CDD库更新(2020年10月):在批次之间创建链接,甚至在不同的Vault中创建批次

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2020年10月12日

CDD库中链接批次/批次的新字段类型

鉴于CDD Vault中存储除小分子以外的其他实体的日益普及,CDD现在提供了一种新的“批处理链接”字段类型,该字段类型允许将批记录链接到存储在相​​同或单独的CDD Vault中的其他实体(如果跨库链接功能)已为您的CDD帐户启用)。该新字段类型在 设定值> Vault > Batch Fields.

方案用例1

配准衍生细胞系,以关联化验测试结果。批处理链接功能可跟踪各个保管库之间的批处理之间的父子关系。

购买了两个商业实体,并在各自的文件库中进行了注册。将质粒DNA转染到亲本细胞系中,产生表达GFP的衍生子细胞系。对于每个衍生的细胞系实体,我们指的是从商业来源获得的亲本细胞系,以及转染到商业细胞系中的质粒DNA。商业亲本细胞系和质粒DNA都在CDD保管库中注册,因此可以使用我们的新Batch Link数据字段功能进行链接。

在这里,CEL-07在Cell Vault中注册了两个外部链接,这些链接引用存储在单独的CDD Vault中的实体:

  1. Cell Vault中的CEL-06是父细胞系
  2. DNA-01是来自质粒库的DNA质粒

单元保险库示例

值得注意的提示

  1. 单击CEL-06实体ID后,请注意新的“链接”子选项卡,其中列出了所有引用CEL-06的其他实体。通过这种方式,每个组件都会使用指向实体页面上的派生实体的前向链接自动更新。

方案用例2

收集土壤样品并在CDD Vault中注册。培养样品,并将培养物注册为CDD Vault中的实体。分离出细菌菌落,并在CDD Vault中注册为实体。最后,从分离的细菌中纯化出一种蛋白质,并在CDD Vault中注册为实体。可以在多个CDD保险柜中创建的一系列Batch Link数据字段中轻松跟踪和表示此终结点样本的沿袭。

土壤样本示例

在上面的CDD Vault搜索结果报告中,我们:

  1. 从田间采集的土壤样品开始 [TST-1012],
  2. 培养田间样品 [SJS-0671] 培养细菌菌落
  3. 分离感兴趣的殖民地 [SJS-0669]
  4. 最终从该细菌菌株中纯化出一种蛋白质 [PRO-01].

值得注意的提示

  1. 要轻松跟踪血统,请将选择列表(或自由文本)“阶段”批处理字段添加到所有相关的CDD保管库。该字段将标识您的特定工作流程步骤。然后,您可以“在您的保险柜中搜索”,然后按此血统Stage的时间顺序对搜索结果报告进行排序。另一种策略是使用“项目”来代表您的血统阶段,您只需在搜索结果表中包括“项目名称”即可。
  2. 在多个CDD保险柜中对Batch Link字段进行一致的命名。

要启用交叉链接,保险柜管理员应创建一个或多个新的Batch Link数据字段:

  1. 导航到 设定值> Vault > Batch Fields
  2. 点击“添加/编辑批处理字段”铅笔图标
  3. 向下滚动到现有批处理字段的底部
  4. 点击“添加批次字段”按钮
  5. 输入新的批次字段名称
  6. 从数据类型下拉列表中选择“批处理链接”选项
  7. (可选)选择该值必须是可选的还是必需的
  8. 点击绿色的“更新批次字段”按钮

新的批处理链接字段类型

这个新字段将存储引用另一个实体的特定批次的链接。当手动创建或编辑批处理以填充“批处理链接”数据字段时,用户可以使用CDD Vault“查找”功能来搜索已在CDD Vault中注册的实体。

搜索在您的保管库中注册的实体

还可以使用“导入数据”向导来填充Batch Link数据字段。您的导入数据文件应包含分子批次ID的字段或列,可以直接将其映射到新的Batch Link数据字段中。

值得注意的提示

  1. 要将批量链接插入存储在单独的CDD保险柜中的实体,必须为您的帐户启用“跨保险柜链接”功能。要启用此功能,Vault管理员必须通过电子邮件发送支持并要求激活该功能。
  2. 单击特定实体/分子ID时显示的“显示”页面现在包含一个新的“链接”子选项卡。该页面将显示由Vault组织的任何引用该实体的ELN条目或分子批次。

新的“链接”子标签

将值映射到分子级字段

CDD库允许用户使用“数据导入”向导填充在分子级别创建的数据字段。通常,这些数据字段旨在包含与母体化合物有关的信息(与与特定分子批次有关的数据相反)。

以前,在“导入数据”向导中,可以在“分子字段”部分的子菜单内的下拉窗口中映射这些分子级别的数据字段。

子菜单下拉面板

在此版本中,此子菜单下拉面板已删除,并且所有可用的分子字段都在“导入数据”向导的“分子字段”部分列出。

导入数据向导的分子场部分