您如何移动化合物可能很重要

2013年5月6日

分配过程影响表观生物活性

从桌子上 肖恩·埃金斯(Sean Ekins) ,科学副总裁, 协作药物发现公司

移液器吸头在板上

我有一些协作超出了CDD的角色,而CDD用户可能更感兴趣。 PLOS ONE的最新文章“通过计算和统计分析确定分配过程影响表观生物活性”,由我本人与Joe Olechno( Labcyte,Inc )和安东尼·威廉姆斯(皇家化学学会)建议,分子的分配方式可能会影响您从实验中获得的结果。

使用来自Astra Zeneca专利的数据,我们研究了计算的物理性能与使用基于尖端的方法或通过声学分配(使用Labcyte,Inc设备)进行系列稀释后获得的IC50值的相关性。此外,我们还分析了使用药效团对数据建模的更复杂方法(Discovery Studio,Accelrys)。尽管本文进行了更详细的介绍,但最重要的是,使用 声学的 分配方法 药效团 对于这些数据更紧密 类似于X射线结构衍生的药效团,并显示出疏水功能的重要性。

这个故事在德里克·洛(Derek Lowe)的几篇博客中都有介绍(“毒品分析数字,到处都是”),安东尼·威廉姆斯和我在“我们现在在高通量筛选和公共化合物数据库世界中信任哪些数据”在我自己的博客中有关该过程的信息(“变形的新闻稿“), the rejections (“拿出纸什么“) and 让人们意识到我们强调的问题的重要性.

尽管这实际上仅仅是故事的开始,但重要的是要与可能影响数据的其他问题一起考虑。此外,请确保我们用尽可能多的信息来注释数据(例如,我们如何分配化合物),这对于将来需要对数据进行建模或分析的其他人可能会有用。

 

 

 

 


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