网络研讨会生物:人类与机器增强的科学发现

Mark A.Musen,M.D.,博士
生物医学信息学和生物医学数据科学教授
生物医学信息学研究主任
斯坦福大学

马克·穆森
Musen博士是斯坦福大学生物医学信息学和生物医学数据科学教授,他是斯坦福大学生物医学信息学研究中心主任。 Musen博士从事与智能系统,可重用本体,用于科学数据集发布的元数据以及生物医学决策支持有关的研究。他的小组开发了Protégé,Protégé是世界上使用最广泛的技术,用于构建和管理术语和本体。他是美国国家健康研究所(NIH)创建的最初的国家生物医学计算中心之一-国家生物医学本体论中心的首席研究员。他是扩展数据注释和检索中心(CEDAR)的首席研究员。 CEDAR是NIH大数据到知识倡议的支持下的卓越中心,其目标是开发新技术以简化生物医学实验元数据的编写和管理。 Musen博士领导斯坦福大学世界卫生组织分类,术语和标准合作中心,该中心已经开发了许多信息基础设施,用于11 国际疾病分类(ICD-11)版。

木森博士是美国医学信息协会信息学唐纳德A. B.林德伯格创新奖的获得者,2006年他曾当选为医学信息的美国大学和美国医师协会。他是该杂志的主编 应用本体.


珍妮丝·克兰兹博士
顾问
CDD倡导者

珍妮丝·克兰兹
Jan拥有伊利诺伊大学香槟分校化学学士学位和哈佛大学生物学博士学位。在过去的四年中,她一直担任独立顾问,帮助小型药物开发公司进行项目和拨款策略,管理和撰写。她在公司和非营利组织,“基准研究”和生物信息学以及在这两个领域的大型项目管理中都拥有20多年的经验。

Jan的职业道路既赋予了她在药物发现领域的广度又具有丰富的经验:首先,她在Cubist Pharmaceuticals工作了5年,以理性的基于目标的药物发现为基础,她于1993年在一家初创公司加入时就致力于目标研究抗生素的鉴定,验证和分析开发。其次,沉浸在生物信息学中,包括在一家非营利性疾病和以患者为中心的研究所(ALS-治疗发展研究所)以及Proteome / BioBase的工作,她在那里负责将文献中的生物学信息整理到生物学数据库中的项目知识,然后在专有的管理方法中使用此数据库内容,以将Gene Ontology术语应用于当时新的人类基因组序列。第三,扬(Jan)有机会直接为爱德华·斯科尼克(Edward Scolnick)博士(默克研究部总裁17年)工作,在此期间,她从中学到了药物研发的基本严格性和潜在陷阱,他们从2007年至2012年期间在Broad学院建立并建立了斯坦利精神病学研究中心。

最近,Jan与CDD的Alex Clark和Barry Bunin合作开发和开发了BioAssay Express(BAE),该软件工具使科学家能够使用BioAssay Ontology中的语义术语快速注释化验方案。


StephanSchürer博士
药理学副教授
计算科学中心药物发现总监
迈阿密大学

StephanSchürer博士是迈阿密大学计算科学中心药理学系副教授和药物发现主任,他还是佛罗里达斯克里普斯研究所(Scripps Research Institute)的兼职副教授,此前他是HTS-和药物发现化学信息学的发展。 Schürer博士曾在Eidogen-Sertanty(生命科学信息技术和科学内容产品的开发商)担任高级总监。在Libraria Inc.,他指导内容运营以开发化学和SAR知识库。

Schürer集团的核心研究主题是系统药物发现。我们整合并建模小分子-蛋白质相互作用,系统生物学“组学”和化学数据,以改善疾病模型到新型功能性小分子的翻译。通过使用分布式和并行化的大数据分析,生物信息和化学信息学工具,我们建立了复杂的建模管道,以了解和预测药物作用机理,滥交和多药理学,尤其侧重于激酶和表观遗传性bromodomain阅读器蛋白。在几个重点项目以及大型项目中,我们开发正式的本体(例如BioAssay本体,药物靶向本体),数据标准和最终用户多层软件应用程序。我们拥有从癌症到神经系统疾病的数种药物发现合作。

为了产生和测试最有前途的小分子,我们正在开发计算优化的合成路线,并使用平行合成技术来制造小的化合物库。

Dr Schürer is a PI in two national Consortia, 日e Library of Integrated Network-based Cellular Signatures (LINCS) project (http://bd2k-lincs.org/), which is also part of 日e Big Data to Knowledge (BD2K) program (//datascience.nih.gov/bd2k), and 日e Illuminating 日e Druggable Genome (IDG) project (http://targetcentral.org/).

斯蒂芬·舒勒(StephanSchürer)获得博士学位。在柏林工业大学获得合成有机化学博士学位,并在柏林洪堡大学和加州大学伯克利分校学习化学。


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