingereichtes Papier) analysiert.


FDA批准转售:具有孤儿身份的产品

发言者:罕见病重用分子:105

发布时间:2011年3月18日

FDA-Tabelle 1 - Aus 德r FDA-Ressource, 德r Forschungsdatenbank für seltene Krankheiten (RDRD), in 德r von Orphan 德signierte Produkte (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) mit mindestens einer Vermarktung aufgeführt sind Zulassung für eine Indikation 德r Volkskrankheit.

FDA没有将数据与分子结构相关联。


卖方:科罗拉多州药物发现中心试点图书馆

发布者:C2D2公共分子:2240

PI:Greg Miknis,助理总监

发布时间:2011年3月7日

该文库包含符合药物标准的结构不同的小分子。代表了几种化学型,并且该文库可以应用于多种潜在靶标。

要请求有关收藏的信息,请发送请求至 [电子邮件保护]


LIPID:脂质图的结构数据库

发布者:Lipid Maps数据库分子:22215

PI:Lipidomics网关

发行时间:2/11/2011

Die Lipid-Maps (http://www.lipidmaps.org/) -Strukturen wurden mit üblichen 5-Ionen (H +, 2H ++, K +, Na +, NH4 +) einschließlich Säugerfettacyls, Glycerolipiden, Glycerophospholipiden, Sphingolipiden, Sterollipiden und Prenollipiden annotiert . Die Strukturen und Ionen können nach Struktur und MW durchsucht werden, um die Identifizierung neuer Lipide zu erleichtern.


结核分枝杆菌

发布者:虚拟代谢物分子:274

发布时间:2010年11月5日

由Kinnings等人在《公共科学图书馆·计算生物学》(PLoS Computational Biology),第6卷:e1000976(2010)中发表的274种药物的数据集(已在美国和欧洲批准用于人类)

在PDB中与至少一种结构共结晶的药品。该数据集可与CDD中的其他TB筛查数据集一起使用,以确定哪些批准的药物具有抗Mtb活性(来自文献)。

TB:文献中非复制型Mtb的抑制剂


发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:26

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年10月28日

来自已发表作品的结构和数据:

Darby和Nathan J Antimicrob Chemother 2010:65:1424-1427

Bryk et al。,Cell Host and Microbe 2008:3:137-145

Lin等,Arch.Biochem。生物物理学。 2010 501:214-220

Lin et al。,J.Biol.Chem.2008:283:34423-34431

由Cavalho等人撰写:J Med Chem。2009:52:5789-5792

Lin et al。,Nature 2009:461:621-626


供应商:Astatech,Inc.积木收藏

发布者:Astatech,Inc.分子:6140

发布时间:2010年10月15日

AstaTech,Inc.提供先进和新颖的中间体,以促进药物发现过程。我们的广泛选择包括结构单元,新胺,受保护的胺,非天然氨基酸,酮,醛,杂环,等位酸酐,硼酸和手性中间体。联系 [电子邮件保护] 用于订购信息。


供应商:Chemik 2010目录

发布者:CDD Vault     Moleküle: 3889

PI:CDD

发布时间:2010年10月5日

Chemik已成功地为像惠氏这样的药物发现公司提供了早期项目的支持。我们提供从克到几吨的原材料和最重要的中间产品。凭借在该领域10年的经验,我们可以帮助我们的客户在4-6周内以具有竞争力的价格,优质的产品和持续的服务开发新的中间产品。


疟疾:菲和蒽氨基醇

发布者:CDD Vault     Moleküle: 35

PI:CDD

发布时间:2010年9月21日

小鼠中针对蒽和菲的卤素取代的N-二烷基和单烷基取代的氨基醇盐酸盐的抗疟原虫数据。 6种化合物表现出活性(平均生存时间增加>60天);八种化合物可治愈(IMST>XNUMX天)。该表包含有关详细信息和综合信息的PubMed ID。


TB:BCG / MTB活动

发布者:诺华公司:TB数据分子:283

PI:Srinivasa Rao

发布时间:2010年9月15日

有氧BCG活性(MIC50)-274种化合物

有氧山地车活动性(MIC50)-283种化合物

BCG ATP无氧活性(IC50)-283种化合物

MTB ATP无氧活性(IC50)-283种化合物

细胞毒性(CC50)-223个复合关键词:结核分枝杆菌,牛分枝杆菌,TB


疟疾:抑制JHU JHCCL恶性疟原虫

出版者:约翰·霍普金斯-沙利文(2008)分子:2693

发布时间:2010年6月4日

10 microM下2663种批准药物的抑制百分比

TB,疟疾:GSK疟疾流行的贝叶斯预测


发布者:GSK数据贝叶斯模型(Ekins等)分子:13355

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年5月28日

使用贝叶斯模型(Ekins等人,Mol BioSyst 6:840-851(2010))预测GSK疟疾流行率(由Gamo等人,Nature 465:305-310(2010)发布) 。

活动限制(220000个模型> 0.31, 2,200 Modell>-1.37在整个细胞筛选中被归类为有效成分)。

疟疾:圣裘德儿童研究医院的全细胞疟疾数据集


发布者:圣裘德-疟疾/锥虫生物活性分子:1524

PI:Kip Guy

发布时间:2010年5月26日

由St. Jude CRH(Guiguemde,W等人,《恶性疟原虫的化学遗传学》,自然465,311-315(2010年5月20日))发表的《自然》杂志的补充数据,包括在八种方案的一次筛选中测试的1524种结构:Bland-Altman分析,ADMET计算属性,系统化学筛选,敏感性,协同作用和酶测试以及热熔分析。


疟疾:诺华GNF-Pf数据集

发布者:诺华疟疾分子:5695

发布时间:2010年5月21日

在由红细胞感染试验选择的化合物中,测试了从MR3获得的恶性疟原虫菌株7d2(药物敏感)和W4(氯喹,奎宁,乙胺嘧啶,环鸟嘌呤和磺胺多辛抗药性)的增殖抑制作用。


供应商:ASINEX新型抗疟疾筛查套装

发布者:ASINEX分子:1

PI:Mark Parisi

发布时间:2010年5月20日

机密数据集:594种来自ASINEX的新化合物。有关ASINEX设计的更多信息,请参见附件。

访问:新的CDD用户-您的注册将通过批准流程,然后再授予对记录的访问权限。现有CDD用户请联系 [电子邮件保护]


供应商:ASINEX Tres Cantos(GSK)抗疟亚种

发布者:ASINEX分子:278

PI:Mark Parisi

发布时间:2010年5月20日

278 ASINEX主动抗疟疾数据与GSK数据一致。

可用于立即筛选。相应的数据集归ASINEX所有。有关更多信息,请联系Mark Parisi:电子邮件: [电子邮件保护]

电话:1-877-ASINEX1

传真:1-336-721 1618-


疟疾:Tres Cantos抗疟疾套装(TCAMS)

发布者:GSK反疟疾数据分子:13471

PI:哈维尔·加莫

发布时间:2010年5月19日

在葛兰素史克(GlaxoSmithKline)筛选库中筛选了大约200万种化合物,鉴定出超过13,500种人红细胞中恶性疟原虫增殖抑制剂。这项工作是在西班牙Tres Cantos的Severa Ochoa 2,GlaxoSmithKline的Tres Cantos医疗发展园区进行的。

TB:Sacchettini等。等评论-其他抗结核药

发表者:PK分子:18

发布时间:2010年2月5日

Sacchettini JC,Rubin EJ和Freundlich JS Drugs与Bugs的图1中未经批准的抗结核药物:追求顽固的捕食性结核分枝杆菌,《自然评论微生物学》(Nature Reviews Microbiology)6,6,41-52,(2008)。


TB:结核小分子专利数据

发布者:TB专利数据分子:20775

PI:协作药物研究

发布时间:2010年1月7日

美国专利商标局,欧洲专利局和世界知识产权组织的结核研究结构和专利信息。


TB:Makarov等人,NM4TB联盟

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:32

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2010年1月1日

1,3-苯并噻嗪-4-酮(BTZ)的结构活性关系数据。 Makarov等人和NM4TB协会的同事在2009年《科学》杂志上发表的出版物“通过阻断阿拉伯合成来杀死苯并噻嗪酮杀死结核分枝杆菌”(PMID:19299584)。


供应商:TimTec多样性集

发布者:TimTec分子:9998

PI:卖方

发布时间:2010年1月5日

10,000种不同药物化合物的筛选库


供应商:TimTec OGT抑制剂类似物SET

发布者:TimTec分子:334

PI:卖方

发布时间:2010年1月5日

O-GlcNAc转移酶抑制剂类似物SET


供应商:TimTec ActiTarg-K,激酶调节剂

发布者:TimTec分子:6212

PI:卖方

发布时间:2010年1月5日

ActiTarg-K可计数6,000多种化合物,并提供高质量的类药物分子筛选库,以识别新型蛋白激酶抑制剂的合成方向

供应商:TimTec天然产物衍生物库

发布者:TimTec分子:3001

PI:卖方

发布时间:2010年1月5日

TimTec的NDL-3000天然衍生物


供应商:TimTec天然产品库

发布者:TimTec分子:479

PI:卖方

发布时间:2010年1月5日

TimTec的NPL纯天然产品


供应商:筛选库

发布者:AsisChem分子:43121

发布时间:2009年10月26日

您可以单独选择40,000多种类似药物的小分子化合物。所有化合物的库存量最高为25mg。


供应商:构建基块

发布者:AsisChem分子:176

发布时间:2009年10月26日

可用于药物发现的化合物的集合。如果没有库存,则所有连接都将在几周内提供,最大数量为10克。


TB:TAACF-NIAID CB2库

发布者:南方研究院分子:102634

PI:Robert Goldman

发布时间:2009年9月30日

筛选具有抑制结核分枝杆菌菌株H37Rv生长能力的商业(ChemBridge)化合物库的结果。参见PMID:19758845


TB:EthR抑制剂(Willand等)

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:5

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2009年9月28日

转录抑制因子EthR的药物样抑制剂。分子和来自Willand等的数据。 Nature Medicine 15:537-544(2009)PMID:19412174


VENDOR,ADME:来自许多结构不同的商业药物的基准数据。

发布者:NM4TB:Karlen Group网站分子:24

PI:不同的Karlen

发布时间:2009年6月11日

在瑞典市场上对药物进行多变量分析是选择少量,理化不同的24种药物的基础。选择时要考虑诸如结构多样性,商业可用性,价格和合适的定量分析技术等因素。测量汇编数据集的亲脂性,pKa,跨人Caco-2细胞单层的溶解性和通透性。我们假设该数据集可以作为验证新实验技术或计算机模型的基准。它也可以用作开发新计算模型的各种初始数据集。

数据取自:

介绍结构多样且可商购的药物数据集,以进行相关性和基准研究。

SköldC,Winiwarter S.,Wernevik J.,BergströmF.,EngströmL.,Allen R.,Box K.,Comer J.,Mole J.,Hallberg A.,LennernäsH.,Lundstedt T.,Ungell AL,卡伦·A

J Med.Chem。2006 Nov 16; 49(23):6660-71。


TB:已发表文献的吸收数据

发布者:CDD:结核病策展文学分子:24

发布时间:2009年5月28日

参考文献中的结核吸收数据

5'-O- [N-(水杨酰基)氨磺酰基]腺苷的2-三唑取代类似物对铁载体生物合成的抑制:对结核分枝杆菌有效的抗菌核苷。

Gupte,A .;夏威夷州,博肖夫; DJ威尔逊; Neres,J .; Labello,NP; RV索姆;邢C; CE,Barry; CC,奥尔德里奇

J Med Chem(2008)Vol.51,No.23,pp.7495-7507渗透率数据。


TB:公开文献中的药代动力学数据

发布者:CDD:结核病策展文学分子:28

发布时间:2009年5月28日

TB药代动力学数据来自已发表的文献资料。 28个唯一和通用连接的SAR数据。

数据包括PubMed引文,目标,测试的细胞和生物,生物利用度,Vm,Vd,Cmax等。


TB:已发表文献的毒性数据

出版者:CDD:TB精选文学分子:638

发布时间:2009年5月28日

TB毒性数据来自已发表的文献资料。来自PubMed参考的638个SAR数据以及常见连接的SAR数据。

数据包括PubMed引文,目标,细胞和生物体测试,细胞生存力,LD50,CC50,MNTD等。


结核病:已发表文献的疗效数据

出版者:CDD:TB精选文学分子:6768

发布时间:2009年5月28日

结核病功效数据来自已发表的文献资料。来自超过300种PubMed参考文献的6771独特以及常规连接的SAR数据。

数据包括PubMed引文,靶标,细胞和生物-睾丸​​,MIC,%抑制,EC50-EC100,IC50等。


TB:MLSMR

发布者:南方研究院分子:214507

PI:Robert Goldman

发布时间:2009年5月8日

在分子库小分子储存库(MLSMR)中收集的200,000种化合物的多样化集合已于2008年春季提供给Southern Research Molecular Libraries Screening Center,以针对Mtb H37Rv进行初步测试。从该初次筛选中选择最具活性的化合物,并在针对H37Rv的剂量反应分析和使用Vero细胞的细胞毒性反筛选中以10种浓度进行测试。


疟疾:约翰霍普金斯大学临床化合物图书馆

出版者:约翰·霍普金斯-沙利文(2008)分子:1878

发布时间:2009年4月28日

筛选药物的浓度为10 µM。将对氯喹敏感的3D7或多重耐药的Dd2处于同步环期的寄生虫培养在含10%人血清的RPMI 1640培养基中,并在药物和[48H]-次黄嘌呤存在下孵育96或3小时。 96孔板每孔含0.2 ml培养物,寄生虫血药浓度为0.2%,血细胞比容为2-4%,在48 h时放射性掺入信号为10,000 cpm,在96 h时为20,000 cpm,背景值小于500 cpm。筛选实验一式两份进行,抑制百分比报告为两次实验的平均值。


TB:文献综述

发布者:结核病文献数据分子:49

PI:Ballel等。

发布时间:2009年4月17日

结核病的SAR数据是从针对结核分枝杆菌的药物调查中收集的,包括具有已知作用机制和未知作用机制的药物(Ballel等人,“新型小分子合成抗分枝杆菌药”,载于抗菌剂和化学疗法,2005年6月)。使用TubercuList / TBDB /其他目标链接和改进的引用更新了4/17。


TB:Sacchettini等人,评论

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:12月。

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2009年2月18日

Sacchettini JC,Rubin EJ和Freundlich JS药物与臭虫中表1和表2第一排和第二排的抗结核药物:追求持久的掠食性结核分枝杆菌,《自然评论微生物学》(Nature Reviews Microbiology),6,41-52,(2008)。


供应商:IUPUI-分布式药物发现(D3)公共数据

发布者:IUPUI-D3枚举73K N-AcylAA-OH,-OMe,-NH2分子:48818

PI:MJ O'Donnell和WL Scott

发布时间:2009年1月1日

可以公开获取的酰化非天然氨基酸及其甲酯的虚拟目录。我们鼓励我们的同事与我们谈谈对“分布式药物发现”项目和合成方法的兴趣,《组合化学杂志》(印刷中)中的三篇文章对此进行了介绍。


供应商:ASINEX构建基块

发布者:ASINEX分子:6745

PI:Mark Parisi

发布时间:2008年12月23日

类似于毒品的构建基块:如果您正在考虑一项潜在客户优化计划,那么我们的构建基块可能恰恰是您所要的。


寄生虫:香水

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:228

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月21日

香气的分子和结构名称数据摘自2006年由Wiley-VCH发行的Roman Kaiser所著的《全世界的感性香水》。分子编号是指书中的编号。


毒药:毒药

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:306

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月18日

Die EPA-Toxcast-Bibliothek von Verbindungen (hauptsächlich Pestizide) ist unter http://www.epa.gov/ncct/dsstox/DataFiles.html verfügbar

http://www.epa.gov/ncct/toxcast/


FDA批准的毒物:建议的最高每日允许量

发布者:CDD-肖恩·埃金斯分子:1215

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins)

发布时间:2008年12月10日

FDA数据库包含建议的1200多种药物的最大每日剂量值。该数据集代表在Matthews,EJ等人的以下出版物中使用的一些分子,Current Drug Discovery Technologies,1(1):61-76。 (2004年)


卖方:阿育吠陀传统以当前的健康需求为目标

发布者:Falguni Dasgupta:个人数据编译分子:37

PI:Falguni Dasgupta

发布时间:2008年10月30日

结合现代观点对印度药用植物及其提取物的传统用途进行了讨论,目的是在官方要求下找到共同点,重新评估需求并在健康和保健领域创造机会,以及寻找新的药品供应线。 ”


寄生虫:桑德勒UCSF Celera半胱氨酸蛋白酶抑制剂库

发布者:McKerrow Group分子:1860

PI:Jim McKerrow

发布时间:2008年10月23日

体外克氏锥虫和布氏锥虫寄生虫和特异性酶筛选。


FDA批准:批准药品

发布者:约翰霍普金斯大学临床化合物库分子:2815

PI:David Sullivan

发布时间:2008年10月16日

FDA批准的具有明确分子结构的药物,包括Physicians'Desk参考文献中的763个分子,DrugBank中的780个分子,2007年橙皮书中的1151个以及FDA博士列表中的1007个。克里斯·利宾斯基


供应商:ASINEX GPCR重点库

发布者:ASINEX分子:3502

PI:Mark Parisi

发布时间:2008年10月2日

CDD社区可享受折扣价的高质量,基于药物的,GPCR导向的套装。该库汇集了我们的药物化学知识和我们从文献中识别特权片段并将其以前所未有的方式组合在一起的能力。


GPCR:PDSP Ki数据库

发布者:PDSP Ki数据库分子:20026

PI:布莱恩·罗斯(Bryan Roth)

发布时间:2008年9月16日

相对于PDSP数据库中的699个GPCR目标,超过47,000 Ki值(NIMH精神药物筛选计划)


供应商:ASINEX Synergy库

发布者:ASINEX分子:25008

PI:Mark Parisi

发布时间:2008年4月26日

ASINEX开发了一个新的高多样性文库,其中富含药效团片段。库的设计基于两种形式的Synergy。第一个是不同技术与目标技术之间的相互关系,第二个涉及多步关键中间体(6-9个步骤)的融合,以创建复杂的连接。有关更多信息,请参见下面的PDF。


TOX:根据公共数据具有已知毒性特征的结构

发布者:具有已知毒性概况的结构分子:135

PI:肖恩·埃金斯(Sean Ekins),博士

发布时间:2008年3月28日

已知化合物的组织特异性毒性特征与参考文献


意外抑制剂:Shoichet释放了混杂抑制剂

发布者:Shoichet已出版混杂抑制剂分子:111

PI:Brian Shoichet

发布时间:2008年3月26日

通过水溶液中有机分子的自缔合实现“假阳性”结果的聚集体


TOX:加州大学戴维斯分校-吊床公共记录

发布者:加州大学戴维斯分校-吊床分子:714

PI:布鲁斯·汉莫克

发布时间:2008年3月17日

可溶性环氧化物水解酶(sEH)的抑制剂-这些酶具有3个主要功能:解毒,分解代谢和调节信号分子。


疟疾,TRYPANOSOME:圣裘德公共数据

发布者:圣裘德-疟疾/锥虫生物活性分子:2426

PI:Kip Guy

发布时间:2008年3月5日

圣裘德儿童研究医院Kip Guy实验室的开放获取结果,包括针对疟疾和布鲁氏杆菌的生物活性剂的HTS


疟疾:Drexel公共数据

发布者:德雷克塞尔大学分子:195

PI:让-克洛德·布拉德利

发布时间:2008年3月2日

之间正在进行的开放数据协作的结果

Drexel(Ugi-4CC产品)和UCSF(动物筛查)。该数据集是研究人员如何公开发布选定结果的示例。 (相反,默认情况下,所有组都是私有的。)


疟疾:美国陆军调查

发布者:美国陆军疟疾文献调查分子:12318

 

发布时间:2008年2月29日

广泛收集了抗疟药的SAR数据,包括化学结构,生物活性数据,药理学数据和毒性数据(最初由美国陆军于1946年作为“抗疟药概述”发布)


疟疾:PlasmoDB

出版者:UPenn-疟疾文献数据分子:120

PI:David Roos

发布时间:2008年2月19日

疟疾抑制物的PlasmoDB是从包括化学结构,PlasmoDB基因标识符,靶基因名称和抗恶性疟原虫,间日疟原虫,伯氏疟原虫,约氏疟原虫,查博迪体育,温克氏Petteri的文献在内的文献中汇编而来


疟疾:天然产物(NPPDB)

发行者:国家天然产物研究中心分子:426

PI:Babu Tekwani

发布时间:2008年2月15日

黄酮类天然产物抗疟疾数据库,包括抗疟疾和细胞毒性数据(密西西比大学,国家天然产物研究中心)


TB:TAACF测试结果

发布者:结核早期药物发现计划分子:812

PI:Bernard Munos

发布时间:2008年2月12日

在Alamar Blue全细胞试验中,可公开获得的812种化合物的文库对结核分枝杆菌(H37Rv)的抗菌活性


FDA批准:孤儿药

发布者:已知药物分子:1721

PI:Christopher Lipinski

发布时间:2007年10月26日

FDA批准的具有特定适应症,保荐人姓名和化学结构的药物(如果有)